MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 43738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013715	GTG	2	6	232662	232667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457298
4502	NC_013715	GAG	2	6	232716	232721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457298
4503	NC_013715	TGC	2	6	232729	232734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457298
4504	NC_013715	GGC	2	6	232745	232750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457298
4505	NC_013715	CGG	2	6	232967	232972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457299
4506	NC_013715	CCG	2	6	232994	232999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457299
4507	NC_013715	CAG	2	6	233032	233037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457299
4508	NC_013715	CAG	2	6	233044	233049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457299
4509	NC_013715	C	6	6	233066	233071	0 %	0 %	0 %	100 %	283457299
4510	NC_013715	CAGGGA	2	12	233083	233094	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	283457299
4511	NC_013715	GAT	2	6	233146	233151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457299
4512	NC_013715	CGC	2	6	233221	233226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457299
4513	NC_013715	CCA	2	6	233235	233240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457299
4514	NC_013715	GAA	2	6	233248	233253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457299
4515	NC_013715	ACC	2	6	233318	233323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457299
4516	NC_013715	GGTCAG	2	12	233353	233364	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283457299
4517	NC_013715	CAGC	2	8	233413	233420	25 %	0 %	25 %	50 %	283457299
4518	NC_013715	GCG	2	6	233483	233488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457299
4519	NC_013715	GCGGGG	2	12	233522	233533	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	283457299
4520	NC_013715	TCA	2	6	233546	233551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457299
4521	NC_013715	CCG	2	6	233553	233558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457299
4522	NC_013715	CCG	2	6	233654	233659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457299
4523	NC_013715	GCC	2	6	233795	233800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457299
4524	NC_013715	GGA	2	6	233839	233844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457299
4525	NC_013715	CG	3	6	233865	233870	0 %	0 %	50 %	50 %	283457299
4526	NC_013715	GCG	2	6	233884	233889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457299
4527	NC_013715	CTC	2	6	233902	233907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457299
4528	NC_013715	GTC	2	6	233929	233934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457299
4529	NC_013715	GGA	2	6	233935	233940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457299
4530	NC_013715	GCC	2	6	233945	233950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457299
4531	NC_013715	CGC	2	6	233980	233985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457299
4532	NC_013715	GCT	2	6	233997	234002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457299
4533	NC_013715	GTT	2	6	234010	234015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457299
4534	NC_013715	GTG	2	6	234056	234061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457301
4535	NC_013715	GC	3	6	234078	234083	0 %	0 %	50 %	50 %	283457301
4536	NC_013715	CTT	2	6	234105	234110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457301
4537	NC_013715	CAC	2	6	234193	234198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457301
4538	NC_013715	GAC	2	6	234226	234231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457301
4539	NC_013715	CGC	2	6	234270	234275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457301
4540	NC_013715	GAT	2	6	234280	234285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457301
4541	NC_013715	AGT	2	6	234342	234347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457301
4542	NC_013715	GGGT	2	8	234371	234378	0 %	25 %	75 %	0 %	283457301
4543	NC_013715	TGC	2	6	234399	234404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457301
4544	NC_013715	GAA	2	6	234466	234471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457301
4545	NC_013715	GCCTGC	2	12	234578	234589	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	283457301
4546	NC_013715	CGC	2	6	234591	234596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457301
4547	NC_013715	TTC	2	6	234607	234612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457301
4548	NC_013715	TGG	2	6	234621	234626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457301
4549	NC_013715	GCG	2	6	234650	234655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457301
4550	NC_013715	GGGC	2	8	234948	234955	0 %	0 %	75 %	25 %	283457303
4551	NC_013715	GAA	2	6	234979	234984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457303
4552	NC_013715	AGA	2	6	235045	235050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457303
4553	NC_013715	GCG	2	6	235068	235073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457303
4554	NC_013715	GC	3	6	235105	235110	0 %	0 %	50 %	50 %	283457303
4555	NC_013715	GAA	2	6	235136	235141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457303
4556	NC_013715	GGC	2	6	235232	235237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457303
4557	NC_013715	GCG	2	6	235296	235301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457303
4558	NC_013715	GCG	2	6	235377	235382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457303
4559	NC_013715	TGG	2	6	235414	235419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457303
4560	NC_013715	TG	3	6	235490	235495	0 %	50 %	50 %	0 %	283457303
4561	NC_013715	CGG	2	6	235528	235533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457303
4562	NC_013715	GC	3	6	235621	235626	0 %	0 %	50 %	50 %	283457303
4563	NC_013715	AGCG	2	8	235692	235699	25 %	0 %	50 %	25 %	283457303
4564	NC_013715	CGC	2	6	235716	235721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457303
4565	NC_013715	GCT	2	6	235742	235747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457303
4566	NC_013715	TGA	2	6	235850	235855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457303
4567	NC_013715	GAA	2	6	235988	235993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457303
4568	NC_013715	CCCG	2	8	235996	236003	0 %	0 %	25 %	75 %	283457303
4569	NC_013715	TTC	2	6	236008	236013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457303
4570	NC_013715	CCG	2	6	236022	236027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457303
4571	NC_013715	CCG	2	6	236033	236038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457303
