MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL01

Total Repeats: 6967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014824	AGG	2	6	192	197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133720
2	NC_014824	GT	3	6	215	220	0 %	50 %	50 %	0 %	317133720
3	NC_014824	ATGG	2	8	281	288	25 %	25 %	50 %	0 %	317133720
4	NC_014824	GAT	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
5	NC_014824	T	6	6	345	350	0 %	100 %	0 %	0 %	317133720
6	NC_014824	A	6	6	384	389	100 %	0 %	0 %	0 %	317133720
7	NC_014824	TGA	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
8	NC_014824	T	7	7	411	417	0 %	100 %	0 %	0 %	317133720
9	NC_014824	TCAG	2	8	442	449	25 %	25 %	25 %	25 %	317133720
10	NC_014824	A	6	6	479	484	100 %	0 %	0 %	0 %	317133720
11	NC_014824	CAG	2	6	487	492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133720
12	NC_014824	A	6	6	521	526	100 %	0 %	0 %	0 %	317133720
13	NC_014824	AAT	2	6	531	536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133720
14	NC_014824	A	6	6	614	619	100 %	0 %	0 %	0 %	317133720
15	NC_014824	CTT	2	6	686	691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133720
16	NC_014824	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	317133720
17	NC_014824	AT	3	6	732	737	50 %	50 %	0 %	0 %	317133720
18	NC_014824	GAT	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
19	NC_014824	AT	3	6	773	778	50 %	50 %	0 %	0 %	317133720
20	NC_014824	A	6	6	873	878	100 %	0 %	0 %	0 %	317133720
21	NC_014824	TGA	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
22	NC_014824	GAT	3	9	904	912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
23	NC_014824	ATCT	2	8	922	929	25 %	50 %	0 %	25 %	317133720
24	NC_014824	GAA	2	6	939	944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133720
25	NC_014824	ATA	2	6	970	975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133720
26	NC_014824	GAA	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133720
27	NC_014824	GGA	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133720
28	NC_014824	ACG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133720
29	NC_014824	A	6	6	1172	1177	100 %	0 %	0 %	0 %	317133720
30	NC_014824	ATA	2	6	1187	1192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133720
31	NC_014824	GAC	2	6	1250	1255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133720
32	NC_014824	CAA	2	6	1259	1264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133720
33	NC_014824	CGAT	2	8	1340	1347	25 %	25 %	25 %	25 %	317133720
34	NC_014824	TGA	2	6	1365	1370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
35	NC_014824	AGTA	2	8	1371	1378	50 %	25 %	25 %	0 %	317133720
36	NC_014824	GCTT	2	8	1392	1399	0 %	50 %	25 %	25 %	317133720
37	NC_014824	TTC	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133720
38	NC_014824	TCA	2	6	1455	1460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133720
39	NC_014824	ATGAT	2	10	1493	1502	40 %	40 %	20 %	0 %	317133720
40	NC_014824	ACAG	2	8	1544	1551	50 %	0 %	25 %	25 %	317133720
41	NC_014824	ATA	2	6	1567	1572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133720
42	NC_014824	A	6	6	1572	1577	100 %	0 %	0 %	0 %	317133720
43	NC_014824	ATA	2	6	1672	1677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133720
44	NC_014824	GAT	2	6	1696	1701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
45	NC_014824	T	6	6	1703	1708	0 %	100 %	0 %	0 %	317133720
46	NC_014824	CGG	2	6	1743	1748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317133720
47	NC_014824	ATAA	2	8	1759	1766	75 %	25 %	0 %	0 %	317133720
48	NC_014824	GAA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133720
49	NC_014824	ATC	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133720
50	NC_014824	A	6	6	1860	1865	100 %	0 %	0 %	0 %	317133720
51	NC_014824	TA	3	6	1903	1908	50 %	50 %	0 %	0 %	317133720
52	NC_014824	GAA	2	6	1924	1929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133720
53	NC_014824	AAATC	2	10	1969	1978	60 %	20 %	0 %	20 %	317133720
54	NC_014824	GAA	3	9	2112	2120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133720
55	NC_014824	CAG	2	6	2134	2139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133720
56	NC_014824	AGA	2	6	2348	2353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
57	NC_014824	A	6	6	2381	2386	100 %	0 %	0 %	0 %	317133721
58	NC_014824	AGA	2	6	2423	2428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
59	NC_014824	ATC	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133721
60	NC_014824	TCT	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133721
61	NC_014824	TCG	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133721
62	NC_014824	A	7	7	2571	2577	100 %	0 %	0 %	0 %	317133721
63	NC_014824	AAT	2	6	2588	2593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133721
64	NC_014824	A	6	6	2681	2686	100 %	0 %	0 %	0 %	317133721
65	NC_014824	AT	3	6	2699	2704	50 %	50 %	0 %	0 %	317133721
66	NC_014824	ATG	2	6	2718	2723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
67	NC_014824	A	6	6	2760	2765	100 %	0 %	0 %	0 %	317133721
68	NC_014824	GGATTC	2	12	2850	2861	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	317133721
