MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 41771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014643	CGC	2	6	272802	272807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111925
4502	NC_014643	GGC	2	6	272821	272826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111925
4503	NC_014643	GCA	2	6	272880	272885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111925
4504	NC_014643	GTC	2	6	272923	272928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111925
4505	NC_014643	TCCCCT	2	12	272948	272959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311111925
4506	NC_014643	AGT	2	6	272967	272972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111925
4507	NC_014643	CGG	2	6	272976	272981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111925
4508	NC_014643	GTC	2	6	273118	273123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111925
4509	NC_014643	TTC	2	6	273127	273132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111925
4510	NC_014643	AG	3	6	273139	273144	50 %	0 %	50 %	0 %	311111925
4511	NC_014643	GAGCAA	2	12	273316	273327	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	311111925
4512	NC_014643	CGG	2	6	273333	273338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111925
4513	NC_014643	GCC	2	6	273362	273367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111925
4514	NC_014643	TCG	2	6	273512	273517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111926
4515	NC_014643	CG	3	6	273597	273602	0 %	0 %	50 %	50 %	311111926
4516	NC_014643	TTC	2	6	273655	273660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111926
4517	NC_014643	CGG	2	6	273693	273698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111926
4518	NC_014643	CCG	2	6	273701	273706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111926
4519	NC_014643	CG	3	6	273714	273719	0 %	0 %	50 %	50 %	311111926
4520	NC_014643	TTC	2	6	273739	273744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111926
4521	NC_014643	CGTG	2	8	273793	273800	0 %	25 %	50 %	25 %	311111926
4522	NC_014643	GTG	2	6	273905	273910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111926
4523	NC_014643	CGG	2	6	273954	273959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111926
4524	NC_014643	CTT	2	6	273963	273968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111926
4525	NC_014643	CA	3	6	273977	273982	50 %	0 %	0 %	50 %	311111926
4526	NC_014643	TCGT	2	8	274097	274104	0 %	50 %	25 %	25 %	311111926
4527	NC_014643	TA	3	6	274107	274112	50 %	50 %	0 %	0 %	311111926
4528	NC_014643	TTCAAG	2	12	274303	274314	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	311111926
4529	NC_014643	GC	4	8	274316	274323	0 %	0 %	50 %	50 %	311111926
4530	NC_014643	CTT	2	6	274402	274407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111926
4531	NC_014643	ATA	2	6	274463	274468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111926
4532	NC_014643	TCG	2	6	274484	274489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111926
4533	NC_014643	CAC	2	6	274654	274659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111926
4534	NC_014643	CG	3	6	274698	274703	0 %	0 %	50 %	50 %	311111926
4535	NC_014643	GAT	2	6	274729	274734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111926
4536	NC_014643	TGT	2	6	275079	275084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311111927
4537	NC_014643	GGC	2	6	275184	275189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111927
4538	NC_014643	CTT	2	6	275221	275226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111927
4539	NC_014643	GCG	2	6	275377	275382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111927
4540	NC_014643	ATT	2	6	275429	275434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311111927
4541	NC_014643	CGCTG	2	10	275448	275457	0 %	20 %	40 %	40 %	311111927
4542	NC_014643	GTT	2	6	275491	275496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311111927
4543	NC_014643	GTA	2	6	275500	275505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111927
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4545	NC_014643	GC	3	6	275539	275544	0 %	0 %	50 %	50 %	311111927
4546	NC_014643	CGA	2	6	275553	275558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111927
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4548	NC_014643	CACG	2	8	275572	275579	25 %	0 %	25 %	50 %	311111927
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4551	NC_014643	CGCA	2	8	275679	275686	25 %	0 %	25 %	50 %	311111927
4552	NC_014643	ACGC	2	8	275767	275774	25 %	0 %	25 %	50 %	311111927
4553	NC_014643	GGT	2	6	275778	275783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111927
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4555	NC_014643	TCT	2	6	275887	275892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111927
4556	NC_014643	TCT	2	6	275910	275915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111927
4557	NC_014643	TGCCCG	2	12	275916	275927	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	311111927
4558	NC_014643	CGC	2	6	275998	276003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111927
4559	NC_014643	TCCT	2	8	276021	276028	0 %	50 %	0 %	50 %	311111927
4560	NC_014643	GTGC	2	8	276193	276200	0 %	25 %	50 %	25 %	311111927
4561	NC_014643	GTC	2	6	276311	276316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111927
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4563	NC_014643	CG	3	6	276520	276525	0 %	0 %	50 %	50 %	311111928
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4565	NC_014643	CGCC	2	8	276752	276759	0 %	0 %	25 %	75 %	311111928
