MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_013501	AGCCC	2	10	633440	633449	20 %	0 %	20 %	60 %	268316128
14002	NC_013501	AGG	2	6	633485	633490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316128
14003	NC_013501	GTG	2	6	633517	633522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316128
14004	NC_013501	CACG	2	8	633576	633583	25 %	0 %	25 %	50 %	268316128
14005	NC_013501	AGA	2	6	633726	633731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316128
14006	NC_013501	GCC	2	6	633733	633738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316128
14007	NC_013501	ACG	2	6	633758	633763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316128
14008	NC_013501	CGA	2	6	633780	633785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316128
14009	NC_013501	TCG	2	6	633845	633850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316128
14010	NC_013501	AGA	2	6	633899	633904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316128
14011	NC_013501	GGA	2	6	633954	633959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316128
14012	NC_013501	TCA	2	6	633989	633994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316128
14013	NC_013501	GCG	2	6	634033	634038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316128
14014	NC_013501	CGA	2	6	634065	634070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316128
14015	NC_013501	CGA	2	6	634158	634163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316128
14016	NC_013501	TCA	2	6	634172	634177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316128
14017	NC_013501	GCT	2	6	634188	634193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316128
14018	NC_013501	CAA	2	6	634200	634205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316128
14019	NC_013501	CAC	2	6	634290	634295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316128
14020	NC_013501	CGC	2	6	634302	634307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316128
14021	NC_013501	CCA	2	6	634311	634316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316128
14022	NC_013501	GTC	2	6	634318	634323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316128
14023	NC_013501	CAT	2	6	634368	634373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316128
14024	NC_013501	GGA	2	6	634416	634421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316128
14025	NC_013501	ACGA	2	8	634549	634556	50 %	0 %	25 %	25 %	268316128
14026	NC_013501	GT	3	6	634657	634662	0 %	50 %	50 %	0 %	268316128
14027	NC_013501	GAG	2	6	634729	634734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316128
14028	NC_013501	CG	3	6	634737	634742	0 %	0 %	50 %	50 %	268316128
14029	NC_013501	CAC	2	6	634743	634748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316128
14030	NC_013501	CGG	2	6	634810	634815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316128
14031	NC_013501	TCG	2	6	634820	634825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316128
14032	NC_013501	TCG	2	6	634862	634867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316128
14033	NC_013501	CGA	2	6	634884	634889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316128
14034	NC_013501	CGC	2	6	634941	634946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316128
14035	NC_013501	ACC	2	6	634972	634977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316128
14036	NC_013501	GAG	2	6	634981	634986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316128
14037	NC_013501	GAC	3	9	634998	635006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316128
14038	NC_013501	GAG	2	6	635008	635013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316128
14039	NC_013501	CAT	2	6	635249	635254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316129
14040	NC_013501	GAA	2	6	635364	635369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316129
14041	NC_013501	GAC	2	6	635550	635555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316129
14042	NC_013501	CGA	2	6	635558	635563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316129
14043	NC_013501	CAG	2	6	635574	635579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316129
14044	NC_013501	TGC	2	6	635581	635586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316129
14045	NC_013501	CAGGC	2	10	635665	635674	20 %	0 %	40 %	40 %	268316129
14046	NC_013501	GAC	2	6	635727	635732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316129
14047	NC_013501	GCG	2	6	635737	635742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316129
14048	NC_013501	CGG	2	6	635855	635860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316130
14049	NC_013501	TGT	2	6	635863	635868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316130
14050	NC_013501	TGC	2	6	635875	635880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316130
14051	NC_013501	CAG	2	6	635889	635894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316130
14052	NC_013501	CTGG	2	8	635966	635973	0 %	25 %	50 %	25 %	268316130
14053	NC_013501	CTG	2	6	635982	635987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316130
14054	NC_013501	CGGC	2	8	636046	636053	0 %	0 %	50 %	50 %	268316130
14055	NC_013501	GGT	2	6	636096	636101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316130
14056	NC_013501	CCG	2	6	636139	636144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316130
14057	NC_013501	ACGAT	2	10	636163	636172	40 %	20 %	20 %	20 %	268316130
14058	NC_013501	GAA	2	6	636195	636200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316130
