MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 83208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014664	CGAGGC	2	12	514252	514263	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312113228
11002	NC_014664	CGA	2	6	514282	514287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113228
11003	NC_014664	CAC	2	6	514295	514300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113228
11004	NC_014664	GAT	2	6	514313	514318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113228
11005	NC_014664	CGT	2	6	514480	514485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113228
11006	NC_014664	GCG	4	12	514556	514567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113228
11007	NC_014664	GAC	2	6	514862	514867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113229
11008	NC_014664	CGA	2	6	514871	514876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113229
11009	NC_014664	CGA	2	6	514910	514915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113229
11010	NC_014664	CGG	2	6	514941	514946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113229
11011	NC_014664	GCG	2	6	514968	514973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113229
11012	NC_014664	TCG	2	6	515123	515128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113229
11013	NC_014664	CTC	2	6	515133	515138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113229
11014	NC_014664	AGGC	2	8	515170	515177	25 %	0 %	50 %	25 %	312113229
11015	NC_014664	CGA	3	9	515278	515286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113230
11016	NC_014664	CGT	2	6	515287	515292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113230
11017	NC_014664	TCT	2	6	515328	515333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113230
11018	NC_014664	GAA	2	6	515530	515535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113230
11019	NC_014664	CGT	2	6	515559	515564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113230
11020	NC_014664	GCC	2	6	515578	515583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113230
11021	NC_014664	TGAA	2	8	515651	515658	50 %	25 %	25 %	0 %	312113230
11022	NC_014664	GCG	2	6	515711	515716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113230
11023	NC_014664	TCG	2	6	515723	515728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113230
11024	NC_014664	CGC	3	9	515796	515804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113230
11025	NC_014664	CGA	2	6	515805	515810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113230
11026	NC_014664	GGCG	2	8	515897	515904	0 %	0 %	75 %	25 %	312113230
11027	NC_014664	CCG	2	6	515921	515926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113230
11028	NC_014664	CGC	2	6	515929	515934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113230
11029	NC_014664	ACC	2	6	515942	515947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113230
11030	NC_014664	CG	3	6	515950	515955	0 %	0 %	50 %	50 %	312113230
11031	NC_014664	GCC	2	6	515989	515994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113230
11032	NC_014664	AGC	2	6	516065	516070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113230
11033	NC_014664	TCG	2	6	516096	516101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113230
11034	NC_014664	GCC	2	6	516154	516159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113230
11035	NC_014664	CGA	2	6	516198	516203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113230
11036	NC_014664	CCGGC	2	10	516234	516243	0 %	0 %	40 %	60 %	312113230
11037	NC_014664	GAT	2	6	516247	516252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113230
11038	NC_014664	CCG	2	6	516273	516278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113230
11039	NC_014664	CCCGA	2	10	516293	516302	20 %	0 %	20 %	60 %	312113230
11040	NC_014664	GGC	2	6	516406	516411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113231
11041	NC_014664	GC	3	6	516466	516471	0 %	0 %	50 %	50 %	312113231
11042	NC_014664	T	6	6	516475	516480	0 %	100 %	0 %	0 %	312113231
11043	NC_014664	GTC	2	6	516491	516496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113231
11044	NC_014664	CGC	3	9	516529	516537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113231
11045	NC_014664	CCGTT	2	10	516619	516628	0 %	40 %	20 %	40 %	312113231
11046	NC_014664	TGA	2	6	517101	517106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113232
11047	NC_014664	TC	3	6	517122	517127	0 %	50 %	0 %	50 %	312113232
11048	NC_014664	GAAA	2	8	517162	517169	75 %	0 %	25 %	0 %	312113232
11049	NC_014664	CGG	2	6	517177	517182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113232
11050	NC_014664	CCGC	2	8	517229	517236	0 %	0 %	25 %	75 %	312113232
11051	NC_014664	CAG	2	6	517250	517255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11052	NC_014664	CG	3	6	517263	517268	0 %	0 %	50 %	50 %	312113232
11053	NC_014664	GCCGC	2	10	517276	517285	0 %	0 %	40 %	60 %	312113232
11054	NC_014664	CCCG	2	8	517334	517341	0 %	0 %	25 %	75 %	312113232
11055	NC_014664	GCG	2	6	517347	517352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113232
11056	NC_014664	GCT	2	6	517364	517369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11057	NC_014664	GGC	2	6	517400	517405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113232
11058	NC_014664	TCG	2	6	517458	517463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11059	NC_014664	TCGTG	2	10	517494	517503	0 %	40 %	40 %	20 %	312113232
11060	NC_014664	AGA	2	6	517515	517520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113232
11061	NC_014664	CGG	2	6	517542	517547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113232
11062	NC_014664	GTC	2	6	517660	517665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11063	NC_014664	CGT	2	6	517748	517753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11064	NC_014664	ACG	2	6	517770	517775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11065	NC_014664	CG	3	6	517784	517789	0 %	0 %	50 %	50 %	312113232
11066	NC_014664	TCA	2	6	517884	517889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113232
11067	NC_014664	GCGA	2	8	517898	517905	25 %	0 %	50 %	25 %	312113232
11068	NC_014664	AAC	2	6	517922	517927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312113232
11069	NC_014664	AGCG	2	8	517928	517935	25 %	0 %	50 %	25 %	312113232
