MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_013501	CCG	2	6	2009987	2009992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317285
44503	NC_013501	GGT	2	6	2010000	2010005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317285
44504	NC_013501	C	6	6	2010038	2010043	0 %	0 %	0 %	100 %	268317285
44505	NC_013501	TGCG	2	8	2010164	2010171	0 %	25 %	50 %	25 %	268317285
44506	NC_013501	CCA	2	6	2010174	2010179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317285
44507	NC_013501	CACG	2	8	2010180	2010187	25 %	0 %	25 %	50 %	268317285
44508	NC_013501	CCA	2	6	2010228	2010233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317285
44509	NC_013501	GGC	2	6	2010271	2010276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317285
44510	NC_013501	CGC	2	6	2010294	2010299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317285
44511	NC_013501	CCT	2	6	2010324	2010329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317285
44512	NC_013501	GCG	2	6	2010449	2010454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317285
44513	NC_013501	GAATC	2	10	2010486	2010495	40 %	20 %	20 %	20 %	268317285
44514	NC_013501	CGG	2	6	2010507	2010512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317285
44515	NC_013501	GCCTGG	2	12	2010752	2010763	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268317286
44516	NC_013501	GCC	2	6	2010794	2010799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317286
44517	NC_013501	TCGA	2	8	2010881	2010888	25 %	25 %	25 %	25 %	268317286
44518	NC_013501	CGT	2	6	2010897	2010902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317286
44519	NC_013501	GAT	2	6	2010925	2010930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317286
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44522	NC_013501	CGA	2	6	2011195	2011200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317286
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44524	NC_013501	CCT	2	6	2011254	2011259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317286
44525	NC_013501	GCG	2	6	2011285	2011290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317286
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44534	NC_013501	TCG	2	6	2011511	2011516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317286
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44540	NC_013501	CGC	2	6	2011866	2011871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317287
44541	NC_013501	GC	4	8	2011870	2011877	0 %	0 %	50 %	50 %	268317287
44542	NC_013501	ATCCAG	2	12	2011897	2011908	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268317287
44543	NC_013501	CGG	2	6	2012024	2012029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317287
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44550	NC_013501	TCCAGC	2	12	2012300	2012311	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268317287
44551	NC_013501	GGC	2	6	2012398	2012403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317287
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44587	NC_013501	GCG	2	6	2014124	2014129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317289
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44598	NC_013501	GTT	2	6	2014573	2014578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317290
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44602	NC_013501	CAT	2	6	2014795	2014800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317290
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44604	NC_013501	GCA	2	6	2014972	2014977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317290
44605	NC_013501	T	6	6	2015030	2015035	0 %	100 %	0 %	0 %	268317290
44606	NC_013501	C	6	6	2015094	2015099	0 %	0 %	0 %	100 %	268317290
44607	NC_013501	TC	3	6	2015224	2015229	0 %	50 %	0 %	50 %	268317290
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44615	NC_013501	CG	3	6	2015847	2015852	0 %	0 %	50 %	50 %	268317290
44616	NC_013501	CGCC	2	8	2015910	2015917	0 %	0 %	25 %	75 %	268317290
44617	NC_013501	TGA	2	6	2015980	2015985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317290
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44728	NC_013501	GCCC	2	8	2021531	2021538	0 %	0 %	25 %	75 %	268317294
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44961	NC_013501	GCC	2	6	2031779	2031784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317302
44962	NC_013501	CGG	2	6	2031785	2031790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317302
44963	NC_013501	CTC	2	6	2031791	2031796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317302
44964	NC_013501	GGC	2	6	2031861	2031866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317302
44965	NC_013501	GGC	2	6	2031870	2031875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317302
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44980	NC_013501	GCC	2	6	2032754	2032759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317302
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44982	NC_013501	TCG	3	9	2032872	2032880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317302
44983	NC_013501	GTC	2	6	2032928	2032933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317302
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44985	NC_013501	CCGA	2	8	2032980	2032987	25 %	0 %	25 %	50 %	268317302
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44987	NC_013501	GCG	2	6	2033057	2033062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317302
44988	NC_013501	GTCC	2	8	2033074	2033081	0 %	25 %	25 %	50 %	268317302
44989	NC_013501	ACCAGC	2	12	2033082	2033093	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	268317302
44990	NC_013501	CTT	2	6	2033197	2033202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317302
44991	NC_013501	GCGG	2	8	2033260	2033267	0 %	0 %	75 %	25 %	268317302
44992	NC_013501	CAGC	2	8	2033354	2033361	25 %	0 %	25 %	50 %	268317302
44993	NC_013501	CAG	3	9	2033405	2033413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317302
44994	NC_013501	GTC	2	6	2033430	2033435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317302
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44999	NC_013501	AGT	2	6	2033880	2033885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317303
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