MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014834	TGCGG	2	10	254648	254657	0 %	20 %	60 %	20 %	316931619
6002	NC_014834	CGA	2	6	254723	254728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931619
6003	NC_014834	GAG	2	6	254745	254750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931619
6004	NC_014834	CTG	2	6	254784	254789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931619
6005	NC_014834	GCC	2	6	254792	254797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931619
6006	NC_014834	CTT	2	6	254822	254827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931619
6007	NC_014834	GCC	2	6	254837	254842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931619
6008	NC_014834	GCC	3	9	254913	254921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931619
6009	NC_014834	CGGCGT	2	12	254924	254935	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931619
6010	NC_014834	GCC	2	6	254936	254941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931619
6011	NC_014834	AGG	2	6	254947	254952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931619
6012	NC_014834	GGT	2	6	254999	255004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931619
6013	NC_014834	TGG	2	6	255037	255042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931619
6014	NC_014834	CGG	2	6	255053	255058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931619
6015	NC_014834	GGA	2	6	255092	255097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931619
6016	NC_014834	CGC	3	9	255109	255117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931619
6017	NC_014834	GCT	2	6	255164	255169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931619
6018	NC_014834	CTT	2	6	255213	255218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931620
6019	NC_014834	GGC	2	6	255283	255288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931620
6020	NC_014834	CGG	2	6	255300	255305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931620
6021	NC_014834	GCA	2	6	255314	255319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931620
6022	NC_014834	GGC	2	6	255373	255378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931620
6023	NC_014834	CGG	2	6	255408	255413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931620
6024	NC_014834	GCAGC	2	10	255414	255423	20 %	0 %	40 %	40 %	316931620
6025	NC_014834	CAGC	2	8	255471	255478	25 %	0 %	25 %	50 %	316931620
6026	NC_014834	CTT	2	6	255510	255515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931620
6027	NC_014834	CCG	2	6	255545	255550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931620
6028	NC_014834	CGC	2	6	255558	255563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931620
6029	NC_014834	CAT	2	6	255633	255638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931620
6030	NC_014834	CCG	2	6	255641	255646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931620
6031	NC_014834	GCG	2	6	255675	255680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931620
6032	NC_014834	TGGC	2	8	255727	255734	0 %	25 %	50 %	25 %	316931620
6033	NC_014834	CGC	2	6	255755	255760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931620
6034	NC_014834	GCC	2	6	255924	255929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931620
6035	NC_014834	GCG	2	6	255965	255970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931620
6036	NC_014834	GCCG	2	8	255979	255986	0 %	0 %	50 %	50 %	316931620
6037	NC_014834	GCG	2	6	256043	256048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931620
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6039	NC_014834	GCG	2	6	256144	256149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931620
6040	NC_014834	GTG	2	6	256158	256163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931620
6041	NC_014834	GAA	2	6	256549	256554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931621
6042	NC_014834	AGA	2	6	256557	256562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931621
6043	NC_014834	CGGCAG	2	12	256585	256596	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316931621
6044	NC_014834	CGC	2	6	256646	256651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931621
6045	NC_014834	CGC	2	6	256657	256662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931621
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6047	NC_014834	CG	4	8	256888	256895	0 %	0 %	50 %	50 %	316931621
6048	NC_014834	GAG	2	6	257015	257020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931621
6049	NC_014834	GGC	2	6	257036	257041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931621
6050	NC_014834	ATC	2	6	257042	257047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931621
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6052	NC_014834	CGT	2	6	257088	257093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931621
6053	NC_014834	GAT	2	6	257125	257130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931621
6054	NC_014834	ACG	2	6	257145	257150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931621
6055	NC_014834	ACG	2	6	257169	257174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931621
6056	NC_014834	CCG	2	6	257227	257232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931621
6057	NC_014834	GAG	2	6	257282	257287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931621
6058	NC_014834	CG	3	6	257293	257298	0 %	0 %	50 %	50 %	316931621
6059	NC_014834	GATC	2	8	257332	257339	25 %	25 %	25 %	25 %	316931621
6060	NC_014834	CGG	2	6	257379	257384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931621
6061	NC_014834	TGC	2	6	257385	257390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931621
6062	NC_014834	GC	3	6	257419	257424	0 %	0 %	50 %	50 %	316931621
