MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 43738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_013715	AAC	2	6	2252801	2252806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458981
43502	NC_013715	GC	3	6	2252821	2252826	0 %	0 %	50 %	50 %	283458981
43503	NC_013715	CAC	2	6	2252835	2252840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458981
43504	NC_013715	ACG	2	6	2252927	2252932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458982
43505	NC_013715	GCA	2	6	2252953	2252958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458982
43506	NC_013715	GGC	2	6	2253094	2253099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458982
43507	NC_013715	ATC	2	6	2253127	2253132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43508	NC_013715	GGC	2	6	2253135	2253140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458982
43509	NC_013715	CGG	2	6	2253153	2253158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458982
43510	NC_013715	TCACCG	2	12	2253188	2253199	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283458982
43511	NC_013715	TCA	2	6	2253209	2253214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43512	NC_013715	CGCCTG	2	12	2253228	2253239	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	283458982
43513	NC_013715	CAT	2	6	2253243	2253248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43514	NC_013715	AAC	2	6	2253278	2253283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458982
43515	NC_013715	TCT	2	6	2253299	2253304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458982
43516	NC_013715	TCT	3	9	2253326	2253334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458982
43517	NC_013715	CAA	2	6	2253411	2253416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458982
43518	NC_013715	TCA	2	6	2253419	2253424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43519	NC_013715	CAACCC	2	12	2253474	2253485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458982
43520	NC_013715	CTC	2	6	2253537	2253542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458982
43521	NC_013715	TCA	2	6	2253554	2253559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43522	NC_013715	GC	3	6	2253642	2253647	0 %	0 %	50 %	50 %	283458982
43523	NC_013715	CGC	2	6	2253660	2253665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458982
43524	NC_013715	CAT	2	6	2253684	2253689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43525	NC_013715	CGC	2	6	2253723	2253728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458982
43526	NC_013715	CGC	2	6	2253756	2253761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458982
43527	NC_013715	CGA	2	6	2253891	2253896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458982
43528	NC_013715	TCT	2	6	2253956	2253961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458982
43529	NC_013715	GCG	3	9	2254010	2254018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458982
43530	NC_013715	GCA	2	6	2254027	2254032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458982
43531	NC_013715	CAT	2	6	2254035	2254040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43532	NC_013715	TCA	2	6	2254055	2254060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43533	NC_013715	ACGC	2	8	2254127	2254134	25 %	0 %	25 %	50 %	283458982
43534	NC_013715	CAT	3	9	2254164	2254172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43535	NC_013715	TCA	2	6	2254175	2254180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43536	NC_013715	GCA	2	6	2254189	2254194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458982
43537	NC_013715	TCA	2	6	2254268	2254273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43538	NC_013715	CCA	2	6	2254275	2254280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458982
43539	NC_013715	CCG	3	9	2254287	2254295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458982
43540	NC_013715	CTA	2	6	2254302	2254307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43541	NC_013715	CAC	2	6	2254341	2254346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458982
43542	NC_013715	CCTC	2	8	2254352	2254359	0 %	25 %	0 %	75 %	283458982
43543	NC_013715	CGG	2	6	2254365	2254370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458982
43544	NC_013715	GCT	2	6	2254392	2254397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458982
43545	NC_013715	CGG	2	6	2254398	2254403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458982
43546	NC_013715	ATC	2	6	2254447	2254452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43547	NC_013715	ACT	2	6	2254533	2254538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458982
43548	NC_013715	CGC	2	6	2254573	2254578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458982
43549	NC_013715	ACC	2	6	2254759	2254764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458983
43550	NC_013715	CA	3	6	2254833	2254838	50 %	0 %	0 %	50 %	283458983
43551	NC_013715	TCA	2	6	2254839	2254844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458983
43552	NC_013715	GTC	3	9	2254907	2254915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458983
43553	NC_013715	CTG	2	6	2254937	2254942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458983
43554	NC_013715	CG	3	6	2254955	2254960	0 %	0 %	50 %	50 %	283458983
43555	NC_013715	CAAC	2	8	2254965	2254972	50 %	0 %	0 %	50 %	283458983
43556	NC_013715	CTG	2	6	2255060	2255065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458983
43557	NC_013715	CTG	2	6	2255072	2255077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458983
