MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_013501	TCG	2	6	474460	474465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316002
10502	NC_013501	GCG	2	6	474474	474479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316002
10503	NC_013501	GCC	2	6	474549	474554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316002
10504	NC_013501	ACGGCC	2	12	474562	474573	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268316002
10505	NC_013501	CCG	2	6	474679	474684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316002
10506	NC_013501	AGC	2	6	474697	474702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316002
10507	NC_013501	GTC	2	6	474738	474743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316002
10508	NC_013501	AGG	2	6	474764	474769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316002
10509	NC_013501	AGC	2	6	474838	474843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316002
10510	NC_013501	GCGG	2	8	474861	474868	0 %	0 %	75 %	25 %	268316002
10511	NC_013501	GCG	2	6	474936	474941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316002
10512	NC_013501	GCA	2	6	474956	474961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316002
10513	NC_013501	TCG	2	6	475069	475074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316002
10514	NC_013501	GGC	2	6	475076	475081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316002
10515	NC_013501	GGAG	2	8	475143	475150	25 %	0 %	75 %	0 %	268316002
10516	NC_013501	GGC	2	6	475157	475162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316002
10517	NC_013501	CAG	3	9	475188	475196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316002
10518	NC_013501	ACGT	2	8	475207	475214	25 %	25 %	25 %	25 %	268316002
10519	NC_013501	TGCG	2	8	475237	475244	0 %	25 %	50 %	25 %	268316002
10520	NC_013501	GCC	2	6	475246	475251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316002
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10522	NC_013501	CGT	2	6	475337	475342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316002
10523	NC_013501	CGGCG	2	10	475412	475421	0 %	0 %	60 %	40 %	268316002
10524	NC_013501	GCT	2	6	475430	475435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316002
10525	NC_013501	CGG	2	6	475438	475443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316002
10526	NC_013501	GCCCG	2	10	475499	475508	0 %	0 %	40 %	60 %	268316002
10527	NC_013501	TTC	2	6	475539	475544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268316002
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10539	NC_013501	CGG	2	6	476919	476924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316003
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10546	NC_013501	GTT	2	6	477112	477117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268316004
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10549	NC_013501	GTG	2	6	477278	477283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316004
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10552	NC_013501	GCG	2	6	477482	477487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316004
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10554	NC_013501	GCC	2	6	477562	477567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316004
10555	NC_013501	GCT	2	6	477574	477579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316004
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10557	NC_013501	CGTGG	2	10	477637	477646	0 %	20 %	60 %	20 %	268316004
10558	NC_013501	CGG	2	6	477666	477671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316004
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10563	NC_013501	GGT	2	6	477820	477825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316005
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10567	NC_013501	CGGCG	2	10	478201	478210	0 %	0 %	60 %	40 %	268316005
10568	NC_013501	CGAG	2	8	478224	478231	25 %	0 %	50 %	25 %	268316005
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10592	NC_013501	CGT	2	6	479754	479759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316006
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10603	NC_013501	CTG	2	6	480557	480562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316007
10604	NC_013501	CTG	2	6	480590	480595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316007
10605	NC_013501	CT	3	6	480617	480622	0 %	50 %	0 %	50 %	268316007
10606	NC_013501	CTG	2	6	480653	480658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316007
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10610	NC_013501	TCA	2	6	480870	480875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316008
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10615	NC_013501	CGGT	2	8	481095	481102	0 %	25 %	50 %	25 %	268316008
10616	NC_013501	GGCATC	2	12	481103	481114	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268316008
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10975	NC_013501	ACG	2	6	497201	497206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316024
10976	NC_013501	CTG	2	6	497209	497214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316024
10977	NC_013501	GCA	2	6	497238	497243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316024
10978	NC_013501	GCG	2	6	497266	497271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316024
10979	NC_013501	GCC	2	6	497276	497281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316024
10980	NC_013501	TCG	2	6	497288	497293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316024
10981	NC_013501	GCC	2	6	497344	497349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316024
10982	NC_013501	CGA	2	6	497376	497381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316024
10983	NC_013501	ATC	2	6	497521	497526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316024
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10985	NC_013501	CAC	2	6	497536	497541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268316024
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10987	NC_013501	CGGC	2	8	497584	497591	0 %	0 %	50 %	50 %	268316024
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10991	NC_013501	CGG	2	6	497766	497771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316024
10992	NC_013501	CTG	2	6	497806	497811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316024
10993	NC_013501	GCT	2	6	497823	497828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316024
10994	NC_013501	GCC	2	6	497848	497853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268316024
10995	NC_013501	TGC	2	6	497864	497869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316024
10996	NC_013501	CGACG	2	10	497931	497940	20 %	0 %	40 %	40 %	268316024
10997	NC_013501	GGA	2	6	497952	497957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268316024
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10999	NC_013501	GCT	2	6	498006	498011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316024
11000	NC_013501	ACT	2	6	498068	498073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268316024

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