MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013501	CCG	3	9	44481	44489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315623
1002	NC_013501	GCC	2	6	44521	44526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315623
1003	NC_013501	CAG	2	6	44547	44552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315623
1004	NC_013501	CGGT	2	8	44576	44583	0 %	25 %	50 %	25 %	268315623
1005	NC_013501	GCC	2	6	44625	44630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315623
1006	NC_013501	GGCG	2	8	44632	44639	0 %	0 %	75 %	25 %	268315623
1007	NC_013501	AGCGC	2	10	44707	44716	20 %	0 %	40 %	40 %	268315623
1008	NC_013501	TCCAGC	2	12	44796	44807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268315623
1009	NC_013501	TCG	2	6	44823	44828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315623
1010	NC_013501	GT	3	6	44847	44852	0 %	50 %	50 %	0 %	268315623
1011	NC_013501	C	6	6	44894	44899	0 %	0 %	0 %	100 %	268315623
1012	NC_013501	CAG	3	9	44975	44983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315623
1013	NC_013501	CGG	2	6	45019	45024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315623
1014	NC_013501	CGAAG	2	10	45173	45182	40 %	0 %	40 %	20 %	268315624
1015	NC_013501	GGCG	2	8	45217	45224	0 %	0 %	75 %	25 %	268315624
1016	NC_013501	GGC	2	6	45239	45244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315624
1017	NC_013501	CGC	2	6	45269	45274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315624
1018	NC_013501	AGC	2	6	45288	45293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315624
1019	NC_013501	GC	4	8	45292	45299	0 %	0 %	50 %	50 %	268315624
1020	NC_013501	TCG	3	9	45303	45311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315624
1021	NC_013501	TCGG	2	8	45315	45322	0 %	25 %	50 %	25 %	268315624
1022	NC_013501	GCCCA	2	10	45336	45345	20 %	0 %	20 %	60 %	268315624
1023	NC_013501	CGG	2	6	45475	45480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315624
1024	NC_013501	TCG	2	6	45504	45509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315624
1025	NC_013501	CG	3	6	45508	45513	0 %	0 %	50 %	50 %	268315624
1026	NC_013501	CGG	2	6	45535	45540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315624
1027	NC_013501	GC	3	6	45637	45642	0 %	0 %	50 %	50 %	268315624
1028	NC_013501	CCA	2	6	45647	45652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315624
1029	NC_013501	GGGCTC	2	12	45668	45679	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268315624
1030	NC_013501	CCG	2	6	45682	45687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315624
1031	NC_013501	GCC	2	6	45702	45707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315624
1032	NC_013501	GTGG	2	8	45767	45774	0 %	25 %	75 %	0 %	268315624
1033	NC_013501	CCA	2	6	45796	45801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315624
1034	NC_013501	GAGC	2	8	45850	45857	25 %	0 %	50 %	25 %	268315624
1035	NC_013501	GCA	2	6	45865	45870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315624
1036	NC_013501	GGT	2	6	45878	45883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315624
1037	NC_013501	GCC	2	6	45887	45892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315624
1038	NC_013501	CGA	2	6	45906	45911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315624
1039	NC_013501	TGC	2	6	46002	46007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315624
1040	NC_013501	AGC	2	6	46029	46034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315624
1041	NC_013501	CAG	2	6	46073	46078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315624
1042	NC_013501	CCA	2	6	46144	46149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315624
1043	NC_013501	GCC	2	6	46218	46223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315624
1044	NC_013501	GCC	2	6	46230	46235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315624
1045	NC_013501	GCG	2	6	46296	46301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315624
1046	NC_013501	CGC	2	6	46335	46340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315624
1047	NC_013501	TTC	2	6	46385	46390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315624
1048	NC_013501	GCC	2	6	46419	46424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315624
1049	NC_013501	CG	3	6	46462	46467	0 %	0 %	50 %	50 %	268315624
1050	NC_013501	GCA	2	6	46477	46482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315624
1051	NC_013501	CGAC	2	8	46492	46499	25 %	0 %	25 %	50 %	268315624
1052	NC_013501	CTT	2	6	46564	46569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315624
1053	NC_013501	CAC	2	6	46577	46582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315624
1054	NC_013501	CGCACG	2	12	46590	46601	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268315624
1055	NC_013501	GCG	2	6	46630	46635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315624
1056	NC_013501	CGGCC	2	10	46741	46750	0 %	0 %	40 %	60 %	268315624
1057	NC_013501	CG	3	6	46834	46839	0 %	0 %	50 %	50 %	268315624
1058	NC_013501	TGG	2	6	46849	46854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315624
1059	NC_013501	GGAG	2	8	46963	46970	25 %	0 %	75 %	0 %	268315625
1060	NC_013501	GCG	2	6	47064	47069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315625
1061	NC_013501	CTG	2	6	47084	47089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315625
1062	NC_013501	TGA	2	6	47160	47165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315625
1063	NC_013501	CAA	2	6	47170	47175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315625
1064	NC_013501	CAA	2	6	47221	47226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315625
1065	NC_013501	CTA	2	6	47248	47253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315625
1066	NC_013501	ACT	2	6	47256	47261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315625
