MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013501	CAG	2	6	133091	133096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315700
3002	NC_013501	GAT	2	6	133118	133123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315700
3003	NC_013501	CCG	2	6	133125	133130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315700
3004	NC_013501	GCCG	2	8	133136	133143	0 %	0 %	50 %	50 %	268315700
3005	NC_013501	CGG	2	6	133144	133149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315700
3006	NC_013501	GTG	2	6	133212	133217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315700
3007	NC_013501	GCA	2	6	133240	133245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315700
3008	NC_013501	CGAC	2	8	133255	133262	25 %	0 %	25 %	50 %	268315700
3009	NC_013501	AGC	2	6	133263	133268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315700
3010	NC_013501	GTG	2	6	133317	133322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315700
3011	NC_013501	GTG	2	6	133332	133337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315700
3012	NC_013501	GC	3	6	133351	133356	0 %	0 %	50 %	50 %	268315700
3013	NC_013501	AAC	2	6	133359	133364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315700
3014	NC_013501	CGG	2	6	133381	133386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315700
3015	NC_013501	ACG	2	6	133389	133394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315700
3016	NC_013501	GCT	2	6	133421	133426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315700
3017	NC_013501	GTG	2	6	133471	133476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315700
3018	NC_013501	ACC	2	6	133479	133484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315700
3019	NC_013501	AAAAG	2	10	133513	133522	80 %	0 %	20 %	0 %	268315700
3020	NC_013501	CGC	2	6	133543	133548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315700
3021	NC_013501	CAG	2	6	133580	133585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315700
3022	NC_013501	CAG	2	6	133595	133600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315700
3023	NC_013501	AGC	2	6	133602	133607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315700
3024	NC_013501	CAG	2	6	133636	133641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315701
3025	NC_013501	GCC	2	6	133676	133681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315701
3026	NC_013501	TCG	2	6	133697	133702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315701
3027	NC_013501	CAG	2	6	133705	133710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315701
3028	NC_013501	CAG	2	6	133747	133752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315701
3029	NC_013501	GCC	2	6	133799	133804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315701
3030	NC_013501	CGC	2	6	133843	133848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315701
3031	NC_013501	CGG	2	6	133908	133913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315701
3032	NC_013501	GGC	2	6	133997	134002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315701
3033	NC_013501	GTA	2	6	134020	134025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315701
3034	NC_013501	AGA	3	9	134034	134042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315701
3035	NC_013501	GGC	2	6	134044	134049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315701
3036	NC_013501	ACC	2	6	134096	134101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315701
3037	NC_013501	ACG	2	6	134132	134137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315701
3038	NC_013501	GTA	2	6	134152	134157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315701
3039	NC_013501	CGT	2	6	134196	134201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315701
3040	NC_013501	TAG	2	6	134246	134251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315701
3041	NC_013501	GCG	2	6	134252	134257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315701
3042	NC_013501	CGGA	2	8	134290	134297	25 %	0 %	50 %	25 %	268315701
3043	NC_013501	CGA	2	6	134334	134339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315701
3044	NC_013501	CAC	2	6	134413	134418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315701
3045	NC_013501	GCG	2	6	134439	134444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315701
3046	NC_013501	GC	3	6	134505	134510	0 %	0 %	50 %	50 %	268315701
3047	NC_013501	GCC	2	6	134543	134548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315701
3048	NC_013501	CAG	2	6	134551	134556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315701
3049	NC_013501	GCC	2	6	134557	134562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315701
3050	NC_013501	CGC	2	6	134605	134610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315701
3051	NC_013501	CGT	2	6	134692	134697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315701
3052	NC_013501	GTC	2	6	134698	134703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315701
3053	NC_013501	ACGT	2	8	134717	134724	25 %	25 %	25 %	25 %	268315701
3054	NC_013501	CG	3	6	134748	134753	0 %	0 %	50 %	50 %	268315701
3055	NC_013501	AGCGGC	2	12	134768	134779	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	268315701
3056	NC_013501	GTG	2	6	134810	134815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315701
3057	NC_013501	GCA	2	6	134829	134834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315701
3058	NC_013501	TGA	2	6	134889	134894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315701
3059	NC_013501	CCG	2	6	134925	134930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315701
3060	NC_013501	GCCG	2	8	134958	134965	0 %	0 %	50 %	50 %	268315701
3061	NC_013501	CGC	2	6	134991	134996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315701
3062	NC_013501	CG	3	6	135006	135011	0 %	0 %	50 %	50 %	268315701
3063	NC_013501	CAG	2	6	135013	135018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315701
3064	NC_013501	TCG	2	6	135041	135046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315701
3065	NC_013501	GTG	2	6	135053	135058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315701
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3067	NC_013501	GATC	2	8	135114	135121	25 %	25 %	25 %	25 %	268315701
3068	NC_013501	A	6	6	135190	135195	100 %	0 %	0 %	0 %	268315701
3069	NC_013501	CAA	2	6	135213	135218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315701
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3071	NC_013501	GTTGC	2	10	135265	135274	0 %	40 %	40 %	20 %	268315701
