MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL02

Total Repeats: 6072

< Previous12345678910111213Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014825	ATC	2	6	347704	347709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788977
6002	NC_014825	AAT	2	6	347736	347741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319788977
6003	NC_014825	GCC	2	6	347776	347781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319788977
6004	NC_014825	CTG	2	6	347797	347802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788977
6005	NC_014825	TTA	2	6	347840	347845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319788977
6006	NC_014825	AC	3	6	347858	347863	50 %	0 %	0 %	50 %	319788977
6007	NC_014825	TGTC	2	8	347880	347887	0 %	50 %	25 %	25 %	319788977
6008	NC_014825	GCT	2	6	347949	347954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788977
6009	NC_014825	ATC	2	6	347995	348000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788977
6010	NC_014825	CAT	2	6	348045	348050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788977
6011	NC_014825	ATCTG	2	10	348065	348074	20 %	40 %	20 %	20 %	319788977
6012	NC_014825	ATT	2	6	348082	348087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319788977
6013	NC_014825	CAT	2	6	348159	348164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788977
6014	NC_014825	T	6	6	348193	348198	0 %	100 %	0 %	0 %	319788977
6015	NC_014825	T	6	6	348260	348265	0 %	100 %	0 %	0 %	319788977
6016	NC_014825	T	6	6	348391	348396	0 %	100 %	0 %	0 %	319788977
6017	NC_014825	CAG	2	6	348423	348428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788977
6018	NC_014825	AT	3	6	348467	348472	50 %	50 %	0 %	0 %	319788977
6019	NC_014825	GCA	2	6	348609	348614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788978
6020	NC_014825	ATG	2	6	348630	348635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788978
6021	NC_014825	CAG	2	6	348806	348811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788978
6022	NC_014825	CTC	2	6	348818	348823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319788978
6023	NC_014825	GCC	2	6	348936	348941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319788978
6024	NC_014825	TTG	2	6	348978	348983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319788978
6025	NC_014825	CAG	2	6	349060	349065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788978
6026	NC_014825	TCA	2	6	349081	349086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788978
6027	NC_014825	ATC	2	6	349088	349093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788978
6028	NC_014825	TTGTC	2	10	349111	349120	0 %	60 %	20 %	20 %	319788978
6029	NC_014825	AT	3	6	349155	349160	50 %	50 %	0 %	0 %	319788978
6030	NC_014825	AT	3	6	349165	349170	50 %	50 %	0 %	0 %	319788978
6031	NC_014825	GCA	2	6	349392	349397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788978
6032	NC_014825	TCA	2	6	349419	349424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788978
6033	NC_014825	ACA	2	6	349481	349486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788978
6034	NC_014825	GCT	2	6	349584	349589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788978
6035	NC_014825	CAT	2	6	349633	349638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788978
6036	NC_014825	GCAG	2	8	349675	349682	25 %	0 %	50 %	25 %	319788978
6037	NC_014825	AT	3	6	349697	349702	50 %	50 %	0 %	0 %	319788978
6038	NC_014825	GTCC	2	8	349713	349720	0 %	25 %	25 %	50 %	319788979
6039	NC_014825	GCTTT	2	10	349869	349878	0 %	60 %	20 %	20 %	319788979
6040	NC_014825	TCA	2	6	349920	349925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788979
6041	NC_014825	GAA	2	6	350021	350026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788979
6042	NC_014825	CAA	2	6	350037	350042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788979
6043	NC_014825	ATC	2	6	350272	350277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788980
6044	NC_014825	TTCT	2	8	350487	350494	0 %	75 %	0 %	25 %	319788980
6045	NC_014825	CAT	2	6	350577	350582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788980
6046	NC_014825	CAG	2	6	350643	350648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788980
6047	NC_014825	ATAACT	2	12	350659	350670	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319788980
6048	NC_014825	GTC	2	6	350703	350708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788981
6049	NC_014825	CTT	2	6	350772	350777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788981
6050	NC_014825	CTT	2	6	350780	350785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788981
6051	NC_014825	AGC	2	6	350797	350802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788981
6052	NC_014825	TTC	2	6	350803	350808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788981
6053	NC_014825	CCG	2	6	350824	350829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319788981
6054	NC_014825	CG	3	6	350875	350880	0 %	0 %	50 %	50 %	319788981
6055	NC_014825	TCT	2	6	350961	350966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788981
6056	NC_014825	ATGA	2	8	350998	351005	50 %	25 %	25 %	0 %	319788981
6057	NC_014825	TC	3	6	351020	351025	0 %	50 %	0 %	50 %	319788981
6058	NC_014825	CAG	2	6	351030	351035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788981
6059	NC_014825	ATG	2	6	351089	351094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788981
6060	NC_014825	GAA	2	6	351126	351131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788981
6061	NC_014825	TCG	2	6	351184	351189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788981
6062	NC_014825	TCCTG	2	10	351218	351227	0 %	40 %	20 %	40 %	319788981
6063	NC_014825	CAA	2	6	351248	351253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788981
6064	NC_014825	ACA	2	6	351283	351288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788981
6065	NC_014825	TTC	2	6	351291	351296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788981
6066	NC_014825	TA	4	8	351377	351384	50 %	50 %	0 %	0 %	319788981
6067	NC_014825	CAT	2	6	351530	351535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788981
6068	NC_014825	GATA	2	8	351593	351600	50 %	25 %	25 %	0 %	319788981
6069	NC_014825	TAG	2	6	351898	351903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788981
6070	NC_014825	CTG	2	6	352082	352087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788981
6071	NC_014825	TCA	2	6	352297	352302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788981
6072	NC_014825	CAG	2	6	352374	352379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788981

< Previous12345678910111213Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.