MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013501	GGC	2	6	204308	204313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315765
4502	NC_013501	GCA	2	6	204317	204322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4503	NC_013501	GTC	2	6	204327	204332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4504	NC_013501	GCG	2	6	204343	204348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315765
4505	NC_013501	GTA	2	6	204474	204479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315765
4506	NC_013501	GCC	2	6	204480	204485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315765
4507	NC_013501	TCG	2	6	204559	204564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4508	NC_013501	GTC	2	6	204567	204572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4509	NC_013501	TGG	2	6	204605	204610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315765
4510	NC_013501	CGGC	2	8	204731	204738	0 %	0 %	50 %	50 %	268315765
4511	NC_013501	GGTT	2	8	204749	204756	0 %	50 %	50 %	0 %	268315765
4512	NC_013501	TTC	2	6	204768	204773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315765
4513	NC_013501	GT	3	6	204866	204871	0 %	50 %	50 %	0 %	268315765
4514	NC_013501	GAA	2	6	204873	204878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315765
4515	NC_013501	CGT	2	6	204884	204889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4516	NC_013501	GGA	2	6	204899	204904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315765
4517	NC_013501	CGG	2	6	204916	204921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315765
4518	NC_013501	CCG	2	6	204931	204936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315765
4519	NC_013501	GCAGGT	2	12	204947	204958	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268315765
4520	NC_013501	CAG	2	6	204984	204989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4521	NC_013501	GCG	2	6	205036	205041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315765
4522	NC_013501	GTT	2	6	205042	205047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315765
4523	NC_013501	GAAAC	2	10	205055	205064	60 %	0 %	20 %	20 %	268315765
4524	NC_013501	GC	4	8	205089	205096	0 %	0 %	50 %	50 %	268315765
4525	NC_013501	CAG	2	6	205143	205148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4526	NC_013501	GCA	2	6	205190	205195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4527	NC_013501	GCC	3	9	205197	205205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315765
4528	NC_013501	GGT	2	6	205291	205296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315765
4529	NC_013501	C	6	6	205305	205310	0 %	0 %	0 %	100 %	268315765
4530	NC_013501	CCAG	2	8	205355	205362	25 %	0 %	25 %	50 %	268315765
4531	NC_013501	GGCC	2	8	205388	205395	0 %	0 %	50 %	50 %	268315765
4532	NC_013501	CTG	2	6	205401	205406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4533	NC_013501	CCG	2	6	205475	205480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315765
4534	NC_013501	GTC	2	6	205495	205500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4535	NC_013501	CTG	3	9	205560	205568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4536	NC_013501	CGC	2	6	205683	205688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315765
4537	NC_013501	CAG	2	6	205695	205700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4538	NC_013501	AGC	2	6	205720	205725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4539	NC_013501	GGC	2	6	205750	205755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315766
4540	NC_013501	GCC	2	6	205770	205775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315766
4541	NC_013501	CAG	2	6	205776	205781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315766
4542	NC_013501	TGCAGG	2	12	205783	205794	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268315766
4543	NC_013501	TGC	2	6	205807	205812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315766
4544	NC_013501	TCT	2	6	205918	205923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315766
4545	NC_013501	CAG	2	6	205968	205973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315766
4546	NC_013501	CAC	2	6	206007	206012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315766
4547	NC_013501	ATG	2	6	206059	206064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315766
4548	NC_013501	AAC	2	6	206071	206076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315766
4549	NC_013501	GGA	2	6	206245	206250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315767
4550	NC_013501	ATC	2	6	206356	206361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315767
4551	NC_013501	TGGC	2	8	206401	206408	0 %	25 %	50 %	25 %	268315767
4552	NC_013501	GAACCT	2	12	206498	206509	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268315767
4553	NC_013501	CGA	2	6	206539	206544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315767
4554	NC_013501	GCCG	2	8	206591	206598	0 %	0 %	50 %	50 %	268315767
4555	NC_013501	GAA	2	6	206658	206663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315767
4556	NC_013501	CGAT	2	8	206720	206727	25 %	25 %	25 %	25 %	268315768
4557	NC_013501	CAG	2	6	206776	206781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315768
4558	NC_013501	GA	3	6	206789	206794	50 %	0 %	50 %	0 %	268315768
4559	NC_013501	GCG	2	6	206835	206840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315768
4560	NC_013501	GGC	2	6	206916	206921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315768