3072	NC_013501	TTC	3	9	135319	135327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315702
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3074	NC_013501	CGGG	2	8	135417	135424	0 %	0 %	75 %	25 %	268315702
3075	NC_013501	GCG	2	6	135466	135471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315702
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3079	NC_013501	TGA	2	6	135663	135668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315702
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3085	NC_013501	GAA	2	6	135970	135975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315702
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3088	NC_013501	GTCC	2	8	136229	136236	0 %	25 %	25 %	50 %	268315703
3089	NC_013501	CAG	2	6	136251	136256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315703
3090	NC_013501	GGC	2	6	136286	136291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315703
3091	NC_013501	GCT	2	6	136299	136304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315703
3092	NC_013501	CGC	2	6	136331	136336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315703
3093	NC_013501	GCA	2	6	136358	136363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315703
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3101	NC_013501	GGC	2	6	136525	136530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315703
3102	NC_013501	GCCGAA	2	12	136563	136574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315703
3103	NC_013501	CAG	2	6	136674	136679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315703
3104	NC_013501	CG	3	6	136697	136702	0 %	0 %	50 %	50 %	268315703
3105	NC_013501	ACG	2	6	136725	136730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315703
3106	NC_013501	CG	3	6	136741	136746	0 %	0 %	50 %	50 %	268315703
3107	NC_013501	CCA	2	6	136903	136908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315704
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3109	NC_013501	TCG	2	6	136977	136982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315704
3110	NC_013501	GATC	2	8	137002	137009	25 %	25 %	25 %	25 %	268315704
3111	NC_013501	CCA	2	6	137014	137019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315704
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3118	NC_013501	GCC	2	6	137225	137230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315704
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3228	NC_013501	TGC	2	6	141908	141913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315709
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3231	NC_013501	GATCAG	2	12	141978	141989	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	268315709
3232	NC_013501	TGA	2	6	142007	142012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315709
3233	NC_013501	CGA	2	6	142052	142057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315709
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3237	NC_013501	GGC	2	6	142311	142316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315710
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3239	NC_013501	GCCCA	2	10	142444	142453	20 %	0 %	20 %	60 %	268315710
3240	NC_013501	CTG	3	9	142464	142472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315710
3241	NC_013501	CTG	2	6	142488	142493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315710
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3243	NC_013501	CAG	2	6	142590	142595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315710
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3335	NC_013501	CCTGG	2	10	146595	146604	0 %	20 %	40 %	40 %	268315713
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3340	NC_013501	CTG	2	6	146797	146802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315713
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3359	NC_013501	CGAAA	2	10	147616	147625	60 %	0 %	20 %	20 %	268315714
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3364	NC_013501	GCT	2	6	147841	147846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315714
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3472	NC_013501	CGGTG	2	10	152127	152136	0 %	20 %	60 %	20 %	268315717
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3475	NC_013501	GC	3	6	152387	152392	0 %	0 %	50 %	50 %	268315717
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3479	NC_013501	TGG	2	6	152484	152489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315717
3480	NC_013501	CGG	3	9	152495	152503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315717
3481	NC_013501	ATGG	2	8	152545	152552	25 %	25 %	50 %	0 %	268315717
3482	NC_013501	GTC	2	6	152611	152616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315717
3483	NC_013501	CTA	2	6	152674	152679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315717
3484	NC_013501	CTGG	2	8	152719	152726	0 %	25 %	50 %	25 %	268315717
3485	NC_013501	CGG	2	6	152751	152756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315717
3486	NC_013501	CTAT	2	8	152806	152813	25 %	50 %	0 %	25 %	268315717
3487	NC_013501	GGGAG	2	10	152908	152917	20 %	0 %	80 %	0 %	268315717
3488	NC_013501	CCG	2	6	152945	152950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315717
3489	NC_013501	CTGCGC	2	12	152972	152983	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	268315717
3490	NC_013501	CGG	2	6	152993	152998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315717
3491	NC_013501	CTG	2	6	153035	153040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315717
3492	NC_013501	ACG	2	6	153094	153099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315717
3493	NC_013501	ACA	2	6	153114	153119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315717
3494	NC_013501	GCT	2	6	153157	153162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315717
3495	NC_013501	CG	3	6	153199	153204	0 %	0 %	50 %	50 %	268315717
3496	NC_013501	GCC	2	6	153215	153220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315717
3497	NC_013501	GCT	2	6	153253	153258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315717
3498	NC_013501	GGC	2	6	153415	153420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315717
3499	NC_013501	GTCG	2	8	153442	153449	0 %	25 %	50 %	25 %	268315717
3500	NC_013501	GCT	2	6	153463	153468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315717

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