MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 43738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_013715	AGC	2	6	849560	849565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457842
16503	NC_013715	CTT	2	6	849584	849589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457842
16504	NC_013715	CCG	2	6	849660	849665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457842
16505	NC_013715	GCGT	2	8	849677	849684	0 %	25 %	50 %	25 %	283457842
16506	NC_013715	GTA	2	6	849722	849727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457842
16507	NC_013715	CGG	2	6	849728	849733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457842
16508	NC_013715	CTC	2	6	849755	849760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457842
16509	NC_013715	GGT	2	6	849781	849786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457842
16510	NC_013715	CTT	2	6	849818	849823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457842
16511	NC_013715	TGG	2	6	849828	849833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457842
16512	NC_013715	CTT	2	6	849947	849952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457842
16513	NC_013715	GTC	2	6	849953	849958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457842
16514	NC_013715	TCG	2	6	849990	849995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457842
16515	NC_013715	GAA	2	6	850037	850042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457842
16516	NC_013715	TCA	2	6	850108	850113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457842
16517	NC_013715	CTT	2	6	850139	850144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457842
16518	NC_013715	AGC	2	6	850146	850151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457842
16519	NC_013715	TCG	2	6	850152	850157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457842
16520	NC_013715	TGA	2	6	850180	850185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457842
16521	NC_013715	GAA	2	6	850205	850210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457842
16522	NC_013715	GAC	2	6	850280	850285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457842
16523	NC_013715	CAGC	2	8	850315	850322	25 %	0 %	25 %	50 %	283457842
16524	NC_013715	CAC	2	6	850330	850335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457842
16525	NC_013715	TGC	2	6	850383	850388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457842
16526	NC_013715	TTG	2	6	850425	850430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457842
16527	NC_013715	TGG	2	6	850440	850445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457842
16528	NC_013715	TCT	2	6	850549	850554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457842
16529	NC_013715	GAG	2	6	850626	850631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457842
16530	NC_013715	GAA	2	6	850640	850645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457842
16531	NC_013715	GGT	2	6	850666	850671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457842
16532	NC_013715	GAA	2	6	850682	850687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457842
16533	NC_013715	CCA	2	6	850743	850748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457842
16534	NC_013715	CTT	2	6	850760	850765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457842
16535	NC_013715	TGC	2	6	850787	850792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457842
16536	NC_013715	TCA	2	6	850833	850838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457842
16537	NC_013715	GCT	2	6	850852	850857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457842
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16539	NC_013715	TCT	2	6	851019	851024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457842
16540	NC_013715	CT	3	6	851101	851106	0 %	50 %	0 %	50 %	283457843
16541	NC_013715	CGCC	2	8	851125	851132	0 %	0 %	25 %	75 %	283457843
16542	NC_013715	GTT	2	6	851137	851142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457843
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16544	NC_013715	CTA	2	6	851208	851213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457843
16545	NC_013715	CT	3	6	851232	851237	0 %	50 %	0 %	50 %	283457843
16546	NC_013715	AAG	2	6	851851	851856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457844
16547	NC_013715	AGA	2	6	851957	851962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457844
16548	NC_013715	CTG	2	6	851971	851976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457844
16549	NC_013715	TCG	2	6	852029	852034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457844
16550	NC_013715	CGC	2	6	852052	852057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457844
16551	NC_013715	GGCG	2	8	852075	852082	0 %	0 %	75 %	25 %	283457844
16552	NC_013715	AGC	2	6	852104	852109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457844
16553	NC_013715	C	6	6	852113	852118	0 %	0 %	0 %	100 %	283457844
16554	NC_013715	CAT	3	9	852135	852143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457844
16555	NC_013715	CGG	2	6	852147	852152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457844
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16557	NC_013715	GC	3	6	852186	852191	0 %	0 %	50 %	50 %	283457844
16558	NC_013715	GGT	2	6	852235	852240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457844
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16560	NC_013715	CGG	2	6	852276	852281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457844
16561	NC_013715	CCG	2	6	852284	852289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457844
16562	NC_013715	CTG	2	6	852357	852362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457844
16563	NC_013715	CTG	2	6	852460	852465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457844
16564	NC_013715	GCAG	2	8	852495	852502	25 %	0 %	50 %	25 %	283457844
16565	NC_013715	CTC	3	9	852723	852731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457844
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16567	NC_013715	CATCG	2	10	852933	852942	20 %	20 %	20 %	40 %	283457844
16568	NC_013715	CAT	2	6	852960	852965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457844
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16570	NC_013715	CAT	2	6	852987	852992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457844
16571	NC_013715	GCT	2	6	852994	852999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457844
16572	NC_013715	TGA	2	6	853005	853010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457844
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16575	NC_013715	TTCC	2	8	853067	853074	0 %	50 %	0 %	50 %	283457844
16576	NC_013715	GTG	2	6	853084	853089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457844
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16579	NC_013715	CGA	2	6	853233	853238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457844
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16587	NC_013715	CGT	2	6	853787	853792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457845
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16590	NC_013715	GA	3	6	853909	853914	50 %	0 %	50 %	0 %	283457845
16591	NC_013715	GCA	2	6	854026	854031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457845
16592	NC_013715	TTCCCT	2	12	854091	854102	0 %	50 %	0 %	50 %	283457845
16593	NC_013715	CAA	2	6	854143	854148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457845
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16595	NC_013715	CT	3	6	854197	854202	0 %	50 %	0 %	50 %	283457846
16596	NC_013715	TGCG	2	8	854222	854229	0 %	25 %	50 %	25 %	283457846
16597	NC_013715	TCGGGC	2	12	854241	854252	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283457846
16598	NC_013715	AAACGC	2	12	854280	854291	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	283457846
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16600	NC_013715	CTT	2	6	854479	854484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457846
16601	NC_013715	CCT	2	6	854487	854492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457846
16602	NC_013715	AGC	2	6	854497	854502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457846
16603	NC_013715	CA	3	6	854504	854509	50 %	0 %	0 %	50 %	283457846
16604	NC_013715	GAA	2	6	854519	854524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457846
16605	NC_013715	CAG	2	6	854554	854559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457846
16606	NC_013715	AGC	2	6	854690	854695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457846
16607	NC_013715	CAA	2	6	854718	854723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457846
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16609	NC_013715	GGT	2	6	854845	854850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457846
16610	NC_013715	TGG	2	6	854862	854867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457846
16611	NC_013715	GGT	2	6	854911	854916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457846
16612	NC_013715	GC	3	6	854996	855001	0 %	0 %	50 %	50 %	283457846
16613	NC_013715	AGC	2	6	855002	855007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457846
16614	NC_013715	AGC	2	6	855064	855069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457846
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16617	NC_013715	GCC	2	6	855124	855129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457846
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