MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013501	GAT	2	6	294495	294500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315851
6502	NC_013501	G	6	6	294636	294641	0 %	0 %	100 %	0 %	268315851
6503	NC_013501	CTG	2	6	294658	294663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315851
6504	NC_013501	GGC	2	6	294692	294697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315851
6505	NC_013501	GCC	2	6	294823	294828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315852
6506	NC_013501	CTG	2	6	294869	294874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315852
6507	NC_013501	GGCC	2	8	294948	294955	0 %	0 %	50 %	50 %	268315852
6508	NC_013501	GCT	2	6	295021	295026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315852
6509	NC_013501	CTGG	2	8	295048	295055	0 %	25 %	50 %	25 %	268315852
6510	NC_013501	GAG	2	6	295076	295081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315852
6511	NC_013501	CGG	3	9	295129	295137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315852
6512	NC_013501	TGC	3	9	295149	295157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315852
6513	NC_013501	G	6	6	295187	295192	0 %	0 %	100 %	0 %	268315852
6514	NC_013501	GCGTCG	2	12	295205	295216	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268315852
6515	NC_013501	CGG	3	9	295345	295353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315852
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6517	NC_013501	GC	3	6	295442	295447	0 %	0 %	50 %	50 %	268315852
6518	NC_013501	TCT	2	6	295449	295454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315852
6519	NC_013501	CCGCG	2	10	295460	295469	0 %	0 %	40 %	60 %	268315852
6520	NC_013501	CG	4	8	295466	295473	0 %	0 %	50 %	50 %	268315852
6521	NC_013501	TGC	2	6	295512	295517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315852
6522	NC_013501	TGGA	2	8	295532	295539	25 %	25 %	50 %	0 %	268315852
6523	NC_013501	AGC	2	6	295571	295576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315852
6524	NC_013501	CGCT	2	8	295589	295596	0 %	25 %	25 %	50 %	268315852
6525	NC_013501	GGA	2	6	295597	295602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315852
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6532	NC_013501	GCTC	2	8	296142	296149	0 %	25 %	25 %	50 %	268315853
6533	NC_013501	CTA	2	6	296281	296286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315853
6534	NC_013501	ATCGGG	2	12	296390	296401	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268315853
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6539	NC_013501	AAG	2	6	296615	296620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315853
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6542	NC_013501	TCG	2	6	296763	296768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315853
6543	NC_013501	GAG	2	6	296798	296803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315853
6544	NC_013501	GT	3	6	297152	297157	0 %	50 %	50 %	0 %	268315854
6545	NC_013501	CAA	2	6	297159	297164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315854
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6548	NC_013501	CTG	2	6	297367	297372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315854
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6550	NC_013501	CGGC	2	8	297440	297447	0 %	0 %	50 %	50 %	268315854
6551	NC_013501	TGA	2	6	297449	297454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315854
6552	NC_013501	T	6	6	297455	297460	0 %	100 %	0 %	0 %	268315854
6553	NC_013501	GCAGC	2	10	297495	297504	20 %	0 %	40 %	40 %	268315854
6554	NC_013501	GTG	2	6	297514	297519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315854
6555	NC_013501	TGG	2	6	297521	297526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315854
6556	NC_013501	TCGA	2	8	297556	297563	25 %	25 %	25 %	25 %	268315854
6557	NC_013501	GGC	2	6	297585	297590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315854
6558	NC_013501	GC	3	6	297589	297594	0 %	0 %	50 %	50 %	268315854
6559	NC_013501	GGCC	2	8	297699	297706	0 %	0 %	50 %	50 %	268315854
6560	NC_013501	TCG	2	6	297728	297733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315854
6561	NC_013501	GGA	2	6	297765	297770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315854
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6602	NC_013501	CCGGC	2	10	299373	299382	0 %	0 %	40 %	60 %	268315855
6603	NC_013501	GCT	2	6	299438	299443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315855
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6744	NC_013501	GCA	2	6	306066	306071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315857
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6764	NC_013501	CG	3	6	306760	306765	0 %	0 %	50 %	50 %	268315858
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6981	NC_013501	CTT	2	6	316290	316295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315863
6982	NC_013501	GGC	2	6	316317	316322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315863
6983	NC_013501	GTT	2	6	316326	316331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315863
6984	NC_013501	GGC	2	6	316343	316348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315863
6985	NC_013501	CGG	2	6	316401	316406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315863
6986	NC_013501	TGA	2	6	316437	316442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315863
6987	NC_013501	TCGA	2	8	316489	316496	25 %	25 %	25 %	25 %	268315863
6988	NC_013501	TCG	2	6	316497	316502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315863
6989	NC_013501	TGC	2	6	316541	316546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315863
6990	NC_013501	TGT	2	6	316574	316579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315863
6991	NC_013501	AGC	2	6	316592	316597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
6992	NC_013501	GCG	2	6	316610	316615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315863
6993	NC_013501	CAG	2	6	316696	316701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
6994	NC_013501	CAG	2	6	316705	316710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
6995	NC_013501	CAG	2	6	316735	316740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
6996	NC_013501	CGT	2	6	316779	316784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315863
6997	NC_013501	GCA	2	6	316785	316790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863
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7000	NC_013501	AGC	2	6	316940	316945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315863

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