MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_013501	CGA	2	6	2329102	2329107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317548
51502	NC_013501	GCT	2	6	2329348	2329353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317548
51503	NC_013501	TCG	2	6	2329406	2329411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317548
51504	NC_013501	CGA	2	6	2329432	2329437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317548
51505	NC_013501	ATC	2	6	2329439	2329444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317548
51506	NC_013501	GCG	2	6	2329500	2329505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317548
51507	NC_013501	GCG	3	9	2329528	2329536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317548
51508	NC_013501	GCC	2	6	2329595	2329600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317548
51509	NC_013501	CCGA	2	8	2329628	2329635	25 %	0 %	25 %	50 %	268317548
51510	NC_013501	CGG	2	6	2329728	2329733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317548
51511	NC_013501	AGC	2	6	2329740	2329745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317548
51512	NC_013501	CGC	2	6	2329790	2329795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317548
51513	NC_013501	TGC	2	6	2329803	2329808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317548
51514	NC_013501	AAG	2	6	2329823	2329828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317548
51515	NC_013501	T	6	6	2330646	2330651	0 %	100 %	0 %	0 %	268317549
51516	NC_013501	CAT	2	6	2330676	2330681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317549
51517	NC_013501	CGA	2	6	2330683	2330688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317549
51518	NC_013501	AGA	2	6	2330759	2330764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317549
51519	NC_013501	GTTC	2	8	2330867	2330874	0 %	50 %	25 %	25 %	268317549
51520	NC_013501	CCCA	2	8	2330880	2330887	25 %	0 %	0 %	75 %	268317549
51521	NC_013501	GTT	2	6	2330906	2330911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317549
51522	NC_013501	GCG	2	6	2330942	2330947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317549
51523	NC_013501	CG	3	6	2330959	2330964	0 %	0 %	50 %	50 %	268317549
51524	NC_013501	ACCGA	2	10	2330965	2330974	40 %	0 %	20 %	40 %	268317549
51525	NC_013501	AGC	2	6	2330977	2330982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317549
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51527	NC_013501	CCGG	2	8	2331014	2331021	0 %	0 %	50 %	50 %	268317549
51528	NC_013501	AGG	2	6	2331138	2331143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317550
51529	NC_013501	CGGC	2	8	2331214	2331221	0 %	0 %	50 %	50 %	268317550
51530	NC_013501	CG	3	6	2331240	2331245	0 %	0 %	50 %	50 %	268317550
51531	NC_013501	CAGCGC	2	12	2331289	2331300	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268317550
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51533	NC_013501	TCC	2	6	2331317	2331322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317550
51534	NC_013501	GCG	2	6	2331334	2331339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317550
51535	NC_013501	GAA	2	6	2331354	2331359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317550
51536	NC_013501	GC	3	6	2331456	2331461	0 %	0 %	50 %	50 %	268317550
51537	NC_013501	GCGCC	2	10	2331478	2331487	0 %	0 %	40 %	60 %	268317550
51538	NC_013501	CAGG	2	8	2331541	2331548	25 %	0 %	50 %	25 %	268317550
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51541	NC_013501	GTT	2	6	2331606	2331611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268317550
51542	NC_013501	GCGG	2	8	2331634	2331641	0 %	0 %	75 %	25 %	268317550
51543	NC_013501	CGG	2	6	2331653	2331658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317550
51544	NC_013501	GCCG	2	8	2331674	2331681	0 %	0 %	50 %	50 %	268317550
51545	NC_013501	CG	4	8	2331691	2331698	0 %	0 %	50 %	50 %	268317550
51546	NC_013501	CGG	2	6	2332162	2332167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317551
51547	NC_013501	TCG	2	6	2332174	2332179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317551
51548	NC_013501	CGA	2	6	2332190	2332195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317551
51549	NC_013501	TTCGA	2	10	2332303	2332312	20 %	40 %	20 %	20 %	268317551
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51551	NC_013501	CAC	2	6	2332491	2332496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317551
51552	NC_013501	GCG	2	6	2332527	2332532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317551
51553	NC_013501	CCT	2	6	2332547	2332552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317551
51554	NC_013501	GGC	2	6	2332567	2332572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317551
51555	NC_013501	GCCG	2	8	2332602	2332609	0 %	0 %	50 %	50 %	268317551
51556	NC_013501	TGC	2	6	2332618	2332623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317551
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51558	NC_013501	CCT	2	6	2332643	2332648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317551
51559	NC_013501	GGC	2	6	2332659	2332664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317551
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51562	NC_013501	GCC	2	6	2332794	2332799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317551
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51601	NC_013501	TTCC	2	8	2334318	2334325	0 %	50 %	0 %	50 %	268317551