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4570	NC_014643	GCA	2	6	276938	276943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111928
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4578	NC_014643	TGAT	2	8	277183	277190	25 %	50 %	25 %	0 %	311111928
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4587	NC_014643	CGA	2	6	278009	278014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111929
4588	NC_014643	GCA	2	6	278035	278040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111929
4589	NC_014643	TTCT	2	8	278073	278080	0 %	75 %	0 %	25 %	311111929
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4593	NC_014643	GCAT	2	8	278539	278546	25 %	25 %	25 %	25 %	311111929
4594	NC_014643	TGA	2	6	278730	278735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111930
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4598	NC_014643	TAC	2	6	278929	278934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111930
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4602	NC_014643	CTA	2	6	279012	279017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111930
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4604	NC_014643	TCA	2	6	279139	279144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111931
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4606	NC_014643	ATG	2	6	279297	279302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111931
4607	NC_014643	GCC	2	6	279313	279318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111931
4608	NC_014643	AT	3	6	279319	279324	50 %	50 %	0 %	0 %	311111931
4609	NC_014643	AG	3	6	279332	279337	50 %	0 %	50 %	0 %	311111931
4610	NC_014643	CGC	2	6	279362	279367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111931
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4612	NC_014643	GCG	2	6	279427	279432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111931
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4618	NC_014643	AC	3	6	279816	279821	50 %	0 %	0 %	50 %	311111931
4619	NC_014643	GCA	2	6	279907	279912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111931
4620	NC_014643	TCA	2	6	279920	279925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111931
4621	NC_014643	GCA	2	6	279928	279933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111931
4622	NC_014643	GCA	2	6	280046	280051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111931
4623	NC_014643	GCACG	2	10	280268	280277	20 %	0 %	40 %	40 %	311111931
4624	NC_014643	TGC	2	6	280311	280316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111931
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4626	NC_014643	AGG	2	6	280361	280366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311111931
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4631	NC_014643	TGC	2	6	280573	280578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111931
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4642	NC_014643	GCA	2	6	281507	281512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111933
4643	NC_014643	GC	3	6	281608	281613	0 %	0 %	50 %	50 %	311111933
4644	NC_014643	CCT	2	6	281615	281620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311111933
4645	NC_014643	AAC	2	6	281631	281636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311111933
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4648	NC_014643	TTG	2	6	281959	281964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311111933
4649	NC_014643	CAG	2	6	281991	281996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111933
4650	NC_014643	TGC	2	6	282000	282005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111933
4651	NC_014643	GA	3	6	282193	282198	50 %	0 %	50 %	0 %	311111933
4652	NC_014643	TCT	2	6	282212	282217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111933
4653	NC_014643	TAGCG	2	10	282293	282302	20 %	20 %	40 %	20 %	311111933
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4657	NC_014643	GCA	2	6	282365	282370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111933
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4681	NC_014643	CTTC	2	8	283699	283706	0 %	50 %	0 %	50 %	311111934
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4740	NC_014643	CTT	2	6	287924	287929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111939
4741	NC_014643	GCA	2	6	287932	287937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111939
4742	NC_014643	ATC	2	6	287943	287948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111939
4743	NC_014643	CAT	2	6	288198	288203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111939
4744	NC_014643	CCA	2	6	288214	288219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111939
4745	NC_014643	CCA	2	6	288290	288295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111939
4746	NC_014643	ACC	2	6	288342	288347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111939
4747	NC_014643	GCA	2	6	288355	288360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111939
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4751	NC_014643	ACC	2	6	288592	288597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111939
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4760	NC_014643	GC	3	6	289080	289085	0 %	0 %	50 %	50 %	311111940
4761	NC_014643	ACC	3	9	289102	289110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111940
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4765	NC_014643	CAGT	2	8	289305	289312	25 %	25 %	25 %	25 %	311111940
