MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 plasmid pRMAR01

Total Repeats: 1961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013502	GTG	2	6	91812	91817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318417
1502	NC_013502	GCA	2	6	91853	91858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318417
1503	NC_013502	CGGAG	2	10	91964	91973	20 %	0 %	60 %	20 %	268318417
1504	NC_013502	AGC	2	6	91993	91998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318417
1505	NC_013502	AGC	2	6	92032	92037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318417
1506	NC_013502	GGC	2	6	92040	92045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318417
1507	NC_013502	GGT	2	6	92106	92111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318417
1508	NC_013502	CAG	2	6	92121	92126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318417
1509	NC_013502	GTA	2	6	92136	92141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318417
1510	NC_013502	GCCG	2	8	92189	92196	0 %	0 %	50 %	50 %	268318417
1511	NC_013502	TGCG	2	8	92251	92258	0 %	25 %	50 %	25 %	268318417
1512	NC_013502	AGC	2	6	92272	92277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318417
1513	NC_013502	AGC	2	6	92521	92526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318418
1514	NC_013502	ACT	2	6	92542	92547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318418
1515	NC_013502	CGG	2	6	92551	92556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318418
1516	NC_013502	GCTGGA	2	12	92597	92608	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268318418
1517	NC_013502	GAG	2	6	92610	92615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318418
1518	NC_013502	CGA	3	9	92630	92638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318418
1519	NC_013502	AGG	3	9	92641	92649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318418
1520	NC_013502	GGT	2	6	92667	92672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318418
1521	NC_013502	GCT	2	6	92777	92782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318418
1522	NC_013502	GCGG	2	8	92809	92816	0 %	0 %	75 %	25 %	268318418
1523	NC_013502	GCT	2	6	92834	92839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318418
1524	NC_013502	GCT	2	6	92885	92890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318418
1525	NC_013502	GCA	2	6	92906	92911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318418
1526	NC_013502	GTGCGG	2	12	92922	92933	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	268318418
1527	NC_013502	CGA	2	6	92948	92953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318418
1528	NC_013502	GGC	2	6	92975	92980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318418
1529	NC_013502	TGC	2	6	93013	93018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318418
1530	NC_013502	GCCGGA	2	12	93050	93061	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	268318418
1531	NC_013502	GCT	2	6	93089	93094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318418
1532	NC_013502	GCG	2	6	93151	93156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318418
1533	NC_013502	TGGACG	2	12	93184	93195	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268318418
1534	NC_013502	GGA	2	6	93203	93208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318418
1535	NC_013502	GCT	2	6	93209	93214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318418
1536	NC_013502	GGC	2	6	93218	93223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318418
1537	NC_013502	CGG	2	6	93236	93241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318418
1538	NC_013502	GGTGCT	2	12	93242	93253	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	268318418
1539	NC_013502	GAG	2	6	93255	93260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318418
1540	NC_013502	GGC	2	6	93261	93266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318418
1541	NC_013502	CGG	2	6	93285	93290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318418
1542	NC_013502	GC	3	6	93340	93345	0 %	0 %	50 %	50 %	268318418
1543	NC_013502	TGGC	2	8	93393	93400	0 %	25 %	50 %	25 %	268318418
1544	NC_013502	GGC	2	6	93414	93419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318418
1545	NC_013502	ACG	2	6	93544	93549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318419
1546	NC_013502	GCGGG	2	10	93551	93560	0 %	0 %	80 %	20 %	268318419
1547	NC_013502	GGT	2	6	93626	93631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318419
1548	NC_013502	GCAGG	2	10	93638	93647	20 %	0 %	60 %	20 %	268318419
1549	NC_013502	A	6	6	94021	94026	100 %	0 %	0 %	0 %	268318420
1550	NC_013502	ATG	2	6	94047	94052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318420
1551	NC_013502	CGG	2	6	94079	94084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318420
1552	NC_013502	AAT	2	6	94088	94093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318420
1553	NC_013502	CCG	2	6	94098	94103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318420
1554	NC_013502	GCG	2	6	94132	94137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318420
1555	NC_013502	GC	3	6	94249	94254	0 %	0 %	50 %	50 %	268318420
1556	NC_013502	AGG	2	6	94317	94322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318420
1557	NC_013502	CTG	2	6	94379	94384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318420