43558	NC_013715	AGA	2	6	2255104	2255109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458983
43559	NC_013715	AGC	3	9	2255144	2255152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458983
43560	NC_013715	CCG	2	6	2255208	2255213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458983
43561	NC_013715	CCA	2	6	2255265	2255270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458983
43562	NC_013715	GACGAA	2	12	2255285	2255296	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	283458983
43563	NC_013715	GCA	2	6	2255333	2255338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458983
43564	NC_013715	CTG	2	6	2255342	2255347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458983
43565	NC_013715	TCG	2	6	2255355	2255360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458983
43566	NC_013715	CCGCA	2	10	2255409	2255418	20 %	0 %	20 %	60 %	283458983
43567	NC_013715	CGT	2	6	2255698	2255703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458983
43568	NC_013715	CAG	2	6	2255720	2255725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458983
43569	NC_013715	ACCGGC	2	12	2255729	2255740	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	283458983
43570	NC_013715	GTC	2	6	2255828	2255833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458983
43571	NC_013715	ATC	2	6	2255879	2255884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458983
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43573	NC_013715	AAT	2	6	2256149	2256154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458984
43574	NC_013715	AT	3	6	2256206	2256211	50 %	50 %	0 %	0 %	283458984
43575	NC_013715	GCC	2	6	2256248	2256253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458984
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43583	NC_013715	CAG	2	6	2256527	2256532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458984
43584	NC_013715	GAA	2	6	2256598	2256603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458984
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43586	NC_013715	ACC	2	6	2256653	2256658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458984
43587	NC_013715	CTT	3	9	2256742	2256750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458984
43588	NC_013715	CAAGGA	2	12	2256751	2256762	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	283458984
43589	NC_013715	CGG	3	9	2256775	2256783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458984
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43594	NC_013715	CCG	2	6	2256936	2256941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458984
43595	NC_013715	GCTG	2	8	2257006	2257013	0 %	25 %	50 %	25 %	283458984
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43598	NC_013715	GCA	2	6	2257225	2257230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458984
43599	NC_013715	CAG	2	6	2257315	2257320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458986
43600	NC_013715	GAA	2	6	2257353	2257358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458986
43601	NC_013715	GTC	2	6	2257558	2257563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458986
43602	NC_013715	AAG	2	6	2257564	2257569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458986
43603	NC_013715	CTGAGG	2	12	2257910	2257921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283458987
43604	NC_013715	CTC	2	6	2257970	2257975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458987
43605	NC_013715	TCT	2	6	2258008	2258013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458987
43606	NC_013715	CAG	2	6	2258051	2258056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458987
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43608	NC_013715	GA	3	6	2258076	2258081	50 %	0 %	50 %	0 %	283458987
43609	NC_013715	CGC	2	6	2258087	2258092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458987
43610	NC_013715	CAG	2	6	2258123	2258128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458987
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43612	NC_013715	CTC	2	6	2258201	2258206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458987
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43614	NC_013715	GCC	3	9	2258223	2258231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458987
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43727	NC_013715	TCG	2	6	2263314	2263319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458992
43728	NC_013715	TTC	2	6	2263376	2263381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458992
43729	NC_013715	GCG	2	6	2263550	2263555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458993
43730	NC_013715	ACCT	2	8	2263639	2263646	25 %	25 %	0 %	50 %	283458993
43731	NC_013715	GTT	2	6	2263649	2263654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458993
43732	NC_013715	CGGAA	2	10	2263710	2263719	40 %	0 %	40 %	20 %	283458993
43733	NC_013715	GCA	2	6	2263764	2263769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458993
43734	NC_013715	CGG	2	6	2263928	2263933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458994
43735	NC_013715	CG	3	6	2263945	2263950	0 %	0 %	50 %	50 %	283458994
43736	NC_013715	TACGCA	2	12	2263962	2263973	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	283458994
43737	NC_013715	CTT	2	6	2263987	2263992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458994
43738	NC_013715	CGG	2	6	2264000	2264005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458994

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