MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 43738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013715	GC	3	6	19	24	0 %	0 %	50 %	50 %	283457090
2	NC_013715	GCC	2	6	49	54	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457090
3	NC_013715	CGG	2	6	59	64	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457090
4	NC_013715	TTC	2	6	120	125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457090
5	NC_013715	TCA	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457090
6	NC_013715	GAG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457090
7	NC_013715	GAT	2	6	258	263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457090
8	NC_013715	CCG	2	6	368	373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457090
9	NC_013715	CG	3	6	377	382	0 %	0 %	50 %	50 %	283457090
10	NC_013715	TAC	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457090
11	NC_013715	TGA	2	6	438	443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457090
12	NC_013715	CCCT	2	8	457	464	0 %	25 %	0 %	75 %	283457090
13	NC_013715	GCA	2	6	504	509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
14	NC_013715	GCT	2	6	511	516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457090
15	NC_013715	CGG	2	6	581	586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457090
16	NC_013715	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
17	NC_013715	AGC	2	6	740	745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
18	NC_013715	CGG	2	6	777	782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457090
19	NC_013715	CTG	2	6	805	810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457090
20	NC_013715	GAG	2	6	874	879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457090
21	NC_013715	TGA	3	9	909	917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457090
22	NC_013715	TCG	2	6	922	927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457090
23	NC_013715	TTC	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457090
24	NC_013715	CGA	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
25	NC_013715	GGA	2	6	1005	1010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457090
26	NC_013715	TTC	2	6	1012	1017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457090
27	NC_013715	ACC	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457090
28	NC_013715	GCC	2	6	1074	1079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457090
29	NC_013715	AGC	2	6	1082	1087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
30	NC_013715	TTCGG	2	10	1120	1129	0 %	40 %	40 %	20 %	283457090
31	NC_013715	GAA	2	6	1185	1190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457090
32	NC_013715	GCC	2	6	1300	1305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457090
33	NC_013715	GAA	2	6	1311	1316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457090
34	NC_013715	GCC	2	6	1317	1322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457090
35	NC_013715	CT	3	6	1369	1374	0 %	50 %	0 %	50 %	283457090
36	NC_013715	GGT	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457090
37	NC_013715	TCT	2	6	1509	1514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457090
38	NC_013715	GGC	2	6	1561	1566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457090
39	NC_013715	ACG	2	6	1576	1581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
40	NC_013715	GC	3	6	1607	1612	0 %	0 %	50 %	50 %	283457090
41	NC_013715	AGC	2	6	1676	1681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
42	NC_013715	GC	3	6	1680	1685	0 %	0 %	50 %	50 %	283457090
43	NC_013715	CTG	2	6	2593	2598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457091
44	NC_013715	GCT	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457091
45	NC_013715	ACCG	2	8	3001	3008	25 %	0 %	25 %	50 %	283457091
46	NC_013715	GGC	2	6	3063	3068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457091
47	NC_013715	TGC	2	6	3071	3076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457091
48	NC_013715	CGC	2	6	3184	3189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457091
49	NC_013715	ACC	2	6	3190	3195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457091
50	NC_013715	GGT	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457091
51	NC_013715	GCT	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457091
52	NC_013715	GCCG	2	8	3373	3380	0 %	0 %	50 %	50 %	283457091
53	NC_013715	TGA	2	6	3384	3389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457091
54	NC_013715	TGA	2	6	3429	3434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457091
55	NC_013715	GTTC	2	8	3495	3502	0 %	50 %	25 %	25 %	283457091
56	NC_013715	CTG	2	6	3589	3594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457091
57	NC_013715	GCC	2	6	3633	3638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457092
58	NC_013715	CG	3	6	3640	3645	0 %	0 %	50 %	50 %	283457092
59	NC_013715	GTT	2	6	3758	3763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457092
60	NC_013715	CTG	2	6	3783	3788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457092
61	NC_013715	GCCT	2	8	3790	3797	0 %	25 %	25 %	50 %	283457092
62	NC_013715	CGG	2	6	3802	3807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457092
63	NC_013715	TTG	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457092
64	NC_013715	GCG	2	6	3873	3878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457092
65	NC_013715	CT	3	6	3882	3887	0 %	50 %	0 %	50 %	283457092
66	NC_013715	CGGG	2	8	3921	3928	0 %	0 %	75 %	25 %	283457092
67	NC_013715	CG	3	6	3934	3939	0 %	0 %	50 %	50 %	283457092
68	NC_013715	GCA	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457092
69	NC_013715	GTGC	2	8	4044	4051	0 %	25 %	50 %	25 %	283457092
70	NC_013715	GGA	2	6	4094	4099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457092
71	NC_013715	CGG	2	6	4123	4128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457092
72	NC_013715	GTC	3	9	4129	4137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457092
73	NC_013715	GGT	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457092
