MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_013501	GTC	2	6	2933056	2933061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318067
65002	NC_013501	TCC	2	6	2933123	2933128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318067
65003	NC_013501	GCC	2	6	2933148	2933153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318067
65004	NC_013501	GCA	2	6	2933190	2933195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318067
65005	NC_013501	AGC	2	6	2933264	2933269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318067
65006	NC_013501	CGTC	2	8	2933345	2933352	0 %	25 %	25 %	50 %	268318067
65007	NC_013501	GCC	2	6	2933430	2933435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318067
65008	NC_013501	ACCG	2	8	2933566	2933573	25 %	0 %	25 %	50 %	268318067
65009	NC_013501	CAC	2	6	2933584	2933589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318067
65010	NC_013501	CAC	2	6	2933632	2933637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318067
65011	NC_013501	GCC	2	6	2933648	2933653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318067
65012	NC_013501	GCC	2	6	2933723	2933728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318067
65013	NC_013501	CGTGCG	2	12	2933733	2933744	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268318067
65014	NC_013501	CTG	2	6	2933797	2933802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318067
65015	NC_013501	CCT	2	6	2933841	2933846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318067
65016	NC_013501	CAG	2	6	2933933	2933938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318067
65017	NC_013501	GAGC	2	8	2933947	2933954	25 %	0 %	50 %	25 %	268318067
65018	NC_013501	ATA	2	6	2933962	2933967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318067
65019	NC_013501	CGC	2	6	2934102	2934107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318067
65020	NC_013501	GAT	2	6	2934109	2934114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318067
65021	NC_013501	GCT	2	6	2934126	2934131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318067
65022	NC_013501	CCG	2	6	2934140	2934145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318068
65023	NC_013501	CTG	2	6	2934159	2934164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318068
65024	NC_013501	AGCGCC	2	12	2934229	2934240	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268318068
65025	NC_013501	TCC	2	6	2934292	2934297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318068
65026	NC_013501	CAG	2	6	2934345	2934350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318068
65027	NC_013501	GCT	2	6	2934404	2934409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318068
65028	NC_013501	GCG	2	6	2934428	2934433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318068
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65030	NC_013501	CAC	2	6	2934498	2934503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318068
65031	NC_013501	GCC	2	6	2934519	2934524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318068
65032	NC_013501	GCT	2	6	2934623	2934628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318068
65033	NC_013501	TAGCG	2	10	2934673	2934682	20 %	20 %	40 %	20 %	268318068
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65037	NC_013501	TA	3	6	2934923	2934928	50 %	50 %	0 %	0 %	268318069
65038	NC_013501	TA	3	6	2934972	2934977	50 %	50 %	0 %	0 %	268318069
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65041	NC_013501	AT	3	6	2935138	2935143	50 %	50 %	0 %	0 %	268318069
65042	NC_013501	TTC	2	6	2935236	2935241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318069
65043	NC_013501	TTC	2	6	2935263	2935268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318069
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65045	NC_013501	CT	3	6	2935431	2935436	0 %	50 %	0 %	50 %	268318070
65046	NC_013501	TAA	2	6	2935445	2935450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318070
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65048	NC_013501	T	6	6	2935501	2935506	0 %	100 %	0 %	0 %	268318070
65049	NC_013501	TTTC	2	8	2935604	2935611	0 %	75 %	0 %	25 %	268318070
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65051	NC_013501	T	6	6	2935709	2935714	0 %	100 %	0 %	0 %	268318070
65052	NC_013501	CTT	2	6	2935764	2935769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318070
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65055	NC_013501	T	6	6	2935895	2935900	0 %	100 %	0 %	0 %	268318070
65056	NC_013501	GTT	2	6	2935978	2935983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318070
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65058	NC_013501	TCA	2	6	2936056	2936061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318070
65059	NC_013501	TTGCC	2	10	2936085	2936094	0 %	40 %	20 %	40 %	268318070
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65067	NC_013501	TCT	2	6	2936442	2936447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318070
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65091	NC_013501	GCG	2	6	2937303	2937308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318071
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65462	NC_013501	CTT	2	6	2955437	2955442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318086
65463	NC_013501	GTCTTC	2	12	2955447	2955458	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	268318086
65464	NC_013501	TCT	2	6	2955469	2955474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318086
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65473	NC_013501	TCG	2	6	2955974	2955979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318087
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65483	NC_013501	CTG	2	6	2956351	2956356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318088
65484	NC_013501	GCT	2	6	2956383	2956388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318088
65485	NC_013501	CTGT	2	8	2956391	2956398	0 %	50 %	25 %	25 %	268318088
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65488	NC_013501	GCC	2	6	2956468	2956473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318088
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65490	NC_013501	CGCC	2	8	2956517	2956524	0 %	0 %	25 %	75 %	268318088
65491	NC_013501	CGT	2	6	2956578	2956583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318088
65492	NC_013501	CGG	2	6	2956599	2956604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318088
65493	NC_013501	TGC	2	6	2956667	2956672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318088
65494	NC_013501	CTG	2	6	2956708	2956713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318088
65495	NC_013501	GCC	2	6	2956836	2956841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318088
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