MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 43738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_013715	GTTC	2	8	2120544	2120551	0 %	50 %	25 %	25 %	283458889
41002	NC_013715	GGC	2	6	2120584	2120589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458889
41003	NC_013715	CGG	2	6	2120736	2120741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458890
41004	NC_013715	CTT	2	6	2120743	2120748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458890
41005	NC_013715	GGC	2	6	2120768	2120773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458890
41006	NC_013715	GCA	2	6	2120821	2120826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458890
41007	NC_013715	AGGG	2	8	2120850	2120857	25 %	0 %	75 %	0 %	283458890
41008	NC_013715	CTG	2	6	2120864	2120869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458890
41009	NC_013715	TTC	2	6	2120888	2120893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458890
41010	NC_013715	GAT	3	9	2120924	2120932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458890
41011	NC_013715	GGT	2	6	2120965	2120970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458890
41012	NC_013715	TCG	2	6	2121000	2121005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458890
41013	NC_013715	GTTTTT	2	12	2121015	2121026	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	283458890
41014	NC_013715	GCG	2	6	2121067	2121072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458890
41015	NC_013715	TCA	2	6	2121097	2121102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458890
41016	NC_013715	ATC	2	6	2121351	2121356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458891
41017	NC_013715	GAA	2	6	2121402	2121407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458891
41018	NC_013715	GCG	2	6	2121481	2121486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458891
41019	NC_013715	CAC	2	6	2121554	2121559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458891
41020	NC_013715	GCA	2	6	2121593	2121598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458891
41021	NC_013715	CGA	2	6	2121599	2121604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458891
41022	NC_013715	AGG	2	6	2121616	2121621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458891
41023	NC_013715	CAA	2	6	2121731	2121736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283458891
41024	NC_013715	GGC	2	6	2121786	2121791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458891
41025	NC_013715	TGG	2	6	2121802	2121807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458891
41026	NC_013715	CGG	2	6	2121823	2121828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458891
41027	NC_013715	TTC	2	6	2121843	2121848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458891
41028	NC_013715	CGG	2	6	2121863	2121868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458891
41029	NC_013715	GCT	3	9	2121914	2121922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458891
41030	NC_013715	GCC	2	6	2121959	2121964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458891
41031	NC_013715	CTG	2	6	2121975	2121980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458891
41032	NC_013715	GATGAG	2	12	2122002	2122013	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	283458891
41033	NC_013715	GAC	2	6	2122038	2122043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458891
41034	NC_013715	CGA	2	6	2122064	2122069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458891
41035	NC_013715	GGC	2	6	2122070	2122075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458891
41036	NC_013715	GCC	2	6	2122108	2122113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458891
41037	NC_013715	ACT	2	6	2122122	2122127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458891
41038	NC_013715	TGG	2	6	2122149	2122154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458891
41039	NC_013715	GCGG	2	8	2122366	2122373	0 %	0 %	75 %	25 %	283458892
41040	NC_013715	GC	3	6	2122415	2122420	0 %	0 %	50 %	50 %	283458892
41041	NC_013715	CGG	2	6	2122493	2122498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458892
41042	NC_013715	GAA	2	6	2122500	2122505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458892
41043	NC_013715	TCA	2	6	2122526	2122531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458892
41044	NC_013715	GCC	2	6	2122542	2122547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458892
41045	NC_013715	CGG	2	6	2122601	2122606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458892
41046	NC_013715	CGG	2	6	2122681	2122686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458892
41047	NC_013715	TGA	2	6	2122706	2122711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458892
41048	NC_013715	CCT	2	6	2122754	2122759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458892
41049	NC_013715	CGC	2	6	2122875	2122880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458892
41050	NC_013715	GTC	2	6	2122887	2122892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458892
41051	NC_013715	AGG	2	6	2122898	2122903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458892
41052	NC_013715	GTT	2	6	2122911	2122916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458892
41053	NC_013715	CAG	3	9	2122917	2122925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458892
41054	NC_013715	GGC	2	6	2122926	2122931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458892
41055	NC_013715	ACCG	2	8	2122968	2122975	25 %	0 %	25 %	50 %	283458892
41056	NC_013715	TGA	2	6	2122988	2122993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458892
