MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013501	GGC	2	6	247613	247618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315806
5502	NC_013501	GGC	2	6	247621	247626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315806
5503	NC_013501	TGC	2	6	247640	247645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315806
5504	NC_013501	AAG	2	6	247699	247704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315806
5505	NC_013501	TGG	2	6	247754	247759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315806
5506	NC_013501	CCA	3	9	247788	247796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315806
5507	NC_013501	CGG	2	6	247806	247811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315806
5508	NC_013501	TTC	2	6	247855	247860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315806
5509	NC_013501	TGG	2	6	247904	247909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315806
5510	NC_013501	CAG	2	6	247959	247964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315806
5511	NC_013501	TAC	2	6	247969	247974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315806
5512	NC_013501	TGG	2	6	248009	248014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315806
5513	NC_013501	ATC	2	6	248017	248022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315806
5514	NC_013501	GCT	2	6	248040	248045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315806
5515	NC_013501	CAT	2	6	248076	248081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315807
5516	NC_013501	AC	3	6	248092	248097	50 %	0 %	0 %	50 %	268315807
5517	NC_013501	TGG	2	6	248141	248146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315807
5518	NC_013501	CAT	2	6	248154	248159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315807
5519	NC_013501	CTG	2	6	248317	248322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315807
5520	NC_013501	TGG	2	6	248324	248329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315807
5521	NC_013501	GCT	2	6	248349	248354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315807
5522	NC_013501	CGGC	2	8	248435	248442	0 %	0 %	50 %	50 %	268315807
5523	NC_013501	T	6	6	248501	248506	0 %	100 %	0 %	0 %	268315808
5524	NC_013501	CGT	2	6	248519	248524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315808
5525	NC_013501	CTG	2	6	248564	248569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315808
5526	NC_013501	TTC	2	6	248597	248602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315808
5527	NC_013501	GTG	2	6	248618	248623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315808
5528	NC_013501	GAA	2	6	248783	248788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315808
5529	NC_013501	GTC	2	6	248925	248930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315809
5530	NC_013501	GTG	2	6	249018	249023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315809
5531	NC_013501	CGC	2	6	249071	249076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315809
5532	NC_013501	GCC	2	6	249159	249164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315809
5533	NC_013501	CG	3	6	249220	249225	0 %	0 %	50 %	50 %	268315809
5534	NC_013501	CCG	2	6	249321	249326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315809
5535	NC_013501	ATCT	2	8	249390	249397	25 %	50 %	0 %	25 %	268315809
5536	NC_013501	ACCTG	2	10	249478	249487	20 %	20 %	20 %	40 %	268315809
5537	NC_013501	CAC	2	6	249536	249541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315809
5538	NC_013501	TTC	2	6	249549	249554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315809
5539	NC_013501	CTC	2	6	249660	249665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315809
5540	NC_013501	GGA	2	6	249692	249697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315809
5541	NC_013501	TGG	2	6	249700	249705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315809
5542	NC_013501	GCG	2	6	249761	249766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315809
5543	NC_013501	CAT	2	6	249815	249820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315809
5544	NC_013501	GCA	2	6	250120	250125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315810
5545	NC_013501	CGT	2	6	250126	250131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315810
5546	NC_013501	CGT	2	6	250134	250139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315810
5547	NC_013501	A	6	6	250155	250160	100 %	0 %	0 %	0 %	268315810
5548	NC_013501	TCA	2	6	250172	250177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315810
5549	NC_013501	AGG	2	6	250188	250193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315810
5550	NC_013501	ACT	2	6	250211	250216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315810
5551	NC_013501	ATC	2	6	250222	250227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315810
5552	NC_013501	AGCG	2	8	250228	250235	25 %	0 %	50 %	25 %	268315810
5553	NC_013501	TCG	2	6	250265	250270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315810
5554	NC_013501	CGT	2	6	250314	250319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315810
5555	NC_013501	CGA	2	6	250326	250331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315810
5556	NC_013501	GCA	2	6	250371	250376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315810
5557	NC_013501	TGC	2	6	250521	250526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315811
5558	NC_013501	GCC	2	6	250598	250603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315811
5559	NC_013501	AGG	2	6	250649	250654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315811
5560	NC_013501	GCC	2	6	250659	250664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315811
5561	NC_013501	GCCA	2	8	250729	250736	25 %	0 %	25 %	50 %	268315811
5562	NC_013501	TTC	2	6	250756	250761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315811
