MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_013501	GCCGTC	2	12	2057738	2057749	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	268317313
45502	NC_013501	CGG	2	6	2057791	2057796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317313
45503	NC_013501	GC	3	6	2057814	2057819	0 %	0 %	50 %	50 %	268317313
45504	NC_013501	GCT	2	6	2057836	2057841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317313
45505	NC_013501	CCG	2	6	2057874	2057879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317313
45506	NC_013501	TCG	2	6	2057889	2057894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317313
45507	NC_013501	CG	3	6	2057938	2057943	0 %	0 %	50 %	50 %	268317313
45508	NC_013501	TCC	2	6	2057991	2057996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317313
45509	NC_013501	CAA	2	6	2058062	2058067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268317313
45510	NC_013501	CGG	2	6	2058124	2058129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317313
45511	NC_013501	GGC	2	6	2058151	2058156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317313
45512	NC_013501	GACCAC	2	12	2058167	2058178	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	268317313
45513	NC_013501	CGA	2	6	2058230	2058235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317313
45514	NC_013501	GCG	2	6	2058325	2058330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317313
45515	NC_013501	CCG	2	6	2058360	2058365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317313
45516	NC_013501	TCGC	2	8	2058368	2058375	0 %	25 %	25 %	50 %	268317313
45517	NC_013501	GC	3	6	2058374	2058379	0 %	0 %	50 %	50 %	268317313
45518	NC_013501	CGT	2	6	2058412	2058417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317313
45519	NC_013501	CAGGTC	2	12	2058425	2058436	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268317313
45520	NC_013501	GGC	2	6	2058461	2058466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317313
45521	NC_013501	GTT	2	6	2058533	2058538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317313
45522	NC_013501	CCGC	2	8	2058619	2058626	0 %	0 %	25 %	75 %	268317313
45523	NC_013501	GATC	2	8	2058664	2058671	25 %	25 %	25 %	25 %	268317313
45524	NC_013501	AGA	2	6	2058679	2058684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317313
45525	NC_013501	GTT	2	6	2058809	2058814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317313
45526	NC_013501	GGT	2	6	2058893	2058898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317313
45527	NC_013501	GGCG	2	8	2058910	2058917	0 %	0 %	75 %	25 %	268317313
45528	NC_013501	CGT	2	6	2058961	2058966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317313
45529	NC_013501	TA	3	6	2059061	2059066	50 %	50 %	0 %	0 %	268317313
45530	NC_013501	GCC	2	6	2059208	2059213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317313
45531	NC_013501	CCT	2	6	2059236	2059241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317313
45532	NC_013501	TGA	2	6	2059282	2059287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317313
45533	NC_013501	GTT	2	6	2059301	2059306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317313
45534	NC_013501	GAA	2	6	2059346	2059351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317313
45535	NC_013501	CGG	2	6	2059393	2059398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317313
45536	NC_013501	CGGCCA	2	12	2059531	2059542	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268317313
45537	NC_013501	GGT	2	6	2059547	2059552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317313
45538	NC_013501	GCCG	2	8	2059574	2059581	0 %	0 %	50 %	50 %	268317313
45539	NC_013501	CCG	2	6	2059704	2059709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317313
45540	NC_013501	CGG	2	6	2059816	2059821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317313
45541	NC_013501	CCA	2	6	2059861	2059866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317313
45542	NC_013501	GCA	2	6	2059888	2059893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317313
45543	NC_013501	CAT	2	6	2059904	2059909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317313
45544	NC_013501	TGC	2	6	2060025	2060030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317314
45545	NC_013501	GC	3	6	2060112	2060117	0 %	0 %	50 %	50 %	268317314
45546	NC_013501	CG	4	8	2060262	2060269	0 %	0 %	50 %	50 %	268317314
45547	NC_013501	CTG	2	6	2060294	2060299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317314
45548	NC_013501	ATTC	2	8	2060314	2060321	25 %	50 %	0 %	25 %	268317314
45549	NC_013501	GTT	2	6	2060396	2060401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317314
45550	NC_013501	GCACGC	2	12	2060422	2060433	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268317314
45551	NC_013501	CTG	2	6	2060567	2060572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317314
45552	NC_013501	CAT	2	6	2060599	2060604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317314
45553	NC_013501	TTG	2	6	2060616	2060621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317314
45554	NC_013501	ATGGC	2	10	2060637	2060646	20 %	20 %	40 %	20 %	268317314
45555	NC_013501	GTT	2	6	2060762	2060767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317314
45556	NC_013501	GCCA	2	8	2060781	2060788	25 %	0 %	25 %	50 %	268317314
45557	NC_013501	TGA	2	6	2060827	2060832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317314