74	NC_013715	GCT	2	6	4226	4231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457092
75	NC_013715	CG	3	6	4250	4255	0 %	0 %	50 %	50 %	283457092
76	NC_013715	AGC	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457092
77	NC_013715	GCT	2	6	4319	4324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457092
78	NC_013715	T	6	6	4352	4357	0 %	100 %	0 %	0 %	283457092
79	NC_013715	CGC	2	6	4368	4373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457092
80	NC_013715	GACG	2	8	4388	4395	25 %	0 %	50 %	25 %	283457092
81	NC_013715	T	6	6	4432	4437	0 %	100 %	0 %	0 %	283457092
82	NC_013715	TCGA	2	8	4455	4462	25 %	25 %	25 %	25 %	283457092
83	NC_013715	GCG	2	6	4467	4472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457092
84	NC_013715	AGG	2	6	4495	4500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457092
85	NC_013715	GCGTG	2	10	4544	4553	0 %	20 %	60 %	20 %	283457092
86	NC_013715	CTG	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457092
87	NC_013715	GGT	2	6	4596	4601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457092
88	NC_013715	CTC	2	6	4694	4699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457092
89	NC_013715	TTC	2	6	4706	4711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457092
90	NC_013715	GATTCT	2	12	4715	4726	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	283457092
91	NC_013715	TGA	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457092
92	NC_013715	GC	3	6	4755	4760	0 %	0 %	50 %	50 %	283457092
93	NC_013715	GGA	2	6	4835	4840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457092
94	NC_013715	CGG	2	6	4870	4875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457092
95	NC_013715	GC	3	6	4877	4882	0 %	0 %	50 %	50 %	283457092
96	NC_013715	TTC	2	6	6041	6046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457093
97	NC_013715	CAT	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457093
98	NC_013715	CAG	2	6	6109	6114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457093
99	NC_013715	CAC	2	6	6214	6219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457093
100	NC_013715	CGA	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457093
101	NC_013715	GGC	4	12	6418	6429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457093
102	NC_013715	TGG	2	6	6441	6446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457093
103	NC_013715	GTG	2	6	6469	6474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457093
104	NC_013715	GGT	2	6	6547	6552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457093
105	NC_013715	GC	3	6	6666	6671	0 %	0 %	50 %	50 %	283457093
106	NC_013715	CAG	2	6	6679	6684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457093
107	NC_013715	TCG	2	6	6740	6745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457093
108	NC_013715	AG	3	6	6762	6767	50 %	0 %	50 %	0 %	283457093
109	NC_013715	GAA	2	6	6771	6776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457093
110	NC_013715	GAG	2	6	6901	6906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457093
111	NC_013715	CG	3	6	7083	7088	0 %	0 %	50 %	50 %	283457093
112	NC_013715	CGTG	2	8	7137	7144	0 %	25 %	50 %	25 %	283457093
113	NC_013715	AGACCA	2	12	7199	7210	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	283457093
114	NC_013715	CCG	2	6	7325	7330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457093
115	NC_013715	GAC	2	6	7365	7370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457093
116	NC_013715	CCG	2	6	7371	7376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457093
117	NC_013715	CTG	2	6	7384	7389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457093
118	NC_013715	CTC	2	6	7425	7430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457093
119	NC_013715	TGG	2	6	7460	7465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457093
120	NC_013715	GGT	2	6	7480	7485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457093
121	NC_013715	GC	3	6	7557	7562	0 %	0 %	50 %	50 %	283457093
122	NC_013715	GAT	2	6	7602	7607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457093
123	NC_013715	GAC	2	6	7633	7638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457093
124	NC_013715	CTG	3	9	7717	7725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457093
125	NC_013715	GCC	2	6	7785	7790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457093
126	NC_013715	TGA	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457093
127	NC_013715	GTG	2	6	7868	7873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457093
128	NC_013715	GAA	2	6	7878	7883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457093
129	NC_013715	ACC	2	6	7960	7965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457093
130	NC_013715	CGC	2	6	7978	7983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457093
131	NC_013715	CTG	2	6	7987	7992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457093
132	NC_013715	GCG	2	6	8014	8019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457093
133	NC_013715	TCT	2	6	8030	8035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457093
134	NC_013715	CAG	2	6	8080	8085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457093
135	NC_013715	TA	3	6	8161	8166	50 %	50 %	0 %	0 %	283457094
136	NC_013715	CGAG	2	8	8169	8176	25 %	0 %	50 %	25 %	283457094
137	NC_013715	GAA	2	6	8204	8209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457094
138	NC_013715	CAG	2	6	8210	8215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457094
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140	NC_013715	TTA	2	6	8343	8348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457095
141	NC_013715	CCG	2	6	8395	8400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457095
142	NC_013715	ACG	2	6	8418	8423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457095
143	NC_013715	ACG	2	6	8601	8606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457095
144	NC_013715	ACG	2	6	8706	8711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457095
145	NC_013715	CG	3	6	8740	8745	0 %	0 %	50 %	50 %	283457095
