MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_013501	CCCG	2	8	2217047	2217054	0 %	0 %	25 %	75 %	268317447
49002	NC_013501	AGCG	2	8	2217059	2217066	25 %	0 %	50 %	25 %	268317447
49003	NC_013501	TACCC	2	10	2217109	2217118	20 %	20 %	0 %	60 %	268317448
49004	NC_013501	GCGG	2	8	2217122	2217129	0 %	0 %	75 %	25 %	268317448
49005	NC_013501	GGTC	2	8	2217226	2217233	0 %	25 %	50 %	25 %	268317448
49006	NC_013501	GCC	2	6	2217278	2217283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317448
49007	NC_013501	GC	3	6	2217338	2217343	0 %	0 %	50 %	50 %	268317448
49008	NC_013501	CCAGCA	2	12	2217352	2217363	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	268317448
49009	NC_013501	TGAA	2	8	2217402	2217409	50 %	25 %	25 %	0 %	268317448
49010	NC_013501	CCA	2	6	2217425	2217430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317448
49011	NC_013501	CAC	2	6	2217452	2217457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317448
49012	NC_013501	CTG	2	6	2217476	2217481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317448
49013	NC_013501	CTG	2	6	2217527	2217532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317448
49014	NC_013501	ATCGT	2	10	2217597	2217606	20 %	40 %	20 %	20 %	268317448
49015	NC_013501	TCGGCC	2	12	2217645	2217656	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	268317448
49016	NC_013501	GT	3	6	2217721	2217726	0 %	50 %	50 %	0 %	268317448
49017	NC_013501	GAA	2	6	2217923	2217928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317448
49018	NC_013501	TCC	2	6	2217996	2218001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317448
49019	NC_013501	CCT	2	6	2218021	2218026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317448
49020	NC_013501	GCG	2	6	2218030	2218035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317448
49021	NC_013501	GTCGTA	2	12	2218043	2218054	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268317448
49022	NC_013501	GC	3	6	2218115	2218120	0 %	0 %	50 %	50 %	268317448
49023	NC_013501	TCG	2	6	2218152	2218157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317448
49024	NC_013501	GTC	2	6	2218214	2218219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317448
49025	NC_013501	GCC	2	6	2218302	2218307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317448
49026	NC_013501	GCC	2	6	2218309	2218314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317448
49027	NC_013501	CCT	2	6	2218351	2218356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317448
49028	NC_013501	CAG	2	6	2218364	2218369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317448
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49031	NC_013501	GAA	2	6	2218412	2218417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317448
49032	NC_013501	TTC	2	6	2218466	2218471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317448
49033	NC_013501	GCT	2	6	2218501	2218506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317448
49034	NC_013501	GCC	2	6	2218581	2218586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317448
49035	NC_013501	CAG	2	6	2218604	2218609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317448
49036	NC_013501	TGC	2	6	2218644	2218649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317448
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49039	NC_013501	GCG	2	6	2218745	2218750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317448
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49042	NC_013501	TGC	2	6	2219224	2219229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317449
49043	NC_013501	CG	3	6	2219240	2219245	0 %	0 %	50 %	50 %	268317449
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49051	NC_013501	GC	3	6	2219588	2219593	0 %	0 %	50 %	50 %	268317450
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49053	NC_013501	TGCC	2	8	2219653	2219660	0 %	25 %	25 %	50 %	268317450
49054	NC_013501	CTG	2	6	2219719	2219724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317450
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49062	NC_013501	ATCG	2	8	2219872	2219879	25 %	25 %	25 %	25 %	268317450
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49085	NC_013501	GCT	2	6	2220719	2220724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317452
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49094	NC_013501	GC	3	6	2221162	2221167	0 %	0 %	50 %	50 %	268317453
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49115	NC_013501	GCA	3	9	2222333	2222341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317454
49116	NC_013501	TCT	2	6	2222422	2222427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317454
49117	NC_013501	TGC	2	6	2222464	2222469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317454
49118	NC_013501	CGG	2	6	2222487	2222492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317454
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49219	NC_013501	ACGCC	2	10	2226994	2227003	20 %	0 %	20 %	60 %	268317460
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49222	NC_013501	CCCACC	2	12	2227077	2227088	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	268317460
49223	NC_013501	GC	4	8	2227090	2227097	0 %	0 %	50 %	50 %	268317460
49224	NC_013501	CG	3	6	2227126	2227131	0 %	0 %	50 %	50 %	268317460
49225	NC_013501	CCA	2	6	2227141	2227146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317460
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49229	NC_013501	CAC	2	6	2227412	2227417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317460
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49462	NC_013501	CTC	2	6	2237364	2237369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317469
49463	NC_013501	CTA	2	6	2237388	2237393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317469
49464	NC_013501	GCT	2	6	2237418	2237423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317469
49465	NC_013501	CCA	2	6	2237450	2237455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317469
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49471	NC_013501	TGC	2	6	2237705	2237710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317469
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49473	NC_013501	GCT	2	6	2237808	2237813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317469
49474	NC_013501	CGA	2	6	2237838	2237843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317469
49475	NC_013501	GAT	2	6	2237844	2237849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317469
49476	NC_013501	GCT	2	6	2237904	2237909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317469
49477	NC_013501	CCCG	2	8	2237928	2237935	0 %	0 %	25 %	75 %	268317469
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49483	NC_013501	CGA	2	6	2238279	2238284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317469
49484	NC_013501	CCGCGG	2	12	2238285	2238296	0 %	0 %	50 %	50 %	268317469
49485	NC_013501	CGT	2	6	2238312	2238317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317469
49486	NC_013501	ATC	2	6	2238349	2238354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317469
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49490	NC_013501	GAG	2	6	2238709	2238714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317469
49491	NC_013501	ACG	2	6	2238767	2238772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317469
49492	NC_013501	TCA	2	6	2238782	2238787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317469
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49494	NC_013501	TCGA	2	8	2238937	2238944	25 %	25 %	25 %	25 %	268317469
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