MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 41771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_014643	GCA	2	6	1117532	1117537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112717
19003	NC_014643	CGC	2	6	1117599	1117604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112717
19004	NC_014643	AGGT	2	8	1117619	1117626	25 %	25 %	50 %	0 %	311112717
19005	NC_014643	AGC	2	6	1117636	1117641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112717
19006	NC_014643	AGT	2	6	1117642	1117647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112717
19007	NC_014643	GTG	2	6	1117689	1117694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112718
19008	NC_014643	CAG	2	6	1117700	1117705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112718
19009	NC_014643	CAGC	2	8	1117784	1117791	25 %	0 %	25 %	50 %	311112718
19010	NC_014643	CAG	2	6	1117800	1117805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112718
19011	NC_014643	TGA	2	6	1117816	1117821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112718
19012	NC_014643	GCG	2	6	1117831	1117836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112718
19013	NC_014643	TGT	2	6	1117868	1117873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311112718
19014	NC_014643	A	6	6	1117890	1117895	100 %	0 %	0 %	0 %	311112718
19015	NC_014643	CTG	2	6	1117899	1117904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112718
19016	NC_014643	CTG	2	6	1117931	1117936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112718
19017	NC_014643	TA	3	6	1117986	1117991	50 %	50 %	0 %	0 %	311112718
19018	NC_014643	ATT	2	6	1117995	1118000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311112718
19019	NC_014643	TAT	2	6	1118054	1118059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311112718
19020	NC_014643	TGG	2	6	1118113	1118118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112718
19021	NC_014643	A	6	6	1118302	1118307	100 %	0 %	0 %	0 %	311112718
19022	NC_014643	TA	4	8	1118341	1118348	50 %	50 %	0 %	0 %	311112718
19023	NC_014643	CGC	2	6	1118384	1118389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112718
19024	NC_014643	CCT	2	6	1118390	1118395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311112718
19025	NC_014643	CTG	2	6	1118571	1118576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112718
19026	NC_014643	GTAT	2	8	1118591	1118598	25 %	50 %	25 %	0 %	311112718
19027	NC_014643	TTA	2	6	1118626	1118631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311112718
19028	NC_014643	AGTG	2	8	1118645	1118652	25 %	25 %	50 %	0 %	311112718
19029	NC_014643	ATT	2	6	1118655	1118660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311112718
19030	NC_014643	AGA	3	9	1118695	1118703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311112718
19031	NC_014643	TGTC	2	8	1118731	1118738	0 %	50 %	25 %	25 %	311112718
19032	NC_014643	TTTAG	2	10	1118739	1118748	20 %	60 %	20 %	0 %	311112718
19033	NC_014643	CGG	2	6	1118857	1118862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112718
19034	NC_014643	CG	3	6	1118892	1118897	0 %	0 %	50 %	50 %	311112718
19035	NC_014643	ATA	2	6	1118903	1118908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311112718
19036	NC_014643	ACGC	2	8	1118995	1119002	25 %	0 %	25 %	50 %	311112719
19037	NC_014643	TGC	2	6	1119027	1119032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112719
19038	NC_014643	CAT	2	6	1119051	1119056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112719
19039	NC_014643	TCG	2	6	1119062	1119067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112719
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19041	NC_014643	TCG	2	6	1119098	1119103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112719
19042	NC_014643	ATC	3	9	1119125	1119133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112719
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19045	NC_014643	AGTT	2	8	1119322	1119329	25 %	50 %	25 %	0 %	311112719
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19047	NC_014643	GC	3	6	1119396	1119401	0 %	0 %	50 %	50 %	311112719
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19050	NC_014643	GC	3	6	1119453	1119458	0 %	0 %	50 %	50 %	311112719
19051	NC_014643	CCG	2	6	1119530	1119535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112719
19052	NC_014643	TCG	2	6	1119548	1119553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112719
19053	NC_014643	GAA	2	6	1119565	1119570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311112719
19054	NC_014643	GGGC	2	8	1119571	1119578	0 %	0 %	75 %	25 %	311112719
19055	NC_014643	GCGG	2	8	1119611	1119618	0 %	0 %	75 %	25 %	311112719
19056	NC_014643	TAG	2	6	1119623	1119628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112719
19057	NC_014643	CGAT	2	8	1119686	1119693	25 %	25 %	25 %	25 %	311112719
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19059	NC_014643	AGT	2	6	1119768	1119773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112719
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19099	NC_014643	TCA	2	6	1121799	1121804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112720
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19101	NC_014643	GACGG	2	10	1121855	1121864	20 %	0 %	60 %	20 %	311112720
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19116	NC_014643	CCA	2	6	1122652	1122657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112720
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19121	NC_014643	GCT	2	6	1123102	1123107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112720
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19231	NC_014643	GC	3	6	1129165	1129170	0 %	0 %	50 %	50 %	311112727
19232	NC_014643	GCC	2	6	1129183	1129188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112727
19233	NC_014643	CCG	2	6	1129208	1129213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112727
19234	NC_014643	GCT	2	6	1129215	1129220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112727
19235	NC_014643	GC	3	6	1129357	1129362	0 %	0 %	50 %	50 %	311112727
19236	NC_014643	AGGGG	2	10	1129398	1129407	20 %	0 %	80 %	0 %	311112727
19237	NC_014643	CGC	3	9	1129419	1129427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112727
19238	NC_014643	GAG	2	6	1129432	1129437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311112727
19239	NC_014643	CCG	2	6	1129470	1129475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112727
19240	NC_014643	GGGC	2	8	1129500	1129507	0 %	0 %	75 %	25 %	311112727
19241	NC_014643	TGA	2	6	1129560	1129565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112727
19242	NC_014643	GGA	2	6	1129692	1129697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311112727
19243	NC_014643	GCT	2	6	1129698	1129703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112727
19244	NC_014643	GTG	2	6	1129798	1129803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112727
19245	NC_014643	ATG	3	9	1130723	1130731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112728
