MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013501	CTG	2	6	518232	518237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316042
11502	NC_013501	GTC	2	6	518248	518253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316042
11503	NC_013501	TGG	2	6	518437	518442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316042
11504	NC_013501	GT	3	6	518443	518448	0 %	50 %	50 %	0 %	268316042
11505	NC_013501	GCC	2	6	518465	518470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316042
11506	NC_013501	GGA	2	6	518471	518476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316042
11507	NC_013501	GGT	3	9	518567	518575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316042
11508	NC_013501	CGATT	2	10	518728	518737	20 %	40 %	20 %	20 %	268316043
11509	NC_013501	GCG	2	6	518796	518801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316043
11510	NC_013501	CG	3	6	518845	518850	0 %	0 %	50 %	50 %	268316043
11511	NC_013501	GCT	2	6	518918	518923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316043
11512	NC_013501	GGA	2	6	518951	518956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316043
11513	NC_013501	ACG	2	6	519033	519038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316043
11514	NC_013501	GGC	2	6	519098	519103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316043
11515	NC_013501	ACGT	2	8	519144	519151	25 %	25 %	25 %	25 %	268316043
11516	NC_013501	GGC	2	6	519194	519199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316043
11517	NC_013501	GC	4	8	519304	519311	0 %	0 %	50 %	50 %	268316043
11518	NC_013501	GAC	2	6	519345	519350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316043
11519	NC_013501	GCG	2	6	519375	519380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316043
11520	NC_013501	TCA	2	6	519418	519423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316043
11521	NC_013501	GCAC	2	8	519430	519437	25 %	0 %	25 %	50 %	268316043
11522	NC_013501	CGCC	2	8	519469	519476	0 %	0 %	25 %	75 %	268316043
11523	NC_013501	GC	3	6	519484	519489	0 %	0 %	50 %	50 %	268316043
11524	NC_013501	AGGAC	2	10	519541	519550	40 %	0 %	40 %	20 %	268316043
11525	NC_013501	GCA	2	6	519605	519610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316043
11526	NC_013501	GC	3	6	519635	519640	0 %	0 %	50 %	50 %	268316043
11527	NC_013501	CCG	2	6	519661	519666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316043
11528	NC_013501	GCTG	2	8	519685	519692	0 %	25 %	50 %	25 %	268316043
11529	NC_013501	CGG	2	6	519696	519701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316043
11530	NC_013501	CGG	2	6	519770	519775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316043
11531	NC_013501	GCC	2	6	519795	519800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316043
11532	NC_013501	CGG	2	6	519818	519823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316043
11533	NC_013501	GGC	2	6	519897	519902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316043
11534	NC_013501	GGC	2	6	519935	519940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316043
11535	NC_013501	AGC	2	6	520045	520050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316043
11536	NC_013501	CACG	2	8	520067	520074	25 %	0 %	25 %	50 %	268316043
11537	NC_013501	GC	3	6	520136	520141	0 %	0 %	50 %	50 %	268316043
11538	NC_013501	GTG	3	9	520152	520160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316043
11539	NC_013501	CGGC	2	8	520164	520171	0 %	0 %	50 %	50 %	268316043
11540	NC_013501	GCC	2	6	520276	520281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316043
11541	NC_013501	AAG	2	6	520324	520329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316043
11542	NC_013501	GC	3	6	520336	520341	0 %	0 %	50 %	50 %	268316043
11543	NC_013501	CTG	2	6	520353	520358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316043
11544	NC_013501	GGC	2	6	520388	520393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316043
11545	NC_013501	CG	3	6	520426	520431	0 %	0 %	50 %	50 %	268316043
11546	NC_013501	AGG	2	6	520468	520473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316043
11547	NC_013501	CCG	2	6	520497	520502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316043
11548	NC_013501	GTGC	2	8	520668	520675	0 %	25 %	50 %	25 %	268316043
11549	NC_013501	GCT	2	6	520676	520681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316043
11550	NC_013501	TTCT	2	8	520757	520764	0 %	75 %	0 %	25 %	268316044
11551	NC_013501	GCG	2	6	520796	520801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316044
11552	NC_013501	CAC	2	6	520825	520830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316044
11553	NC_013501	GGA	2	6	521047	521052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316044
11554	NC_013501	GGC	2	6	521104	521109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316044
11555	NC_013501	CGA	2	6	521152	521157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316044
11556	NC_013501	GTC	2	6	521161	521166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316044
11557	NC_013501	GGT	2	6	521191	521196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316044
11558	NC_013501	GCC	2	6	521237	521242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316044
11559	NC_013501	TGC	2	6	521265	521270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316044
11560	NC_013501	GGC	2	6	521272	521277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316044
11561	NC_013501	CCA	2	6	521298	521303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316044
11562	NC_013501	TGA	2	6	521316	521321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316044
11563	NC_013501	G	6	6	521922	521927	0 %	0 %	100 %	0 %	268316045
