MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_013501	GGT	2	6	2621631	2621636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317803
58002	NC_013501	GCCG	2	8	2621686	2621693	0 %	0 %	50 %	50 %	268317803
58003	NC_013501	TGCT	2	8	2621944	2621951	0 %	50 %	25 %	25 %	268317804
58004	NC_013501	AGC	2	6	2622046	2622051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317804
58005	NC_013501	GCC	2	6	2622096	2622101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317804
58006	NC_013501	GTC	2	6	2622117	2622122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317804
58007	NC_013501	GCTG	2	8	2622230	2622237	0 %	25 %	50 %	25 %	268317804
58008	NC_013501	CGGC	2	8	2622259	2622266	0 %	0 %	50 %	50 %	268317804
58009	NC_013501	CGT	3	9	2622269	2622277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317804
58010	NC_013501	GCT	2	6	2622281	2622286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317804
58011	NC_013501	GCC	2	6	2622315	2622320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317804
58012	NC_013501	CGCTG	2	10	2622365	2622374	0 %	20 %	40 %	40 %	268317804
58013	NC_013501	GACGGC	2	12	2622411	2622422	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	268317804
58014	NC_013501	CTGG	2	8	2622428	2622435	0 %	25 %	50 %	25 %	268317804
58015	NC_013501	GGCAC	2	10	2622444	2622453	20 %	0 %	40 %	40 %	268317804
58016	NC_013501	GGC	2	6	2622458	2622463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317804
58017	NC_013501	GCC	2	6	2622476	2622481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317804
58018	NC_013501	GCT	2	6	2622494	2622499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317804
58019	NC_013501	GCA	2	6	2622509	2622514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317804
58020	NC_013501	TGGG	2	8	2622531	2622538	0 %	25 %	75 %	0 %	268317804
58021	NC_013501	CCG	2	6	2622632	2622637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317804
58022	NC_013501	CG	3	6	2622636	2622641	0 %	0 %	50 %	50 %	268317804
58023	NC_013501	GCT	2	6	2622645	2622650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317804
58024	NC_013501	TCC	2	6	2622657	2622662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317804
58025	NC_013501	CGA	2	6	2622754	2622759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317805
58026	NC_013501	CAT	2	6	2622866	2622871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317805
58027	NC_013501	ACT	2	6	2622891	2622896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317805
58028	NC_013501	CGA	2	6	2622910	2622915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317805
58029	NC_013501	TCG	2	6	2622969	2622974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
58030	NC_013501	GAA	2	6	2623001	2623006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317805
58031	NC_013501	GGC	2	6	2623033	2623038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317805
58032	NC_013501	GGC	2	6	2623061	2623066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317805
58033	NC_013501	CGG	2	6	2623077	2623082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317805
58034	NC_013501	GGT	2	6	2623123	2623128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317805
58035	NC_013501	TCG	2	6	2623137	2623142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
58036	NC_013501	GCT	2	6	2623180	2623185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
58037	NC_013501	ATC	2	6	2623187	2623192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317805
58038	NC_013501	GCG	2	6	2623200	2623205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317805
58039	NC_013501	ATG	2	6	2623214	2623219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317805
58040	NC_013501	GCT	2	6	2623261	2623266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
58041	NC_013501	TC	3	6	2623299	2623304	0 %	50 %	0 %	50 %	268317805
58042	NC_013501	TGA	2	6	2623305	2623310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317805
58043	NC_013501	CAC	2	6	2623318	2623323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317805
58044	NC_013501	GCG	2	6	2623326	2623331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317805
58045	NC_013501	TTCG	2	8	2623339	2623346	0 %	50 %	25 %	25 %	268317805
58046	NC_013501	CG	3	6	2623404	2623409	0 %	0 %	50 %	50 %	268317805
58047	NC_013501	GCC	2	6	2623438	2623443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317805
58048	NC_013501	GAC	2	6	2623487	2623492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317805
58049	NC_013501	TCG	2	6	2623501	2623506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
58050	NC_013501	CTG	2	6	2623532	2623537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
58051	NC_013501	CTG	3	9	2623541	2623549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
58052	NC_013501	CGT	4	12	2623578	2623589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317805
58053	NC_013501	CTG	3	9	2623813	2623821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58054	NC_013501	TGC	2	6	2623832	2623837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58055	NC_013501	CGC	2	6	2623937	2623942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317806
58056	NC_013501	GC	3	6	2623941	2623946	0 %	0 %	50 %	50 %	268317806
58057	NC_013501	CGC	2	6	2623963	2623968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317806
58058	NC_013501	ACA	2	6	2624017	2624022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268317806