5563	NC_013501	CAG	2	6	250768	250773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315811
5564	NC_013501	TGG	2	6	250790	250795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315811
5565	NC_013501	GCT	2	6	250842	250847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315811
5566	NC_013501	AGC	2	6	250888	250893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315811
5567	NC_013501	GTC	3	9	250938	250946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315811
5568	NC_013501	TCG	2	6	250997	251002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315812
5569	NC_013501	GCT	2	6	251015	251020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315812
5570	NC_013501	CTTTC	2	10	251154	251163	0 %	60 %	0 %	40 %	268315812
5571	NC_013501	GAA	2	6	251172	251177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315812
5572	NC_013501	GTG	2	6	251184	251189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315812
5573	NC_013501	CGG	2	6	251218	251223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315812
5574	NC_013501	GTG	2	6	251277	251282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315812
5575	NC_013501	CTG	2	6	251289	251294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315812
5576	NC_013501	ACG	2	6	251308	251313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315812
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5578	NC_013501	CTG	2	6	251379	251384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315812
5579	NC_013501	TTC	2	6	251397	251402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315813
5580	NC_013501	CGC	2	6	251411	251416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315813
5581	NC_013501	GTC	2	6	251469	251474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315813
5582	NC_013501	GCC	3	9	251506	251514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315813
5583	NC_013501	CAT	2	6	251532	251537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315813
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5585	NC_013501	GGC	2	6	251568	251573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315813
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5587	NC_013501	CTG	2	6	251673	251678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315813
5588	NC_013501	AGC	2	6	251758	251763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315813
5589	NC_013501	TCG	2	6	251773	251778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315813
5590	NC_013501	CTG	2	6	251787	251792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315813
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5593	NC_013501	TCG	2	6	251857	251862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315813
5594	NC_013501	CAC	2	6	251967	251972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315813
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5598	NC_013501	GGCC	2	8	252145	252152	0 %	0 %	50 %	50 %	268315813
5599	NC_013501	GCT	2	6	252186	252191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315813
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5601	NC_013501	GCG	2	6	252323	252328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315813
5602	NC_013501	GCT	2	6	252356	252361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315813
5603	NC_013501	CAG	2	6	252381	252386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315813
5604	NC_013501	CCT	2	6	252428	252433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315813
5605	NC_013501	GTC	2	6	252489	252494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315813
5606	NC_013501	TCA	2	6	252500	252505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315813
5607	NC_013501	GGTCGT	2	12	252548	252559	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	268315813
5608	NC_013501	GCA	3	9	252569	252577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315813
5609	NC_013501	CAC	2	6	252603	252608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315813
5610	NC_013501	CGC	2	6	252631	252636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315813
5611	NC_013501	ACCC	2	8	252690	252697	25 %	0 %	0 %	75 %	268315813
5612	NC_013501	AAG	2	6	252712	252717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315813
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5615	NC_013501	GCG	2	6	252755	252760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315813
5616	NC_013501	CGC	2	6	252826	252831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315813
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5619	NC_013501	GC	3	6	252907	252912	0 %	0 %	50 %	50 %	268315813
5620	NC_013501	GAA	2	6	252927	252932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315813
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5859	NC_013501	CGG	2	6	264225	264230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315823
5860	NC_013501	GGCT	2	8	264730	264737	0 %	25 %	50 %	25 %	268315824
5861	NC_013501	TTG	2	6	264743	264748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315824
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5863	NC_013501	TGG	2	6	264854	264859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315824
5864	NC_013501	GGC	2	6	264911	264916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315824
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5867	NC_013501	CCGCA	2	10	264976	264985	20 %	0 %	20 %	60 %	268315824
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5873	NC_013501	CTG	2	6	265366	265371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315824
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5982	NC_013501	GCC	2	6	270467	270472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315829
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