MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_013501	GCC	2	6	719631	719636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316200
16002	NC_013501	CCA	2	6	719700	719705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316200
16003	NC_013501	GGC	2	6	719716	719721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316200
16004	NC_013501	CAT	2	6	719782	719787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316200
16005	NC_013501	AGC	2	6	719811	719816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316200
16006	NC_013501	AGG	2	6	719859	719864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316200
16007	NC_013501	CGG	2	6	719894	719899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316200
16008	NC_013501	CGCC	2	8	719905	719912	0 %	0 %	25 %	75 %	268316200
16009	NC_013501	AC	3	6	719944	719949	50 %	0 %	0 %	50 %	268316200
16010	NC_013501	CG	3	6	719993	719998	0 %	0 %	50 %	50 %	268316200
16011	NC_013501	ACG	2	6	720231	720236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316200
16012	NC_013501	CGA	2	6	720334	720339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316200
16013	NC_013501	CGA	2	6	720346	720351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316200
16014	NC_013501	TTC	2	6	720377	720382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316200
16015	NC_013501	GATCTG	2	12	720416	720427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268316200
16016	NC_013501	GAA	2	6	720445	720450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316200
16017	NC_013501	TTG	2	6	720551	720556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316200
16018	NC_013501	AGG	2	6	720615	720620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316200
16019	NC_013501	GTGGCC	2	12	720668	720679	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268316200
16020	NC_013501	CAT	2	6	720706	720711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316200
16021	NC_013501	CGAGCC	2	12	720715	720726	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268316200
16022	NC_013501	GCTGGC	2	12	720742	720753	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268316200
16023	NC_013501	GCGG	2	8	720754	720761	0 %	0 %	75 %	25 %	268316200
16024	NC_013501	GAG	2	6	720877	720882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316201
16025	NC_013501	CGAGTT	2	12	720933	720944	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268316201
16026	NC_013501	CTG	2	6	721036	721041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316201
16027	NC_013501	CAT	2	6	721059	721064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316201
16028	NC_013501	CTG	2	6	721096	721101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316201
16029	NC_013501	CGG	2	6	721110	721115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316201
16030	NC_013501	ACCT	2	8	721174	721181	25 %	25 %	0 %	50 %	268316201
16031	NC_013501	GCAC	2	8	721184	721191	25 %	0 %	25 %	50 %	268316201
16032	NC_013501	GCA	2	6	721194	721199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316201
16033	NC_013501	GCC	2	6	721234	721239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316201
16034	NC_013501	TGG	2	6	721244	721249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316201
16035	NC_013501	CGG	3	9	721265	721273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316201
16036	NC_013501	CG	3	6	721291	721296	0 %	0 %	50 %	50 %	268316201
16037	NC_013501	GCC	2	6	721297	721302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316201
16038	NC_013501	GCCC	2	8	721375	721382	0 %	0 %	25 %	75 %	268316201
16039	NC_013501	CGC	2	6	721391	721396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316201
16040	NC_013501	CCG	2	6	721405	721410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316201
16041	NC_013501	GACCTG	2	12	721498	721509	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268316201
16042	NC_013501	GAG	2	6	721588	721593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316201
16043	NC_013501	GGC	2	6	721629	721634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316201
16044	NC_013501	CG	3	6	721661	721666	0 %	0 %	50 %	50 %	268316201
16045	NC_013501	GGGA	2	8	721714	721721	25 %	0 %	75 %	0 %	268316202
16046	NC_013501	GGCC	2	8	721724	721731	0 %	0 %	50 %	50 %	268316202
16047	NC_013501	GCC	2	6	721758	721763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316202
16048	NC_013501	GAC	2	6	721884	721889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316202
16049	NC_013501	GAG	2	6	721971	721976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316202
16050	NC_013501	GGA	2	6	721994	721999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316202
16051	NC_013501	CGA	2	6	722135	722140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316202
16052	NC_013501	GCT	2	6	722159	722164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316202
16053	NC_013501	GCA	2	6	722174	722179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316202
16054	NC_013501	GCT	2	6	722219	722224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316202
16055	NC_013501	GCC	2	6	722235	722240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316202
16056	NC_013501	TGG	2	6	722248	722253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316202
16057	NC_013501	GCG	2	6	722282	722287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316202
16058	NC_013501	GCT	2	6	722288	722293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316202
16059	NC_013501	TGG	2	6	722311	722316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316202
16060	NC_013501	CCG	2	6	722336	722341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316202
16061	NC_013501	GCT	2	6	722384	722389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316202
16062	NC_013501	GGC	2	6	722390	722395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316202
16063	NC_013501	TGG	2	6	722422	722427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316202
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16065	NC_013501	CGG	2	6	722483	722488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316202