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19247	NC_014643	TGC	2	6	1130779	1130784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112728
19248	NC_014643	CTG	2	6	1130826	1130831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112728
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19250	NC_014643	TA	3	6	1131025	1131030	50 %	50 %	0 %	0 %	311112729
19251	NC_014643	GAT	2	6	1131035	1131040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112729
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19255	NC_014643	GAT	3	9	1131341	1131349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112729
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19258	NC_014643	TA	5	10	1131583	1131592	50 %	50 %	0 %	0 %	311112729
19259	NC_014643	ATC	2	6	1131719	1131724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112729
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19261	NC_014643	AAT	2	6	1131741	1131746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311112729
19262	NC_014643	CAG	2	6	1131775	1131780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112730
19263	NC_014643	TAT	2	6	1132009	1132014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311112730
19264	NC_014643	CAA	2	6	1132045	1132050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311112730
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19267	NC_014643	TTTG	2	8	1132119	1132126	0 %	75 %	25 %	0 %	311112730
19268	NC_014643	CTG	2	6	1132156	1132161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112730
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19327	NC_014643	A	7	7	1138264	1138270	100 %	0 %	0 %	0 %	311112734
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19333	NC_014643	CAT	2	6	1138537	1138542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112734
19334	NC_014643	TGG	2	6	1138545	1138550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112734
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19345	NC_014643	CTG	2	6	1138922	1138927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112734
19346	NC_014643	T	6	6	1138935	1138940	0 %	100 %	0 %	0 %	311112734
19347	NC_014643	TCCC	2	8	1139001	1139008	0 %	25 %	0 %	75 %	311112734
19348	NC_014643	GAT	2	6	1139092	1139097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112734
19349	NC_014643	TGA	2	6	1139163	1139168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112734
19350	NC_014643	AGC	2	6	1139174	1139179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112734
19351	NC_014643	AAT	2	6	1139298	1139303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311112734
19352	NC_014643	GCTT	2	8	1139373	1139380	0 %	50 %	25 %	25 %	311112734
19353	NC_014643	CTG	2	6	1139414	1139419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112734
19354	NC_014643	GCTGAG	2	12	1139455	1139466	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	311112734
19355	NC_014643	CA	3	6	1139496	1139501	50 %	0 %	0 %	50 %	311112734
19356	NC_014643	CT	3	6	1139524	1139529	0 %	50 %	0 %	50 %	311112734
19357	NC_014643	CTG	2	6	1139540	1139545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112734
19358	NC_014643	GAGT	2	8	1139552	1139559	25 %	25 %	50 %	0 %	311112734
19359	NC_014643	A	7	7	1139564	1139570	100 %	0 %	0 %	0 %	311112734
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19361	NC_014643	GGCGGG	2	12	1139705	1139716	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	311112734
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19369	NC_014643	TCT	2	6	1139999	1140004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112734
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19375	NC_014643	TGC	2	6	1140224	1140229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112734
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19379	NC_014643	TGG	2	6	1140322	1140327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112734
19380	NC_014643	GT	3	6	1140509	1140514	0 %	50 %	50 %	0 %	311112734
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19450	NC_014643	TTA	2	6	1145159	1145164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311112738
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19458	NC_014643	CCCAG	2	10	1145560	1145569	20 %	0 %	20 %	60 %	311112738
19459	NC_014643	GAA	2	6	1145602	1145607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311112738
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19463	NC_014643	CTG	2	6	1145767	1145772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112738
19464	NC_014643	CCA	2	6	1145777	1145782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112738
19465	NC_014643	TAC	2	6	1145785	1145790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112738
19466	NC_014643	CAG	2	6	1145811	1145816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112738
19467	NC_014643	GAT	2	6	1145898	1145903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112738
19468	NC_014643	CTT	2	6	1145943	1145948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112738
19469	NC_014643	CAG	2	6	1146015	1146020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112738
19470	NC_014643	GCC	2	6	1146049	1146054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112738
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19473	NC_014643	CTA	2	6	1146154	1146159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112738
19474	NC_014643	GCA	2	6	1146177	1146182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112738
19475	NC_014643	CGA	2	6	1146224	1146229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112738
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19477	NC_014643	CTGG	2	8	1146264	1146271	0 %	25 %	50 %	25 %	311112738
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19484	NC_014643	CG	3	6	1146606	1146611	0 %	0 %	50 %	50 %	311112738
19485	NC_014643	GCC	2	6	1146667	1146672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112738
19486	NC_014643	ACCG	2	8	1146697	1146704	25 %	0 %	25 %	50 %	311112738
19487	NC_014643	CG	3	6	1146703	1146708	0 %	0 %	50 %	50 %	311112738
19488	NC_014643	CTG	2	6	1146712	1146717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112738
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19491	NC_014643	TTC	2	6	1146881	1146886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112738
19492	NC_014643	GCC	2	6	1146890	1146895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112738
19493	NC_014643	GCG	2	6	1146950	1146955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112738
19494	NC_014643	CG	3	6	1147063	1147068	0 %	0 %	50 %	50 %	311112738
19495	NC_014643	CCGA	2	8	1147157	1147164	25 %	0 %	25 %	50 %	311112738
19496	NC_014643	CGA	2	6	1147245	1147250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112738
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19500	NC_014643	CGTC	2	8	1147443	1147450	0 %	25 %	25 %	50 %	311112739

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