4561	NC_013501	GAT	2	6	206946	206951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315768
4562	NC_013501	TCG	2	6	207047	207052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315768
4563	NC_013501	GTG	2	6	207073	207078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315768
4564	NC_013501	CGG	2	6	207091	207096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315768
4565	NC_013501	GTG	2	6	207172	207177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315768
4566	NC_013501	GCA	2	6	207186	207191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315768
4567	NC_013501	ATG	3	9	207199	207207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315768
4568	NC_013501	CAC	2	6	207234	207239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315768
4569	NC_013501	GCG	2	6	207254	207259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315768
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4571	NC_013501	TCG	2	6	207324	207329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315769
4572	NC_013501	CG	3	6	207370	207375	0 %	0 %	50 %	50 %	268315769
4573	NC_013501	GAG	2	6	207386	207391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315769
4574	NC_013501	TGG	2	6	207411	207416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315769
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4577	NC_013501	TGC	2	6	207483	207488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315769
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4580	NC_013501	CAA	2	6	207571	207576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315769
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4582	NC_013501	CGC	2	6	207597	207602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315769
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4585	NC_013501	TCT	2	6	207717	207722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315769
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4587	NC_013501	GTG	2	6	207809	207814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315769
4588	NC_013501	TGC	2	6	207852	207857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315769
4589	NC_013501	GCCG	2	8	207919	207926	0 %	0 %	50 %	50 %	268315769
4590	NC_013501	TGC	2	6	207993	207998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315769
4591	NC_013501	AGG	2	6	208005	208010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315769
4592	NC_013501	CTG	2	6	208031	208036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315770
4593	NC_013501	CTT	2	6	208111	208116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315770
4594	NC_013501	GCAA	2	8	208122	208129	50 %	0 %	25 %	25 %	268315770
4595	NC_013501	CAGG	2	8	208135	208142	25 %	0 %	50 %	25 %	268315770
4596	NC_013501	GGCG	2	8	208156	208163	0 %	0 %	75 %	25 %	268315770
4597	NC_013501	GCC	2	6	208173	208178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315770
4598	NC_013501	GCCG	2	8	208207	208214	0 %	0 %	50 %	50 %	268315770
4599	NC_013501	GCAGT	2	10	208226	208235	20 %	20 %	40 %	20 %	268315770
4600	NC_013501	CGC	2	6	208243	208248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315770
4601	NC_013501	GCT	2	6	208255	208260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315770
4602	NC_013501	CGT	2	6	208261	208266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315770
4603	NC_013501	CGT	2	6	208279	208284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315770
4604	NC_013501	CGTC	2	8	208293	208300	0 %	25 %	25 %	50 %	268315770
4605	NC_013501	TCCG	2	8	208327	208334	0 %	25 %	25 %	50 %	268315770
4606	NC_013501	CCCTCG	2	12	208371	208382	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	268315770
4607	NC_013501	CAG	2	6	208481	208486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315770
4608	NC_013501	TCG	2	6	208503	208508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315770
4609	NC_013501	GGCC	2	8	208543	208550	0 %	0 %	50 %	50 %	268315770
4610	NC_013501	CTTC	2	8	208570	208577	0 %	50 %	0 %	50 %	268315770
4611	NC_013501	CCA	2	6	208693	208698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315770
4612	NC_013501	CGT	2	6	208703	208708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315770
4613	NC_013501	GTGGG	2	10	208752	208761	0 %	20 %	80 %	0 %	268315770
4614	NC_013501	GCC	2	6	208814	208819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315770
4615	NC_013501	ATA	2	6	208853	208858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268315770
4616	NC_013501	CAGCG	2	10	208874	208883	20 %	0 %	40 %	40 %	268315770
4617	NC_013501	GCG	2	6	208898	208903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315770
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4619	NC_013501	GCC	2	6	208935	208940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315770
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4621	NC_013501	AGC	2	6	209046	209051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315770
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4983	NC_013501	GCG	2	6	225064	225069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315786
4984	NC_013501	GGC	2	6	225085	225090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315786
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4988	NC_013501	CGT	2	6	225307	225312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315787
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