14059	NC_013501	CTG	2	6	636258	636263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316130
14060	NC_013501	GC	5	10	636384	636393	0 %	0 %	50 %	50 %	268316130
14061	NC_013501	TAC	2	6	636411	636416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316130
14062	NC_013501	GCA	2	6	636446	636451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316130
14063	NC_013501	CCG	2	6	636511	636516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316131
14064	NC_013501	TGG	2	6	636520	636525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316131
14065	NC_013501	TGC	2	6	636538	636543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316131
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14067	NC_013501	GGC	2	6	636584	636589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316131
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14069	NC_013501	CG	5	10	636649	636658	0 %	0 %	50 %	50 %	268316131
14070	NC_013501	CGG	2	6	636749	636754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316131
14071	NC_013501	CTT	2	6	636787	636792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316131
14072	NC_013501	TGC	2	6	636856	636861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316131
14073	NC_013501	CCAGC	2	10	636881	636890	20 %	0 %	20 %	60 %	268316131
14074	NC_013501	AGGTGA	2	12	636892	636903	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	268316131
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14083	NC_013501	GAA	2	6	637445	637450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316131
14084	NC_013501	ACG	2	6	637475	637480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316131
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14086	NC_013501	TGG	2	6	637496	637501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316131
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14089	NC_013501	CGG	2	6	637810	637815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316132
14090	NC_013501	GCC	2	6	637841	637846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316132
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14092	NC_013501	GCT	2	6	637940	637945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316132
14093	NC_013501	TGC	2	6	637963	637968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316132
14094	NC_013501	CTG	2	6	637983	637988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316132
14095	NC_013501	GGGC	2	8	638030	638037	0 %	0 %	75 %	25 %	268316132
14096	NC_013501	CGA	2	6	638114	638119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316132
14097	NC_013501	GCT	2	6	638126	638131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316132
14098	NC_013501	CAGCTC	2	12	638157	638168	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268316132
14099	NC_013501	GAG	2	6	638175	638180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316132
14100	NC_013501	GC	3	6	638288	638293	0 %	0 %	50 %	50 %	268316132
14101	NC_013501	CGA	2	6	638300	638305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316132
14102	NC_013501	CCGC	2	8	638309	638316	0 %	0 %	25 %	75 %	268316132
14103	NC_013501	CGTG	2	8	638369	638376	0 %	25 %	50 %	25 %	268316132
14104	NC_013501	ACG	2	6	638421	638426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316132
14105	NC_013501	CAT	2	6	638435	638440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316132
14106	NC_013501	CAA	2	6	638447	638452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316132
14107	NC_013501	CGA	2	6	638453	638458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316132
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14109	NC_013501	ATC	2	6	638604	638609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316132
14110	NC_013501	TCT	2	6	638680	638685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316132
14111	NC_013501	CGA	2	6	638747	638752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316132
14112	NC_013501	TGC	2	6	638785	638790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316132
14113	NC_013501	CGG	3	9	638825	638833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316132
14114	NC_013501	GCGG	2	8	638876	638883	0 %	0 %	75 %	25 %	268316132
14115	NC_013501	GAT	2	6	638918	638923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316132
14116	NC_013501	GCA	2	6	638984	638989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316132
14117	NC_013501	CAA	3	9	639023	639031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316132
14118	NC_013501	GCA	2	6	639041	639046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316132
14119	NC_013501	TGC	2	6	639049	639054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316132
14120	NC_013501	AGC	2	6	639121	639126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316133
14121	NC_013501	CGCA	2	8	639134	639141	25 %	0 %	25 %	50 %	268316133
14122	NC_013501	TGC	2	6	639196	639201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316133
14123	NC_013501	GCG	2	6	639233	639238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316133
14124	NC_013501	GCA	2	6	639275	639280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316133
14125	NC_013501	CGG	2	6	639311	639316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316133
14126	NC_013501	TCCA	2	8	639324	639331	25 %	25 %	0 %	50 %	268316133
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14130	NC_013501	GC	4	8	639551	639558	0 %	0 %	50 %	50 %	268316133
