MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013501	TAC	2	6	498097	498102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316024
11002	NC_013501	GCG	2	6	498172	498177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316024
11003	NC_013501	TCG	2	6	498236	498241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316024
11004	NC_013501	CCG	2	6	498250	498255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316024
11005	NC_013501	CGA	2	6	498266	498271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316024
11006	NC_013501	TCA	2	6	498308	498313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316024
11007	NC_013501	GAG	2	6	498376	498381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316024
11008	NC_013501	GCT	2	6	498387	498392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316024
11009	NC_013501	CG	4	8	498409	498416	0 %	0 %	50 %	50 %	268316024
11010	NC_013501	CCGGCT	2	12	498458	498469	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	268316024
11011	NC_013501	CCAGCC	2	12	498479	498490	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	268316024
11012	NC_013501	GAA	2	6	498511	498516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316024
11013	NC_013501	GGA	2	6	498540	498545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316024
11014	NC_013501	CTT	2	6	498554	498559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316024
11015	NC_013501	GAA	2	6	498664	498669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268316025
11016	NC_013501	CGA	2	6	498720	498725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316025
11017	NC_013501	ATC	2	6	498733	498738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316025
11018	NC_013501	GAC	2	6	498754	498759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316025
11019	NC_013501	TGA	2	6	498761	498766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316025
11020	NC_013501	CTG	2	6	498769	498774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316025
11021	NC_013501	TGC	2	6	498857	498862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316025
11022	NC_013501	TCGC	2	8	498884	498891	0 %	25 %	25 %	50 %	268316025
11023	NC_013501	TGA	2	6	498905	498910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316025
11024	NC_013501	ACA	2	6	499028	499033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268316025
11025	NC_013501	GC	3	6	499380	499385	0 %	0 %	50 %	50 %	268316026
11026	NC_013501	CGG	2	6	499400	499405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316026
11027	NC_013501	GCA	2	6	499426	499431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316026
11028	NC_013501	GCA	2	6	499435	499440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316026
11029	NC_013501	GAG	2	6	499448	499453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316026
11030	NC_013501	GGC	2	6	499477	499482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316026
11031	NC_013501	TGG	2	6	499487	499492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316026
11032	NC_013501	GC	4	8	499521	499528	0 %	0 %	50 %	50 %	268316026
11033	NC_013501	GCA	2	6	499531	499536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316026
11034	NC_013501	GCC	2	6	499551	499556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316026
11035	NC_013501	GGC	2	6	499603	499608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316026
11036	NC_013501	GCAC	2	8	499613	499620	25 %	0 %	25 %	50 %	268316026
11037	NC_013501	CGC	2	6	499629	499634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316026
11038	NC_013501	CTG	2	6	499655	499660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316026
11039	NC_013501	GCG	2	6	499682	499687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316026
11040	NC_013501	GCG	2	6	499765	499770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316026
11041	NC_013501	CCA	2	6	499773	499778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316026
11042	NC_013501	CAC	2	6	499784	499789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316026
11043	NC_013501	CGT	2	6	499850	499855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316026
11044	NC_013501	GCT	3	9	499929	499937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316027
11045	NC_013501	CGC	2	6	499980	499985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316027
11046	NC_013501	CAT	3	9	500019	500027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316027
11047	NC_013501	TCG	2	6	500144	500149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316027
11048	NC_013501	TGG	2	6	500164	500169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316027
11049	NC_013501	GAG	2	6	500218	500223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316027
11050	NC_013501	GTG	2	6	500236	500241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316027
11051	NC_013501	GCC	2	6	500242	500247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316027
11052	NC_013501	GGC	2	6	500284	500289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316027
11053	NC_013501	ACC	2	6	500290	500295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316027
11054	NC_013501	TCG	2	6	500299	500304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316027
11055	NC_013501	GTGC	2	8	500409	500416	0 %	25 %	50 %	25 %	268316027
11056	NC_013501	AGC	2	6	500453	500458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316027
11057	NC_013501	ATTC	2	8	500469	500476	25 %	50 %	0 %	25 %	268316027
11058	NC_013501	TGC	2	6	500510	500515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316027
11059	NC_013501	CGAC	2	8	500549	500556	25 %	0 %	25 %	50 %	268316027
11060	NC_013501	TTCCG	2	10	500570	500579	0 %	40 %	20 %	40 %	268316027
11061	NC_013501	CG	3	6	500586	500591	0 %	0 %	50 %	50 %	268316027
11062	NC_013501	TTC	2	6	500593	500598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316027
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11064	NC_013501	GC	3	6	500695	500700	0 %	0 %	50 %	50 %	268316027
11065	NC_013501	AGC	2	6	500741	500746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316027
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11068	NC_013501	GCG	2	6	500831	500836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316027
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11071	NC_013501	ACGC	2	8	500874	500881	25 %	0 %	25 %	50 %	268316027
11072	NC_013501	TGC	2	6	500987	500992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316027
11073	NC_013501	GCCA	2	8	501042	501049	25 %	0 %	25 %	50 %	268316027
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11076	NC_013501	GCT	2	6	501237	501242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316028
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11082	NC_013501	TCA	2	6	501596	501601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316028
11083	NC_013501	CG	3	6	501621	501626	0 %	0 %	50 %	50 %	268316028
11084	NC_013501	GAG	2	6	501658	501663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316028
11085	NC_013501	CGC	2	6	501680	501685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316028
11086	NC_013501	GGT	2	6	501693	501698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316028
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11088	NC_013501	GGC	2	6	501837	501842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316028
11089	NC_013501	CAG	2	6	501858	501863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316028
11090	NC_013501	GCG	2	6	501880	501885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316028
