MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CFBP2957 chromosome complete genome

Total Repeats: 81659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014307	GC	3	6	50897	50902	0 %	0 %	50 %	50 %	300702422
1002	NC_014307	GCT	3	9	50929	50937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702422
1003	NC_014307	CTG	2	6	50966	50971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702422
1004	NC_014307	GGGC	2	8	50974	50981	0 %	0 %	75 %	25 %	300702422
1005	NC_014307	CTT	2	6	50986	50991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702422
1006	NC_014307	CG	3	6	51000	51005	0 %	0 %	50 %	50 %	300702422
1007	NC_014307	CGCT	2	8	51032	51039	0 %	25 %	25 %	50 %	300702422
1008	NC_014307	GCT	2	6	51043	51048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702422
1009	NC_014307	GCCG	2	8	51089	51096	0 %	0 %	50 %	50 %	300702422
1010	NC_014307	CGCGG	2	10	51214	51223	0 %	0 %	60 %	40 %	300702422
1011	NC_014307	CGC	2	6	51307	51312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702422
1012	NC_014307	CTG	2	6	51332	51337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702422
1013	NC_014307	GCT	2	6	51558	51563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702423
1014	NC_014307	CAG	2	6	51620	51625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702423
1015	NC_014307	GAT	2	6	51724	51729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702423
1016	NC_014307	GTG	2	6	51740	51745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702423
1017	NC_014307	ACC	2	6	51747	51752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702423
1018	NC_014307	ACC	2	6	51764	51769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702423
1019	NC_014307	ACC	2	6	51779	51784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702423
1020	NC_014307	A	6	6	51817	51822	100 %	0 %	0 %	0 %	300702423
1021	NC_014307	GAG	2	6	51866	51871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702423
1022	NC_014307	TGA	2	6	51959	51964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702424
1023	NC_014307	ACC	2	6	52009	52014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702424
1024	NC_014307	GCC	2	6	52036	52041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702424
1025	NC_014307	CAT	2	6	52089	52094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702424
1026	NC_014307	GGCC	2	8	52131	52138	0 %	0 %	50 %	50 %	300702424
1027	NC_014307	AGC	2	6	52246	52251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702424
1028	NC_014307	GC	4	8	52271	52278	0 %	0 %	50 %	50 %	300702424
1029	NC_014307	GCA	2	6	52283	52288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702424
1030	NC_014307	GTG	2	6	52351	52356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702424
1031	NC_014307	GCC	2	6	52357	52362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702424
1032	NC_014307	CGG	2	6	52367	52372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702424
1033	NC_014307	GC	3	6	52415	52420	0 %	0 %	50 %	50 %	300702424
1034	NC_014307	CG	3	6	52441	52446	0 %	0 %	50 %	50 %	300702424
1035	NC_014307	CG	3	6	52503	52508	0 %	0 %	50 %	50 %	300702424
1036	NC_014307	CTG	2	6	52566	52571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702424
1037	NC_014307	CCGG	2	8	52573	52580	0 %	0 %	50 %	50 %	300702424
1038	NC_014307	GCCC	2	8	52597	52604	0 %	0 %	25 %	75 %	300702424
1039	NC_014307	GTC	2	6	52620	52625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702424
1040	NC_014307	GGC	2	6	52644	52649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702424
1041	NC_014307	CGG	2	6	52787	52792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702424
1042	NC_014307	TGCT	2	8	52795	52802	0 %	50 %	25 %	25 %	300702424
1043	NC_014307	CGCC	2	8	52865	52872	0 %	0 %	25 %	75 %	300702424
1044	NC_014307	CGGC	2	8	52895	52902	0 %	0 %	50 %	50 %	300702424
1045	NC_014307	GC	3	6	52901	52906	0 %	0 %	50 %	50 %	300702424
1046	NC_014307	TGG	2	6	52909	52914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702424
1047	NC_014307	ATCCGT	2	12	53010	53021	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300702424
1048	NC_014307	GCT	2	6	53208	53213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702425
1049	NC_014307	TGC	2	6	53224	53229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702425
1050	NC_014307	CGT	2	6	53276	53281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702425
1051	NC_014307	GC	4	8	53290	53297	0 %	0 %	50 %	50 %	300702425
1052	NC_014307	CCAGCA	2	12	53347	53358	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300702425
1053	NC_014307	CAG	2	6	53438	53443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702425
