MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_013501	GCT	3	9	654705	654713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14502	NC_013501	GCT	2	6	654717	654722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14503	NC_013501	GAC	2	6	654735	654740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14504	NC_013501	GCT	2	6	654744	654749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14505	NC_013501	CTG	2	6	654832	654837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14506	NC_013501	GTG	2	6	654856	654861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316146
14507	NC_013501	GCT	2	6	654879	654884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14508	NC_013501	CGGA	2	8	654893	654900	25 %	0 %	50 %	25 %	268316146
14509	NC_013501	GAT	2	6	654903	654908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316146
14510	NC_013501	GCT	2	6	654942	654947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14511	NC_013501	GCG	2	6	654950	654955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316146
14512	NC_013501	GCGG	2	8	654984	654991	0 %	0 %	75 %	25 %	268316146
14513	NC_013501	ACG	2	6	655000	655005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14514	NC_013501	GCT	2	6	655026	655031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14515	NC_013501	GT	3	6	655040	655045	0 %	50 %	50 %	0 %	268316146
14516	NC_013501	ACT	2	6	655046	655051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316146
14517	NC_013501	CGT	2	6	655083	655088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14518	NC_013501	GCTGGT	2	12	655122	655133	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	268316146
14519	NC_013501	GTG	2	6	655150	655155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316146
14520	NC_013501	TGG	2	6	655178	655183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316146
14521	NC_013501	TGC	2	6	655238	655243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14522	NC_013501	CTG	2	6	655261	655266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14523	NC_013501	GGCT	2	8	655267	655274	0 %	25 %	50 %	25 %	268316146
14524	NC_013501	GGC	2	6	655308	655313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316146
14525	NC_013501	GCG	2	6	655322	655327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316146
14526	NC_013501	TGC	2	6	655337	655342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14527	NC_013501	AGC	2	6	655397	655402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14528	NC_013501	AGGCG	2	10	655407	655416	20 %	0 %	60 %	20 %	268316146
14529	NC_013501	CCG	2	6	655425	655430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316146
14530	NC_013501	GGC	2	6	655456	655461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316146
14531	NC_013501	ACG	2	6	655493	655498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14532	NC_013501	CTG	2	6	655573	655578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14533	NC_013501	CGT	2	6	655647	655652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14534	NC_013501	GGC	2	6	655653	655658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316146
14535	NC_013501	GCT	2	6	655662	655667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14536	NC_013501	TGG	2	6	655687	655692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316146
14537	NC_013501	CGT	2	6	655731	655736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14538	NC_013501	GCC	2	6	655762	655767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316146
14539	NC_013501	GGCG	2	8	655769	655776	0 %	0 %	75 %	25 %	268316146
14540	NC_013501	TGC	3	9	655811	655819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316146
14541	NC_013501	TGG	2	6	655832	655837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316146
14542	NC_013501	ACC	2	6	655864	655869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316146
14543	NC_013501	GCC	2	6	655875	655880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316146
14544	NC_013501	TGG	3	9	655931	655939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316146
14545	NC_013501	GAA	2	6	655960	655965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316146
14546	NC_013501	GCT	2	6	656124	656129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316147
14547	NC_013501	GCA	2	6	656130	656135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316147
14548	NC_013501	GTC	2	6	656144	656149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316147
14549	NC_013501	TCA	2	6	656204	656209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316147
14550	NC_013501	GCC	2	6	656307	656312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316147
14551	NC_013501	CCG	2	6	656335	656340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316147
14552	NC_013501	GGT	2	6	656475	656480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316147
14553	NC_013501	CGT	2	6	656490	656495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316147
14554	NC_013501	GGT	2	6	656502	656507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316147
14555	NC_013501	CG	3	6	656525	656530	0 %	0 %	50 %	50 %	268316147
14556	NC_013501	CGG	2	6	656536	656541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316147
14557	NC_013501	CGC	2	6	656573	656578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316147
14558	NC_013501	CACG	2	8	656580	656587	25 %	0 %	25 %	50 %	268316147
14559	NC_013501	CCG	2	6	656599	656604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316147
14560	NC_013501	CG	3	6	656603	656608	0 %	0 %	50 %	50 %	268316147
14561	NC_013501	GTG	2	6	656860	656865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316147
14562	NC_013501	CGTGCG	2	12	656883	656894	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268316147
14563	NC_013501	GGC	2	6	656922	656927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316147
14564	NC_013501	CTT	2	6	656943	656948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316147
14565	NC_013501	CAT	2	6	657003	657008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316147
14566	NC_013501	CTA	2	6	657066	657071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316147
14567	NC_013501	TAC	2	6	657281	657286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316148
14568	NC_013501	CGC	2	6	657294	657299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316148
14569	NC_013501	CGG	2	6	657312	657317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316148
14570	NC_013501	CTG	2	6	657398	657403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316148
14571	NC_013501	TGGC	2	8	657419	657426	0 %	25 %	50 %	25 %	268316148
