MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014834	CG	3	6	188071	188076	0 %	0 %	50 %	50 %	316931559
4502	NC_014834	GCG	2	6	188079	188084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931559
4503	NC_014834	CG	3	6	188087	188092	0 %	0 %	50 %	50 %	316931559
4504	NC_014834	CGT	2	6	188284	188289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931560
4505	NC_014834	CGGAC	2	10	188329	188338	20 %	0 %	40 %	40 %	316931560
4506	NC_014834	CGG	2	6	188367	188372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931560
4507	NC_014834	CATCG	2	10	188377	188386	20 %	20 %	20 %	40 %	316931560
4508	NC_014834	GAA	2	6	188398	188403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931560
4509	NC_014834	ATC	2	6	188408	188413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931560
4510	NC_014834	CG	3	6	188470	188475	0 %	0 %	50 %	50 %	316931560
4511	NC_014834	GGCT	2	8	188480	188487	0 %	25 %	50 %	25 %	316931560
4512	NC_014834	TCGG	2	8	188540	188547	0 %	25 %	50 %	25 %	316931560
4513	NC_014834	GCC	2	6	188573	188578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931560
4514	NC_014834	AGC	2	6	188628	188633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931560
4515	NC_014834	CAA	2	6	188668	188673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931560
4516	NC_014834	CGC	2	6	188692	188697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931560
4517	NC_014834	ACCGG	2	10	188744	188753	20 %	0 %	40 %	40 %	316931560
4518	NC_014834	TGA	2	6	188763	188768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931560
4519	NC_014834	AAG	2	6	188786	188791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931560
4520	NC_014834	CGA	2	6	188836	188841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931560
4521	NC_014834	AGA	2	6	188859	188864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931560
4522	NC_014834	GAA	2	6	188903	188908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931560
4523	NC_014834	CGC	2	6	188956	188961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931560
4524	NC_014834	CGG	2	6	189001	189006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931560
4525	NC_014834	TCAAA	2	10	189024	189033	60 %	20 %	0 %	20 %	316931560
4526	NC_014834	TGG	2	6	189036	189041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931560
4527	NC_014834	CCGCGC	2	12	189139	189150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931560
4528	NC_014834	CGC	2	6	189154	189159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931560
4529	NC_014834	TGG	2	6	189168	189173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931560
4530	NC_014834	AAG	2	6	189203	189208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931560
4531	NC_014834	AGC	2	6	189428	189433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931561
4532	NC_014834	TCG	2	6	189480	189485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931561
4533	NC_014834	CGG	3	9	189544	189552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931561
4534	NC_014834	GTG	2	6	189554	189559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931561
4535	NC_014834	TGC	2	6	189561	189566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931561
4536	NC_014834	GC	3	6	189622	189627	0 %	0 %	50 %	50 %	316931561
4537	NC_014834	CCG	2	6	189642	189647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931561
4538	NC_014834	TGCTGG	2	12	189777	189788	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	316931561
4539	NC_014834	CGG	2	6	189789	189794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931561
4540	NC_014834	ACG	2	6	189795	189800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931561
4541	NC_014834	CCGGTG	2	12	189857	189868	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931561
4542	NC_014834	ATG	2	6	189869	189874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931561
4543	NC_014834	CGA	3	9	189892	189900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931561
4544	NC_014834	TTCA	2	8	190065	190072	25 %	50 %	0 %	25 %	316931562
4545	NC_014834	ACCGA	2	10	190074	190083	40 %	0 %	20 %	40 %	316931562
4546	NC_014834	GGC	2	6	190166	190171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931562
4547	NC_014834	CGC	2	6	190177	190182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931562
4548	NC_014834	GGC	2	6	190184	190189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931562
4549	NC_014834	GCA	2	6	190271	190276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931562
4550	NC_014834	CAT	2	6	190301	190306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931562
4551	NC_014834	GC	3	6	190324	190329	0 %	0 %	50 %	50 %	316931562
4552	NC_014834	GAC	2	6	190359	190364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931562
4553	NC_014834	CGA	4	12	190367	190378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931562
4554	NC_014834	ATC	2	6	190413	190418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931562
4555	NC_014834	CGG	2	6	190447	190452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931562
4556	NC_014834	CGG	2	6	190463	190468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931562
4557	NC_014834	GCG	2	6	190519	190524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931562
4558	NC_014834	CGT	2	6	190540	190545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931562
4559	NC_014834	GCA	2	6	190559	190564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931562
4560	NC_014834	CTG	2	6	190578	190583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931562
4561	NC_014834	GTCC	2	8	190611	190618	0 %	25 %	25 %	50 %	316931562
4562	NC_014834	GCT	2	6	190835	190840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931563
4563	NC_014834	GCT	2	6	190892	190897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931563
4564	NC_014834	ACC	2	6	190956	190961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931563
4565	NC_014834	CG	4	8	191003	191010	0 %	0 %	50 %	50 %	316931563
