MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 43738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013715	ATG	2	6	203880	203885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457273
4002	NC_013715	ACG	2	6	203996	204001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457273
4003	NC_013715	ATTC	2	8	204002	204009	25 %	50 %	0 %	25 %	283457273
4004	NC_013715	GCT	2	6	204023	204028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457273
4005	NC_013715	ATG	2	6	204111	204116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457273
4006	NC_013715	CTT	2	6	204141	204146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457273
4007	NC_013715	GTT	2	6	204169	204174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457273
4008	NC_013715	TGC	2	6	204265	204270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457273
4009	NC_013715	TCG	2	6	204308	204313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457273
4010	NC_013715	GCG	2	6	204329	204334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457273
4011	NC_013715	GCCG	2	8	204502	204509	0 %	0 %	50 %	50 %	283457273
4012	NC_013715	GTG	2	6	204593	204598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457273
4013	NC_013715	GTGC	2	8	204617	204624	0 %	25 %	50 %	25 %	283457273
4014	NC_013715	CTC	2	6	204633	204638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457273
4015	NC_013715	TGG	2	6	204681	204686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457273
4016	NC_013715	CTG	2	6	204687	204692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457273
4017	NC_013715	GAG	2	6	204701	204706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457273
4018	NC_013715	GAA	2	6	204709	204714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457273
4019	NC_013715	GCTGA	2	10	204722	204731	20 %	20 %	40 %	20 %	283457273
4020	NC_013715	TGC	2	6	204769	204774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457273
4021	NC_013715	GCT	2	6	204776	204781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457273
4022	NC_013715	TCG	3	9	204836	204844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457273
4023	NC_013715	GCG	2	6	204848	204853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457273
4024	NC_013715	TGG	2	6	204867	204872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457273
4025	NC_013715	TCG	2	6	204902	204907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457273
4026	NC_013715	TCG	2	6	204923	204928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457273
4027	NC_013715	GTG	2	6	205062	205067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457273
4028	NC_013715	AGG	2	6	205080	205085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457273
4029	NC_013715	ACGGC	2	10	205230	205239	20 %	0 %	40 %	40 %	283457273
4030	NC_013715	TTC	2	6	205255	205260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457273
4031	NC_013715	ATG	2	6	205269	205274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457273
4032	NC_013715	TCG	2	6	205301	205306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457273
4033	NC_013715	TTC	2	6	205457	205462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457273
4034	NC_013715	TGG	2	6	205483	205488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457273
4035	NC_013715	TGA	2	6	205515	205520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457273
4036	NC_013715	TGG	2	6	205590	205595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457273
4037	NC_013715	TCAT	2	8	205713	205720	25 %	50 %	0 %	25 %	283457273
4038	NC_013715	ATTCTG	2	12	205769	205780	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	283457273
4039	NC_013715	GCGG	2	8	205793	205800	0 %	0 %	75 %	25 %	283457273
4040	NC_013715	TTC	2	6	205850	205855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457273
4041	NC_013715	CGT	2	6	205883	205888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457273
4042	NC_013715	CAT	2	6	205924	205929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457273
4043	NC_013715	CGT	2	6	205985	205990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457273
4044	NC_013715	GAA	2	6	206008	206013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457273
4045	NC_013715	TAA	2	6	206074	206079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457274
4046	NC_013715	AT	3	6	206087	206092	50 %	50 %	0 %	0 %	283457274
4047	NC_013715	AGGG	2	8	206101	206108	25 %	0 %	75 %	0 %	283457274
4048	NC_013715	CTG	2	6	206113	206118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457274
4049	NC_013715	GTC	3	9	206150	206158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457275
4050	NC_013715	GTT	2	6	206187	206192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457275
4051	NC_013715	GCT	2	6	206197	206202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457275
4052	NC_013715	CGGG	2	8	206260	206267	0 %	0 %	75 %	25 %	283457275
4053	NC_013715	AAG	2	6	206305	206310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457275
4054	NC_013715	TGG	2	6	206315	206320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457275
4055	NC_013715	TGC	2	6	206348	206353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457275
4056	NC_013715	CG	3	6	206368	206373	0 %	0 %	50 %	50 %	283457275
4057	NC_013715	CGC	2	6	206421	206426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457275
4058	NC_013715	TCT	2	6	206532	206537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457275
4059	NC_013715	T	6	6	206541	206546	0 %	100 %	0 %	0 %	283457275
4060	NC_013715	GGA	2	6	206547	206552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457275
4061	NC_013715	CGC	2	6	206572	206577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457275
4062	NC_013715	TGCGAT	2	12	206607	206618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	283457275
4063	NC_013715	TAT	2	6	207163	207168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457276
4064	NC_013715	ACC	2	6	207186	207191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457276
4065	NC_013715	TC	3	6	207198	207203	0 %	50 %	0 %	50 %	283457276
4066	NC_013715	TGA	2	6	207262	207267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457276
4067	NC_013715	CTT	2	6	207278	207283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457276
4068	NC_013715	AGGTTG	2	12	207318	207329	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	283457276
4069	NC_013715	ACT	2	6	207344	207349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457276
4070	NC_013715	GTT	2	6	207383	207388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457276
4071	NC_013715	GGA	2	6	207520	207525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457276
4072	NC_013715	GTC	2	6	207534	207539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457276
4073	NC_013715	CTG	2	6	207548	207553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457276
