MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013501	ACG	2	6	316955	316960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7002	NC_013501	GCC	2	6	316961	316966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315863
7003	NC_013501	GTC	2	6	316969	316974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7004	NC_013501	CAG	2	6	316984	316989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
7005	NC_013501	CGGT	3	12	317024	317035	0 %	25 %	50 %	25 %	268315863
7006	NC_013501	GC	4	8	317106	317113	0 %	0 %	50 %	50 %	268315864
7007	NC_013501	CGCA	2	8	317134	317141	25 %	0 %	25 %	50 %	268315864
7008	NC_013501	TGTGGC	2	12	317234	317245	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	268315864
7009	NC_013501	GCG	2	6	317284	317289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315864
7010	NC_013501	CGCC	2	8	317314	317321	0 %	0 %	25 %	75 %	268315864
7011	NC_013501	A	6	6	317529	317534	100 %	0 %	0 %	0 %	268315864
7012	NC_013501	CGTG	2	8	317537	317544	0 %	25 %	50 %	25 %	268315864
7013	NC_013501	GA	3	6	317548	317553	50 %	0 %	50 %	0 %	268315864
7014	NC_013501	ATC	2	6	317563	317568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315864
7015	NC_013501	CAACG	2	10	317652	317661	40 %	0 %	20 %	40 %	268315865
7016	NC_013501	GCCT	2	8	317672	317679	0 %	25 %	25 %	50 %	268315865
7017	NC_013501	CGCGG	2	10	317685	317694	0 %	0 %	60 %	40 %	268315865
7018	NC_013501	CTT	2	6	317695	317700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315865
7019	NC_013501	CAG	2	6	317720	317725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7020	NC_013501	AGG	2	6	317755	317760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315865
7021	NC_013501	GCC	2	6	317798	317803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315865
7022	NC_013501	GTA	2	6	317900	317905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315865
7023	NC_013501	TGC	2	6	317938	317943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7024	NC_013501	AGC	2	6	317955	317960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7025	NC_013501	TCA	2	6	317971	317976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315865
7026	NC_013501	CTG	2	6	318002	318007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7027	NC_013501	GCG	2	6	318025	318030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315865
7028	NC_013501	CGG	2	6	318037	318042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315865
7029	NC_013501	GCG	2	6	318051	318056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315865
7030	NC_013501	CCA	2	6	318139	318144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315865
7031	NC_013501	AGC	2	6	318156	318161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7032	NC_013501	AGC	2	6	318171	318176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7033	NC_013501	TGC	2	6	318313	318318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7034	NC_013501	GCT	2	6	318410	318415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7035	NC_013501	GCA	2	6	318449	318454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7036	NC_013501	GAA	2	6	318485	318490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315865
7037	NC_013501	CGG	2	6	318495	318500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315865
7038	NC_013501	CGT	2	6	318523	318528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7039	NC_013501	GGGC	2	8	318535	318542	0 %	0 %	75 %	25 %	268315865
7040	NC_013501	CTGCG	2	10	318545	318554	0 %	20 %	40 %	40 %	268315865
7041	NC_013501	AGC	4	12	318579	318590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7042	NC_013501	TGC	2	6	318592	318597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315865
7043	NC_013501	CCT	2	6	318782	318787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315866
7044	NC_013501	GGC	2	6	318882	318887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315866
7045	NC_013501	CACC	2	8	318923	318930	25 %	0 %	0 %	75 %	268315866
7046	NC_013501	TGT	2	6	318950	318955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315866
7047	NC_013501	GCC	2	6	319053	319058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315866
7048	NC_013501	GAC	2	6	319078	319083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315866
7049	NC_013501	GCC	2	6	319134	319139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315866
7050	NC_013501	CAG	2	6	319209	319214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315866
7051	NC_013501	GCG	2	6	319224	319229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315866
7052	NC_013501	ACG	2	6	319312	319317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315866
7053	NC_013501	TGA	2	6	319340	319345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315866
7054	NC_013501	AGC	2	6	319357	319362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315866
7055	NC_013501	GGC	2	6	319934	319939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315867
7056	NC_013501	TTC	2	6	320003	320008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315867
7057	NC_013501	GAA	2	6	320032	320037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315867
7058	NC_013501	ATG	2	6	320085	320090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315867
7059	NC_013501	GAT	2	6	320220	320225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315868
7060	NC_013501	TACG	2	8	320226	320233	25 %	25 %	25 %	25 %	268315868
7061	NC_013501	CGCGA	2	10	320234	320243	20 %	0 %	40 %	40 %	268315868
7062	NC_013501	GCA	2	6	320323	320328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315868
7063	NC_013501	CAG	2	6	320363	320368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315868
7064	NC_013501	CAG	2	6	320411	320416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315868
7065	NC_013501	CG	3	6	320419	320424	0 %	0 %	50 %	50 %	268315868
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7067	NC_013501	ACGAG	2	10	320464	320473	40 %	0 %	40 %	20 %	268315868
