MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 83208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014664	CGCC	2	8	650704	650711	0 %	0 %	25 %	75 %	312113352
14002	NC_014664	CCG	2	6	650749	650754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113352
14003	NC_014664	GCG	2	6	650774	650779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113353
14004	NC_014664	TTC	2	6	650825	650830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113353
14005	NC_014664	CGC	2	6	650835	650840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113353
14006	NC_014664	GAGCTT	2	12	650881	650892	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312113353
14007	NC_014664	CAC	2	6	650926	650931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113353
14008	NC_014664	CGCC	2	8	650937	650944	0 %	0 %	25 %	75 %	312113353
14009	NC_014664	CAC	2	6	650986	650991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113353
14010	NC_014664	CTG	2	6	651058	651063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113353
14011	NC_014664	GCA	2	6	651068	651073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113353
14012	NC_014664	GTC	2	6	651191	651196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113353
14013	NC_014664	GATC	2	8	651198	651205	25 %	25 %	25 %	25 %	312113353
14014	NC_014664	CGCC	3	12	651245	651256	0 %	0 %	25 %	75 %	312113353
14015	NC_014664	TGA	2	6	651357	651362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113353
14016	NC_014664	CGA	2	6	651363	651368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113353
14017	NC_014664	GC	3	6	651441	651446	0 %	0 %	50 %	50 %	312113353
14018	NC_014664	TGG	2	6	651450	651455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113353
14019	NC_014664	CG	5	10	651469	651478	0 %	0 %	50 %	50 %	312113353
14020	NC_014664	GGC	2	6	651487	651492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113353
14021	NC_014664	CGA	2	6	651559	651564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113353
14022	NC_014664	CGA	2	6	651576	651581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113353
14023	NC_014664	AGC	2	6	651620	651625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113353
14024	NC_014664	CTT	2	6	651640	651645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113353
14025	NC_014664	GGC	2	6	651664	651669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113353
14026	NC_014664	GCCT	2	8	651706	651713	0 %	25 %	25 %	50 %	312113353
14027	NC_014664	GC	3	6	651765	651770	0 %	0 %	50 %	50 %	312113353
14028	NC_014664	GC	3	6	651838	651843	0 %	0 %	50 %	50 %	312113353
14029	NC_014664	CCG	2	6	651855	651860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113353
14030	NC_014664	CGC	2	6	651873	651878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113353
14031	NC_014664	GCC	2	6	651886	651891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113353
14032	NC_014664	GCC	3	9	651898	651906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113353
14033	NC_014664	CGC	2	6	651921	651926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113353
14034	NC_014664	GGTC	2	8	653788	653795	0 %	25 %	50 %	25 %	312113354
14035	NC_014664	GGC	2	6	653866	653871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113354
14036	NC_014664	GAA	2	6	653888	653893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113354
14037	NC_014664	GCCGAG	2	12	653894	653905	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312113354
14038	NC_014664	CGG	2	6	654166	654171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113354
14039	NC_014664	CTG	2	6	654182	654187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113354
14040	NC_014664	CCG	2	6	654195	654200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113354
14041	NC_014664	GC	4	8	654290	654297	0 %	0 %	50 %	50 %	312113354
14042	NC_014664	CAT	2	6	654344	654349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113354
14043	NC_014664	T	6	6	654618	654623	0 %	100 %	0 %	0 %	312113355
14044	NC_014664	CTGG	2	8	654641	654648	0 %	25 %	50 %	25 %	312113355
14045	NC_014664	CTG	3	9	654660	654668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113355
14046	NC_014664	TTC	2	6	654701	654706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113355
14047	NC_014664	CGAC	2	8	654721	654728	25 %	0 %	25 %	50 %	312113355
14048	NC_014664	CG	5	10	654770	654779	0 %	0 %	50 %	50 %	312113355
14049	NC_014664	GCG	2	6	654811	654816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113355
14050	NC_014664	GGC	2	6	654821	654826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113355
14051	NC_014664	TC	3	6	654912	654917	0 %	50 %	0 %	50 %	312113355
14052	NC_014664	CGG	2	6	654919	654924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113355
14053	NC_014664	CGT	2	6	654938	654943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113355