1558	NC_013502	GGCA	2	8	94440	94447	25 %	0 %	50 %	25 %	268318420
1559	NC_013502	ACC	2	6	94453	94458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318420
1560	NC_013502	C	6	6	94457	94462	0 %	0 %	0 %	100 %	268318420
1561	NC_013502	CTGC	2	8	94472	94479	0 %	25 %	25 %	50 %	268318420
1562	NC_013502	GA	3	6	94507	94512	50 %	0 %	50 %	0 %	268318420
1563	NC_013502	A	6	6	94618	94623	100 %	0 %	0 %	0 %	268318421
1564	NC_013502	GAG	2	6	94674	94679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318421
1565	NC_013502	GAT	2	6	94704	94709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318421
1566	NC_013502	TAA	2	6	94829	94834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318421
1567	NC_013502	CATT	2	8	94888	94895	25 %	50 %	0 %	25 %	268318421
1568	NC_013502	A	6	6	94899	94904	100 %	0 %	0 %	0 %	268318421
1569	NC_013502	ACA	2	6	94938	94943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318421
1570	NC_013502	TGA	2	6	95120	95125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318421
1571	NC_013502	A	6	6	95129	95134	100 %	0 %	0 %	0 %	268318421
1572	NC_013502	ATT	2	6	95276	95281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318421
1573	NC_013502	GAA	2	6	95359	95364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318421
1574	NC_013502	AAG	2	6	95397	95402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318421
1575	NC_013502	CTT	2	6	95407	95412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318421
1576	NC_013502	ATG	2	6	95471	95476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318421
1577	NC_013502	AT	3	6	95486	95491	50 %	50 %	0 %	0 %	268318422
1578	NC_013502	CCA	2	6	95495	95500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318422
1579	NC_013502	TAG	2	6	95529	95534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318422
1580	NC_013502	AGT	2	6	95602	95607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318422
1581	NC_013502	CA	3	6	95655	95660	50 %	0 %	0 %	50 %	268318422
1582	NC_013502	AG	3	6	95729	95734	50 %	0 %	50 %	0 %	268318422
1583	NC_013502	GAA	2	6	95759	95764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318422
1584	NC_013502	TAT	3	9	95765	95773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318422
1585	NC_013502	AGAT	2	8	95782	95789	50 %	25 %	25 %	0 %	268318422
1586	NC_013502	TAA	2	6	95791	95796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318422
1587	NC_013502	TTTTCT	2	12	95815	95826	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	268318422
1588	NC_013502	GAAA	2	8	95892	95899	75 %	0 %	25 %	0 %	268318422
1589	NC_013502	AGAT	2	8	95902	95909	50 %	25 %	25 %	0 %	268318422
1590	NC_013502	AT	3	6	95920	95925	50 %	50 %	0 %	0 %	268318422
1591	NC_013502	GGA	2	6	95956	95961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318422
1592	NC_013502	AAT	2	6	96013	96018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318422
1593	NC_013502	ACTA	2	8	96074	96081	50 %	25 %	0 %	25 %	268318422
1594	NC_013502	ATTC	2	8	96148	96155	25 %	50 %	0 %	25 %	268318422
1595	NC_013502	AAAT	2	8	96172	96179	75 %	25 %	0 %	0 %	268318422
1596	NC_013502	A	6	6	96200	96205	100 %	0 %	0 %	0 %	268318422
1597	NC_013502	CAT	2	6	96223	96228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318422
1598	NC_013502	TGG	2	6	96253	96258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318422
1599	NC_013502	G	6	6	96341	96346	0 %	0 %	100 %	0 %	268318422
1600	NC_013502	AGA	2	6	96347	96352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318422
1601	NC_013502	ACT	2	6	96723	96728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318423
1602	NC_013502	CCT	2	6	96814	96819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318423
1603	NC_013502	TGG	2	6	96849	96854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318423
1604	NC_013502	CGG	2	6	96876	96881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318423
1605	NC_013502	CGA	2	6	96942	96947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318423
1606	NC_013502	ATC	2	6	96959	96964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318423
1607	NC_013502	CTT	2	6	96973	96978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318423
1608	NC_013502	CG	3	6	97068	97073	0 %	0 %	50 %	50 %	268318423
1609	NC_013502	CGGC	2	8	97082	97089	0 %	0 %	50 %	50 %	268318423
1610	NC_013502	CTT	2	6	97121	97126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318423
1611	NC_013502	AGG	2	6	97176	97181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318423
1612	NC_013502	TCC	2	6	97230	97235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318423
1613	NC_013502	ACGGGG	2	12	97247	97258	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	268318423
1614	NC_013502	TTG	2	6	97266	97271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318423
1615	NC_013502	GGT	2	6	97279	97284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318423
1616	NC_013502	TCA	2	6	97293	97298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318423
1617	NC_013502	GGCT	2	8	97304	97311	0 %	25 %	50 %	25 %	268318423
1618	NC_013502	TGC	2	6	97368	97373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318423
1619	NC_013502	ACA	2	6	97386	97391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318423
1620	NC_013502	CCG	2	6	97448	97453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318423
