MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_013501	CGG	2	6	2469078	2469083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317662
54502	NC_013501	GTC	2	6	2469087	2469092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317662
54503	NC_013501	TTC	2	6	2469099	2469104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317662
54504	NC_013501	TTC	2	6	2469260	2469265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317663
54505	NC_013501	GCA	2	6	2469283	2469288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54506	NC_013501	TGC	2	6	2469291	2469296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54507	NC_013501	GCA	2	6	2469310	2469315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54508	NC_013501	CGG	2	6	2469329	2469334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317663
54509	NC_013501	GCC	2	6	2469343	2469348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317663
54510	NC_013501	TCG	2	6	2469420	2469425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54511	NC_013501	GCCG	2	8	2469428	2469435	0 %	0 %	50 %	50 %	268317663
54512	NC_013501	GCC	2	6	2469453	2469458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317663
54513	NC_013501	GC	3	6	2469466	2469471	0 %	0 %	50 %	50 %	268317663
54514	NC_013501	CGT	2	6	2469476	2469481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54515	NC_013501	GCC	2	6	2469535	2469540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317663
54516	NC_013501	CGG	2	6	2469568	2469573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317663
54517	NC_013501	CTG	2	6	2469644	2469649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54518	NC_013501	GCG	2	6	2469705	2469710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317663
54519	NC_013501	CAG	2	6	2469740	2469745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54520	NC_013501	CGG	2	6	2469796	2469801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317663
54521	NC_013501	CCGC	2	8	2469802	2469809	0 %	0 %	25 %	75 %	268317663
54522	NC_013501	CAGC	2	8	2469824	2469831	25 %	0 %	25 %	50 %	268317663
54523	NC_013501	CTC	2	6	2469833	2469838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317663
54524	NC_013501	C	6	6	2469985	2469990	0 %	0 %	0 %	100 %	268317663
54525	NC_013501	TGC	2	6	2470017	2470022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54526	NC_013501	GC	3	6	2470039	2470044	0 %	0 %	50 %	50 %	268317663
54527	NC_013501	GCA	2	6	2470196	2470201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54528	NC_013501	GCA	2	6	2470219	2470224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54529	NC_013501	CGA	2	6	2470228	2470233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54530	NC_013501	TCA	2	6	2470234	2470239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317663
54531	NC_013501	TCG	2	6	2470260	2470265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54532	NC_013501	TCC	2	6	2470296	2470301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317663
54533	NC_013501	CGA	2	6	2470307	2470312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54534	NC_013501	CGC	2	6	2470314	2470319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317663
54535	NC_013501	GAA	2	6	2470367	2470372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317663
54536	NC_013501	GGC	2	6	2470421	2470426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317663
54537	NC_013501	GATCG	2	10	2470469	2470478	20 %	20 %	40 %	20 %	268317663
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54539	NC_013501	TGC	2	6	2470554	2470559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54540	NC_013501	CG	3	6	2470579	2470584	0 %	0 %	50 %	50 %	268317663
54541	NC_013501	GTA	2	6	2470775	2470780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317663
54542	NC_013501	GCA	2	6	2470810	2470815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54543	NC_013501	GCA	2	6	2470846	2470851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54544	NC_013501	CAG	2	6	2470871	2470876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54545	NC_013501	CGG	2	6	2470881	2470886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317663
54546	NC_013501	TTC	2	6	2470889	2470894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317663
54547	NC_013501	GCA	3	9	2470930	2470938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317663
54548	NC_013501	CTT	2	6	2471088	2471093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317664
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54550	NC_013501	GATGC	2	10	2471236	2471245	20 %	20 %	40 %	20 %	268317664
54551	NC_013501	GGC	2	6	2471298	2471303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317664
54552	NC_013501	GCCAG	2	10	2471313	2471322	20 %	0 %	40 %	40 %	268317664
54553	NC_013501	GCG	2	6	2471325	2471330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317664
54554	NC_013501	CAG	2	6	2471350	2471355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317664
54555	NC_013501	ATCC	2	8	2471375	2471382	25 %	25 %	0 %	50 %	268317664
54556	NC_013501	CAG	2	6	2471410	2471415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317664
54557	NC_013501	GCG	2	6	2471445	2471450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317664
54558	NC_013501	GCG	2	6	2471495	2471500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317664
54559	NC_013501	CTG	2	6	2471503	2471508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317664
54560	NC_013501	GCC	2	6	2471520	2471525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317664
54561	NC_013501	ACC	2	6	2471595	2471600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317664
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54566	NC_013501	CCCAG	2	10	2471769	2471778	20 %	0 %	20 %	60 %	268317664
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54573	NC_013501	GC	3	6	2472001	2472006	0 %	0 %	50 %	50 %	268317664
54574	NC_013501	GCC	2	6	2472014	2472019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317664
54575	NC_013501	CAG	2	6	2472166	2472171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317664
54576	NC_013501	CGAT	2	8	2472200	2472207	25 %	25 %	25 %	25 %	268317664
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54580	NC_013501	AGCGAA	2	12	2472276	2472287	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	268317664
54581	NC_013501	GATC	2	8	2472354	2472361	25 %	25 %	25 %	25 %	268317664
54582	NC_013501	GCA	3	9	2472381	2472389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317664
54583	NC_013501	ATG	2	6	2472392	2472397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317664
54584	NC_013501	TCA	2	6	2472411	2472416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317664
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54586	NC_013501	GGA	2	6	2472469	2472474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317664
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54588	NC_013501	ACG	2	6	2472580	2472585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317665
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54593	NC_013501	TTC	2	6	2472735	2472740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317665
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54597	NC_013501	CAGCAC	2	12	2472813	2472824	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	268317665
54598	NC_013501	GAG	2	6	2472825	2472830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317665
54599	NC_013501	ACG	2	6	2472886	2472891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317665
54600	NC_013501	CAG	2	6	2472903	2472908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317665
54601	NC_013501	AGC	3	9	2472916	2472924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317665
54602	NC_013501	CAA	2	6	2473140	2473145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268317666
54603	NC_013501	TCG	2	6	2473222	2473227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317666
54604	NC_013501	CCGG	2	8	2473316	2473323	0 %	0 %	50 %	50 %	268317666
54605	NC_013501	CGGC	2	8	2473346	2473353	0 %	0 %	50 %	50 %	268317666
54606	NC_013501	CCA	2	6	2473418	2473423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317666
54607	NC_013501	CAG	2	6	2473437	2473442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317666
54608	NC_013501	GTC	2	6	2474070	2474075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317667
54609	NC_013501	GCC	2	6	2474116	2474121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317667
54610	NC_013501	ACC	2	6	2474151	2474156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317667
54611	NC_013501	TGC	2	6	2474214	2474219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317667
54612	NC_013501	GCTAC	2	10	2474238	2474247	20 %	20 %	20 %	40 %	268317667
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54614	NC_013501	ATC	2	6	2474428	2474433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317668
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