146	NC_013715	CTG	2	6	8756	8761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457095
147	NC_013715	TTC	2	6	8770	8775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457095
148	NC_013715	CCG	2	6	8807	8812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457095
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150	NC_013715	CCA	2	6	8868	8873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457095
151	NC_013715	ATG	2	6	8874	8879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457095
152	NC_013715	GCT	2	6	8881	8886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457095
153	NC_013715	GC	3	6	8900	8905	0 %	0 %	50 %	50 %	283457095
154	NC_013715	CGTAC	2	10	8967	8976	20 %	20 %	20 %	40 %	283457095
155	NC_013715	GC	3	6	8998	9003	0 %	0 %	50 %	50 %	283457095
156	NC_013715	GGT	2	6	9004	9009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457095
157	NC_013715	GGA	2	6	9016	9021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457095
158	NC_013715	CCTG	2	8	9036	9043	0 %	25 %	25 %	50 %	283457095
159	NC_013715	TCA	2	6	9105	9110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457095
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161	NC_013715	TTG	2	6	9279	9284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457095
162	NC_013715	TCGT	2	8	9354	9361	0 %	50 %	25 %	25 %	283457095
163	NC_013715	GGA	2	6	9388	9393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457095
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168	NC_013715	GGCTCA	2	12	9523	9534	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283457095
169	NC_013715	CGT	2	6	9557	9562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457095
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249	NC_013715	GTGA	2	8	14396	14403	25 %	25 %	50 %	0 %	283457099
250	NC_013715	TCG	2	6	14425	14430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457099
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252	NC_013715	ACCCCG	2	12	14444	14455	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	283457099
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258	NC_013715	AG	3	6	14808	14813	50 %	0 %	50 %	0 %	283457100
259	NC_013715	ACTC	2	8	14814	14821	25 %	25 %	0 %	50 %	283457100
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261	NC_013715	TCT	2	6	14874	14879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457100
262	NC_013715	AAG	2	6	14923	14928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457100
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265	NC_013715	GGA	2	6	14966	14971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457100
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370	NC_013715	GAC	2	6	20076	20081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457106
371	NC_013715	CCT	2	6	20099	20104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457106
372	NC_013715	CTC	2	6	20118	20123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457106
373	NC_013715	CTC	2	6	20127	20132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457106
374	NC_013715	CCGC	2	8	20134	20141	0 %	0 %	25 %	75 %	283457106
375	NC_013715	CAGC	2	8	20222	20229	25 %	0 %	25 %	50 %	283457106
376	NC_013715	GC	3	6	20228	20233	0 %	0 %	50 %	50 %	283457106
377	NC_013715	AAT	2	6	20256	20261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457106
378	NC_013715	GCCA	2	8	20295	20302	25 %	0 %	25 %	50 %	283457106
379	NC_013715	GCA	2	6	20330	20335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457106
380	NC_013715	GCA	2	6	20369	20374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457106
381	NC_013715	AAG	2	6	20413	20418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457106
382	NC_013715	AGC	2	6	20522	20527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457106
383	NC_013715	GCAC	2	8	20542	20549	25 %	0 %	25 %	50 %	283457106
384	NC_013715	CAGA	2	8	20663	20670	50 %	0 %	25 %	25 %	283457106
385	NC_013715	CGT	2	6	20682	20687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457106
386	NC_013715	CGC	2	6	20724	20729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457107
387	NC_013715	CTT	2	6	20755	20760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457107
388	NC_013715	TTG	2	6	20765	20770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457107
389	NC_013715	CGT	2	6	20838	20843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457107
390	NC_013715	TCC	2	6	20876	20881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457107
391	NC_013715	GAC	2	6	20971	20976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457107
392	NC_013715	CCA	2	6	20978	20983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457107
393	NC_013715	CTG	2	6	21007	21012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457107
394	NC_013715	CTG	2	6	21019	21024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457107
395	NC_013715	TCC	2	6	21040	21045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457107
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410	NC_013715	TCA	2	6	22515	22520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457110
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430	NC_013715	CGCA	2	8	23012	23019	25 %	0 %	25 %	50 %	283457110
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471	NC_013715	TCC	2	6	25027	25032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457112
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495	NC_013715	CAT	2	6	26088	26093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457113
496	NC_013715	CTTC	2	8	26103	26110	0 %	50 %	0 %	50 %	283457113
497	NC_013715	CGC	2	6	26111	26116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
498	NC_013715	GCC	2	6	26159	26164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
499	NC_013715	CCG	2	6	26201	26206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
500	NC_013715	TGG	2	6	26239	26244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457113

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