11091	NC_013501	GCC	2	6	501927	501932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316028
11092	NC_013501	ACGA	2	8	501961	501968	50 %	0 %	25 %	25 %	268316028
11093	NC_013501	CGG	2	6	502014	502019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316028
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11095	NC_013501	CGGGAT	2	12	502053	502064	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268316028
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11098	NC_013501	GCGAC	2	10	502137	502146	20 %	0 %	40 %	40 %	268316028
11099	NC_013501	GC	3	6	502217	502222	0 %	0 %	50 %	50 %	268316028
11100	NC_013501	G	6	6	502224	502229	0 %	0 %	100 %	0 %	268316028
11101	NC_013501	TGG	2	6	502235	502240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316028
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11104	NC_013501	GTG	2	6	502318	502323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316028
11105	NC_013501	GGC	2	6	502347	502352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316028
11106	NC_013501	CGG	2	6	502409	502414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316029
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11109	NC_013501	CTGGGA	2	12	502477	502488	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268316029
11110	NC_013501	GCG	2	6	502527	502532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316029
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11112	NC_013501	GTG	2	6	502555	502560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316029
11113	NC_013501	CGT	2	6	502571	502576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316029
11114	NC_013501	AGC	2	6	502586	502591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316029
11115	NC_013501	CGA	2	6	502665	502670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316029
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11118	NC_013501	CGG	2	6	502747	502752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316029
11119	NC_013501	GTG	2	6	502756	502761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316029
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11121	NC_013501	GGC	2	6	502833	502838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316029
11122	NC_013501	TGC	2	6	502883	502888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316029
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11225	NC_013501	GCCG	2	8	506820	506827	0 %	0 %	50 %	50 %	268316033
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11233	NC_013501	GGTC	2	8	507103	507110	0 %	25 %	50 %	25 %	268316033
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11238	NC_013501	CGG	2	6	507172	507177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316033
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11353	NC_013501	GGA	2	6	512174	512179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316038
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11355	NC_013501	GAT	2	6	512324	512329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316038
11356	NC_013501	CCAG	2	8	512401	512408	25 %	0 %	25 %	50 %	268316038
11357	NC_013501	GCC	2	6	512432	512437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316038
11358	NC_013501	CCGC	2	8	512455	512462	0 %	0 %	25 %	75 %	268316038
11359	NC_013501	GTG	2	6	512463	512468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316038
11360	NC_013501	GCC	2	6	512480	512485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316038
11361	NC_013501	TGA	2	6	512518	512523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316038
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11363	NC_013501	GAT	2	6	512546	512551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316038
11364	NC_013501	GCG	2	6	512555	512560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316038
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11369	NC_013501	GC	3	6	512770	512775	0 %	0 %	50 %	50 %	268316038
11370	NC_013501	GACG	2	8	512810	512817	25 %	0 %	50 %	25 %	268316038
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11375	NC_013501	CGA	2	6	513365	513370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316039
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11382	NC_013501	CGGG	2	8	513708	513715	0 %	0 %	75 %	25 %	268316039
11383	NC_013501	GCT	2	6	513746	513751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316039
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11388	NC_013501	GTG	2	6	513960	513965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316039
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11402	NC_013501	CTGGG	2	10	514494	514503	0 %	20 %	60 %	20 %	268316039
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11405	NC_013501	TTC	2	6	514675	514680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316040
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11454	NC_013501	TACCTG	2	12	516464	516475	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	268316041
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11458	NC_013501	GAC	2	6	516565	516570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316041
11459	NC_013501	GA	3	6	516591	516596	50 %	0 %	50 %	0 %	268316041
11460	NC_013501	GTG	2	6	516659	516664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316041
11461	NC_013501	TGG	2	6	516720	516725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316041
11462	NC_013501	TGG	2	6	516795	516800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316041
11463	NC_013501	TAC	2	6	516902	516907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316041
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11465	NC_013501	GGC	2	6	516977	516982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316042
11466	NC_013501	TGG	2	6	517011	517016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316042
11467	NC_013501	CGC	2	6	517023	517028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316042
11468	NC_013501	ACC	2	6	517035	517040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316042
11469	NC_013501	GGCC	2	8	517055	517062	0 %	0 %	50 %	50 %	268316042
11470	NC_013501	TGC	2	6	517201	517206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316042
11471	NC_013501	TAC	2	6	517230	517235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316042
11472	NC_013501	GCG	2	6	517271	517276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316042
11473	NC_013501	CG	4	8	517287	517294	0 %	0 %	50 %	50 %	268316042
11474	NC_013501	GTG	2	6	517308	517313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316042
11475	NC_013501	GCT	2	6	517382	517387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316042
11476	NC_013501	TGGG	2	8	517422	517429	0 %	25 %	75 %	0 %	268316042
11477	NC_013501	G	7	7	517472	517478	0 %	0 %	100 %	0 %	268316042
11478	NC_013501	GGT	2	6	517487	517492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316042
11479	NC_013501	GTT	2	6	517517	517522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316042
11480	NC_013501	GT	3	6	517534	517539	0 %	50 %	50 %	0 %	268316042
11481	NC_013501	TCA	2	6	517540	517545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316042
11482	NC_013501	G	6	6	517568	517573	0 %	0 %	100 %	0 %	268316042
11483	NC_013501	GC	3	6	517596	517601	0 %	0 %	50 %	50 %	268316042
11484	NC_013501	TGA	2	6	517666	517671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316042
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11487	NC_013501	GGT	2	6	517779	517784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316042
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