69	NC_014824	TGA	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
70	NC_014824	TTC	2	6	2885	2890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133721
71	NC_014824	AAG	2	6	2912	2917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
72	NC_014824	AGC	2	6	2924	2929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133721
73	NC_014824	AAT	2	6	2930	2935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133721
74	NC_014824	TCA	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133721
75	NC_014824	TGA	2	6	2987	2992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
76	NC_014824	ATA	2	6	3001	3006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133721
77	NC_014824	AAG	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
78	NC_014824	GATA	2	8	3017	3024	50 %	25 %	25 %	0 %	317133721
79	NC_014824	GAG	2	6	3075	3080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133721
80	NC_014824	TTCG	2	8	3111	3118	0 %	50 %	25 %	25 %	317133721
81	NC_014824	GAA	2	6	3179	3184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
82	NC_014824	AGA	2	6	3206	3211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
83	NC_014824	GAT	2	6	3219	3224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
84	NC_014824	AATT	2	8	3232	3239	50 %	50 %	0 %	0 %	317133721
85	NC_014824	TTTGAG	2	12	3264	3275	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	317133721
86	NC_014824	CGG	2	6	3332	3337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317133721
87	NC_014824	ACT	2	6	3354	3359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133721
88	NC_014824	AGC	2	6	3380	3385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133721
89	NC_014824	ATAA	2	8	3522	3529	75 %	25 %	0 %	0 %	317133721
90	NC_014824	TGA	2	6	3554	3559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
91	NC_014824	GAT	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
92	NC_014824	ACTT	2	8	3719	3726	25 %	50 %	0 %	25 %	317133721
93	NC_014824	AGA	2	6	3797	3802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
94	NC_014824	ATC	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133721
95	NC_014824	GAA	2	6	3873	3878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
96	NC_014824	A	6	6	3881	3886	100 %	0 %	0 %	0 %	317133721
97	NC_014824	AGG	2	6	3890	3895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133721
98	NC_014824	TAA	2	6	3962	3967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133721
99	NC_014824	AAT	2	6	3968	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133721
100	NC_014824	AGC	2	6	4003	4008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133721
101	NC_014824	CAGT	2	8	4022	4029	25 %	25 %	25 %	25 %	317133721
102	NC_014824	GTATA	2	10	4099	4108	40 %	40 %	20 %	0 %	317133721
103	NC_014824	ATG	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
104	NC_014824	CTG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133721
105	NC_014824	A	6	6	4325	4330	100 %	0 %	0 %	0 %	317133721
106	NC_014824	AAT	2	6	4377	4382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133721
107	NC_014824	ATT	2	6	4392	4397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133721
108	NC_014824	T	8	8	4544	4551	0 %	100 %	0 %	0 %	317133722
109	NC_014824	AGA	2	6	4561	4566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133722
110	NC_014824	A	6	6	4621	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	317133722
111	NC_014824	A	6	6	4655	4660	100 %	0 %	0 %	0 %	317133722
112	NC_014824	AAG	2	6	4692	4697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133722
113	NC_014824	TA	3	6	4754	4759	50 %	50 %	0 %	0 %	317133722
114	NC_014824	CAT	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133722
115	NC_014824	AGA	2	6	4788	4793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133722
116	NC_014824	TGA	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133722
117	NC_014824	AT	3	6	4919	4924	50 %	50 %	0 %	0 %	317133722
118	NC_014824	AAG	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133722
119	NC_014824	GAC	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133722
120	NC_014824	TCA	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133722
121	NC_014824	TACAA	2	10	5209	5218	60 %	20 %	0 %	20 %	317133722
122	NC_014824	TTA	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133722
123	NC_014824	TAA	2	6	5274	5279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133722
124	NC_014824	ATA	2	6	5303	5308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133722
125	NC_014824	A	6	6	5358	5363	100 %	0 %	0 %	0 %	317133722
126	NC_014824	CTTT	2	8	5366	5373	0 %	75 %	0 %	25 %	317133722
127	NC_014824	TTTTG	2	10	5388	5397	0 %	80 %	20 %	0 %	317133722
128	NC_014824	A	6	6	5429	5434	100 %	0 %	0 %	0 %	317133722
129	NC_014824	ATT	2	6	5467	5472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133722
130	NC_014824	CAG	2	6	5537	5542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133722
131	NC_014824	TCT	2	6	5551	5556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133722
132	NC_014824	TTTG	2	8	5598	5605	0 %	75 %	25 %	0 %	317133722
133	NC_014824	GAA	2	6	5611	5616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133722
