MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_013501	GGT	2	6	547300	547305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316060
12003	NC_013501	CTGG	2	8	547350	547357	0 %	25 %	50 %	25 %	268316060
12004	NC_013501	GCG	2	6	547367	547372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316060
12005	NC_013501	TGGG	2	8	547389	547396	0 %	25 %	75 %	0 %	268316060
12006	NC_013501	CCG	2	6	547418	547423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316060
12007	NC_013501	CGG	2	6	547471	547476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316060
12008	NC_013501	CGA	2	6	547498	547503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316060
12009	NC_013501	GCCG	2	8	547532	547539	0 %	0 %	50 %	50 %	268316060
12010	NC_013501	TGC	2	6	547584	547589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316060
12011	NC_013501	CGC	2	6	547598	547603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316060
12012	NC_013501	GCT	3	9	547615	547623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316060
12013	NC_013501	CCGA	2	8	547667	547674	25 %	0 %	25 %	50 %	268316060
12014	NC_013501	CCGG	2	8	547680	547687	0 %	0 %	50 %	50 %	268316060
12015	NC_013501	CGTG	2	8	547817	547824	0 %	25 %	50 %	25 %	268316060
12016	NC_013501	GCG	2	6	547834	547839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316060
12017	NC_013501	GCT	2	6	547957	547962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316060
12018	NC_013501	CGT	2	6	547977	547982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316060
12019	NC_013501	GAC	2	6	548002	548007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316060
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12021	NC_013501	GATC	2	8	548023	548030	25 %	25 %	25 %	25 %	268316060
12022	NC_013501	TCG	2	6	548147	548152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316061
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12029	NC_013501	GC	3	6	548380	548385	0 %	0 %	50 %	50 %	268316061
12030	NC_013501	CGA	2	6	548391	548396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316061
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12035	NC_013501	TCG	2	6	548559	548564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316061
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12039	NC_013501	GGC	2	6	548695	548700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316061
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12043	NC_013501	GGCG	2	8	548889	548896	0 %	0 %	75 %	25 %	268316061
12044	NC_013501	CGA	2	6	548968	548973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316061
12045	NC_013501	CGAGC	2	10	548983	548992	20 %	0 %	40 %	40 %	268316061
12046	NC_013501	GCA	2	6	549030	549035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316061
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12052	NC_013501	CGT	2	6	549228	549233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316061
12053	NC_013501	GC	3	6	549273	549278	0 %	0 %	50 %	50 %	268316061
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12104	NC_013501	GGTG	2	8	551130	551137	0 %	25 %	75 %	0 %	268316063
12105	NC_013501	GCCG	2	8	551148	551155	0 %	0 %	50 %	50 %	268316063
12106	NC_013501	GGAAA	2	10	551161	551170	60 %	0 %	40 %	0 %	268316063
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12112	NC_013501	GC	4	8	551559	551566	0 %	0 %	50 %	50 %	268316063
12113	NC_013501	CCA	2	6	551597	551602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316063
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12119	NC_013501	CCG	2	6	551803	551808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316063
12120	NC_013501	TCGAC	2	10	551873	551882	20 %	20 %	20 %	40 %	268316063
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12225	NC_013501	CG	3	6	556618	556623	0 %	0 %	50 %	50 %	268316068
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12231	NC_013501	TGGCG	2	10	556818	556827	0 %	20 %	60 %	20 %	268316068
12232	NC_013501	GCC	2	6	556833	556838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316068
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12236	NC_013501	CAT	2	6	556990	556995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316068
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12358	NC_013501	GCC	2	6	563385	563390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316074
12359	NC_013501	GC	3	6	563409	563414	0 %	0 %	50 %	50 %	268316074
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