11564	NC_013501	CTG	2	6	521928	521933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316045
11565	NC_013501	GACG	2	8	522024	522031	25 %	0 %	50 %	25 %	268316045
11566	NC_013501	GAAGTC	2	12	522072	522083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	268316045
11567	NC_013501	ATC	2	6	522099	522104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316045
11568	NC_013501	GGTC	2	8	522209	522216	0 %	25 %	50 %	25 %	268316045
11569	NC_013501	CGG	2	6	522233	522238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316045
11570	NC_013501	GGC	2	6	522275	522280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316045
11571	NC_013501	ACC	2	6	522295	522300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316045
11572	NC_013501	CGG	2	6	522305	522310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316045
11573	NC_013501	ACGT	2	8	522384	522391	25 %	25 %	25 %	25 %	268316045
11574	NC_013501	GAG	2	6	522405	522410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316045
11575	NC_013501	ACC	2	6	522489	522494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316045
11576	NC_013501	CCA	2	6	522502	522507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316045
11577	NC_013501	GCA	2	6	522521	522526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316045
11578	NC_013501	CGC	2	6	522652	522657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316045
11579	NC_013501	GC	3	6	522687	522692	0 %	0 %	50 %	50 %	268316045
11580	NC_013501	TGC	2	6	522748	522753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316045
11581	NC_013501	GC	3	6	522769	522774	0 %	0 %	50 %	50 %	268316045
11582	NC_013501	GCC	2	6	522783	522788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316045
11583	NC_013501	CAC	2	6	522803	522808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316045
11584	NC_013501	CAT	2	6	522815	522820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316045
11585	NC_013501	ACC	2	6	522831	522836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316045
11586	NC_013501	GGC	2	6	522894	522899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316045
11587	NC_013501	TCTG	2	8	522925	522932	0 %	50 %	25 %	25 %	268316045
11588	NC_013501	GCA	2	6	522938	522943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316045
11589	NC_013501	CAA	2	6	522959	522964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316045
11590	NC_013501	TGC	2	6	522985	522990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316045
11591	NC_013501	AGT	2	6	523042	523047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316045
11592	NC_013501	TGC	2	6	523126	523131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316046
11593	NC_013501	GCT	2	6	523375	523380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316046
11594	NC_013501	AGC	2	6	523423	523428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316046
11595	NC_013501	GGT	2	6	523460	523465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316046
11596	NC_013501	GCAC	2	8	523483	523490	25 %	0 %	25 %	50 %	268316046
11597	NC_013501	GCG	2	6	523693	523698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316046
11598	NC_013501	CCG	2	6	523733	523738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316046
11599	NC_013501	ACCT	2	8	523746	523753	25 %	25 %	0 %	50 %	268316046
11600	NC_013501	GGC	2	6	523764	523769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316046
11601	NC_013501	GCC	2	6	523788	523793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316046
11602	NC_013501	GCCG	2	8	523796	523803	0 %	0 %	50 %	50 %	268316046
11603	NC_013501	TGC	2	6	523999	524004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316046
11604	NC_013501	GCA	2	6	524120	524125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316046
11605	NC_013501	GGC	2	6	524150	524155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316046
11606	NC_013501	ACC	2	6	524176	524181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316046
11607	NC_013501	TGC	2	6	524227	524232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316046
11608	NC_013501	GACGC	2	10	524319	524328	20 %	0 %	40 %	40 %	268316046
11609	NC_013501	CGA	2	6	524369	524374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316046
11610	NC_013501	GCTTCG	2	12	524394	524405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316046
11611	NC_013501	GTG	2	6	524466	524471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316046
11612	NC_013501	CCG	2	6	524524	524529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316046
11613	NC_013501	ACA	2	6	524545	524550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316046
11614	NC_013501	CCGTG	2	10	524597	524606	0 %	20 %	40 %	40 %	268316046
11615	NC_013501	GGTC	2	8	524641	524648	0 %	25 %	50 %	25 %	268316046
11616	NC_013501	GCG	2	6	524679	524684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316047
11617	NC_013501	GCT	2	6	524709	524714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316047
11618	NC_013501	GGC	2	6	524715	524720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316047
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11620	NC_013501	CGGA	2	8	524762	524769	25 %	0 %	50 %	25 %	268316047
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11858	NC_013501	GCT	2	6	535557	535562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316054
11859	NC_013501	GAC	2	6	535570	535575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316054
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11863	NC_013501	TCG	2	6	535748	535753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316054
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