4572	NC_013715	GAA	2	6	236054	236059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457303
4573	NC_013715	GCGTG	2	10	236060	236069	0 %	20 %	60 %	20 %	283457303
4574	NC_013715	GCC	2	6	236114	236119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457303
4575	NC_013715	GGA	2	6	236138	236143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457303
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4577	NC_013715	TGG	2	6	236161	236166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457303
4578	NC_013715	GC	3	6	236188	236193	0 %	0 %	50 %	50 %	283457303
4579	NC_013715	GTTCC	2	10	236247	236256	0 %	40 %	20 %	40 %	283457303
4580	NC_013715	GTG	2	6	236274	236279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457303
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4584	NC_013715	GAGGTT	2	12	236514	236525	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	283457303
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4587	NC_013715	GTC	2	6	236562	236567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457303
4588	NC_013715	CCG	2	6	236581	236586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457303
4589	NC_013715	GCC	2	6	236616	236621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457303
4590	NC_013715	GTG	2	6	236631	236636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457303
4591	NC_013715	CGC	2	6	236694	236699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457303
4592	NC_013715	GTG	3	9	236703	236711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457303
4593	NC_013715	AGC	2	6	236764	236769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457303
4594	NC_013715	AGT	2	6	236794	236799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457303
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4596	NC_013715	GAA	2	6	237117	237122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457304
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4598	NC_013715	CCA	2	6	237179	237184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457304
4599	NC_013715	CTC	3	9	237186	237194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457304
4600	NC_013715	TCC	2	6	237196	237201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457304
4601	NC_013715	AAG	2	6	237214	237219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457304
4602	NC_013715	CAA	2	6	237252	237257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457304
4603	NC_013715	GAAG	2	8	237264	237271	50 %	0 %	50 %	0 %	283457304
4604	NC_013715	AAG	2	6	237277	237282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457304
4605	NC_013715	AAG	2	6	237469	237474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457304
4606	NC_013715	GCG	2	6	237503	237508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457304
4607	NC_013715	CG	3	6	237544	237549	0 %	0 %	50 %	50 %	283457304
4608	NC_013715	GCT	2	6	237555	237560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457304
4609	NC_013715	CACC	2	8	237605	237612	25 %	0 %	0 %	75 %	283457304
4610	NC_013715	CGA	2	6	237615	237620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457304
4611	NC_013715	CTG	2	6	237692	237697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457304
4612	NC_013715	GTC	2	6	237706	237711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457304
4613	NC_013715	AAC	2	6	237712	237717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457304
4614	NC_013715	GAC	2	6	237766	237771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457304
4615	NC_013715	GACC	2	8	237777	237784	25 %	0 %	25 %	50 %	283457304
4616	NC_013715	GAC	2	6	237835	237840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457304
4617	NC_013715	AAG	2	6	237850	237855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457304
4618	NC_013715	TGT	2	6	237891	237896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457304
4619	NC_013715	CGA	2	6	237942	237947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457304
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4621	NC_013715	GC	3	6	237984	237989	0 %	0 %	50 %	50 %	283457304
4622	NC_013715	AAG	2	6	237991	237996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457304
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4635	NC_013715	CTG	3	9	238668	238676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457305
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4851	NC_013715	GAAG	2	8	248221	248228	50 %	0 %	50 %	0 %	283457314
4852	NC_013715	CGC	2	6	248233	248238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457314
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4859	NC_013715	TGCCGC	2	12	248575	248586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	283457314
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4862	NC_013715	GCC	2	6	248687	248692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457314
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4865	NC_013715	TGGCT	2	10	249050	249059	0 %	40 %	40 %	20 %	283457314
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4983	NC_013715	ACG	2	6	254804	254809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457320
4984	NC_013715	GCG	2	6	254818	254823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457320
4985	NC_013715	GCA	2	6	254857	254862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457320
4986	NC_013715	GC	3	6	254876	254881	0 %	0 %	50 %	50 %	283457320
4987	NC_013715	CAG	2	6	254894	254899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457320
4988	NC_013715	CCA	2	6	254902	254907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457320
4989	NC_013715	TCC	2	6	254955	254960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457320
4990	NC_013715	AGC	2	6	255018	255023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457320
4991	NC_013715	TCA	2	6	255033	255038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457320
4992	NC_013715	ACAGG	2	10	255044	255053	40 %	0 %	40 %	20 %	283457320
4993	NC_013715	GGGGT	2	10	255174	255183	0 %	20 %	80 %	0 %	283457320
4994	NC_013715	AAT	2	6	255197	255202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457320
4995	NC_013715	GCG	2	6	255227	255232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457320
4996	NC_013715	CGG	2	6	255250	255255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457320
4997	NC_013715	CGC	2	6	255278	255283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457320
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4999	NC_013715	TGC	2	6	255341	255346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457320
5000	NC_013715	TCT	2	6	255468	255473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457320

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