134	NC_014824	ATT	2	6	5690	5695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133722
135	NC_014824	AAT	2	6	5743	5748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133722
136	NC_014824	TTAT	2	8	5762	5769	25 %	75 %	0 %	0 %	317133722
137	NC_014824	ATT	2	6	5855	5860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133722
138	NC_014824	GCA	2	6	6204	6209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133723
139	NC_014824	TCCT	2	8	6223	6230	0 %	50 %	0 %	50 %	317133723
140	NC_014824	AGA	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133723
141	NC_014824	AGGAA	2	10	6288	6297	60 %	0 %	40 %	0 %	317133723
142	NC_014824	AAG	2	6	6330	6335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133723
143	NC_014824	AAT	2	6	6336	6341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133723
144	NC_014824	T	6	6	6360	6365	0 %	100 %	0 %	0 %	317133723
145	NC_014824	TAT	2	6	6473	6478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133723
146	NC_014824	A	6	6	6491	6496	100 %	0 %	0 %	0 %	317133723
147	NC_014824	A	6	6	6516	6521	100 %	0 %	0 %	0 %	317133723
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152	NC_014824	ATT	3	9	6889	6897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133724
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154	NC_014824	CTG	2	6	6981	6986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133724
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158	NC_014824	AGA	2	6	7090	7095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
159	NC_014824	CTA	2	6	7224	7229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133724
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161	NC_014824	AGA	2	6	7353	7358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
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163	NC_014824	CTA	2	6	7407	7412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133724
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168	NC_014824	GAAG	2	8	7540	7547	50 %	0 %	50 %	0 %	317133724
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172	NC_014824	A	6	6	7655	7660	100 %	0 %	0 %	0 %	317133724
173	NC_014824	CTT	2	6	7757	7762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133724
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182	NC_014824	TGT	2	6	8152	8157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133724
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250	NC_014824	GAATTC	2	12	11655	11666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	317133726
251	NC_014824	TGA	2	6	11715	11720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133726
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253	NC_014824	CAA	2	6	11834	11839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133726
254	NC_014824	GTAT	2	8	11897	11904	25 %	50 %	25 %	0 %	317133726
255	NC_014824	A	6	6	11930	11935	100 %	0 %	0 %	0 %	317133726
256	NC_014824	TCT	2	6	11962	11967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133726
257	NC_014824	GA	4	8	11971	11978	50 %	0 %	50 %	0 %	317133726
258	NC_014824	ATA	2	6	12037	12042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133726
259	NC_014824	AGC	2	6	12210	12215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133726
260	NC_014824	TATT	2	8	12242	12249	25 %	75 %	0 %	0 %	317133726
261	NC_014824	AGA	2	6	12278	12283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133726
262	NC_014824	CTG	2	6	12383	12388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133726
263	NC_014824	TCT	2	6	12452	12457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133727
264	NC_014824	ATG	2	6	12481	12486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133727
265	NC_014824	AGA	2	6	12496	12501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133727
266	NC_014824	A	7	7	12501	12507	100 %	0 %	0 %	0 %	317133727
267	NC_014824	A	8	8	12509	12516	100 %	0 %	0 %	0 %	317133727
268	NC_014824	A	8	8	12524	12531	100 %	0 %	0 %	0 %	317133727
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397	NC_014824	GAT	2	6	19356	19361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133731
398	NC_014824	TAA	2	6	19420	19425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133731
399	NC_014824	AGGA	2	8	19456	19463	50 %	0 %	50 %	0 %	317133731
400	NC_014824	AGG	2	6	19507	19512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133731
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457	NC_014824	TAA	3	9	22321	22329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133733
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461	NC_014824	A	6	6	22488	22493	100 %	0 %	0 %	0 %	317133734
462	NC_014824	TAAT	2	8	22494	22501	50 %	50 %	0 %	0 %	317133734
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497	NC_014824	A	6	6	23911	23916	100 %	0 %	0 %	0 %	317133735
498	NC_014824	AGAAA	2	10	23943	23952	80 %	0 %	20 %	0 %	317133735
499	NC_014824	A	6	6	23950	23955	100 %	0 %	0 %	0 %	317133735
500	NC_014824	TTTGAT	2	12	24000	24011	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	317133735

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