MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 83208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_014664	CGT	2	6	608505	608510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113318
13003	NC_014664	CG	3	6	608541	608546	0 %	0 %	50 %	50 %	312113318
13004	NC_014664	CGC	2	6	608636	608641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113318
13005	NC_014664	GTC	2	6	608665	608670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113318
13006	NC_014664	CGC	3	9	608671	608679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113318
13007	NC_014664	CCG	2	6	608742	608747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113318
13008	NC_014664	CG	4	8	608760	608767	0 %	0 %	50 %	50 %	312113318
13009	NC_014664	GCC	2	6	608875	608880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113318
13010	NC_014664	CG	3	6	608881	608886	0 %	0 %	50 %	50 %	312113318
13011	NC_014664	CGC	2	6	608889	608894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113318
13012	NC_014664	CGC	2	6	608942	608947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113318
13013	NC_014664	CGA	2	6	608982	608987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113318
13014	NC_014664	TCG	2	6	608995	609000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113318
13015	NC_014664	ATG	2	6	609039	609044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113318
13016	NC_014664	CGG	3	9	609047	609055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113319
13017	NC_014664	GAA	2	6	609063	609068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113319
13018	NC_014664	CGCT	2	8	609069	609076	0 %	25 %	25 %	50 %	312113319
13019	NC_014664	GAA	2	6	609081	609086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113319
13020	NC_014664	GGC	2	6	609095	609100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113319
13021	NC_014664	TGGA	2	8	609177	609184	25 %	25 %	50 %	0 %	312113319
13022	NC_014664	CGG	2	6	609241	609246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113319
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13024	NC_014664	CGG	2	6	609260	609265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113319
13025	NC_014664	CG	3	6	609287	609292	0 %	0 %	50 %	50 %	312113319
13026	NC_014664	GGC	2	6	609437	609442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113319
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13028	NC_014664	CGA	2	6	609482	609487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113319
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13033	NC_014664	GGC	2	6	609614	609619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113319
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13052	NC_014664	CCG	2	6	610336	610341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113319
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13057	NC_014664	GCG	3	9	610513	610521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113319
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13071	NC_014664	CG	5	10	611314	611323	0 %	0 %	50 %	50 %	312113320
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13086	NC_014664	CTG	2	6	612238	612243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113322
13087	NC_014664	GC	4	8	612259	612266	0 %	0 %	50 %	50 %	312113322
13088	NC_014664	CGGTC	2	10	612290	612299	0 %	20 %	40 %	40 %	312113322
13089	NC_014664	GCA	2	6	612311	612316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113322
13090	NC_014664	CTC	2	6	612322	612327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113322
13091	NC_014664	CCGC	2	8	612359	612366	0 %	0 %	25 %	75 %	312113322
13092	NC_014664	TAC	2	6	612388	612393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113322
13093	NC_014664	GC	4	8	612396	612403	0 %	0 %	50 %	50 %	312113322
13094	NC_014664	TCA	2	6	612503	612508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113322
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13098	NC_014664	CCGAG	2	10	612704	612713	20 %	0 %	40 %	40 %	312113322
13099	NC_014664	GGC	2	6	612717	612722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113322
13100	NC_014664	GC	3	6	612750	612755	0 %	0 %	50 %	50 %	312113322
13101	NC_014664	TCG	2	6	612758	612763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113322
13102	NC_014664	AGA	2	6	612776	612781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113322
13103	NC_014664	GGC	3	9	612783	612791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113322
13104	NC_014664	GAA	2	6	612819	612824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113322
13105	NC_014664	CGA	2	6	612827	612832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113322
13106	NC_014664	AGC	2	6	612884	612889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113322
13107	NC_014664	GCG	2	6	612914	612919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113322
13108	NC_014664	CGC	2	6	612929	612934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113322
13109	NC_014664	ATCT	2	8	613075	613082	25 %	50 %	0 %	25 %	312113322
13110	NC_014664	GACG	2	8	613263	613270	25 %	0 %	50 %	25 %	312113322