14131	NC_013501	CCGGT	2	10	639577	639586	0 %	20 %	40 %	40 %	268316133
14132	NC_013501	GCT	2	6	639599	639604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316133
14133	NC_013501	GCT	2	6	639608	639613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316133
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14136	NC_013501	TGC	2	6	639880	639885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316133
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14139	NC_013501	CTG	3	9	640002	640010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316133
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14143	NC_013501	GCG	3	9	640262	640270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316133
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14147	NC_013501	CG	3	6	640463	640468	0 %	0 %	50 %	50 %	268316133
14148	NC_013501	GCT	2	6	640508	640513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316133
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14157	NC_013501	GAAC	2	8	641126	641133	50 %	0 %	25 %	25 %	268316134
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14218	NC_013501	CTGC	2	8	644134	644141	0 %	25 %	25 %	50 %	268316136
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14222	NC_013501	GC	3	6	644243	644248	0 %	0 %	50 %	50 %	268316136
14223	NC_013501	GAAC	2	8	644292	644299	50 %	0 %	25 %	25 %	268316136
14224	NC_013501	CGT	2	6	644325	644330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316136
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14226	NC_013501	GGC	2	6	644385	644390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316136
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14228	NC_013501	CCG	2	6	644445	644450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316136
14229	NC_013501	GCT	2	6	644454	644459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316136
14230	NC_013501	CCA	2	6	644490	644495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316136
14231	NC_013501	GGATCC	2	12	644562	644573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268316136
14232	NC_013501	AGG	2	6	644654	644659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316136
14233	NC_013501	CGG	2	6	644707	644712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316136
14234	NC_013501	GC	3	6	644766	644771	0 %	0 %	50 %	50 %	268316136
14235	NC_013501	GGC	2	6	644799	644804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316136
14236	NC_013501	ACC	2	6	644891	644896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316136
14237	NC_013501	GCT	2	6	644909	644914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316137
14238	NC_013501	GCT	2	6	644960	644965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316137
14239	NC_013501	CGG	2	6	644999	645004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316137
14240	NC_013501	CGT	2	6	645048	645053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316137
14241	NC_013501	CGG	2	6	645073	645078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316137
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14244	NC_013501	GTG	3	9	645195	645203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316137
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14250	NC_013501	GCG	2	6	645408	645413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316137
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14252	NC_013501	CTG	2	6	645570	645575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316137
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14259	NC_013501	TGG	2	6	645850	645855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316138
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14265	NC_013501	GTG	2	6	645984	645989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316138
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14267	NC_013501	GCTGG	2	10	646136	646145	0 %	20 %	60 %	20 %	268316138
14268	NC_013501	ATCG	2	8	646173	646180	25 %	25 %	25 %	25 %	268316138
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14272	NC_013501	CTG	2	6	646317	646322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316138
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14335	NC_013501	GACG	2	8	648575	648582	25 %	0 %	50 %	25 %	268316140
14336	NC_013501	TTCG	2	8	648614	648621	0 %	50 %	25 %	25 %	268316140
14337	NC_013501	CTG	2	6	648630	648635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316140
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14345	NC_013501	GTG	2	6	648897	648902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316140
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14347	NC_013501	TGC	3	9	649045	649053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316140
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14351	NC_013501	TAT	2	6	649191	649196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268316140
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14353	NC_013501	GCCC	2	8	649229	649236	0 %	0 %	25 %	75 %	268316140
14354	NC_013501	GTGCCG	2	12	649269	649280	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268316140
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14474	NC_013501	GCG	2	6	653771	653776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316144
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14478	NC_013501	GCT	2	6	653911	653916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316145
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