4566	NC_014834	GTC	2	6	191037	191042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931563
4567	NC_014834	GAC	2	6	191048	191053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931563
4568	NC_014834	CGA	2	6	191090	191095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931563
4569	NC_014834	CTA	2	6	191138	191143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931563
4570	NC_014834	TCG	2	6	191149	191154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931563
4571	NC_014834	GAT	2	6	191168	191173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931563
4572	NC_014834	GCG	2	6	191214	191219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931563
4573	NC_014834	GC	3	6	191227	191232	0 %	0 %	50 %	50 %	316931563
4574	NC_014834	CGC	2	6	191249	191254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931563
4575	NC_014834	TCG	2	6	191260	191265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931563
4576	NC_014834	CGC	4	12	191287	191298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931563
4577	NC_014834	GGCT	2	8	191331	191338	0 %	25 %	50 %	25 %	316931563
4578	NC_014834	CGC	2	6	191450	191455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931563
4579	NC_014834	ATG	2	6	191456	191461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931563
4580	NC_014834	GAT	2	6	191511	191516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931564
4581	NC_014834	TGGC	2	8	191521	191528	0 %	25 %	50 %	25 %	316931564
4582	NC_014834	GTC	2	6	191554	191559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931564
4583	NC_014834	GCC	2	6	191605	191610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931564
4584	NC_014834	GAGC	2	8	191655	191662	25 %	0 %	50 %	25 %	316931564
4585	NC_014834	GCG	2	6	191694	191699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931564
4586	NC_014834	ATC	2	6	191701	191706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931564
4587	NC_014834	TCG	2	6	191711	191716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931564
4588	NC_014834	CGA	2	6	191733	191738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931564
4589	NC_014834	CGATCG	2	12	191753	191764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931564
4590	NC_014834	CGCGGC	2	12	191776	191787	0 %	0 %	50 %	50 %	316931564
4591	NC_014834	CG	3	6	191792	191797	0 %	0 %	50 %	50 %	316931564
4592	NC_014834	GCCG	2	8	191827	191834	0 %	0 %	50 %	50 %	316931564
4593	NC_014834	GAA	2	6	191863	191868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931564
4594	NC_014834	CGGCG	2	10	191879	191888	0 %	0 %	60 %	40 %	316931564
4595	NC_014834	GTG	2	6	191914	191919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931564
4596	NC_014834	GCG	2	6	191922	191927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931564
4597	NC_014834	GCC	2	6	192099	192104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931565
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4599	NC_014834	ATC	2	6	192166	192171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931565
4600	NC_014834	CGA	2	6	192209	192214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931565
4601	NC_014834	GATCTC	2	12	192218	192229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	316931565
4602	NC_014834	CAT	2	6	192269	192274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931565
4603	NC_014834	GC	3	6	192303	192308	0 %	0 %	50 %	50 %	316931565
4604	NC_014834	CCA	2	6	192329	192334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931565
4605	NC_014834	ATC	2	6	192337	192342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931565
4606	NC_014834	CGG	2	6	192417	192422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931565
4607	NC_014834	ATC	2	6	192442	192447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931565
4608	NC_014834	GCG	2	6	192735	192740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931566
4609	NC_014834	CCGT	2	8	192762	192769	0 %	25 %	25 %	50 %	316931566
4610	NC_014834	CGA	2	6	192774	192779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931566
4611	NC_014834	CGA	2	6	192798	192803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931566
4612	NC_014834	GAC	2	6	192872	192877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931566
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4614	NC_014834	TCTGTT	2	12	193008	193019	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	316931566
4615	NC_014834	CGC	2	6	193020	193025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931566
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4618	NC_014834	GGC	2	6	193098	193103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931566
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4742	NC_014834	TCG	2	6	197095	197100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931570
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4858	NC_014834	CG	3	6	202049	202054	0 %	0 %	50 %	50 %	316931575
4859	NC_014834	GGTC	2	8	202080	202087	0 %	25 %	50 %	25 %	316931575
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4981	NC_014834	CG	3	6	206857	206862	0 %	0 %	50 %	50 %	316931579
4982	NC_014834	CAC	2	6	206863	206868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931579
4983	NC_014834	ACC	4	12	206870	206881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931579
4984	NC_014834	CGCC	2	8	206906	206913	0 %	0 %	25 %	75 %	316931579
4985	NC_014834	CGC	2	6	206920	206925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931579
4986	NC_014834	CGA	4	12	206935	206946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931579
4987	NC_014834	GAT	2	6	206956	206961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931579
4988	NC_014834	CGT	2	6	206963	206968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931579
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4990	NC_014834	CCCG	2	8	206978	206985	0 %	0 %	25 %	75 %	316931579
4991	NC_014834	GCC	3	9	206992	207000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931579
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