14054	NC_014664	CG	3	6	654963	654968	0 %	0 %	50 %	50 %	312113355
14055	NC_014664	GCCCG	2	10	655010	655019	0 %	0 %	40 %	60 %	312113355
14056	NC_014664	ATA	2	6	655183	655188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312113356
14057	NC_014664	GC	3	6	655195	655200	0 %	0 %	50 %	50 %	312113356
14058	NC_014664	CAA	2	6	655235	655240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312113356
14059	NC_014664	ATT	2	6	655245	655250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312113356
14060	NC_014664	GGC	2	6	655287	655292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113356
14061	NC_014664	CTA	2	6	655344	655349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113356
14062	NC_014664	CG	3	6	655428	655433	0 %	0 %	50 %	50 %	312113356
14063	NC_014664	GCAG	2	8	655434	655441	25 %	0 %	50 %	25 %	312113356
14064	NC_014664	CGA	2	6	655449	655454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113356
14065	NC_014664	CG	3	6	655459	655464	0 %	0 %	50 %	50 %	312113356
14066	NC_014664	GAGC	2	8	655468	655475	25 %	0 %	50 %	25 %	312113356
14067	NC_014664	CGG	2	6	655488	655493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113356
14068	NC_014664	CGGCG	2	10	655546	655555	0 %	0 %	60 %	40 %	312113356
14069	NC_014664	CCG	2	6	655562	655567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113356
14070	NC_014664	GCCT	2	8	655573	655580	0 %	25 %	25 %	50 %	312113356
14071	NC_014664	GCG	2	6	655633	655638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113356
14072	NC_014664	CTT	2	6	655775	655780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113357
14073	NC_014664	GCG	2	6	655810	655815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113357
14074	NC_014664	CGG	2	6	655837	655842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113357
14075	NC_014664	GGC	2	6	655844	655849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113357
14076	NC_014664	ACAT	2	8	655887	655894	50 %	25 %	0 %	25 %	312113357
14077	NC_014664	CG	3	6	655936	655941	0 %	0 %	50 %	50 %	312113357
14078	NC_014664	CAG	2	6	655979	655984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113357
14079	NC_014664	GTC	2	6	655985	655990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113357
14080	NC_014664	GTC	2	6	656013	656018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113357
14081	NC_014664	CTC	3	9	656117	656125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113357
14082	NC_014664	CGCCGT	2	12	656134	656145	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312113357
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14084	NC_014664	CA	3	6	656262	656267	50 %	0 %	0 %	50 %	312113357
14085	NC_014664	GC	3	6	656275	656280	0 %	0 %	50 %	50 %	312113357
14086	NC_014664	GGC	2	6	656297	656302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113357
14087	NC_014664	CGT	2	6	656428	656433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113357
14088	NC_014664	GC	3	6	656635	656640	0 %	0 %	50 %	50 %	312113358
14089	NC_014664	GCACGG	2	12	656645	656656	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312113358
14090	NC_014664	TCGA	2	8	656691	656698	25 %	25 %	25 %	25 %	312113358
14091	NC_014664	CGA	2	6	656746	656751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113358
14092	NC_014664	CGG	2	6	656824	656829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113358
14093	NC_014664	GAGCAT	2	12	656871	656882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312113358
14094	NC_014664	GAAGGC	2	12	656883	656894	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312113358
14095	NC_014664	CGC	2	6	656912	656917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113358
14096	NC_014664	CAT	2	6	656952	656957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113358
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14098	NC_014664	TCA	2	6	657073	657078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113358
14099	NC_014664	GTGAT	2	10	657141	657150	20 %	40 %	40 %	0 %	312113358
14100	NC_014664	GCCGC	2	10	657181	657190	0 %	0 %	40 %	60 %	312113359
14101	NC_014664	CG	3	6	657409	657414	0 %	0 %	50 %	50 %	312113359
14102	NC_014664	ATC	2	6	657461	657466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113359
14103	NC_014664	CCT	2	6	657481	657486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113359
14104	NC_014664	TGC	2	6	657516	657521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113359
14105	NC_014664	GC	3	6	657560	657565	0 %	0 %	50 %	50 %	312113359
14106	NC_014664	CG	3	6	657586	657591	0 %	0 %	50 %	50 %	312113359
14107	NC_014664	CTC	2	6	657593	657598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113359
14108	NC_014664	GCG	2	6	657641	657646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113359
14109	NC_014664	CAG	3	9	657662	657670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113359
