MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_013501	CGG	2	6	2661911	2661916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317846
59002	NC_013501	CCA	2	6	2661968	2661973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317846
59003	NC_013501	GC	3	6	2662029	2662034	0 %	0 %	50 %	50 %	268317846
59004	NC_013501	TTCC	2	8	2662041	2662048	0 %	50 %	0 %	50 %	268317846
59005	NC_013501	TCC	2	6	2662066	2662071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317846
59006	NC_013501	T	6	6	2662091	2662096	0 %	100 %	0 %	0 %	268317846
59007	NC_013501	TCG	2	6	2662117	2662122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317846
59008	NC_013501	CAT	2	6	2662266	2662271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317846
59009	NC_013501	CAG	2	6	2662285	2662290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317847
59010	NC_013501	GCC	2	6	2662330	2662335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317847
59011	NC_013501	GTC	2	6	2662346	2662351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317847
59012	NC_013501	CAG	3	9	2662400	2662408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317847
59013	NC_013501	AGCGTG	2	12	2662437	2662448	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268317847
59014	NC_013501	CGGG	2	8	2662456	2662463	0 %	0 %	75 %	25 %	268317847
59015	NC_013501	CGG	2	6	2662476	2662481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317847
59016	NC_013501	CCA	2	6	2662489	2662494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317847
59017	NC_013501	AGC	2	6	2662563	2662568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317847
59018	NC_013501	ACC	2	6	2662569	2662574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317847
59019	NC_013501	CCA	2	6	2662594	2662599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317847
59020	NC_013501	GAT	2	6	2662711	2662716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317847
59021	NC_013501	GGC	2	6	2662719	2662724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317847
59022	NC_013501	TCG	2	6	2662734	2662739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317847
59023	NC_013501	GGCC	2	8	2662757	2662764	0 %	0 %	50 %	50 %	268317847
59024	NC_013501	CAG	2	6	2662784	2662789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317847
59025	NC_013501	GCC	2	6	2662814	2662819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317847
59026	NC_013501	GCC	2	6	2662827	2662832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317847
59027	NC_013501	TCC	2	6	2662835	2662840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317847
59028	NC_013501	GCC	2	6	2662869	2662874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317847
59029	NC_013501	GGC	2	6	2662883	2662888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317847
59030	NC_013501	CGC	2	6	2662936	2662941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317848
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59032	NC_013501	CAG	2	6	2662984	2662989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317848
59033	NC_013501	CTGG	2	8	2663014	2663021	0 %	25 %	50 %	25 %	268317848
59034	NC_013501	CCG	2	6	2663026	2663031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317848
59035	NC_013501	CCA	2	6	2663115	2663120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317848
59036	NC_013501	GAT	2	6	2663191	2663196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317848
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59038	NC_013501	G	7	7	2663425	2663431	0 %	0 %	100 %	0 %	268317848
59039	NC_013501	CCGC	2	8	2663432	2663439	0 %	0 %	25 %	75 %	268317848
59040	NC_013501	CAG	2	6	2663500	2663505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317848
59041	NC_013501	CGGCG	2	10	2663526	2663535	0 %	0 %	60 %	40 %	268317848
59042	NC_013501	GTA	2	6	2663548	2663553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317848
59043	NC_013501	GCC	2	6	2663560	2663565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317848
59044	NC_013501	GCCG	2	8	2663581	2663588	0 %	0 %	50 %	50 %	268317848
59045	NC_013501	GCCG	2	8	2663632	2663639	0 %	0 %	50 %	50 %	268317848
59046	NC_013501	GGC	2	6	2663663	2663668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317848
59047	NC_013501	GCC	2	6	2663675	2663680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317848
59048	NC_013501	GGCG	2	8	2663727	2663734	0 %	0 %	75 %	25 %	268317848
59049	NC_013501	CAC	2	6	2663761	2663766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317848
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59051	NC_013501	CTG	2	6	2664006	2664011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317849
59052	NC_013501	TCG	2	6	2664052	2664057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317849
59053	NC_013501	CTGG	2	8	2664071	2664078	0 %	25 %	50 %	25 %	268317849
59054	NC_013501	GAG	2	6	2664102	2664107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317849
59055	NC_013501	GCTGGA	2	12	2664122	2664133	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268317849
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59057	NC_013501	CCG	2	6	2664320	2664325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317849
59058	NC_013501	GCT	2	6	2664398	2664403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317849
59059	NC_013501	TGCGGC	2	12	2664457	2664468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268317849
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59062	NC_013501	GCTG	2	8	2664550	2664557	0 %	25 %	50 %	25 %	268317849
59063	NC_013501	CGC	2	6	2664635	2664640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317849
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59087	NC_013501	TGC	2	6	2665543	2665548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317849
59088	NC_013501	TAC	2	6	2665593	2665598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317849
59089	NC_013501	GCCG	2	8	2665604	2665611	0 %	0 %	50 %	50 %	268317849
59090	NC_013501	GCC	2	6	2665633	2665638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317849
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59092	NC_013501	ACG	2	6	2665678	2665683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317849
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59099	NC_013501	CTG	2	6	2665905	2665910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317849
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59104	NC_013501	GACC	2	8	2666183	2666190	25 %	0 %	25 %	50 %	268317849
59105	NC_013501	CGA	2	6	2666192	2666197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317849
59106	NC_013501	CGA	2	6	2666261	2666266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317849
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59111	NC_013501	GTCCG	2	10	2666643	2666652	0 %	20 %	40 %	40 %	268317850
59112	NC_013501	AGGT	2	8	2666695	2666702	25 %	25 %	50 %	0 %	268317850
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59115	NC_013501	ACC	3	9	2666908	2666916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317850
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59231	NC_013501	CCT	2	6	2671964	2671969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317855
59232	NC_013501	GAA	2	6	2672007	2672012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317855
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59235	NC_013501	CGT	2	6	2672129	2672134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317855
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59343	NC_013501	TCT	2	6	2677927	2677932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317858
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59453	NC_013501	CG	3	6	2682287	2682292	0 %	0 %	50 %	50 %	268317862
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59457	NC_013501	GCT	2	6	2682516	2682521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317862
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