51602	NC_013501	TGG	2	6	2334355	2334360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317551
51603	NC_013501	CG	3	6	2334380	2334385	0 %	0 %	50 %	50 %	268317551
51604	NC_013501	CTC	2	6	2334402	2334407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317551
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51614	NC_013501	GCA	2	6	2334704	2334709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317551
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51616	NC_013501	GCG	2	6	2334738	2334743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317551
51617	NC_013501	GGTC	2	8	2334794	2334801	0 %	25 %	50 %	25 %	268317551
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51846	NC_013501	CGT	2	6	2345587	2345592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317564
51847	NC_013501	ACA	2	6	2345601	2345606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268317564
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51850	NC_013501	CTG	2	6	2345738	2345743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317564
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51864	NC_013501	CGCTGG	2	12	2346315	2346326	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268317564
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51959	NC_013501	GCC	2	6	2350032	2350037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317570
51960	NC_013501	ACG	2	6	2350093	2350098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317570
51961	NC_013501	ACC	2	6	2350119	2350124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317570
51962	NC_013501	CGC	2	6	2350161	2350166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317570
51963	NC_013501	GCCC	2	8	2350181	2350188	0 %	0 %	25 %	75 %	268317570
51964	NC_013501	CTT	2	6	2350229	2350234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317570
51965	NC_013501	ACGG	2	8	2350276	2350283	25 %	0 %	50 %	25 %	268317570
51966	NC_013501	CTG	2	6	2350290	2350295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317570
51967	NC_013501	CGCTG	2	10	2350316	2350325	0 %	20 %	40 %	40 %	268317570
51968	NC_013501	GCT	2	6	2350346	2350351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317570
51969	NC_013501	TGC	2	6	2350375	2350380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317570
51970	NC_013501	GCC	2	6	2350411	2350416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317570
51971	NC_013501	CCGGCT	2	12	2350505	2350516	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	268317570
51972	NC_013501	TCG	2	6	2350528	2350533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317570
51973	NC_013501	GCCG	2	8	2350562	2350569	0 %	0 %	50 %	50 %	268317570
51974	NC_013501	GCCG	2	8	2350627	2350634	0 %	0 %	50 %	50 %	268317570
51975	NC_013501	CACAGG	2	12	2350766	2350777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317571
51976	NC_013501	CGT	2	6	2350842	2350847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317571
51977	NC_013501	GTCG	2	8	2350871	2350878	0 %	25 %	50 %	25 %	268317571
51978	NC_013501	ACC	2	6	2350882	2350887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317571
51979	NC_013501	TCCTGC	2	12	2350915	2350926	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	268317571
51980	NC_013501	GTG	2	6	2350930	2350935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317571
51981	NC_013501	CCCAG	2	10	2350937	2350946	20 %	0 %	20 %	60 %	268317571
51982	NC_013501	CAC	2	6	2350977	2350982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317571
51983	NC_013501	GGC	2	6	2351025	2351030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317571
51984	NC_013501	GC	3	6	2351043	2351048	0 %	0 %	50 %	50 %	268317571
51985	NC_013501	GAG	2	6	2351445	2351450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317572
51986	NC_013501	CTG	2	6	2351535	2351540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317572
51987	NC_013501	GAG	2	6	2351550	2351555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268317572
51988	NC_013501	CTA	2	6	2351612	2351617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317572
51989	NC_013501	CGA	2	6	2351708	2351713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317572
51990	NC_013501	CCA	2	6	2351770	2351775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317572
51991	NC_013501	CAT	2	6	2351804	2351809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317572
51992	NC_013501	GAA	2	6	2351855	2351860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317572
51993	NC_013501	GGT	2	6	2351873	2351878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317572
51994	NC_013501	CTT	2	6	2351894	2351899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317572
51995	NC_013501	CGC	2	6	2351900	2351905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317572
51996	NC_013501	TCT	2	6	2351920	2351925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317572
51997	NC_013501	TCGT	2	8	2351934	2351941	0 %	50 %	25 %	25 %	268317572
51998	NC_013501	CGA	2	6	2352041	2352046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317572
51999	NC_013501	CGA	2	6	2352092	2352097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317572
52000	NC_013501	CGT	2	6	2352116	2352121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317572

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