4074	NC_013715	TGG	2	6	207571	207576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457276
4075	NC_013715	TG	4	8	207632	207639	0 %	50 %	50 %	0 %	283457276
4076	NC_013715	TGC	2	6	207646	207651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457276
4077	NC_013715	TGC	2	6	207664	207669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457276
4078	NC_013715	GCT	2	6	207716	207721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457276
4079	NC_013715	TGA	2	6	207724	207729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457276
4080	NC_013715	ATT	2	6	207752	207757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457276
4081	NC_013715	AGT	2	6	207801	207806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457276
4082	NC_013715	GCCGC	2	10	208426	208435	0 %	0 %	40 %	60 %	283457277
4083	NC_013715	TGC	2	6	208586	208591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457277
4084	NC_013715	CAC	2	6	208644	208649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457277
4085	NC_013715	GAGTCG	2	12	208659	208670	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283457277
4086	NC_013715	CGC	2	6	208673	208678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457277
4087	NC_013715	GTA	2	6	208722	208727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457277
4088	NC_013715	TGAT	2	8	208825	208832	25 %	50 %	25 %	0 %	283457277
4089	NC_013715	CGC	2	6	208839	208844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457277
4090	NC_013715	GCT	2	6	208895	208900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457277
4091	NC_013715	TGG	2	6	208909	208914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457277
4092	NC_013715	TTC	2	6	208919	208924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457277
4093	NC_013715	GAG	2	6	208941	208946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457277
4094	NC_013715	CTG	2	6	208947	208952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457277
4095	NC_013715	TCG	2	6	209012	209017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457277
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4099	NC_013715	TTC	2	6	209298	209303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457278
4100	NC_013715	ATT	2	6	209347	209352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457278
4101	NC_013715	GCT	2	6	209431	209436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457278
4102	NC_013715	TGGC	2	8	209443	209450	0 %	25 %	50 %	25 %	283457278
4103	NC_013715	GTC	3	9	209481	209489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457278
4104	NC_013715	GAC	2	6	209508	209513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457278
4105	NC_013715	TAT	2	6	209595	209600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457278
4106	NC_013715	GC	3	6	209602	209607	0 %	0 %	50 %	50 %	283457278
4107	NC_013715	TGG	2	6	209642	209647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457278
4108	NC_013715	TGA	2	6	209687	209692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457278
4109	NC_013715	GC	3	6	209803	209808	0 %	0 %	50 %	50 %	283457278
4110	NC_013715	CAG	3	9	210922	210930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457279
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4112	NC_013715	ATG	2	6	210961	210966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457279
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4114	NC_013715	AGC	2	6	210998	211003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457279
4115	NC_013715	ATT	2	6	211045	211050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457279
4116	NC_013715	CTT	2	6	211065	211070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457279
4117	NC_013715	TGG	2	6	211078	211083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457279
4118	NC_013715	CAT	2	6	211176	211181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457279
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4120	NC_013715	GGT	2	6	211228	211233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457279
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4242	NC_013715	TCA	2	6	219102	219107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457287
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4244	NC_013715	CGC	2	6	219172	219177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457288
4245	NC_013715	TCA	2	6	219195	219200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457288
4246	NC_013715	CTG	2	6	219214	219219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457288
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4362	NC_013715	GCC	2	6	224667	224672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457292
4363	NC_013715	ATC	2	6	224703	224708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457292
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4480	NC_013715	CTG	2	6	231729	231734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457298
4481	NC_013715	GCTG	2	8	231740	231747	0 %	25 %	50 %	25 %	283457298
4482	NC_013715	GC	3	6	231749	231754	0 %	0 %	50 %	50 %	283457298
4483	NC_013715	GGT	2	6	231788	231793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457298
4484	NC_013715	CGC	2	6	231874	231879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457298
4485	NC_013715	GC	3	6	231942	231947	0 %	0 %	50 %	50 %	283457298
4486	NC_013715	GCA	2	6	232001	232006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457298
4487	NC_013715	GCG	2	6	232009	232014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457298
4488	NC_013715	GCGTG	2	10	232076	232085	0 %	20 %	60 %	20 %	283457298
4489	NC_013715	GAA	2	6	232193	232198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457298
4490	NC_013715	GCT	2	6	232232	232237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457298
4491	NC_013715	GCC	2	6	232245	232250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457298
4492	NC_013715	GCT	2	6	232263	232268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457298
4493	NC_013715	TGC	2	6	232343	232348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457298
4494	NC_013715	CG	3	6	232357	232362	0 %	0 %	50 %	50 %	283457298
4495	NC_013715	AAC	2	6	232428	232433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457298
4496	NC_013715	ATT	2	6	232539	232544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457298
4497	NC_013715	TTG	2	6	232564	232569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457298
4498	NC_013715	GTT	2	6	232599	232604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457298
4499	NC_013715	GAC	2	6	232631	232636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457298
4500	NC_013715	ACC	2	6	232654	232659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457298

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