45558	NC_013501	GCC	2	6	2060853	2060858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317314
45559	NC_013501	GGCA	2	8	2060860	2060867	25 %	0 %	50 %	25 %	268317314
45560	NC_013501	ACCCG	2	10	2061000	2061009	20 %	0 %	20 %	60 %	268317314
45561	NC_013501	GCG	2	6	2061013	2061018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317314
45562	NC_013501	GCT	2	6	2061019	2061024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317314
45563	NC_013501	CAG	2	6	2061047	2061052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317314
45564	NC_013501	CGG	2	6	2061098	2061103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317314
45565	NC_013501	GTT	2	6	2061104	2061109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317314
45566	NC_013501	CGA	2	6	2061115	2061120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317314
45567	NC_013501	TCG	3	9	2061126	2061134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317314
45568	NC_013501	TAG	2	6	2061174	2061179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317314
45569	NC_013501	AAG	2	6	2061180	2061185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317314
45570	NC_013501	AGC	2	6	2061192	2061197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317314
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45572	NC_013501	GCC	2	6	2061359	2061364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317314
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45574	NC_013501	TCG	2	6	2061402	2061407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317314
45575	NC_013501	GAG	2	6	2061408	2061413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317314
45576	NC_013501	ATTCC	2	10	2061434	2061443	20 %	40 %	0 %	40 %	268317314
45577	NC_013501	GCG	2	6	2061477	2061482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317314
45578	NC_013501	TTTC	2	8	2061487	2061494	0 %	75 %	0 %	25 %	268317314
45579	NC_013501	ACC	2	6	2061522	2061527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317314
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45581	NC_013501	CAG	2	6	2061584	2061589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317314
45582	NC_013501	CAG	2	6	2061596	2061601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317314
45583	NC_013501	GC	3	6	2061727	2061732	0 %	0 %	50 %	50 %	268317315
45584	NC_013501	CAG	2	6	2061823	2061828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317315
45585	NC_013501	CCG	2	6	2061856	2061861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317315
45586	NC_013501	TTG	2	6	2061887	2061892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317315
45587	NC_013501	GAG	2	6	2061953	2061958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317315
45588	NC_013501	GTTCTG	2	12	2062012	2062023	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	268317315
45589	NC_013501	GTT	2	6	2062060	2062065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317315
45590	NC_013501	GAT	2	6	2062171	2062176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317315
45591	NC_013501	TCA	2	6	2062184	2062189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317315
45592	NC_013501	CTG	2	6	2062231	2062236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317315
45593	NC_013501	GCA	2	6	2062299	2062304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317315
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45595	NC_013501	ACC	2	6	2062369	2062374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317315
45596	NC_013501	CAGC	2	8	2062446	2062453	25 %	0 %	25 %	50 %	268317315
45597	NC_013501	TTC	2	6	2062565	2062570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317315
45598	NC_013501	GTA	2	6	2062573	2062578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317315
45599	NC_013501	CAG	2	6	2062606	2062611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317315
45600	NC_013501	GCT	2	6	2062701	2062706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317315
45601	NC_013501	GCC	2	6	2062865	2062870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317315
45602	NC_013501	CGT	2	6	2062923	2062928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317315
45603	NC_013501	GTA	2	6	2062948	2062953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317315
45604	NC_013501	GTAGTT	2	12	2062963	2062974	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268317315
45605	NC_013501	GAA	2	6	2062984	2062989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317315
45606	NC_013501	T	6	6	2063004	2063009	0 %	100 %	0 %	0 %	268317315
45607	NC_013501	GCTG	2	8	2063040	2063047	0 %	25 %	50 %	25 %	268317315
45608	NC_013501	GGT	2	6	2063068	2063073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317315
45609	NC_013501	TTC	2	6	2063110	2063115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317315
45610	NC_013501	GCC	2	6	2063140	2063145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317315
45611	NC_013501	GT	3	6	2063175	2063180	0 %	50 %	50 %	0 %	268317315
45612	NC_013501	CGA	2	6	2063212	2063217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317315
45613	NC_013501	GCTGC	2	10	2063227	2063236	0 %	20 %	40 %	40 %	268317315
45614	NC_013501	GCCC	2	8	2063240	2063247	0 %	0 %	25 %	75 %	268317315
45615	NC_013501	CTG	2	6	2063272	2063277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317315