1054	NC_014307	GCA	2	6	53487	53492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702425
1055	NC_014307	TCT	2	6	53653	53658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702426
1056	NC_014307	TCA	2	6	53701	53706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702426
1057	NC_014307	GCA	2	6	53725	53730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702426
1058	NC_014307	TGAAG	2	10	53761	53770	40 %	20 %	40 %	0 %	300702426
1059	NC_014307	CTT	2	6	53806	53811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702426
1060	NC_014307	GATC	2	8	53857	53864	25 %	25 %	25 %	25 %	300702426
1061	NC_014307	GGC	3	9	53872	53880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702426
1062	NC_014307	GTCG	2	8	53912	53919	0 %	25 %	50 %	25 %	300702426
1063	NC_014307	ACC	2	6	53958	53963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702426
1064	NC_014307	CCGG	2	8	54059	54066	0 %	0 %	50 %	50 %	300702426
1065	NC_014307	C	6	6	54109	54114	0 %	0 %	0 %	100 %	300702426
1066	NC_014307	GC	3	6	54315	54320	0 %	0 %	50 %	50 %	300702427
1067	NC_014307	GCGT	2	8	54342	54349	0 %	25 %	50 %	25 %	300702427
1068	NC_014307	GCG	2	6	54355	54360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702427
1069	NC_014307	GCC	2	6	54398	54403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702427
1070	NC_014307	TCG	2	6	54453	54458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702427
1071	NC_014307	CAG	2	6	54470	54475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702427
1072	NC_014307	GCA	2	6	54493	54498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702427
1073	NC_014307	TCC	2	6	54657	54662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702427
1074	NC_014307	CGG	2	6	54688	54693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702427
1075	NC_014307	TGC	2	6	54736	54741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702427
1076	NC_014307	GCA	2	6	54793	54798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702427
1077	NC_014307	GCGG	2	8	54815	54822	0 %	0 %	75 %	25 %	300702427
1078	NC_014307	C	6	6	54940	54945	0 %	0 %	0 %	100 %	300702427
1079	NC_014307	GC	3	6	55020	55025	0 %	0 %	50 %	50 %	300702427
1080	NC_014307	TGC	2	6	55030	55035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702427
1081	NC_014307	GCA	2	6	55363	55368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702428
1082	NC_014307	CCA	2	6	55414	55419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702428
1083	NC_014307	CCG	2	6	55432	55437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702428
1084	NC_014307	CTG	2	6	55443	55448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702428
1085	NC_014307	TGC	2	6	55486	55491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702428
1086	NC_014307	ACC	2	6	55543	55548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702428
1087	NC_014307	GCT	2	6	55550	55555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702428
1088	NC_014307	CAGCAC	2	12	55574	55585	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300702428
1089	NC_014307	CAC	2	6	55592	55597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702428
1090	NC_014307	CTCGGC	2	12	55623	55634	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300702428
1091	NC_014307	TGC	2	6	55678	55683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702428
1092	NC_014307	CG	4	8	55718	55725	0 %	0 %	50 %	50 %	300702428
1093	NC_014307	GGC	2	6	55731	55736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702428
1094	NC_014307	GCT	2	6	55745	55750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702428
1095	NC_014307	TCG	2	6	55815	55820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702428
1096	NC_014307	GGGCT	2	10	55821	55830	0 %	20 %	60 %	20 %	300702428
1097	NC_014307	GCT	2	6	55844	55849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702428
1098	NC_014307	CAT	2	6	55859	55864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702428
1099	NC_014307	CGG	2	6	55876	55881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702428
1100	NC_014307	TAT	2	6	55884	55889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300702428
1101	NC_014307	CTG	2	6	55968	55973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702428
1102	NC_014307	TGC	2	6	56029	56034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702428
1103	NC_014307	CTG	2	6	56043	56048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702428
1104	NC_014307	GGCGC	2	10	56075	56084	0 %	0 %	60 %	40 %	300702428
1105	NC_014307	CTG	2	6	56149	56154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702429
