MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_013501	GCC	2	6	674528	674533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316164
15002	NC_013501	GCC	2	6	674547	674552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316164
15003	NC_013501	CGC	2	6	674689	674694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316165
15004	NC_013501	CG	3	6	674761	674766	0 %	0 %	50 %	50 %	268316165
15005	NC_013501	CTG	2	6	674810	674815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316165
15006	NC_013501	GA	3	6	675009	675014	50 %	0 %	50 %	0 %	268316165
15007	NC_013501	G	6	6	675074	675079	0 %	0 %	100 %	0 %	268316165
15008	NC_013501	TGA	2	6	675142	675147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316165
15009	NC_013501	TCC	2	6	675150	675155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316165
15010	NC_013501	CAG	2	6	675167	675172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316165
15011	NC_013501	TGCC	2	8	675196	675203	0 %	25 %	25 %	50 %	268316165
15012	NC_013501	GAG	2	6	675234	675239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316165
15013	NC_013501	TGA	2	6	675262	675267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316165
15014	NC_013501	CGG	2	6	675285	675290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316165
15015	NC_013501	ACC	2	6	675330	675335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316165
15016	NC_013501	GGC	2	6	675358	675363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316165
15017	NC_013501	CGA	2	6	675373	675378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316165
15018	NC_013501	GCA	2	6	675454	675459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316165
15019	NC_013501	GCC	2	6	675479	675484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316165
15020	NC_013501	CGC	2	6	675519	675524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316165
15021	NC_013501	GCCA	2	8	675528	675535	25 %	0 %	25 %	50 %	268316165
15022	NC_013501	GCC	2	6	675537	675542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316165
15023	NC_013501	GCC	2	6	675557	675562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316165
15024	NC_013501	TGA	2	6	675619	675624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316165
15025	NC_013501	TGG	2	6	675625	675630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316165
15026	NC_013501	TGC	2	6	675719	675724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316165
15027	NC_013501	CGC	2	6	675771	675776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316165
15028	NC_013501	GC	3	6	675780	675785	0 %	0 %	50 %	50 %	268316165
15029	NC_013501	TCC	2	6	675846	675851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268316165
15030	NC_013501	GCG	2	6	675931	675936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316165
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15032	NC_013501	CGG	2	6	676044	676049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316165
15033	NC_013501	GCCG	2	8	676080	676087	0 %	0 %	50 %	50 %	268316165
15034	NC_013501	CAG	2	6	676094	676099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316165
15035	NC_013501	GGT	2	6	676118	676123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316165
15036	NC_013501	TGGCG	2	10	676453	676462	0 %	20 %	60 %	20 %	268316166
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15039	NC_013501	CGG	2	6	676552	676557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316166
15040	NC_013501	GGT	3	9	676564	676572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316166
15041	NC_013501	GAG	2	6	676601	676606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316166
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15043	NC_013501	G	7	7	676661	676667	0 %	0 %	100 %	0 %	268316166
15044	NC_013501	TTCC	2	8	676693	676700	0 %	50 %	0 %	50 %	268316166
15045	NC_013501	GCT	2	6	676726	676731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316166
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15048	NC_013501	CGG	2	6	676911	676916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316166
15049	NC_013501	CCA	2	6	676917	676922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316166
15050	NC_013501	TGA	2	6	676935	676940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316166
15051	NC_013501	GGT	2	6	677050	677055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316166
15052	NC_013501	AGA	2	6	677061	677066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316166
15053	NC_013501	CACGG	2	10	677096	677105	20 %	0 %	40 %	40 %	268316166
15054	NC_013501	GCGG	2	8	677134	677141	0 %	0 %	75 %	25 %	268316166
15055	NC_013501	GGC	2	6	677146	677151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316166
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15058	NC_013501	GCC	2	6	677494	677499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316167
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15060	NC_013501	GTG	2	6	677563	677568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316167
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15118	NC_013501	GC	5	10	680173	680182	0 %	0 %	50 %	50 %	268316168
15119	NC_013501	ACGCG	2	10	680218	680227	20 %	0 %	40 %	40 %	268316168
15120	NC_013501	GACC	2	8	680302	680309	25 %	0 %	25 %	50 %	268316168
15121	NC_013501	GAA	2	6	680329	680334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316168
15122	NC_013501	CAT	2	6	680350	680355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316168
15123	NC_013501	CAT	2	6	680597	680602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316169
15124	NC_013501	CGA	2	6	680618	680623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316169
15125	NC_013501	CCG	2	6	680642	680647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316169
15126	NC_013501	CGG	2	6	680672	680677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316169
15127	NC_013501	CGA	2	6	680693	680698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316169
15128	NC_013501	GCG	2	6	680735	680740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316169
15129	NC_013501	CTA	2	6	680747	680752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316169
15130	NC_013501	CGC	2	6	680789	680794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316169
15131	NC_013501	CGA	2	6	680816	680821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316169
15132	NC_013501	TGC	2	6	680827	680832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316169
15133	NC_013501	TGC	2	6	680863	680868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316169
15134	NC_013501	GCG	2	6	680879	680884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316169
15135	NC_013501	AGC	2	6	680887	680892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316169
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15139	NC_013501	GAG	2	6	680943	680948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316169
15140	NC_013501	GGA	2	6	680960	680965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316169
15141	NC_013501	GAA	2	6	680973	680978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316169
15142	NC_013501	GAG	2	6	680979	680984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316169
15143	NC_013501	AAT	2	6	680992	680997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268316169
15144	NC_013501	GC	3	6	681183	681188	0 %	0 %	50 %	50 %	268316170
15145	NC_013501	TGC	2	6	681199	681204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316170
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15149	NC_013501	GCG	2	6	681427	681432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316171
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15152	NC_013501	GAG	2	6	681488	681493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316171
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15166	NC_013501	CTGC	2	8	682258	682265	0 %	25 %	25 %	50 %	268316172
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15223	NC_013501	TGC	3	9	684333	684341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316173
15224	NC_013501	GCG	2	6	684345	684350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316173
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15226	NC_013501	GCT	2	6	684403	684408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316173
15227	NC_013501	GCTAC	2	10	684421	684430	20 %	20 %	20 %	40 %	268316173
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15232	NC_013501	CTG	3	9	684650	684658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316173
15233	NC_013501	CGCTGG	2	12	684690	684701	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268316173
15234	NC_013501	GCG	2	6	684749	684754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316173
15235	NC_013501	GCC	2	6	684755	684760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316173
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15237	NC_013501	CGG	2	6	684848	684853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316173
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15474	NC_013501	CTG	2	6	694772	694777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316183
15475	NC_013501	TGT	2	6	694797	694802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316183
15476	NC_013501	GCC	2	6	694805	694810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316183
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15478	NC_013501	CAG	2	6	694877	694882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316183
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15480	NC_013501	GGTGG	2	10	694923	694932	0 %	20 %	80 %	0 %	268316183
15481	NC_013501	TCT	2	6	695030	695035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316184
15482	NC_013501	GCT	2	6	695054	695059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316184
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15492	NC_013501	CGG	2	6	695425	695430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316184
15493	NC_013501	CGG	2	6	695456	695461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316184
15494	NC_013501	CAG	2	6	695502	695507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316184
15495	NC_013501	TCT	2	6	695620	695625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316184
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15497	NC_013501	GTC	2	6	695769	695774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316184
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