7068	NC_013501	AAG	2	6	320481	320486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315868
7069	NC_013501	CACGGC	2	12	320522	320533	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268315868
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7071	NC_013501	GAT	2	6	320588	320593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315868
7072	NC_013501	GAT	2	6	320621	320626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315868
7073	NC_013501	GTCCA	2	10	320628	320637	20 %	20 %	20 %	40 %	268315868
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7082	NC_013501	TGGCGG	2	12	320926	320937	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	268315868
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7089	NC_013501	CGA	2	6	321092	321097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315868
7090	NC_013501	CGC	2	6	321146	321151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315868
7091	NC_013501	GATC	2	8	321184	321191	25 %	25 %	25 %	25 %	268315868
7092	NC_013501	AATG	2	8	321250	321257	50 %	25 %	25 %	0 %	268315868
7093	NC_013501	ACG	2	6	321325	321330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315868
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7099	NC_013501	GCTC	2	8	321592	321599	0 %	25 %	25 %	50 %	268315868
7100	NC_013501	GC	3	6	321613	321618	0 %	0 %	50 %	50 %	268315868
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7103	NC_013501	CGCCC	2	10	321724	321733	0 %	0 %	20 %	80 %	268315868
7104	NC_013501	TCG	2	6	321738	321743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315868
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7112	NC_013501	GCCG	2	8	321938	321945	0 %	0 %	50 %	50 %	268315868
7113	NC_013501	GCCG	2	8	321956	321963	0 %	0 %	50 %	50 %	268315868
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7120	NC_013501	CGG	2	6	322111	322116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315868
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7232	NC_013501	GACCG	2	10	326853	326862	20 %	0 %	40 %	40 %	268315872
7233	NC_013501	GCA	2	6	326910	326915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315872
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7242	NC_013501	GAA	2	6	327288	327293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315873
7243	NC_013501	TGC	2	6	327331	327336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315873
7244	NC_013501	TGC	2	6	327352	327357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315873
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7247	NC_013501	TCGCTG	2	12	327384	327395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315873
7248	NC_013501	TGC	2	6	327451	327456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315873
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7250	NC_013501	GCA	2	6	327479	327484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315873
7251	NC_013501	TGC	2	6	327487	327492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315873
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7261	NC_013501	GCT	2	6	328035	328040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315874
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7265	NC_013501	CGAC	2	8	328183	328190	25 %	0 %	25 %	50 %	268315875
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7272	NC_013501	ACG	2	6	328326	328331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315875
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7326	NC_013501	CGC	2	6	330595	330600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315877
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7340	NC_013501	CTG	2	6	331208	331213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315877
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7349	NC_013501	GCTGG	2	10	331477	331486	0 %	20 %	60 %	20 %	268315877
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7357	NC_013501	CTGGC	2	10	331787	331796	0 %	20 %	40 %	40 %	268315877
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7480	NC_013501	GCT	2	6	337700	337705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315885
7481	NC_013501	GTC	2	6	337827	337832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315885
7482	NC_013501	GCC	2	6	337928	337933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315886
7483	NC_013501	GCC	2	6	337980	337985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315886
7484	NC_013501	GAT	2	6	338050	338055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315886
7485	NC_013501	GCC	2	6	338060	338065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315886
7486	NC_013501	CTG	2	6	338111	338116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315886
7487	NC_013501	CAA	2	6	338233	338238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315887
7488	NC_013501	TCT	2	6	338287	338292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315887
7489	NC_013501	CTG	3	9	338310	338318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315887
7490	NC_013501	TTC	2	6	338353	338358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315887
7491	NC_013501	GAG	2	6	338376	338381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315887
7492	NC_013501	GC	3	6	338427	338432	0 %	0 %	50 %	50 %	268315887
7493	NC_013501	CCG	2	6	338459	338464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315887
7494	NC_013501	AGCGC	2	10	338480	338489	20 %	0 %	40 %	40 %	268315887
7495	NC_013501	GAA	2	6	338508	338513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315887
7496	NC_013501	AGG	2	6	338530	338535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315887
7497	NC_013501	CG	3	6	338548	338553	0 %	0 %	50 %	50 %	268315887
7498	NC_013501	CAG	2	6	338562	338567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315887
7499	NC_013501	GCAGGC	2	12	338570	338581	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	268315887
7500	NC_013501	CGA	2	6	338618	338623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315887

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