13111	NC_014664	CTG	2	6	613282	613287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113322
13112	NC_014664	GAAG	2	8	613311	613318	50 %	0 %	50 %	0 %	312113322
13113	NC_014664	TTC	2	6	613325	613330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113322
13114	NC_014664	CGCT	2	8	613334	613341	0 %	25 %	25 %	50 %	312113322
13115	NC_014664	ACG	2	6	613367	613372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113322
13116	NC_014664	CG	3	6	613391	613396	0 %	0 %	50 %	50 %	312113322
13117	NC_014664	CGA	2	6	613410	613415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113322
13118	NC_014664	CTCGAT	2	12	613513	613524	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312113322
13119	NC_014664	AAG	2	6	613609	613614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113322
13120	NC_014664	ACG	2	6	613634	613639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113322
13121	NC_014664	CAT	2	6	613644	613649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113322
13122	NC_014664	CTA	2	6	613668	613673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113322
13123	NC_014664	ATC	2	6	613754	613759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113322
13124	NC_014664	GGC	2	6	613775	613780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113322
13125	NC_014664	CGAAG	2	10	613794	613803	40 %	0 %	40 %	20 %	312113322
13126	NC_014664	TCAAGA	2	12	613853	613864	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312113322
13127	NC_014664	CGA	2	6	613887	613892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113322
13128	NC_014664	ACTC	2	8	614214	614221	25 %	25 %	0 %	50 %	312113323
13129	NC_014664	CAT	2	6	614234	614239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113323
13130	NC_014664	GC	3	6	614285	614290	0 %	0 %	50 %	50 %	312113323
13131	NC_014664	ACG	2	6	614377	614382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113323
13132	NC_014664	CGA	2	6	614387	614392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113323
13133	NC_014664	CGA	2	6	614414	614419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113323
13134	NC_014664	CGC	2	6	614446	614451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113323
13135	NC_014664	GC	3	6	614486	614491	0 %	0 %	50 %	50 %	312113323
13136	NC_014664	CGG	2	6	614557	614562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113323
13137	NC_014664	CGG	3	9	614567	614575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113323
13138	NC_014664	TCG	2	6	614577	614582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113323
13139	NC_014664	CG	3	6	614601	614606	0 %	0 %	50 %	50 %	312113323
13140	NC_014664	CG	3	6	614700	614705	0 %	0 %	50 %	50 %	312113323
13141	NC_014664	CGC	2	6	614755	614760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113323
13142	NC_014664	CG	3	6	614966	614971	0 %	0 %	50 %	50 %	312113323
13143	NC_014664	CG	3	6	614988	614993	0 %	0 %	50 %	50 %	312113323
13144	NC_014664	TG	3	6	615003	615008	0 %	50 %	50 %	0 %	312113323
13145	NC_014664	GT	3	6	615046	615051	0 %	50 %	50 %	0 %	312113323
13146	NC_014664	CGG	2	6	615058	615063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113323
13147	NC_014664	GGC	3	9	615074	615082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113323
13148	NC_014664	GGC	3	9	615092	615100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113323
13149	NC_014664	TGG	2	6	615111	615116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113323
13150	NC_014664	TTCGC	2	10	615249	615258	0 %	40 %	20 %	40 %	312113324
13151	NC_014664	GTC	2	6	615269	615274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113324
13152	NC_014664	CATGC	2	10	615308	615317	20 %	20 %	20 %	40 %	312113324
13153	NC_014664	GC	3	6	615418	615423	0 %	0 %	50 %	50 %	312113324
13154	NC_014664	GCG	2	6	615482	615487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113324
13155	NC_014664	CG	3	6	615512	615517	0 %	0 %	50 %	50 %	312113324
13156	NC_014664	GC	3	6	615534	615539	0 %	0 %	50 %	50 %	312113324
13157	NC_014664	GGA	2	6	615544	615549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113324
13158	NC_014664	TGGATC	2	12	615551	615562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312113324
13159	NC_014664	GGC	2	6	615563	615568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113324
13160	NC_014664	GAG	2	6	615659	615664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113324
13161	NC_014664	GCGCG	2	10	615676	615685	0 %	0 %	60 %	40 %	312113324
13162	NC_014664	GCG	2	6	615729	615734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113324
13163	NC_014664	CGA	2	6	615769	615774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113324
13164	NC_014664	TGA	2	6	615777	615782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113324
13165	NC_014664	GC	4	8	615838	615845	0 %	0 %	50 %	50 %	312113324
13166	NC_014664	TGC	2	6	615873	615878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113324
13167	NC_014664	GCGTG	2	10	615897	615906	0 %	20 %	60 %	20 %	312113324
13168	NC_014664	CTTCG	2	10	616091	616100	0 %	40 %	20 %	40 %	312113325
13169	NC_014664	GGC	2	6	616120	616125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113325