1067	NC_013501	GATC	2	8	47329	47336	25 %	25 %	25 %	25 %	268315625
1068	NC_013501	CCA	2	6	47352	47357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315625
1069	NC_013501	GTG	2	6	47390	47395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315625
1070	NC_013501	CAG	2	6	47471	47476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315625
1071	NC_013501	CTA	2	6	47515	47520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315625
1072	NC_013501	ACG	2	6	47529	47534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315625
1073	NC_013501	GTG	2	6	47573	47578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315625
1074	NC_013501	GAG	2	6	47600	47605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315625
1075	NC_013501	CGA	2	6	47632	47637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315625
1076	NC_013501	GAG	2	6	47687	47692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315625
1077	NC_013501	CGC	2	6	47730	47735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315625
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1079	NC_013501	GGC	2	6	47784	47789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315625
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1082	NC_013501	GAC	2	6	47969	47974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315625
1083	NC_013501	TCA	2	6	47982	47987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315625
1084	NC_013501	CGA	2	6	47989	47994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315625
1085	NC_013501	GAG	2	6	48116	48121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315625
1086	NC_013501	GCG	3	9	48189	48197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315625
1087	NC_013501	TGG	2	6	48198	48203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315625
1088	NC_013501	ATC	2	6	48212	48217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315625
1089	NC_013501	CGAGGT	2	12	48241	48252	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268315625
1090	NC_013501	CGA	2	6	48274	48279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315625
1091	NC_013501	GAA	2	6	48287	48292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315625
1092	NC_013501	GGT	2	6	48301	48306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315625
1093	NC_013501	GC	3	6	48308	48313	0 %	0 %	50 %	50 %	268315625
1094	NC_013501	CTG	2	6	48440	48445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315625
1095	NC_013501	CTG	2	6	48491	48496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315625
1096	NC_013501	TGG	2	6	48528	48533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315625
1097	NC_013501	AGG	2	6	48552	48557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315625
1098	NC_013501	CGCT	2	8	48575	48582	0 %	25 %	25 %	50 %	268315625
1099	NC_013501	CGG	2	6	48591	48596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315625
1100	NC_013501	GGCG	2	8	48597	48604	0 %	0 %	75 %	25 %	268315625
1101	NC_013501	CGA	2	6	48673	48678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315625
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1103	NC_013501	CGC	2	6	48732	48737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315625
1104	NC_013501	CG	3	6	48753	48758	0 %	0 %	50 %	50 %	268315625
1105	NC_013501	GAG	2	6	48827	48832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315625
1106	NC_013501	GCC	2	6	48841	48846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315625
1107	NC_013501	GCC	2	6	48932	48937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315625
1108	NC_013501	GCGG	2	8	48955	48962	0 %	0 %	75 %	25 %	268315625
1109	NC_013501	GACG	2	8	49087	49094	25 %	0 %	50 %	25 %	268315626
1110	NC_013501	CGG	2	6	49112	49117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315626
1111	NC_013501	GCG	2	6	49136	49141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315626
1112	NC_013501	GGA	2	6	49144	49149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315626
1113	NC_013501	CGC	2	6	49157	49162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315626
1114	NC_013501	GCG	2	6	49258	49263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315626
1115	NC_013501	CGG	2	6	49352	49357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315626
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1118	NC_013501	GC	3	6	49454	49459	0 %	0 %	50 %	50 %	268315626
1119	NC_013501	CGA	2	6	49465	49470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315626
1120	NC_013501	GGTGCT	2	12	49492	49503	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	268315626
1121	NC_013501	CAA	2	6	49570	49575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315626
1122	NC_013501	GAA	2	6	49675	49680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315627
1123	NC_013501	GGA	2	6	49701	49706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315627
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1125	NC_013501	GGC	2	6	49719	49724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315627
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1246	NC_013501	CCAG	2	8	55682	55689	25 %	0 %	25 %	50 %	268315632
1247	NC_013501	CGTG	2	8	55691	55698	0 %	25 %	50 %	25 %	268315632
1248	NC_013501	GCA	2	6	55751	55756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315632
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1374	NC_013501	CG	4	8	61608	61615	0 %	0 %	50 %	50 %	268315638
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1499	NC_013501	AAGCAG	2	12	68045	68056	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	268315643
1500	NC_013501	TGA	2	6	68138	68143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315643

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