11070	NC_014664	CCG	2	6	517986	517991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113232
11071	NC_014664	AGA	2	6	518064	518069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113232
11072	NC_014664	CCG	2	6	518073	518078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113232
11073	NC_014664	CGA	2	6	518104	518109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11074	NC_014664	GC	3	6	518160	518165	0 %	0 %	50 %	50 %	312113232
11075	NC_014664	CG	3	6	518205	518210	0 %	0 %	50 %	50 %	312113232
11076	NC_014664	CGG	2	6	518235	518240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113232
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11078	NC_014664	CTC	2	6	518321	518326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113232
11079	NC_014664	CAT	2	6	518362	518367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113232
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11081	NC_014664	ACGCT	2	10	518433	518442	20 %	20 %	20 %	40 %	312113232
11082	NC_014664	GAGC	2	8	518476	518483	25 %	0 %	50 %	25 %	312113232
11083	NC_014664	TCGA	2	8	518492	518499	25 %	25 %	25 %	25 %	312113232
11084	NC_014664	ACG	2	6	518501	518506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11085	NC_014664	CGC	2	6	518546	518551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113232
11086	NC_014664	GC	3	6	518581	518586	0 %	0 %	50 %	50 %	312113232
11087	NC_014664	AGC	2	6	518589	518594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11088	NC_014664	GTCG	2	8	518635	518642	0 %	25 %	50 %	25 %	312113232
11089	NC_014664	CGA	2	6	518652	518657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11090	NC_014664	CG	3	6	518707	518712	0 %	0 %	50 %	50 %	312113232
11091	NC_014664	CGT	2	6	518718	518723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11092	NC_014664	GC	3	6	518731	518736	0 %	0 %	50 %	50 %	312113232
11093	NC_014664	GC	3	6	518764	518769	0 %	0 %	50 %	50 %	312113232
11094	NC_014664	GC	3	6	518825	518830	0 %	0 %	50 %	50 %	312113232
11095	NC_014664	CGG	2	6	518869	518874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113232
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11098	NC_014664	TCAG	2	8	519072	519079	25 %	25 %	25 %	25 %	312113232
11099	NC_014664	CG	4	8	519089	519096	0 %	0 %	50 %	50 %	312113232
11100	NC_014664	TCT	2	6	519269	519274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113232
11101	NC_014664	ACG	2	6	519287	519292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11102	NC_014664	CG	3	6	519291	519296	0 %	0 %	50 %	50 %	312113232
11103	NC_014664	GCAAA	2	10	519386	519395	60 %	0 %	20 %	20 %	312113232
11104	NC_014664	GCG	2	6	519409	519414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113232
11105	NC_014664	CAG	2	6	519518	519523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11106	NC_014664	CAA	2	6	519524	519529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312113232
11107	NC_014664	GCC	2	6	519532	519537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113232
11108	NC_014664	CAG	2	6	519539	519544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11109	NC_014664	CAA	2	6	519545	519550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312113232
11110	NC_014664	TTCG	2	8	519556	519563	0 %	50 %	25 %	25 %	312113232
11111	NC_014664	GCC	2	6	519595	519600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113232
11112	NC_014664	AGC	2	6	519624	519629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11113	NC_014664	GC	3	6	519635	519640	0 %	0 %	50 %	50 %	312113232
11114	NC_014664	TCCCGT	2	12	519655	519666	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	312113232
11115	NC_014664	GCG	2	6	519727	519732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113232
11116	NC_014664	GAC	2	6	519776	519781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11117	NC_014664	CTT	2	6	519787	519792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113232
11118	NC_014664	CAGG	2	8	519806	519813	25 %	0 %	50 %	25 %	312113232
11119	NC_014664	CGC	3	9	519841	519849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113232
11120	NC_014664	CGA	2	6	519907	519912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11121	NC_014664	GCG	2	6	519913	519918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113232
11122	NC_014664	AGC	2	6	519969	519974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11123	NC_014664	CGT	2	6	520003	520008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11124	NC_014664	GACA	2	8	520033	520040	50 %	0 %	25 %	25 %	312113232
11125	NC_014664	TCG	2	6	520056	520061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11126	NC_014664	CG	3	6	520116	520121	0 %	0 %	50 %	50 %	312113232
11127	NC_014664	GCTT	2	8	520141	520148	0 %	50 %	25 %	25 %	312113232
11128	NC_014664	GAA	2	6	520151	520156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113232
11129	NC_014664	GAC	2	6	520191	520196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113232
11130	NC_014664	CGG	2	6	520198	520203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113232
11131	NC_014664	CCA	2	6	520546	520551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113233
11132	NC_014664	GCTC	2	8	520604	520611	0 %	25 %	25 %	50 %	312113233
11133	NC_014664	CGA	2	6	520679	520684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113233
11134	NC_014664	CGC	2	6	520753	520758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113233
11135	NC_014664	CTC	2	6	520818	520823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113233
11136	NC_014664	AAT	2	6	520917	520922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312113233
11137	NC_014664	GGC	2	6	520923	520928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113233
11138	NC_014664	GTC	2	6	520929	520934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113233
11139	NC_014664	GCT	2	6	520952	520957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113233
11140	NC_014664	GGC	3	9	521120	521128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113233
11141	NC_014664	CGC	2	6	521144	521149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113233
11142	NC_014664	TGC	2	6	521179	521184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113233
