MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013501	CGT	2	6	590327	590332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316094
13002	NC_013501	TCG	2	6	590386	590391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316094
13003	NC_013501	AAG	2	6	590398	590403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316094
13004	NC_013501	CGA	2	6	590459	590464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316094
13005	NC_013501	TGT	2	6	590465	590470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316094
13006	NC_013501	CTT	2	6	590495	590500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316094
13007	NC_013501	CCAG	2	8	590510	590517	25 %	0 %	25 %	50 %	268316094
13008	NC_013501	TGTC	2	8	590526	590533	0 %	50 %	25 %	25 %	268316094
13009	NC_013501	CCCA	2	8	590554	590561	25 %	0 %	0 %	75 %	268316094
13010	NC_013501	GTCG	2	8	590571	590578	0 %	25 %	50 %	25 %	268316094
13011	NC_013501	TGG	2	6	590579	590584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316094
13012	NC_013501	GC	3	6	590635	590640	0 %	0 %	50 %	50 %	268316094
13013	NC_013501	TGC	2	6	590653	590658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316094
13014	NC_013501	GCT	2	6	590678	590683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316094
13015	NC_013501	GGT	2	6	590700	590705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316094
13016	NC_013501	CCAG	2	8	590795	590802	25 %	0 %	25 %	50 %	268316094
13017	NC_013501	CGA	2	6	590819	590824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316094
13018	NC_013501	CCA	2	6	590883	590888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316094
13019	NC_013501	CAG	2	6	590907	590912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316094
13020	NC_013501	CGT	2	6	590918	590923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316094
13021	NC_013501	GGC	2	6	590944	590949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316094
13022	NC_013501	CGTGAC	2	12	590970	590981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268316094
13023	NC_013501	CGT	2	6	590988	590993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316094
13024	NC_013501	CCA	3	9	591005	591013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316094
13025	NC_013501	GCA	2	6	591014	591019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316094
13026	NC_013501	GC	3	6	591032	591037	0 %	0 %	50 %	50 %	268316094
13027	NC_013501	CTGC	2	8	591332	591339	0 %	25 %	25 %	50 %	268316095
13028	NC_013501	CGA	2	6	591464	591469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
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13032	NC_013501	CG	3	6	591706	591711	0 %	0 %	50 %	50 %	268316095
13033	NC_013501	ACGC	2	8	591714	591721	25 %	0 %	25 %	50 %	268316095
13034	NC_013501	GCCG	2	8	591725	591732	0 %	0 %	50 %	50 %	268316095
13035	NC_013501	CGC	2	6	591737	591742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316095
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13040	NC_013501	GCC	2	6	592027	592032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316095
13041	NC_013501	GCT	2	6	592103	592108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316095
13042	NC_013501	TC	3	6	592135	592140	0 %	50 %	0 %	50 %	268316095
13043	NC_013501	ACG	2	6	592147	592152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
13044	NC_013501	CTG	2	6	592158	592163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316095
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13050	NC_013501	ATC	2	6	592321	592326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316095
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13052	NC_013501	CGA	2	6	592406	592411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
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13054	NC_013501	ACG	2	6	592522	592527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
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13059	NC_013501	GCCG	2	8	592778	592785	0 %	0 %	50 %	50 %	268316095
13060	NC_013501	CAACGG	2	12	592835	592846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
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13063	NC_013501	CGA	2	6	592904	592909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316095
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13092	NC_013501	GGCG	2	8	593868	593875	0 %	0 %	75 %	25 %	268316096
13093	NC_013501	GAC	2	6	593890	593895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316096
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13098	NC_013501	CGA	2	6	594113	594118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316096
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13102	NC_013501	GTC	2	6	594190	594195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316096
13103	NC_013501	TC	3	6	594204	594209	0 %	50 %	0 %	50 %	268316096
13104	NC_013501	CGT	2	6	594213	594218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316096
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13109	NC_013501	GCG	2	6	594332	594337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316096
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13114	NC_013501	CCGGG	2	10	594492	594501	0 %	0 %	60 %	40 %	268316096
13115	NC_013501	GCC	2	6	594503	594508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316096
13116	NC_013501	ACCG	2	8	594509	594516	25 %	0 %	25 %	50 %	268316096
13117	NC_013501	GAA	2	6	594517	594522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316096
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13239	NC_013501	CAT	2	6	599036	599041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316098
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13462	NC_013501	GGT	4	12	609666	609677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316106
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13475	NC_013501	AGG	2	6	610079	610084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316106
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13477	NC_013501	GTG	2	6	610246	610251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316106
13478	NC_013501	TGGG	2	8	610273	610280	0 %	25 %	75 %	0 %	268316106
13479	NC_013501	TCG	2	6	610285	610290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316106
13480	NC_013501	GGT	2	6	610317	610322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316106
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13483	NC_013501	AGT	2	6	610480	610485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316107
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