MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43004	NC_013501	CAG	2	6	1943615	1943620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317236
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43008	NC_013501	GCCGC	2	10	1943869	1943878	0 %	0 %	40 %	60 %	268317236
43009	NC_013501	CCGG	2	8	1943910	1943917	0 %	0 %	50 %	50 %	268317236
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43117	NC_013501	GCCG	2	8	1948697	1948704	0 %	0 %	50 %	50 %	268317240
43118	NC_013501	CG	3	6	1948748	1948753	0 %	0 %	50 %	50 %	268317240
43119	NC_013501	GGCC	2	8	1948760	1948767	0 %	0 %	50 %	50 %	268317240
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43121	NC_013501	TCG	2	6	1948855	1948860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317240
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43214	NC_013501	CGA	2	6	1952635	1952640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317243
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43228	NC_013501	CGA	2	6	1953232	1953237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317243
43229	NC_013501	GGC	2	6	1953239	1953244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317243
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43231	NC_013501	TCT	2	6	1953387	1953392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317243
43232	NC_013501	TGG	2	6	1953432	1953437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317243
43233	NC_013501	ATC	2	6	1953470	1953475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317243
43234	NC_013501	TCGA	2	8	1953476	1953483	25 %	25 %	25 %	25 %	268317243
43235	NC_013501	GAC	2	6	1953500	1953505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317243
43236	NC_013501	CTG	2	6	1953521	1953526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317243
43237	NC_013501	TCG	2	6	1953555	1953560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317243
43238	NC_013501	CGA	2	6	1953562	1953567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317243
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43241	NC_013501	TGC	2	6	1953840	1953845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317243
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43245	NC_013501	TCG	2	6	1953975	1953980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317244
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43254	NC_013501	GAA	2	6	1954217	1954222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317244
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43261	NC_013501	GCATCG	2	12	1954440	1954451	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268317245
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43265	NC_013501	GGAA	2	8	1954533	1954540	50 %	0 %	50 %	0 %	268317245
43266	NC_013501	TCG	2	6	1954575	1954580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317245
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43293	NC_013501	ACG	2	6	1956299	1956304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317246
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43302	NC_013501	CTG	2	6	1956577	1956582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317246
43303	NC_013501	ACG	2	6	1956620	1956625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317246
43304	NC_013501	CGG	2	6	1956649	1956654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317246
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43311	NC_013501	TCG	2	6	1957303	1957308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317246
43312	NC_013501	GACG	2	8	1957339	1957346	25 %	0 %	50 %	25 %	268317246
43313	NC_013501	TTCG	2	8	1957653	1957660	0 %	50 %	25 %	25 %	268317246
43314	NC_013501	CGG	2	6	1957698	1957703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317246
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43331	NC_013501	CGT	2	6	1958612	1958617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317248
43332	NC_013501	GAG	2	6	1958638	1958643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317248
43333	NC_013501	GTC	2	6	1958673	1958678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317248
43334	NC_013501	GCA	2	6	1958687	1958692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317248
43335	NC_013501	GCG	2	6	1958693	1958698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317248
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43337	NC_013501	TGT	2	6	1958776	1958781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317248
43338	NC_013501	GCG	2	6	1958814	1958819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317249
43339	NC_013501	CTT	2	6	1958914	1958919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317249
43340	NC_013501	CGA	2	6	1958983	1958988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317249
43341	NC_013501	GAT	2	6	1959068	1959073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317249
43342	NC_013501	CGC	2	6	1959139	1959144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317249
43343	NC_013501	TGGCCA	2	12	1959169	1959180	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268317249
43344	NC_013501	GTC	2	6	1959323	1959328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317249
43345	NC_013501	CCA	2	6	1959352	1959357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317249
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43449	NC_013501	AGG	2	6	1964324	1964329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317253
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43452	NC_013501	GCTCAA	2	12	1964403	1964414	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268317253
43453	NC_013501	TCG	2	6	1964444	1964449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317253
43454	NC_013501	CG	3	6	1964490	1964495	0 %	0 %	50 %	50 %	268317253
43455	NC_013501	CGA	2	6	1964541	1964546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317253
43456	NC_013501	CAT	2	6	1964598	1964603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317253
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43458	NC_013501	CGA	2	6	1964649	1964654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317253
43459	NC_013501	CTGGAG	2	12	1964752	1964763	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268317253
43460	NC_013501	CG	3	6	1964774	1964779	0 %	0 %	50 %	50 %	268317253
43461	NC_013501	ATC	2	6	1964845	1964850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317253
43462	NC_013501	AGC	2	6	1964921	1964926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317253
43463	NC_013501	ATC	2	6	1964977	1964982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317253
43464	NC_013501	GTC	2	6	1965037	1965042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317253
43465	NC_013501	AAG	2	6	1965055	1965060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317253
43466	NC_013501	ACGTGG	2	12	1965089	1965100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268317253
43467	NC_013501	GAG	2	6	1965160	1965165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317253
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43483	NC_013501	GGCGTC	2	12	1965922	1965933	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268317254
43484	NC_013501	CCAG	2	8	1965948	1965955	25 %	0 %	25 %	50 %	268317254
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43490	NC_013501	CAG	2	6	1966276	1966281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317254
43491	NC_013501	GCCA	2	8	1966286	1966293	25 %	0 %	25 %	50 %	268317254
43492	NC_013501	CGAT	2	8	1966295	1966302	25 %	25 %	25 %	25 %	268317254
43493	NC_013501	GGC	2	6	1966497	1966502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317255
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43495	NC_013501	CGA	2	6	1966553	1966558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317255
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