MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_013501	GGCC	2	8	453183	453190	0 %	0 %	50 %	50 %	268315985
10002	NC_013501	CTG	3	9	453198	453206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315985
10003	NC_013501	CGG	2	6	453251	453256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315985
10004	NC_013501	CGGCG	2	10	453264	453273	0 %	0 %	60 %	40 %	268315985
10005	NC_013501	GAA	3	9	453306	453314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315985
10006	NC_013501	CAG	2	6	453321	453326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315985
10007	NC_013501	GGT	2	6	453341	453346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315985
10008	NC_013501	GCA	2	6	453374	453379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315985
10009	NC_013501	GCC	2	6	453408	453413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315985
10010	NC_013501	CGA	2	6	453422	453427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315985
10011	NC_013501	ACG	2	6	453439	453444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315985
10012	NC_013501	ACG	2	6	453448	453453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315985
10013	NC_013501	CGA	2	6	453467	453472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315985
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10015	NC_013501	AGC	2	6	453505	453510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315985
10016	NC_013501	CCT	2	6	453515	453520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315985
10017	NC_013501	GCT	2	6	453536	453541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315985
10018	NC_013501	GCC	2	6	453554	453559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315985
10019	NC_013501	GCT	2	6	453718	453723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315986
10020	NC_013501	CGG	2	6	453745	453750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315986
10021	NC_013501	CAT	2	6	453865	453870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315986
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10023	NC_013501	CGA	2	6	453910	453915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315986
10024	NC_013501	GAT	2	6	454000	454005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315986
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10032	NC_013501	CGG	3	9	454224	454232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315986
10033	NC_013501	CTT	2	6	454303	454308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315986
10034	NC_013501	CCATC	2	10	454336	454345	20 %	20 %	0 %	60 %	268315986
10035	NC_013501	CAT	2	6	454357	454362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315986
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10039	NC_013501	CCGG	2	8	454456	454463	0 %	0 %	50 %	50 %	268315986
10040	NC_013501	CTGT	2	8	454632	454639	0 %	50 %	25 %	25 %	268315986
10041	NC_013501	GCC	2	6	454682	454687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315986
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10044	NC_013501	GGC	2	6	454794	454799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315986
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10052	NC_013501	GGC	2	6	455189	455194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315986
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10054	NC_013501	GCC	2	6	455245	455250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315986
10055	NC_013501	TCG	2	6	455280	455285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315986
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10057	NC_013501	GGA	2	6	455335	455340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315986
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10060	NC_013501	GACG	2	8	455540	455547	25 %	0 %	50 %	25 %	268315986
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10068	NC_013501	GTT	2	6	455825	455830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315986
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10119	NC_013501	GGC	2	6	457814	457819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315989
10120	NC_013501	TCA	2	6	457866	457871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315989
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10134	NC_013501	CTG	2	6	458390	458395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315989
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10144	NC_013501	TCG	2	6	458682	458687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315989
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10147	NC_013501	GCA	2	6	458746	458751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315989
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10217	NC_013501	GC	4	8	461271	461278	0 %	0 %	50 %	50 %	268315991
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10222	NC_013501	GCT	2	6	461487	461492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315991
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10226	NC_013501	GCT	2	6	461732	461737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315992
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10228	NC_013501	TCA	2	6	461839	461844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315992
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10231	NC_013501	A	6	6	462008	462013	100 %	0 %	0 %	0 %	268315993
10232	NC_013501	GTT	2	6	462065	462070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315993
10233	NC_013501	T	6	6	462069	462074	0 %	100 %	0 %	0 %	268315993
10234	NC_013501	ACT	2	6	462083	462088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315993
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10474	NC_013501	ACG	2	6	473053	473058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268316002
10475	NC_013501	GGC	2	6	473145	473150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268316002
10476	NC_013501	GTA	2	6	473163	473168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268316002
10477	NC_013501	GGT	2	6	473169	473174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268316002
10478	NC_013501	GC	3	6	473337	473342	0 %	0 %	50 %	50 %	268316002
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10480	NC_013501	CGT	2	6	473384	473389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268316002
10481	NC_013501	TCGA	2	8	473521	473528	25 %	25 %	25 %	25 %	268316002
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