16066	NC_013501	CGT	2	6	722504	722509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316202
16067	NC_013501	GCTGG	2	10	722510	722519	0 %	20 %	60 %	20 %	268316202
16068	NC_013501	GCC	2	6	722526	722531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316202
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16070	NC_013501	CGC	2	6	722541	722546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316202
16071	NC_013501	CCA	2	6	722615	722620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316203
16072	NC_013501	GAAAC	2	10	722621	722630	60 %	0 %	20 %	20 %	268316203
16073	NC_013501	AGC	2	6	722632	722637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316203
16074	NC_013501	GCC	2	6	722641	722646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316203
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16076	NC_013501	TGT	2	6	722692	722697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316203
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16078	NC_013501	AGC	2	6	722707	722712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316203
16079	NC_013501	GTC	2	6	722734	722739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316204
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16081	NC_013501	CAG	3	9	722791	722799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316204
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16083	NC_013501	TGC	2	6	722895	722900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316205
16084	NC_013501	CTGC	2	8	722912	722919	0 %	25 %	25 %	50 %	268316205
16085	NC_013501	CTC	2	6	722927	722932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316205
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16087	NC_013501	CGATCC	2	12	722986	722997	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268316205
16088	NC_013501	GCG	2	6	723070	723075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316205
16089	NC_013501	GAT	3	9	723077	723085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316205
16090	NC_013501	TCT	2	6	723096	723101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316205
16091	NC_013501	TCG	2	6	723111	723116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316205
16092	NC_013501	CGG	2	6	723121	723126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316205
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16094	NC_013501	GTCTG	2	10	723167	723176	0 %	40 %	40 %	20 %	268316206
16095	NC_013501	CGA	2	6	723185	723190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316206
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16098	NC_013501	GTA	2	6	723279	723284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316206
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16101	NC_013501	GC	3	6	723344	723349	0 %	0 %	50 %	50 %	268316206
16102	NC_013501	CAG	2	6	723360	723365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316206
16103	NC_013501	GCG	2	6	723389	723394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316206
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16106	NC_013501	ACC	2	6	723496	723501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316206
16107	NC_013501	CAT	2	6	723576	723581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316206
16108	NC_013501	CGAG	2	8	723593	723600	25 %	0 %	50 %	25 %	268316206
16109	NC_013501	CCCA	2	8	723631	723638	25 %	0 %	0 %	75 %	268316206
16110	NC_013501	CG	3	6	723689	723694	0 %	0 %	50 %	50 %	268316206
16111	NC_013501	GC	3	6	723704	723709	0 %	0 %	50 %	50 %	268316206
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16115	NC_013501	CCAGC	2	10	723813	723822	20 %	0 %	20 %	60 %	268316206
16116	NC_013501	GC	3	6	723911	723916	0 %	0 %	50 %	50 %	268316206
16117	NC_013501	CCA	2	6	723921	723926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316206
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16119	NC_013501	TCG	2	6	723995	724000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316206
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16357	NC_013501	GCA	2	6	734699	734704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316213
16358	NC_013501	CGA	2	6	734729	734734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316213
16359	NC_013501	CCG	2	6	734831	734836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316213
16360	NC_013501	GATGCC	2	12	734837	734848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268316213
16361	NC_013501	ACGC	2	8	734879	734886	25 %	0 %	25 %	50 %	268316213
16362	NC_013501	GGC	3	9	734963	734971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316213
16363	NC_013501	GCG	2	6	735020	735025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316213
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16366	NC_013501	CTGG	2	8	735116	735123	0 %	25 %	50 %	25 %	268316213
16367	NC_013501	CGG	2	6	735124	735129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316213
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16369	NC_013501	CTG	2	6	735222	735227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316213
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16471	NC_013501	TGC	2	6	738759	738764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316214
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16473	NC_013501	TGC	2	6	738834	738839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316214
16474	NC_013501	GCC	2	6	738854	738859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316214
16475	NC_013501	TGC	2	6	738927	738932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316214
16476	NC_013501	CTG	3	9	738959	738967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316214
16477	NC_013501	GGC	2	6	739008	739013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316214
16478	NC_013501	CTG	2	6	739019	739024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316214
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16481	NC_013501	CTG	2	6	739091	739096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316214
16482	NC_013501	GCT	3	9	739099	739107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316214
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