45616	NC_013501	GGC	2	6	2063289	2063294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317315
45617	NC_013501	GCA	2	6	2063346	2063351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317315
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45620	NC_013501	GCCG	2	8	2063566	2063573	0 %	0 %	50 %	50 %	268317315
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45622	NC_013501	GTC	2	6	2063593	2063598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317315
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45627	NC_013501	CTT	2	6	2063814	2063819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317315
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45642	NC_013501	ACGA	2	8	2064515	2064522	50 %	0 %	25 %	25 %	268317315
45643	NC_013501	GGT	2	6	2064580	2064585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317315
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45720	NC_013501	GC	3	6	2068710	2068715	0 %	0 %	50 %	50 %	268317318
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45722	NC_013501	GAT	2	6	2068746	2068751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317318
45723	NC_013501	GTTC	2	8	2068766	2068773	0 %	50 %	25 %	25 %	268317318
45724	NC_013501	CCT	2	6	2068876	2068881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317319
45725	NC_013501	CAG	2	6	2068946	2068951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317319
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45727	NC_013501	CAG	2	6	2068985	2068990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317319
45728	NC_013501	TC	3	6	2069125	2069130	0 %	50 %	0 %	50 %	268317319
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45730	NC_013501	CTC	2	6	2069399	2069404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317320
45731	NC_013501	GAG	2	6	2069421	2069426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317320
45732	NC_013501	GTTG	2	8	2069440	2069447	0 %	50 %	50 %	0 %	268317320
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45833	NC_013501	CCGC	2	8	2072891	2072898	0 %	0 %	25 %	75 %	268317323
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45837	NC_013501	GAC	2	6	2073178	2073183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317323
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45839	NC_013501	GCGCC	2	10	2073190	2073199	0 %	0 %	40 %	60 %	268317323
45840	NC_013501	GCC	2	6	2073216	2073221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317323
45841	NC_013501	GCG	2	6	2073262	2073267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317323
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45843	NC_013501	CCA	2	6	2073334	2073339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317323
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45962	NC_013501	A	7	7	2082244	2082250	100 %	0 %	0 %	0 %	268317329
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45965	NC_013501	TCC	2	6	2082452	2082457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317329
45966	NC_013501	CG	3	6	2082501	2082506	0 %	0 %	50 %	50 %	268317329
45967	NC_013501	CTG	2	6	2082508	2082513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317329
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45970	NC_013501	GCT	2	6	2082678	2082683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317329
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45974	NC_013501	CTG	2	6	2082821	2082826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317330
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45977	NC_013501	TCGCG	2	10	2082949	2082958	0 %	20 %	40 %	40 %	268317330
45978	NC_013501	CG	4	8	2082955	2082962	0 %	0 %	50 %	50 %	268317330
45979	NC_013501	TGC	2	6	2082999	2083004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317330
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45981	NC_013501	GGC	2	6	2083030	2083035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317330
45982	NC_013501	GCT	2	6	2083054	2083059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317330
45983	NC_013501	CAG	2	6	2083109	2083114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317330
45984	NC_013501	CGC	2	6	2083139	2083144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317330
45985	NC_013501	ACCG	2	8	2083187	2083194	25 %	0 %	25 %	50 %	268317330
45986	NC_013501	GCCGAA	2	12	2083229	2083240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317330
45987	NC_013501	GCCCGC	2	12	2083307	2083318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317330
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45989	NC_013501	CGA	2	6	2083363	2083368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317330
45990	NC_013501	TGCC	2	8	2083369	2083376	0 %	25 %	25 %	50 %	268317330
45991	NC_013501	CGT	2	6	2083396	2083401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317330
45992	NC_013501	GCC	2	6	2083433	2083438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317330
45993	NC_013501	TGC	2	6	2083449	2083454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317330
45994	NC_013501	C	6	6	2083617	2083622	0 %	0 %	0 %	100 %	268317330
45995	NC_013501	GAAG	2	8	2083636	2083643	50 %	0 %	50 %	0 %	268317330
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46000	NC_013501	GCT	2	6	2083885	2083890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317331

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