14572	NC_013501	GCT	2	6	657463	657468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316148
14573	NC_013501	CTG	2	6	657518	657523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316148
14574	NC_013501	TTC	2	6	657549	657554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316148
14575	NC_013501	GGC	2	6	657604	657609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316148
14576	NC_013501	ATGG	2	8	657661	657668	25 %	25 %	50 %	0 %	268316148
14577	NC_013501	GCT	2	6	657712	657717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316148
14578	NC_013501	CTG	2	6	657725	657730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316148
14579	NC_013501	GCG	2	6	657743	657748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316148
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14583	NC_013501	ATGC	2	8	657901	657908	25 %	25 %	25 %	25 %	268316149
14584	NC_013501	GAC	2	6	658008	658013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316149
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14586	NC_013501	GCC	2	6	658043	658048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316149
14587	NC_013501	CG	3	6	658085	658090	0 %	0 %	50 %	50 %	268316149
14588	NC_013501	ATC	2	6	658119	658124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316149
14589	NC_013501	GAA	2	6	658157	658162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316149
14590	NC_013501	GGAA	2	8	658180	658187	50 %	0 %	50 %	0 %	268316149
14591	NC_013501	ACG	2	6	658206	658211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316149
14592	NC_013501	CGACTA	2	12	658249	658260	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268316149
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14594	NC_013501	GA	3	6	658344	658349	50 %	0 %	50 %	0 %	268316149
14595	NC_013501	TCG	2	6	658359	658364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316149
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14597	NC_013501	CA	3	6	658440	658445	50 %	0 %	0 %	50 %	268316149
14598	NC_013501	ATC	2	6	658461	658466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316149
14599	NC_013501	GGA	2	6	658522	658527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316149
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14601	NC_013501	GAC	2	6	658538	658543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316149
14602	NC_013501	GGC	2	6	658561	658566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316149
14603	NC_013501	CGG	2	6	658586	658591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316150
14604	NC_013501	GGA	2	6	658620	658625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316150
14605	NC_013501	CGG	2	6	658654	658659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316150
14606	NC_013501	CGC	2	6	658709	658714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316150
14607	NC_013501	CTG	2	6	658720	658725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316150
14608	NC_013501	CTGG	2	8	658728	658735	0 %	25 %	50 %	25 %	268316150
14609	NC_013501	CTG	2	6	658813	658818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316150
14610	NC_013501	CGG	2	6	658905	658910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316150
14611	NC_013501	GCGAA	2	10	659000	659009	40 %	0 %	40 %	20 %	268316150
14612	NC_013501	CTGG	2	8	659016	659023	0 %	25 %	50 %	25 %	268316150
14613	NC_013501	TCG	2	6	659069	659074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316150
14614	NC_013501	CG	3	6	659181	659186	0 %	0 %	50 %	50 %	268316150
14615	NC_013501	CCG	2	6	659202	659207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316150
14616	NC_013501	CTG	2	6	659281	659286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316150
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14618	NC_013501	TAC	2	6	659326	659331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316150
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14741	NC_013501	CGG	2	6	664448	664453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316154
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14974	NC_013501	GCG	2	6	673376	673381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316163
14975	NC_013501	CAG	2	6	673450	673455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316163
14976	NC_013501	GCG	2	6	673464	673469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316163
14977	NC_013501	TTCGC	2	10	673494	673503	0 %	40 %	20 %	40 %	268316163
14978	NC_013501	CTA	2	6	673536	673541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316163
14979	NC_013501	CGA	2	6	673590	673595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316163
14980	NC_013501	GCG	2	6	673626	673631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316163
14981	NC_013501	G	6	6	673644	673649	0 %	0 %	100 %	0 %	268316163
14982	NC_013501	CGACCG	2	12	673668	673679	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268316163
14983	NC_013501	GCACC	2	10	673781	673790	20 %	0 %	20 %	60 %	268316163
14984	NC_013501	GGC	3	9	673796	673804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316163
14985	NC_013501	CGC	2	6	673808	673813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316163
14986	NC_013501	GAC	2	6	673984	673989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316164
14987	NC_013501	AGG	2	6	674112	674117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316164
14988	NC_013501	GAA	2	6	674144	674149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316164
14989	NC_013501	CGG	2	6	674195	674200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316164
14990	NC_013501	TGC	2	6	674217	674222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316164
14991	NC_013501	GCGT	2	8	674241	674248	0 %	25 %	50 %	25 %	268316164
14992	NC_013501	GCG	2	6	674274	674279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316164
14993	NC_013501	GCG	3	9	674281	674289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316164
14994	NC_013501	CTG	3	9	674330	674338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316164
14995	NC_013501	GAA	2	6	674375	674380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316164
14996	NC_013501	TGG	2	6	674391	674396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316164
14997	NC_013501	GC	3	6	674408	674413	0 %	0 %	50 %	50 %	268316164
14998	NC_013501	TCA	2	6	674427	674432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316164
14999	NC_013501	ACCG	2	8	674465	674472	25 %	0 %	25 %	50 %	268316164
15000	NC_013501	CCG	2	6	674514	674519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316164

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