1106	NC_014307	GAT	2	6	56169	56174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702429
1107	NC_014307	GGT	2	6	56181	56186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702429
1108	NC_014307	CGC	2	6	56205	56210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702429
1109	NC_014307	ACG	2	6	56273	56278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702429
1110	NC_014307	TGC	3	9	56279	56287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702429
1111	NC_014307	TGC	2	6	56324	56329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702429
1112	NC_014307	GC	4	8	56337	56344	0 %	0 %	50 %	50 %	300702429
1113	NC_014307	CGGTGC	2	12	56354	56365	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300702429
1114	NC_014307	CG	4	8	56376	56383	0 %	0 %	50 %	50 %	300702429
1115	NC_014307	CGG	2	6	56415	56420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702429
1116	NC_014307	CGA	2	6	56424	56429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702429
1117	NC_014307	TGG	2	6	56453	56458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702429
1118	NC_014307	CTG	2	6	56461	56466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702429
1119	NC_014307	GC	3	6	56467	56472	0 %	0 %	50 %	50 %	300702429
1120	NC_014307	GC	3	6	56475	56480	0 %	0 %	50 %	50 %	300702429
1121	NC_014307	TGC	2	6	56483	56488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702429
1122	NC_014307	CGGGG	2	10	56494	56503	0 %	0 %	80 %	20 %	300702429
1123	NC_014307	CACG	2	8	56550	56557	25 %	0 %	25 %	50 %	300702429
1124	NC_014307	GCT	2	6	56610	56615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702429
1125	NC_014307	TGC	2	6	56627	56632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702429
1126	NC_014307	GGA	2	6	56664	56669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702429
1127	NC_014307	GATG	2	8	56780	56787	25 %	25 %	50 %	0 %	300702429
1128	NC_014307	GCG	2	6	56819	56824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702430
1129	NC_014307	ATC	2	6	56847	56852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702430
1130	NC_014307	GTGGCG	3	18	56853	56870	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300702430
1131	NC_014307	G	6	6	56873	56878	0 %	0 %	100 %	0 %	300702430
1132	NC_014307	GAC	2	6	56922	56927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702430
1133	NC_014307	TGC	2	6	56929	56934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702430
1134	NC_014307	GCA	2	6	56960	56965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702430
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1136	NC_014307	CCG	2	6	56980	56985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702430
1137	NC_014307	CG	3	6	57010	57015	0 %	0 %	50 %	50 %	300702430
1138	NC_014307	GCT	2	6	57026	57031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702430
1139	NC_014307	CGCGC	2	10	57069	57078	0 %	0 %	40 %	60 %	300702430
1140	NC_014307	CG	4	8	57116	57123	0 %	0 %	50 %	50 %	300702430
1141	NC_014307	CGA	2	6	57161	57166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702430
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1143	NC_014307	CCG	2	6	57196	57201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702430
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1145	NC_014307	CG	3	6	57215	57220	0 %	0 %	50 %	50 %	300702430
1146	NC_014307	CTG	3	9	57270	57278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702430
1147	NC_014307	TGC	2	6	57292	57297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702430
1148	NC_014307	CGA	2	6	57347	57352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702430
1149	NC_014307	CGA	2	6	57389	57394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702430
1150	NC_014307	GTG	2	6	57408	57413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702430
1151	NC_014307	GCT	2	6	57425	57430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702430
1152	NC_014307	GC	3	6	57432	57437	0 %	0 %	50 %	50 %	300702430
1153	NC_014307	GCA	2	6	57458	57463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702430
1154	NC_014307	GCG	2	6	57480	57485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702430
1155	NC_014307	CGC	2	6	57499	57504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702430
1156	NC_014307	CTG	2	6	57612	57617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702430
1157	NC_014307	CTG	2	6	57624	57629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702430
1158	NC_014307	CG	3	6	57657	57662	0 %	0 %	50 %	50 %	300702430
1159	NC_014307	CAC	2	6	57755	57760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702430