4766	NC_014643	GCC	2	6	289334	289339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111940
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4769	NC_014643	CTG	2	6	289540	289545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111941
4770	NC_014643	AGCT	2	8	289549	289556	25 %	25 %	25 %	25 %	311111941
4771	NC_014643	GCA	2	6	289566	289571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111941
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4774	NC_014643	GCA	2	6	289785	289790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111941
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4778	NC_014643	TGAG	2	8	290256	290263	25 %	25 %	50 %	0 %	311111942
4779	NC_014643	AGCG	2	8	290348	290355	25 %	0 %	50 %	25 %	311111942
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4782	NC_014643	CGG	2	6	290432	290437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111942
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4785	NC_014643	CG	3	6	290566	290571	0 %	0 %	50 %	50 %	311111942
4786	NC_014643	TCCA	2	8	290599	290606	25 %	25 %	0 %	50 %	311111942
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4789	NC_014643	CTGCGC	2	12	290869	290880	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	311111942
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4814	NC_014643	ACCGCG	2	12	292652	292663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	311111944
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4842	NC_014643	CTT	2	6	294917	294922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111949
4843	NC_014643	GC	3	6	295138	295143	0 %	0 %	50 %	50 %	311111949
4844	NC_014643	GCC	2	6	295193	295198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111949
4845	NC_014643	TCA	2	6	295237	295242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111949
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4847	NC_014643	CG	4	8	295388	295395	0 %	0 %	50 %	50 %	311111949
4848	NC_014643	GATC	2	8	295421	295428	25 %	25 %	25 %	25 %	311111949
4849	NC_014643	GCACC	2	10	295436	295445	20 %	0 %	20 %	60 %	311111949
4850	NC_014643	GCGG	2	8	295511	295518	0 %	0 %	75 %	25 %	311111949
4851	NC_014643	ACT	2	6	295585	295590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111949
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4853	NC_014643	CTG	2	6	295632	295637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111949
4854	NC_014643	CCG	2	6	295777	295782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111949
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4856	NC_014643	GCAG	2	8	295855	295862	25 %	0 %	50 %	25 %	311111949
4857	NC_014643	GGT	2	6	295999	296004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111949
4858	NC_014643	TGG	2	6	296078	296083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111949
4859	NC_014643	GCG	2	6	296110	296115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111949
4860	NC_014643	TCT	2	6	296277	296282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111950
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4862	NC_014643	GGT	2	6	296387	296392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111950
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4902	NC_014643	G	6	6	298147	298152	0 %	0 %	100 %	0 %	311111952
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4963	NC_014643	GCG	2	6	301027	301032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111957
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4979	NC_014643	AGGGTC	2	12	301781	301792	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	311111958
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4981	NC_014643	TTGCG	2	10	301914	301923	0 %	40 %	40 %	20 %	311111958
4982	NC_014643	AGTCAT	2	12	301954	301965	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	311111958
4983	NC_014643	TCG	2	6	302091	302096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111959
4984	NC_014643	CAC	2	6	302111	302116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111959
4985	NC_014643	CACG	2	8	302131	302138	25 %	0 %	25 %	50 %	311111959
4986	NC_014643	TCGA	2	8	302142	302149	25 %	25 %	25 %	25 %	311111959
4987	NC_014643	ACG	2	6	302475	302480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111959
4988	NC_014643	G	6	6	302575	302580	0 %	0 %	100 %	0 %	311111959
4989	NC_014643	GCT	2	6	302646	302651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111960
4990	NC_014643	CTG	2	6	302769	302774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111960
4991	NC_014643	GAC	2	6	302809	302814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111960
4992	NC_014643	CAA	2	6	302826	302831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311111960
4993	NC_014643	CTT	2	6	302977	302982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111961
4994	NC_014643	TTC	2	6	303044	303049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111961
4995	NC_014643	CTG	2	6	303057	303062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111961
4996	NC_014643	TCG	2	6	303068	303073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111961
4997	NC_014643	CTT	2	6	303109	303114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111961
4998	NC_014643	GAC	3	9	303121	303129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111961
4999	NC_014643	GCC	2	6	303160	303165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111961
5000	NC_014643	CGA	2	6	303189	303194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111961

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