11143	NC_014664	GGC	2	6	521193	521198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113233
11144	NC_014664	GC	3	6	521202	521207	0 %	0 %	50 %	50 %	312113233
11145	NC_014664	CGG	2	6	521240	521245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113233
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11148	NC_014664	GAA	2	6	521372	521377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113233
11149	NC_014664	GC	3	6	521391	521396	0 %	0 %	50 %	50 %	312113233
11150	NC_014664	GCC	2	6	521448	521453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113233
11151	NC_014664	GCC	2	6	521535	521540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113233
11152	NC_014664	TCG	2	6	521608	521613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113233
11153	NC_014664	ACGA	2	8	521658	521665	50 %	0 %	25 %	25 %	312113233
11154	NC_014664	GGC	2	6	521678	521683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113233
11155	NC_014664	ATG	2	6	521698	521703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113233
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11157	NC_014664	ATC	2	6	521727	521732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113233
11158	NC_014664	CGGCG	2	10	521756	521765	0 %	0 %	60 %	40 %	312113233
11159	NC_014664	CGC	2	6	521853	521858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113233
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11161	NC_014664	ACGCTG	2	12	521907	521918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312113233
11162	NC_014664	ACC	2	6	521919	521924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113233
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11164	NC_014664	ATC	2	6	521985	521990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113233
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11185	NC_014664	CAT	2	6	522934	522939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113234
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11188	NC_014664	CG	3	6	523491	523496	0 %	0 %	50 %	50 %	312113235
11189	NC_014664	GGC	2	6	523504	523509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113235
11190	NC_014664	TCT	2	6	523514	523519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113235
11191	NC_014664	GCTTC	2	10	523529	523538	0 %	40 %	20 %	40 %	312113235
11192	NC_014664	CGG	2	6	523539	523544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113235
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11197	NC_014664	CGAG	2	8	523734	523741	25 %	0 %	50 %	25 %	312113235
11198	NC_014664	ACG	2	6	523745	523750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113235
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11203	NC_014664	CG	3	6	523892	523897	0 %	0 %	50 %	50 %	312113235
11204	NC_014664	CGC	2	6	523990	523995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113235
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11211	NC_014664	GTC	2	6	524282	524287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113236
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11213	NC_014664	GGCCG	2	10	524363	524372	0 %	0 %	60 %	40 %	312113236
11214	NC_014664	TGA	2	6	524428	524433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113236
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11223	NC_014664	GTC	2	6	524719	524724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113237
11224	NC_014664	CG	4	8	524739	524746	0 %	0 %	50 %	50 %	312113237
11225	NC_014664	TGC	2	6	524750	524755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113237
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11228	NC_014664	CTT	2	6	524865	524870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113237
11229	NC_014664	CGG	2	6	525059	525064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113238
11230	NC_014664	CGG	2	6	525119	525124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113238
11231	NC_014664	TTCA	2	8	525147	525154	25 %	50 %	0 %	25 %	312113238
11232	NC_014664	ATA	2	6	525156	525161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312113238
11233	NC_014664	AGC	2	6	525178	525183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113238
11234	NC_014664	CGC	2	6	525192	525197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113238
11235	NC_014664	GAA	2	6	525207	525212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113238
11236	NC_014664	CGA	3	9	525215	525223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113238
11237	NC_014664	CGG	2	6	525289	525294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113238
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11465	NC_014664	TCGC	2	8	535782	535789	0 %	25 %	25 %	50 %	312113248
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11474	NC_014664	GGCG	2	8	536069	536076	0 %	0 %	75 %	25 %	312113249
11475	NC_014664	ATC	2	6	536078	536083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113249
11476	NC_014664	GCG	2	6	536084	536089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113249
11477	NC_014664	CGG	2	6	536112	536117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113249
11478	NC_014664	GTC	2	6	536221	536226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113249
11479	NC_014664	GGC	2	6	536350	536355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113249
11480	NC_014664	CGT	2	6	536442	536447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113249
11481	NC_014664	CGG	2	6	536457	536462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113249
11482	NC_014664	GGC	2	6	536466	536471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113249
11483	NC_014664	GC	3	6	536470	536475	0 %	0 %	50 %	50 %	312113249
11484	NC_014664	CGC	2	6	536499	536504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113249
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11491	NC_014664	CG	3	6	537098	537103	0 %	0 %	50 %	50 %	312113250
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11493	NC_014664	GC	3	6	537131	537136	0 %	0 %	50 %	50 %	312113250
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11499	NC_014664	CTG	2	6	537324	537329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113250
11500	NC_014664	GCT	2	6	537332	537337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113250

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