MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 43738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_013715	CGG	2	6	2146115	2146120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458911
41502	NC_013715	GCA	3	9	2146121	2146129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458911
41503	NC_013715	CGCGG	2	10	2146193	2146202	0 %	0 %	60 %	40 %	283458911
41504	NC_013715	GTA	2	6	2146323	2146328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458911
41505	NC_013715	GCT	2	6	2146352	2146357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458911
41506	NC_013715	CGA	2	6	2146379	2146384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458911
41507	NC_013715	CGC	2	6	2146431	2146436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458911
41508	NC_013715	GGT	2	6	2146446	2146451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458911
41509	NC_013715	TCA	2	6	2146523	2146528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458911
41510	NC_013715	GCA	2	6	2146559	2146564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458911
41511	NC_013715	GCG	2	6	2146571	2146576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458911
41512	NC_013715	GCA	2	6	2146589	2146594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458911
41513	NC_013715	CGA	2	6	2146598	2146603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458911
41514	NC_013715	CGT	2	6	2146655	2146660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458911
41515	NC_013715	CAC	2	6	2146794	2146799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458911
41516	NC_013715	GCC	2	6	2146809	2146814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458911
41517	NC_013715	TGA	2	6	2146844	2146849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458911
41518	NC_013715	GAA	2	6	2146893	2146898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458911
41519	NC_013715	TGG	2	6	2146901	2146906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458911
41520	NC_013715	ATG	2	6	2146915	2146920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458911
41521	NC_013715	CGG	2	6	2146927	2146932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458911
41522	NC_013715	GC	3	6	2146964	2146969	0 %	0 %	50 %	50 %	283458911
41523	NC_013715	GCG	3	9	2146975	2146983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458911
41524	NC_013715	GC	3	6	2147054	2147059	0 %	0 %	50 %	50 %	283458911
41525	NC_013715	CCG	2	6	2147095	2147100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458911
41526	NC_013715	GAT	2	6	2147118	2147123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458911
41527	NC_013715	GGT	2	6	2147218	2147223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458911
41528	NC_013715	GCT	2	6	2147232	2147237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458911
41529	NC_013715	GGC	2	6	2147242	2147247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458911
41530	NC_013715	TA	3	6	2147257	2147262	50 %	50 %	0 %	0 %	283458911
41531	NC_013715	GAGGT	2	10	2147266	2147275	20 %	20 %	60 %	0 %	283458911
41532	NC_013715	AC	3	6	2147288	2147293	50 %	0 %	0 %	50 %	283458911
41533	NC_013715	TCT	2	6	2147432	2147437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458912
41534	NC_013715	GCG	2	6	2147464	2147469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458912
41535	NC_013715	GCC	2	6	2147497	2147502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458912
41536	NC_013715	GC	3	6	2147512	2147517	0 %	0 %	50 %	50 %	283458912
41537	NC_013715	CTG	2	6	2147565	2147570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458912
41538	NC_013715	CGC	2	6	2147586	2147591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458912
41539	NC_013715	GGC	2	6	2147655	2147660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458912
41540	NC_013715	TTC	2	6	2147671	2147676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458912
41541	NC_013715	CGG	2	6	2147699	2147704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458912
41542	NC_013715	TGT	2	6	2147708	2147713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458912
41543	NC_013715	CGG	2	6	2147716	2147721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458912
41544	NC_013715	CAG	2	6	2147733	2147738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458912
41545	NC_013715	AGCG	2	8	2147745	2147752	25 %	0 %	50 %	25 %	283458912
41546	NC_013715	GCA	2	6	2147762	2147767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458912
41547	NC_013715	GCG	2	6	2147788	2147793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458912
41548	NC_013715	GCG	2	6	2147814	2147819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458912
41549	NC_013715	CGA	2	6	2147846	2147851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458912
41550	NC_013715	TTC	2	6	2147979	2147984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458912
41551	NC_013715	GGC	2	6	2148044	2148049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458912
41552	NC_013715	GC	3	6	2148067	2148072	0 %	0 %	50 %	50 %	283458912
41553	NC_013715	ATG	2	6	2148073	2148078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458912
41554	NC_013715	GCG	2	6	2148081	2148086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458912
41555	NC_013715	TCG	2	6	2148160	2148165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458912
41556	NC_013715	GAA	2	6	2148249	2148254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458912
41557	NC_013715	GCG	3	9	2148274	2148282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458912
41558	NC_013715	CTT	2	6	2148299	2148304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458912
41559	NC_013715	GGC	2	6	2148326	2148331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458912
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41565	NC_013715	CCA	2	6	2148550	2148555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458913