14110	NC_014664	GCG	2	6	657677	657682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113359
14111	NC_014664	CG	3	6	657686	657691	0 %	0 %	50 %	50 %	312113359
14112	NC_014664	CGA	2	6	657721	657726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113359
14113	NC_014664	TCG	2	6	657734	657739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113359
14114	NC_014664	CAG	2	6	657755	657760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113359
14115	NC_014664	GCG	2	6	657794	657799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113359
14116	NC_014664	TCA	2	6	657810	657815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113359
14117	NC_014664	ACG	2	6	657825	657830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113359
14118	NC_014664	CG	3	6	657888	657893	0 %	0 %	50 %	50 %	312113359
14119	NC_014664	TGA	2	6	657902	657907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113359
14120	NC_014664	GC	4	8	658025	658032	0 %	0 %	50 %	50 %	312113360
14121	NC_014664	TCG	2	6	658070	658075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113360
14122	NC_014664	GC	4	8	658076	658083	0 %	0 %	50 %	50 %	312113360
14123	NC_014664	CTG	2	6	658099	658104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113360
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14226	NC_014664	CCG	2	6	661748	661753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113363
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14228	NC_014664	AAG	2	6	662008	662013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113364
14229	NC_014664	TAA	2	6	662051	662056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312113364
14230	NC_014664	GCT	2	6	662112	662117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113364
14231	NC_014664	TGG	2	6	662124	662129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113364
14232	NC_014664	GAG	2	6	662185	662190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113364
14233	NC_014664	AGA	2	6	662195	662200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113364
14234	NC_014664	AGC	2	6	662201	662206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113364
14235	NC_014664	GA	3	6	662219	662224	50 %	0 %	50 %	0 %	312113364
14236	NC_014664	CG	3	6	662249	662254	0 %	0 %	50 %	50 %	312113364
14237	NC_014664	CAT	2	6	662260	662265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113364
14238	NC_014664	GTC	2	6	662266	662271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113364
14239	NC_014664	CGG	2	6	662278	662283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113364
14240	NC_014664	CGG	2	6	662289	662294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113364
14241	NC_014664	CCT	2	6	662295	662300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113364
14242	NC_014664	CAT	2	6	662777	662782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113365
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14245	NC_014664	GCTG	2	8	662861	662868	0 %	25 %	50 %	25 %	312113365
14246	NC_014664	GCT	2	6	662873	662878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113365
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14344	NC_014664	GCCGGT	2	12	668017	668028	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312113371
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14349	NC_014664	GCC	2	6	668223	668228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113371
14350	NC_014664	GCCC	2	8	668253	668260	0 %	0 %	25 %	75 %	312113371
14351	NC_014664	TTG	2	6	668318	668323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312113371
14352	NC_014664	CGA	2	6	668329	668334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113371
14353	NC_014664	GAAG	2	8	668335	668342	50 %	0 %	50 %	0 %	312113371
14354	NC_014664	GGC	2	6	668362	668367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113371
14355	NC_014664	GCG	2	6	668394	668399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113371
14356	NC_014664	GAC	2	6	668431	668436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113371
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14358	NC_014664	AGA	2	6	668514	668519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113371
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14478	NC_014664	TTG	2	6	673904	673909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312113376
14479	NC_014664	CCCG	2	8	673964	673971	0 %	0 %	25 %	75 %	312113376
14480	NC_014664	CGT	2	6	673987	673992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113376
14481	NC_014664	CCT	2	6	674048	674053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113376
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14492	NC_014664	TCG	2	6	674635	674640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113378
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