6063	NC_014834	ACG	2	6	257454	257459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931621
6064	NC_014834	CGC	2	6	257525	257530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931621
6065	NC_014834	GCT	2	6	257617	257622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931621
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6067	NC_014834	CGCC	2	8	257632	257639	0 %	0 %	25 %	75 %	316931621
6068	NC_014834	GAG	2	6	257660	257665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931621
6069	NC_014834	CGA	2	6	257689	257694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931621
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6072	NC_014834	CTG	2	6	257783	257788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931621
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6080	NC_014834	AGGCG	2	10	257958	257967	20 %	0 %	60 %	20 %	316931621
6081	NC_014834	GC	3	6	257986	257991	0 %	0 %	50 %	50 %	316931621
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6086	NC_014834	GC	3	6	258165	258170	0 %	0 %	50 %	50 %	316931621
6087	NC_014834	GC	3	6	258200	258205	0 %	0 %	50 %	50 %	316931621
6088	NC_014834	CGA	2	6	258211	258216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931621
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6094	NC_014834	GCTGGA	2	12	258319	258330	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	316931621
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6098	NC_014834	GC	4	8	258391	258398	0 %	0 %	50 %	50 %	316931621
6099	NC_014834	TCG	2	6	258440	258445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931621
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6101	NC_014834	TCGT	2	8	258494	258501	0 %	50 %	25 %	25 %	316931621
6102	NC_014834	GAGCT	2	10	258611	258620	20 %	20 %	40 %	20 %	316931621
6103	NC_014834	AGG	2	6	258642	258647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931621
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6105	NC_014834	GCT	2	6	258697	258702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931621
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6107	NC_014834	GCG	2	6	258717	258722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931621
6108	NC_014834	TCGG	2	8	258725	258732	0 %	25 %	50 %	25 %	316931621
6109	NC_014834	GC	3	6	258859	258864	0 %	0 %	50 %	50 %	316931622
6110	NC_014834	CGG	3	9	258889	258897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931622
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6112	NC_014834	TCGG	2	8	259029	259036	0 %	25 %	50 %	25 %	316931622
6113	NC_014834	CGT	2	6	259213	259218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931622
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6117	NC_014834	TCG	2	6	259299	259304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931622
6118	NC_014834	CG	3	6	259306	259311	0 %	0 %	50 %	50 %	316931622
6119	NC_014834	ATG	2	6	259353	259358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931622
6120	NC_014834	CG	3	6	259370	259375	0 %	0 %	50 %	50 %	316931622
6121	NC_014834	GAA	2	6	259430	259435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931622
6122	NC_014834	CGT	2	6	259441	259446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931622
6123	NC_014834	GCGACC	2	12	259467	259478	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	316931622
6124	NC_014834	GCG	2	6	259535	259540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931622
6125	NC_014834	GGT	2	6	259628	259633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931622
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6238	NC_014834	CAC	3	9	265297	265305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931627
6239	NC_014834	GCA	2	6	265314	265319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931627
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6241	NC_014834	CAT	2	6	265354	265359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931627
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6481	NC_014834	GCT	3	9	275616	275624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931637
6482	NC_014834	CGC	2	6	275636	275641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931637
6483	NC_014834	GCC	2	6	275643	275648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931637
6484	NC_014834	GCG	2	6	275654	275659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931637
6485	NC_014834	GCA	2	6	275694	275699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6486	NC_014834	GCC	2	6	275700	275705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931638
6487	NC_014834	CAC	2	6	275716	275721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931638
6488	NC_014834	GGCC	2	8	275742	275749	0 %	0 %	50 %	50 %	316931638
6489	NC_014834	CAG	2	6	275767	275772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6490	NC_014834	GCCG	2	8	275780	275787	0 %	0 %	50 %	50 %	316931638
6491	NC_014834	CAG	2	6	275794	275799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6492	NC_014834	CAGC	2	8	275833	275840	25 %	0 %	25 %	50 %	316931638
6493	NC_014834	GC	4	8	275848	275855	0 %	0 %	50 %	50 %	316931638
6494	NC_014834	TCG	2	6	275921	275926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6495	NC_014834	ACCCG	2	10	275928	275937	20 %	0 %	20 %	60 %	316931638
6496	NC_014834	GCA	2	6	275946	275951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6497	NC_014834	CGC	2	6	276016	276021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931638
6498	NC_014834	GCA	2	6	276027	276032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931638
6499	NC_014834	GCCGC	2	10	276033	276042	0 %	0 %	40 %	60 %	316931638
6500	NC_014834	GGC	2	6	276043	276048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931638

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