MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014834	TCC	2	6	276059	276064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931638
6502	NC_014834	GATC	2	8	276093	276100	25 %	25 %	25 %	25 %	316931638
6503	NC_014834	CCGT	2	8	276109	276116	0 %	25 %	25 %	50 %	316931638
6504	NC_014834	TGC	2	6	276144	276149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6505	NC_014834	CGA	2	6	276171	276176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6506	NC_014834	TCG	2	6	276213	276218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6507	NC_014834	CGT	2	6	276222	276227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6508	NC_014834	GCA	2	6	276243	276248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6509	NC_014834	CGC	2	6	276261	276266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931638
6510	NC_014834	GGCG	2	8	276267	276274	0 %	0 %	75 %	25 %	316931638
6511	NC_014834	CAGC	2	8	276298	276305	25 %	0 %	25 %	50 %	316931638
6512	NC_014834	CGC	2	6	276333	276338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931638
6513	NC_014834	TGCCA	2	10	276359	276368	20 %	20 %	20 %	40 %	316931638
6514	NC_014834	GCC	2	6	276408	276413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931638
6515	NC_014834	GC	3	6	276422	276427	0 %	0 %	50 %	50 %	316931638
6516	NC_014834	CCA	2	6	276456	276461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931638
6517	NC_014834	CAC	2	6	276487	276492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931638
6518	NC_014834	GCC	2	6	276495	276500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931638
6519	NC_014834	GCA	2	6	276519	276524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6520	NC_014834	GTG	2	6	276584	276589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931638
6521	NC_014834	CGC	3	9	276603	276611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931638
6522	NC_014834	GCA	2	6	276638	276643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6523	NC_014834	GCG	3	9	276737	276745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931638
6524	NC_014834	GAT	2	6	276750	276755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931638
6525	NC_014834	CG	3	6	276758	276763	0 %	0 %	50 %	50 %	316931638
6526	NC_014834	GATC	2	8	276792	276799	25 %	25 %	25 %	25 %	316931638
6527	NC_014834	ATCG	2	8	276808	276815	25 %	25 %	25 %	25 %	316931638
6528	NC_014834	GTG	2	6	276824	276829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931638
6529	NC_014834	GCCG	2	8	276831	276838	0 %	0 %	50 %	50 %	316931638
6530	NC_014834	AGC	2	6	276848	276853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6531	NC_014834	CG	3	6	276894	276899	0 %	0 %	50 %	50 %	316931638
6532	NC_014834	CGC	2	6	276976	276981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931638
6533	NC_014834	CAT	2	6	277021	277026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931638
6534	NC_014834	CAC	2	6	277027	277032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931638
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6539	NC_014834	CGA	2	6	277351	277356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931639
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6542	NC_014834	CCG	2	6	277470	277475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931639
6543	NC_014834	GTC	2	6	277490	277495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931639
6544	NC_014834	CG	3	6	277576	277581	0 %	0 %	50 %	50 %	316931639
6545	NC_014834	CG	3	6	277633	277638	0 %	0 %	50 %	50 %	316931639
6546	NC_014834	CAG	2	6	277640	277645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931639
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6549	NC_014834	GCT	3	9	277702	277710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931639
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6551	NC_014834	ACACC	2	10	277846	277855	40 %	0 %	0 %	60 %	316931639
6552	NC_014834	TCT	2	6	277882	277887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931639
6553	NC_014834	CGC	2	6	277948	277953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931639
6554	NC_014834	CGT	2	6	278012	278017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931639
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6560	NC_014834	GCT	2	6	278321	278326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931639
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6562	NC_014834	TCG	2	6	278454	278459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931639
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6569	NC_014834	CTT	2	6	278747	278752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931639
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6572	NC_014834	GCA	2	6	278815	278820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931639
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6584	NC_014834	CAGAG	2	10	279345	279354	40 %	0 %	40 %	20 %	316931639
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6602	NC_014834	CG	3	6	280868	280873	0 %	0 %	50 %	50 %	316931640
6603	NC_014834	CGG	2	6	281021	281026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931640
6604	NC_014834	CCAGGC	2	12	281040	281051	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316931640
6605	NC_014834	GATC	2	8	281052	281059	25 %	25 %	25 %	25 %	316931640
6606	NC_014834	CAA	2	6	281088	281093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931640
6607	NC_014834	CGC	2	6	281096	281101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931640
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6611	NC_014834	CG	3	6	281303	281308	0 %	0 %	50 %	50 %	316931640
6612	NC_014834	CGA	2	6	281322	281327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931640
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6615	NC_014834	TCGACG	2	12	281366	281377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931640
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6618	NC_014834	GAGC	2	8	281409	281416	25 %	0 %	50 %	25 %	316931640
6619	NC_014834	GAT	2	6	281427	281432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931640
6620	NC_014834	GGC	2	6	281449	281454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931640
6621	NC_014834	TGA	2	6	281516	281521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931640
6622	NC_014834	GCC	2	6	281594	281599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931640
6623	NC_014834	GAT	3	9	281676	281684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931640
6624	NC_014834	TCG	2	6	281717	281722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931640
6625	NC_014834	AGC	2	6	281771	281776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931640
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6630	NC_014834	AGCA	2	8	281956	281963	50 %	0 %	25 %	25 %	316931640
6631	NC_014834	ATC	2	6	282122	282127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931641
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6633	NC_014834	CGGCG	2	10	282148	282157	0 %	0 %	60 %	40 %	316931641
6634	NC_014834	CGG	2	6	282214	282219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931641
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6639	NC_014834	CCG	2	6	282350	282355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
6640	NC_014834	GCGAG	2	10	282360	282369	20 %	0 %	60 %	20 %	316931641
6641	NC_014834	CGC	2	6	282400	282405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
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6643	NC_014834	GCC	2	6	282476	282481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
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6648	NC_014834	GGTCA	2	10	282749	282758	20 %	20 %	40 %	20 %	316931641
6649	NC_014834	CGC	2	6	282832	282837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
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6654	NC_014834	CGC	2	6	283045	283050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
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6660	NC_014834	GCGCCC	2	12	283185	283196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931641
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6731	NC_014834	GCC	2	6	286506	286511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931645
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6735	NC_014834	GCCG	2	8	286838	286845	0 %	0 %	50 %	50 %	316931645
6736	NC_014834	CCG	2	6	286955	286960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931645
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6981	NC_014834	GGC	2	6	297877	297882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931658
6982	NC_014834	GC	3	6	297926	297931	0 %	0 %	50 %	50 %	316931658
6983	NC_014834	TGC	2	6	297972	297977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931658
6984	NC_014834	GC	3	6	298177	298182	0 %	0 %	50 %	50 %	316931658
6985	NC_014834	CGG	2	6	298201	298206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931658
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6988	NC_014834	CCGGT	2	10	298356	298365	0 %	20 %	40 %	40 %	316931658
6989	NC_014834	GCCGGC	2	12	298376	298387	0 %	0 %	50 %	50 %	316931658
6990	NC_014834	CG	4	8	298398	298405	0 %	0 %	50 %	50 %	316931658
6991	NC_014834	CGC	2	6	298431	298436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931658
6992	NC_014834	GAA	2	6	298457	298462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931658
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6996	NC_014834	GCG	2	6	298581	298586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931658
6997	NC_014834	GGCG	2	8	298591	298598	0 %	0 %	75 %	25 %	316931658
6998	NC_014834	CGG	2	6	298959	298964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931659
6999	NC_014834	CGGCG	2	10	298978	298987	0 %	0 %	60 %	40 %	316931659
7000	NC_014834	TTC	2	6	299030	299035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931659

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