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41568	NC_013715	ACACCA	2	12	2148605	2148616	50 %	0 %	0 %	50 %	283458913
41569	NC_013715	CAG	2	6	2148629	2148634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458913
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41574	NC_013715	ACC	2	6	2148810	2148815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458913
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41579	NC_013715	ACCAA	2	10	2148964	2148973	60 %	0 %	0 %	40 %	283458913
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41583	NC_013715	ACT	2	6	2149099	2149104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458913
41584	NC_013715	ATT	2	6	2149116	2149121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283458913
41585	NC_013715	GAC	2	6	2149156	2149161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458913
41586	NC_013715	GGTTAG	2	12	2149217	2149228	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	283458913
41587	NC_013715	TAA	2	6	2149307	2149312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458913
41588	NC_013715	AT	3	6	2149391	2149396	50 %	50 %	0 %	0 %	283458913
41589	NC_013715	CAGAG	2	10	2149442	2149451	40 %	0 %	40 %	20 %	283458913
41590	NC_013715	GAT	2	6	2149470	2149475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458913
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41592	NC_013715	TAG	2	6	2149612	2149617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458913
41593	NC_013715	ATAG	2	8	2149690	2149697	50 %	25 %	25 %	0 %	283458913
41594	NC_013715	TGC	2	6	2149725	2149730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458913
41595	NC_013715	CT	3	6	2149842	2149847	0 %	50 %	0 %	50 %	283458913
41596	NC_013715	AGC	2	6	2149848	2149853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458913
41597	NC_013715	TTTGA	2	10	2149948	2149957	20 %	60 %	20 %	0 %	283458913
41598	NC_013715	ACA	2	6	2150008	2150013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458913
41599	NC_013715	CAA	2	6	2150024	2150029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458913
41600	NC_013715	CCA	2	6	2150047	2150052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458913
41601	NC_013715	AGA	2	6	2150196	2150201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458913
41602	NC_013715	CAC	2	6	2150220	2150225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458913
41603	NC_013715	CTTT	2	8	2150819	2150826	0 %	75 %	0 %	25 %	283458914
41604	NC_013715	GCT	2	6	2150866	2150871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458914
41605	NC_013715	GCC	2	6	2150943	2150948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458914
41606	NC_013715	AGA	2	6	2150949	2150954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458914
41607	NC_013715	GCT	2	6	2150962	2150967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458914
41608	NC_013715	ACC	2	6	2150970	2150975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458914
41609	NC_013715	CCTC	2	8	2150988	2150995	0 %	25 %	0 %	75 %	283458914
41610	NC_013715	TCTGGG	2	12	2151064	2151075	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	283458914
41611	NC_013715	CGC	2	6	2151164	2151169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458914
41612	NC_013715	GCT	2	6	2151197	2151202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458914
41613	NC_013715	GGC	2	6	2151223	2151228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458914
41614	NC_013715	CTG	2	6	2151260	2151265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458914
41615	NC_013715	CTG	2	6	2151281	2151286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458914
41616	NC_013715	AGC	2	6	2151291	2151296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458914
41617	NC_013715	ATT	2	6	2151395	2151400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283458914
41618	NC_013715	CAT	2	6	2151406	2151411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458914
41619	NC_013715	GATG	2	8	2151565	2151572	25 %	25 %	50 %	0 %	283458914
41620	NC_013715	CTT	2	6	2151592	2151597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458914
41621	NC_013715	GCG	2	6	2151614	2151619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458914
41622	NC_013715	GAGC	2	8	2151682	2151689	25 %	0 %	50 %	25 %	283458914
41623	NC_013715	A	6	6	2151841	2151846	100 %	0 %	0 %	0 %	283458915
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41634	NC_013715	CTG	2	6	2152149	2152154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458915
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41643	NC_013715	CG	3	6	2152797	2152802	0 %	0 %	50 %	50 %	283458915
41644	NC_013715	GCA	2	6	2152874	2152879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458915
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41710	NC_013715	GC	3	6	2156104	2156109	0 %	0 %	50 %	50 %	283458916
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41717	NC_013715	CGTG	2	8	2156409	2156416	0 %	25 %	50 %	25 %	283458917
41718	NC_013715	TGG	2	6	2156420	2156425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458917
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41722	NC_013715	GCT	2	6	2156586	2156591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458917
41723	NC_013715	GAA	2	6	2156652	2156657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458917
41724	NC_013715	CTT	2	6	2156664	2156669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458917
41725	NC_013715	GGGTCT	2	12	2156682	2156693	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	283458917
41726	NC_013715	CTA	2	6	2156706	2156711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458917
41727	NC_013715	GCG	2	6	2156740	2156745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458917
41728	NC_013715	GGC	2	6	2156817	2156822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458917
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