1160	NC_014307	GC	3	6	57771	57776	0 %	0 %	50 %	50 %	300702430
1161	NC_014307	CGG	2	6	57851	57856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702430
1162	NC_014307	GC	5	10	57941	57950	0 %	0 %	50 %	50 %	300702430
1163	NC_014307	GGGGCT	2	12	57998	58009	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300702430
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1166	NC_014307	CGGCG	2	10	58070	58079	0 %	0 %	60 %	40 %	300702430
1167	NC_014307	CTG	2	6	58257	58262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702431
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1169	NC_014307	CTT	2	6	58289	58294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702431
1170	NC_014307	GCC	2	6	58333	58338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702431
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1199	NC_014307	GAC	2	6	59557	59562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702432
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1202	NC_014307	CGC	2	6	59715	59720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702432
1203	NC_014307	GCG	2	6	59767	59772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702432
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1210	NC_014307	CGGC	2	8	59913	59920	0 %	0 %	50 %	50 %	300702432
1211	NC_014307	AGC	2	6	59957	59962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702432
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1214	NC_014307	TCA	2	6	60165	60170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702432
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1222	NC_014307	CTG	2	6	60565	60570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702432
1223	NC_014307	TCC	2	6	60587	60592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702432
1224	NC_014307	CG	4	8	60672	60679	0 %	0 %	50 %	50 %	300702432
1225	NC_014307	CGC	2	6	60701	60706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702432
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1230	NC_014307	GC	3	6	60975	60980	0 %	0 %	50 %	50 %	300702432
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1232	NC_014307	GCCG	2	8	61016	61023	0 %	0 %	50 %	50 %	300702432
1233	NC_014307	CGT	2	6	61045	61050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702432
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1236	NC_014307	CCAGCA	2	12	61119	61130	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300702432
1237	NC_014307	CAT	2	6	61222	61227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702432
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1239	NC_014307	CCGAC	2	10	61293	61302	20 %	0 %	20 %	60 %	300702432
1240	NC_014307	GCC	2	6	61309	61314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702432
1241	NC_014307	GC	3	6	61340	61345	0 %	0 %	50 %	50 %	300702432
1242	NC_014307	TCG	2	6	61367	61372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702432
1243	NC_014307	CGG	2	6	61393	61398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702432
1244	NC_014307	TCC	2	6	61436	61441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702432
1245	NC_014307	TCG	2	6	61496	61501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702432
1246	NC_014307	TTGCGC	2	12	61517	61528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702432
1247	NC_014307	GGC	2	6	61554	61559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702432
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1249	NC_014307	CGG	3	9	61717	61725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702432
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1362	NC_014307	CGGCG	2	10	67648	67657	0 %	0 %	60 %	40 %	300702433
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1365	NC_014307	CTGGG	2	10	67743	67752	0 %	20 %	60 %	20 %	300702433
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1369	NC_014307	CTGG	2	8	67793	67800	0 %	25 %	50 %	25 %	300702433
1370	NC_014307	GC	3	6	67801	67806	0 %	0 %	50 %	50 %	300702433
1371	NC_014307	GGC	2	6	67845	67850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702433
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1495	NC_014307	C	6	6	72746	72751	0 %	0 %	0 %	100 %	300702438
1496	NC_014307	GC	3	6	72770	72775	0 %	0 %	50 %	50 %	300702438
1497	NC_014307	GGC	3	9	72781	72789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702438
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1499	NC_014307	GCTG	2	8	72823	72830	0 %	25 %	50 %	25 %	300702438
1500	NC_014307	CGC	2	6	72868	72873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702438

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