58059	NC_013501	CTCGA	2	10	2624056	2624065	20 %	20 %	20 %	40 %	268317806
58060	NC_013501	CTGCGC	2	12	2624152	2624163	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	268317806
58061	NC_013501	GCG	2	6	2624223	2624228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317806
58062	NC_013501	CGG	2	6	2624262	2624267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317806
58063	NC_013501	CAC	2	6	2624283	2624288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317806
58064	NC_013501	GCC	2	6	2624297	2624302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317806
58065	NC_013501	GGCCA	2	10	2624326	2624335	20 %	0 %	40 %	40 %	268317806
58066	NC_013501	CAG	2	6	2624371	2624376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58067	NC_013501	GCC	2	6	2624395	2624400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317806
58068	NC_013501	CGTCAA	2	12	2624469	2624480	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268317806
58069	NC_013501	AAC	2	6	2624491	2624496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268317806
58070	NC_013501	ATC	2	6	2624551	2624556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317806
58071	NC_013501	TGC	2	6	2624582	2624587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58072	NC_013501	GGC	2	6	2624611	2624616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317806
58073	NC_013501	CGG	2	6	2624652	2624657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317806
58074	NC_013501	CAC	2	6	2624667	2624672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317806
58075	NC_013501	GCCA	2	8	2624677	2624684	25 %	0 %	25 %	50 %	268317806
58076	NC_013501	AGGCC	2	10	2624691	2624700	20 %	0 %	40 %	40 %	268317806
58077	NC_013501	GCG	3	9	2624717	2624725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317806
58078	NC_013501	ACC	2	6	2624731	2624736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317806
58079	NC_013501	ACG	3	9	2624762	2624770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58080	NC_013501	GCC	2	6	2624771	2624776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317806
58081	NC_013501	TTTC	2	8	2624778	2624785	0 %	75 %	0 %	25 %	268317806
58082	NC_013501	CTA	2	6	2624790	2624795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317806
58083	NC_013501	GGA	2	6	2624811	2624816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317806
58084	NC_013501	CGA	3	9	2624907	2624915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58085	NC_013501	TCG	2	6	2624939	2624944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58086	NC_013501	GAG	2	6	2624959	2624964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317806
58087	NC_013501	CTG	2	6	2624965	2624970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58088	NC_013501	CG	3	6	2624990	2624995	0 %	0 %	50 %	50 %	268317806
58089	NC_013501	ACG	2	6	2625035	2625040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58090	NC_013501	CGG	2	6	2625048	2625053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317806
58091	NC_013501	ACCT	2	8	2625064	2625071	25 %	25 %	0 %	50 %	268317806
58092	NC_013501	GGCCA	2	10	2625079	2625088	20 %	0 %	40 %	40 %	268317806
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58095	NC_013501	CGGG	2	8	2625262	2625269	0 %	0 %	75 %	25 %	268317806
58096	NC_013501	TCG	2	6	2625298	2625303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58097	NC_013501	CGG	3	9	2625318	2625326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317806
58098	NC_013501	GCT	2	6	2625354	2625359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58099	NC_013501	CGCC	2	8	2625386	2625393	0 %	0 %	25 %	75 %	268317806
58100	NC_013501	CTA	2	6	2625489	2625494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317806
58101	NC_013501	GCC	2	6	2625498	2625503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317806
58102	NC_013501	CTG	2	6	2625553	2625558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58103	NC_013501	CGA	2	6	2625729	2625734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58104	NC_013501	CGCC	2	8	2625798	2625805	0 %	0 %	25 %	75 %	268317806
58105	NC_013501	GCA	2	6	2625813	2625818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58106	NC_013501	GGC	2	6	2625922	2625927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317806
58107	NC_013501	TCG	3	9	2625953	2625961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317806
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58109	NC_013501	CCGG	2	8	2626010	2626017	0 %	0 %	50 %	50 %	268317806
58110	NC_013501	CTG	2	6	2626072	2626077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317806
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58112	NC_013501	CAA	2	6	2626188	2626193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268317806
58113	NC_013501	CGC	2	6	2626363	2626368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317806
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58115	NC_013501	CGA	2	6	2626401	2626406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317806
58116	NC_013501	CGA	2	6	2626428	2626433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317806
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58462	NC_013501	CGA	2	6	2640627	2640632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317818
58463	NC_013501	CTT	3	9	2640660	2640668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317818
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