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13173	NC_014664	CGTT	2	8	616319	616326	0 %	50 %	25 %	25 %	312113325
13174	NC_014664	CGA	2	6	616333	616338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113325
13175	NC_014664	AAC	2	6	616370	616375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312113325
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13183	NC_014664	GAG	2	6	616729	616734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113326
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13185	NC_014664	CGC	2	6	616757	616762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113326
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13188	NC_014664	CG	3	6	616806	616811	0 %	0 %	50 %	50 %	312113326
13189	NC_014664	GCC	2	6	616827	616832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113326
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13191	NC_014664	ACG	2	6	616982	616987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113326
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13196	NC_014664	GCG	2	6	617317	617322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113326
13197	NC_014664	GCG	2	6	617329	617334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113326
13198	NC_014664	GCT	2	6	617502	617507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113326
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13202	NC_014664	GCA	2	6	618029	618034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113327
13203	NC_014664	TCC	2	6	618058	618063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113327
13204	NC_014664	GTC	2	6	618085	618090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113327
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13209	NC_014664	TCG	2	6	618392	618397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113327
13210	NC_014664	CGG	2	6	618431	618436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113327
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13212	NC_014664	CG	3	6	618558	618563	0 %	0 %	50 %	50 %	312113327
13213	NC_014664	GA	3	6	618589	618594	50 %	0 %	50 %	0 %	312113327
13214	NC_014664	GCG	2	6	618640	618645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113327
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13218	NC_014664	GCCGC	2	10	618722	618731	0 %	0 %	40 %	60 %	312113327
13219	NC_014664	GAC	2	6	618756	618761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113327
13220	NC_014664	ATA	2	6	618810	618815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312113327
13221	NC_014664	CGC	2	6	618908	618913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113327
13222	NC_014664	GGC	2	6	618920	618925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113327
13223	NC_014664	GCA	3	9	618929	618937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113327
13224	NC_014664	GAA	2	6	618957	618962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113327
13225	NC_014664	TCG	2	6	618968	618973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113327
13226	NC_014664	CCG	2	6	618974	618979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113327
13227	NC_014664	CG	3	6	619007	619012	0 %	0 %	50 %	50 %	312113327
13228	NC_014664	ACC	2	6	619045	619050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113327
13229	NC_014664	GC	3	6	619059	619064	0 %	0 %	50 %	50 %	312113327
13230	NC_014664	GAT	2	6	619077	619082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113327
13231	NC_014664	GCC	2	6	619095	619100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113327
13232	NC_014664	GTC	2	6	619104	619109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113327
13233	NC_014664	GC	3	6	619148	619153	0 %	0 %	50 %	50 %	312113327
13234	NC_014664	GCGCC	2	10	619197	619206	0 %	0 %	40 %	60 %	312113327
13235	NC_014664	TCC	2	6	619231	619236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113327
13236	NC_014664	GAG	2	6	619245	619250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113327
13237	NC_014664	CG	3	6	619288	619293	0 %	0 %	50 %	50 %	312113327
13238	NC_014664	CGC	2	6	619307	619312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113327
13239	NC_014664	TTG	2	6	619315	619320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312113327
13240	NC_014664	CA	3	6	619328	619333	50 %	0 %	0 %	50 %	312113327
13241	NC_014664	GCG	2	6	619362	619367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113327
13242	NC_014664	CAC	2	6	619368	619373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113327
13243	NC_014664	CTC	2	6	619374	619379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113327
13244	NC_014664	CG	3	6	619386	619391	0 %	0 %	50 %	50 %	312113327
13245	NC_014664	CAT	2	6	619404	619409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113327
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13247	NC_014664	TTC	2	6	619461	619466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113327
13248	NC_014664	CAAG	2	8	619481	619488	50 %	0 %	25 %	25 %	312113327
13249	NC_014664	GCG	2	6	619539	619544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113328
13250	NC_014664	GAAA	2	8	619570	619577	75 %	0 %	25 %	0 %	312113328