1621	NC_013502	TCC	2	6	97537	97542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318423
1622	NC_013502	CTT	2	6	97546	97551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318423
1623	NC_013502	CGA	2	6	97567	97572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318423
1624	NC_013502	GGC	2	6	97749	97754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318423
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1626	NC_013502	CTAC	2	8	97806	97813	25 %	25 %	0 %	50 %	268318423
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1870	NC_013502	GTC	2	6	115864	115869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318436
1871	NC_013502	TCC	2	6	115884	115889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318436
1872	NC_013502	AAC	2	6	115943	115948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318436
1873	NC_013502	GT	3	6	115997	116002	0 %	50 %	50 %	0 %	268318437
1874	NC_013502	GAT	2	6	116021	116026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318437
1875	NC_013502	GAA	2	6	116067	116072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318437
1876	NC_013502	TGGCC	2	10	116093	116102	0 %	20 %	40 %	40 %	268318437
1877	NC_013502	GCA	2	6	116140	116145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318437
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1879	NC_013502	ACC	2	6	116422	116427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318437
1880	NC_013502	TCT	2	6	116455	116460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318437
1881	NC_013502	ACC	2	6	116469	116474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318437
1882	NC_013502	GC	3	6	116505	116510	0 %	0 %	50 %	50 %	268318437
1883	NC_013502	CTG	2	6	116565	116570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318437
1884	NC_013502	CTG	2	6	116706	116711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318437
1885	NC_013502	GCT	2	6	118633	118638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318438
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1887	NC_013502	CTG	2	6	118682	118687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318438
1888	NC_013502	GGT	2	6	118717	118722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318438
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1890	NC_013502	CG	4	8	118893	118900	0 %	0 %	50 %	50 %	268318438
1891	NC_013502	GAC	2	6	118924	118929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318438
1892	NC_013502	GCA	2	6	118939	118944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318438
1893	NC_013502	CAT	2	6	118958	118963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318438
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1896	NC_013502	GC	3	6	119163	119168	0 %	0 %	50 %	50 %	268318439
1897	NC_013502	GGC	2	6	119193	119198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318439
1898	NC_013502	AGG	2	6	119309	119314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318439
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1900	NC_013502	GCATT	2	10	119423	119432	20 %	40 %	20 %	20 %	268318439
1901	NC_013502	GCTG	2	8	119435	119442	0 %	25 %	50 %	25 %	268318439
1902	NC_013502	C	6	6	119576	119581	0 %	0 %	0 %	100 %	268318439
1903	NC_013502	GGCG	2	8	119598	119605	0 %	0 %	75 %	25 %	268318439
1904	NC_013502	ATA	2	6	119655	119660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318439
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1908	NC_013502	AGCC	2	8	122485	122492	25 %	0 %	25 %	50 %	268318440
1909	NC_013502	ATA	2	6	122549	122554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318440
1910	NC_013502	GTA	2	6	122567	122572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318441
1911	NC_013502	TA	3	6	122578	122583	50 %	50 %	0 %	0 %	268318441
1912	NC_013502	GCCTG	2	10	122619	122628	0 %	20 %	40 %	40 %	268318441
1913	NC_013502	GCT	2	6	122697	122702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318441
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1916	NC_013502	TCC	2	6	122840	122845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318441
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1918	NC_013502	TGA	2	6	122885	122890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318441
1919	NC_013502	CA	3	6	122931	122936	50 %	0 %	0 %	50 %	268318441
1920	NC_013502	AGAAA	2	10	122963	122972	80 %	0 %	20 %	0 %	268318441
1921	NC_013502	GCC	2	6	123000	123005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318441
1922	NC_013502	GCGAT	2	10	123029	123038	20 %	20 %	40 %	20 %	268318441
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1925	NC_013502	CGG	2	6	123122	123127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318441
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1927	NC_013502	TCG	2	6	123260	123265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318441
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1943	NC_013502	CTA	2	6	124079	124084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318441
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1959	NC_013502	TCTT	2	8	125030	125037	0 %	75 %	0 %	25 %	268318442
1960	NC_013502	CTCAG	2	10	125049	125058	20 %	20 %	20 %	40 %	268318442
1961	NC_013502	CGGT	2	8	125069	125076	0 %	25 %	50 %	25 %	268318442

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