41057	NC_013715	CAG	2	6	2123058	2123063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458892
41058	NC_013715	GTA	2	6	2123064	2123069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458892
41059	NC_013715	CAG	2	6	2123091	2123096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458892
41060	NC_013715	ACCGGC	2	12	2123106	2123117	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	283458892
41061	NC_013715	GCCCAT	2	12	2123121	2123132	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283458892
41062	NC_013715	GAC	2	6	2123166	2123171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458892
41063	NC_013715	CGA	2	6	2123177	2123182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458892
41064	NC_013715	TCGGA	2	10	2123215	2123224	20 %	20 %	40 %	20 %	283458892
41065	NC_013715	GC	3	6	2123261	2123266	0 %	0 %	50 %	50 %	283458892
41066	NC_013715	GCC	2	6	2123310	2123315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458892
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41068	NC_013715	GCC	2	6	2123365	2123370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458892
41069	NC_013715	CGA	2	6	2123372	2123377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458892
41070	NC_013715	AGG	2	6	2123408	2123413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458892
41071	NC_013715	GGGC	2	8	2123432	2123439	0 %	0 %	75 %	25 %	283458892
41072	NC_013715	GAG	2	6	2123473	2123478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283458892
41073	NC_013715	ATG	2	6	2123506	2123511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283458892
41074	NC_013715	TGG	2	6	2123537	2123542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458892
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41076	NC_013715	CGA	2	6	2123573	2123578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458892
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41080	NC_013715	GTT	2	6	2123751	2123756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283458892
41081	NC_013715	CTG	2	6	2123763	2123768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458892
41082	NC_013715	CCT	2	6	2124019	2124024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283458893
41083	NC_013715	AAT	2	6	2124158	2124163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458893
41084	NC_013715	GCG	2	6	2124164	2124169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458893
41085	NC_013715	CTT	2	6	2124172	2124177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458893
41086	NC_013715	TCG	2	6	2124246	2124251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458893
41087	NC_013715	TCT	2	6	2124357	2124362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283458893
41088	NC_013715	GGT	2	6	2124365	2124370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458893
41089	NC_013715	TAA	2	6	2124394	2124399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458893
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41094	NC_013715	CG	3	6	2124474	2124479	0 %	0 %	50 %	50 %	283458893
41095	NC_013715	GA	3	6	2124498	2124503	50 %	0 %	50 %	0 %	283458893
41096	NC_013715	CCG	2	6	2124522	2124527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458893
41097	NC_013715	GCT	2	6	2124577	2124582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458893
41098	NC_013715	AAT	2	6	2124611	2124616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283458893
41099	NC_013715	CGC	2	6	2124647	2124652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283458893
41100	NC_013715	CCA	2	6	2124670	2124675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458893
41101	NC_013715	GAA	2	6	2124718	2124723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458893
41102	NC_013715	CAT	2	6	2124724	2124729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283458893
41103	NC_013715	GCG	2	6	2124879	2124884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458893
41104	NC_013715	ACC	2	6	2124885	2124890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458893
41105	NC_013715	CCA	2	6	2124895	2124900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458893
41106	NC_013715	GAA	2	6	2124947	2124952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458893
41107	NC_013715	CGCA	2	8	2125010	2125017	25 %	0 %	25 %	50 %	283458893
41108	NC_013715	GGCCA	2	10	2125040	2125049	20 %	0 %	40 %	40 %	283458893
41109	NC_013715	GAA	3	9	2125073	2125081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283458893
41110	NC_013715	ACC	2	6	2125115	2125120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283458893
41111	NC_013715	GTG	2	6	2125155	2125160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458893
41112	NC_013715	CGT	2	6	2125162	2125167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283458893
41113	NC_013715	GTG	2	6	2125191	2125196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283458893
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41232	NC_013715	CAG	2	6	2132820	2132825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458901
41233	NC_013715	CGG	2	6	2132905	2132910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283458901
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41341	NC_013715	CAG	2	6	2137571	2137576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458904
41342	NC_013715	AGCC	2	8	2137580	2137587	25 %	0 %	25 %	50 %	283458904
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41463	NC_013715	GCA	2	6	2143734	2143739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283458909
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