13251	NC_014664	GCT	2	6	619595	619600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113328
13252	NC_014664	CG	4	8	619652	619659	0 %	0 %	50 %	50 %	312113328
13253	NC_014664	CG	3	6	619692	619697	0 %	0 %	50 %	50 %	312113328
13254	NC_014664	CG	3	6	619707	619712	0 %	0 %	50 %	50 %	312113328
13255	NC_014664	A	7	7	619888	619894	100 %	0 %	0 %	0 %	312113329
13256	NC_014664	TGT	2	6	620037	620042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312113329
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13260	NC_014664	TCG	2	6	620381	620386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113330
13261	NC_014664	CG	3	6	620405	620410	0 %	0 %	50 %	50 %	312113330
13262	NC_014664	GCA	2	6	620418	620423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113330
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13264	NC_014664	CAT	2	6	620472	620477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113330
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13268	NC_014664	TCGC	2	8	620654	620661	0 %	25 %	25 %	50 %	312113330
13269	NC_014664	TTC	2	6	620728	620733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113330
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13271	NC_014664	CGTT	2	8	620745	620752	0 %	50 %	25 %	25 %	312113330
13272	NC_014664	GGC	2	6	620863	620868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113330
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13277	NC_014664	CCTG	2	8	621209	621216	0 %	25 %	25 %	50 %	312113330
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13283	NC_014664	CTCG	2	8	621588	621595	0 %	25 %	25 %	50 %	312113330
13284	NC_014664	AAGG	2	8	621616	621623	50 %	0 %	50 %	0 %	312113330
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13323	NC_014664	GCG	2	6	623400	623405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113332
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13340	NC_014664	CGG	2	6	624253	624258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113333
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13344	NC_014664	CGAAG	2	10	624351	624360	40 %	0 %	40 %	20 %	312113333
13345	NC_014664	GCG	2	6	624383	624388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113333
13346	NC_014664	CCTTCC	2	12	624395	624406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113333
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13350	NC_014664	ATGA	2	8	624612	624619	50 %	25 %	25 %	0 %	312113334
13351	NC_014664	TCCGC	2	10	624632	624641	0 %	20 %	20 %	60 %	312113334
13352	NC_014664	CG	3	6	624751	624756	0 %	0 %	50 %	50 %	312113334
13353	NC_014664	GGTC	2	8	624951	624958	0 %	25 %	50 %	25 %	312113334
13354	NC_014664	TGC	2	6	625003	625008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113334
13355	NC_014664	GCA	2	6	625089	625094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113334
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13357	NC_014664	GC	4	8	625102	625109	0 %	0 %	50 %	50 %	312113334
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13359	NC_014664	CGG	2	6	625131	625136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113334
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13479	NC_014664	CGGTCG	2	12	629798	629809	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312113339
13480	NC_014664	CCG	2	6	630054	630059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113340
13481	NC_014664	GTCCGA	2	12	630085	630096	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312113340
13482	NC_014664	GCG	2	6	630122	630127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113340
13483	NC_014664	CG	4	8	630142	630149	0 %	0 %	50 %	50 %	312113340
13484	NC_014664	CGAAG	2	10	630163	630172	40 %	0 %	40 %	20 %	312113340
13485	NC_014664	GCTC	2	8	630178	630185	0 %	25 %	25 %	50 %	312113340
13486	NC_014664	CGTG	2	8	630187	630194	0 %	25 %	50 %	25 %	312113340
13487	NC_014664	GC	3	6	630250	630255	0 %	0 %	50 %	50 %	312113340
13488	NC_014664	TCGC	2	8	630272	630279	0 %	25 %	25 %	50 %	312113340
13489	NC_014664	GCA	2	6	630286	630291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113340
13490	NC_014664	GAT	2	6	630367	630372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113340
13491	NC_014664	GCC	2	6	630500	630505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113340
13492	NC_014664	CGC	2	6	630510	630515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113340
13493	NC_014664	GCC	2	6	630525	630530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113340
13494	NC_014664	CCG	2	6	630534	630539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113340
13495	NC_014664	CG	3	6	630662	630667	0 %	0 %	50 %	50 %	312113341
13496	NC_014664	AAGA	2	8	630676	630683	75 %	0 %	25 %	0 %	312113341
13497	NC_014664	CG	3	6	630831	630836	0 %	0 %	50 %	50 %	312113341
13498	NC_014664	CGA	2	6	630861	630866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113341
13499	NC_014664	GGC	3	9	630927	630935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113341
13500	NC_014664	TCG	2	6	630965	630970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113341

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