MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_013501	TGC	2	6	2397492	2397497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317609
53002	NC_013501	GCG	2	6	2397498	2397503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317609
53003	NC_013501	GTC	2	6	2397533	2397538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317609
53004	NC_013501	CGT	2	6	2397541	2397546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317609
53005	NC_013501	CGG	3	9	2397557	2397565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317609
53006	NC_013501	GTC	2	6	2397569	2397574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317609
53007	NC_013501	CGGGC	2	10	2397649	2397658	0 %	0 %	60 %	40 %	268317609
53008	NC_013501	GCG	2	6	2397678	2397683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317609
53009	NC_013501	CGT	2	6	2397776	2397781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317609
53010	NC_013501	CAC	2	6	2397791	2397796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317609
53011	NC_013501	GCC	2	6	2397807	2397812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317609
53012	NC_013501	CGC	2	6	2397854	2397859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317609
53013	NC_013501	CG	3	6	2397985	2397990	0 %	0 %	50 %	50 %	268317609
53014	NC_013501	GCC	2	6	2398139	2398144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317610
53015	NC_013501	GTC	2	6	2398153	2398158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317610
53016	NC_013501	TTC	2	6	2398189	2398194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317610
53017	NC_013501	CTC	2	6	2398228	2398233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317610
53018	NC_013501	CCG	2	6	2398337	2398342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317610
53019	NC_013501	TCGT	2	8	2398355	2398362	0 %	50 %	25 %	25 %	268317610
53020	NC_013501	CGAT	2	8	2398367	2398374	25 %	25 %	25 %	25 %	268317610
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53022	NC_013501	GCC	2	6	2398397	2398402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317610
53023	NC_013501	GGC	2	6	2398549	2398554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317610
53024	NC_013501	GTA	2	6	2398567	2398572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317610
53025	NC_013501	CCG	2	6	2398580	2398585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317610
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53031	NC_013501	CGA	2	6	2399034	2399039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317611
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53034	NC_013501	GCTC	2	8	2399124	2399131	0 %	25 %	25 %	50 %	268317611
53035	NC_013501	CGGT	2	8	2399132	2399139	0 %	25 %	50 %	25 %	268317611
53036	NC_013501	TCCGGC	2	12	2399159	2399170	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	268317611
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53045	NC_013501	CGGC	2	8	2399465	2399472	0 %	0 %	50 %	50 %	268317611
53046	NC_013501	GCA	2	6	2399484	2399489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317611
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53049	NC_013501	GGCG	2	8	2399604	2399611	0 %	0 %	75 %	25 %	268317611
53050	NC_013501	GCC	2	6	2399651	2399656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317611
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53053	NC_013501	GAT	2	6	2399722	2399727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317611
53054	NC_013501	GTA	2	6	2399743	2399748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317611
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53066	NC_013501	CGT	2	6	2400456	2400461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317612
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53088	NC_013501	CAC	2	6	2401290	2401295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317612
53089	NC_013501	CG	3	6	2401397	2401402	0 %	0 %	50 %	50 %	268317612
53090	NC_013501	GCC	2	6	2401420	2401425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317612
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53099	NC_013501	GC	4	8	2401709	2401716	0 %	0 %	50 %	50 %	268317612
53100	NC_013501	GC	3	6	2401785	2401790	0 %	0 %	50 %	50 %	268317612
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53112	NC_013501	CGT	2	6	2402450	2402455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317613
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53115	NC_013501	GAT	2	6	2402500	2402505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317613
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53221	NC_013501	TGGG	2	8	2407596	2407603	0 %	25 %	75 %	0 %	268317618
53222	NC_013501	CAT	2	6	2407628	2407633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317618
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53226	NC_013501	CGGAT	2	10	2407813	2407822	20 %	20 %	40 %	20 %	268317618
53227	NC_013501	C	6	6	2407881	2407886	0 %	0 %	0 %	100 %	268317618
53228	NC_013501	CGA	2	6	2407934	2407939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317618
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53463	NC_013501	GTTGAT	2	12	2418636	2418647	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268317627
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53492	NC_013501	AGCTC	2	10	2419775	2419784	20 %	20 %	20 %	40 %	268317628
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