MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48003	NC_013222	A	6	6	2846561	2846566	100 %	0 %	0 %	0 %	260063189
48004	NC_013222	AT	3	6	2846612	2846617	50 %	50 %	0 %	0 %	260063190
48005	NC_013222	TAC	2	6	2846627	2846632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063190
48006	NC_013222	TCA	2	6	2846667	2846672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063190
48007	NC_013222	GGGA	2	8	2846706	2846713	25 %	0 %	75 %	0 %	260063190
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48009	NC_013222	TAT	2	6	2846825	2846830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063190
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48011	NC_013222	CAC	2	6	2846904	2846909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063190
48012	NC_013222	GCT	3	9	2846928	2846936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063191
48013	NC_013222	CTG	2	6	2847011	2847016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063191
48014	NC_013222	GCC	2	6	2847048	2847053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063191
48015	NC_013222	ATACG	2	10	2847067	2847076	40 %	20 %	20 %	20 %	260063191
48016	NC_013222	CGC	2	6	2847077	2847082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063191
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48020	NC_013222	GCT	2	6	2847115	2847120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063191
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48105	NC_013222	T	6	6	2851680	2851685	0 %	100 %	0 %	0 %	260063195
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48108	NC_013222	A	7	7	2851875	2851881	100 %	0 %	0 %	0 %	260063196
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48116	NC_013222	GAA	2	6	2852284	2852289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063196
48117	NC_013222	TGC	2	6	2852303	2852308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063197
48118	NC_013222	C	6	6	2852391	2852396	0 %	0 %	0 %	100 %	260063197
48119	NC_013222	GGA	2	6	2852398	2852403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063197
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48127	NC_013222	CT	3	6	2852935	2852940	0 %	50 %	0 %	50 %	260063198
48128	NC_013222	TTG	2	6	2852971	2852976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063198
48129	NC_013222	TTG	2	6	2852989	2852994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260063198
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48132	NC_013222	TGA	2	6	2853203	2853208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063198
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48185	NC_013222	T	6	6	2855833	2855838	0 %	100 %	0 %	0 %	260063199
48186	NC_013222	TCT	2	6	2855851	2855856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063199
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48200	NC_013222	GGC	2	6	2856723	2856728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063200
48201	NC_013222	GGC	2	6	2856757	2856762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063200
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48203	NC_013222	CAAA	2	8	2856837	2856844	75 %	0 %	0 %	25 %	260063200
48204	NC_013222	GTC	2	6	2856892	2856897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063200
48205	NC_013222	T	6	6	2857033	2857038	0 %	100 %	0 %	0 %	260063201
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48214	NC_013222	ATG	2	6	2857487	2857492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063201
48215	NC_013222	CAG	3	9	2857493	2857501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063201
48216	NC_013222	AGG	2	6	2857599	2857604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063202
48217	NC_013222	TCC	2	6	2857706	2857711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063203
48218	NC_013222	CCT	2	6	2857761	2857766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063203
48219	NC_013222	GTC	2	6	2857870	2857875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063203
48220	NC_013222	GCA	2	6	2857938	2857943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063203
48221	NC_013222	TCGAT	2	10	2857944	2857953	20 %	40 %	20 %	20 %	260063203
48222	NC_013222	GAT	2	6	2858002	2858007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063203
48223	NC_013222	GCC	2	6	2858033	2858038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063203
48224	NC_013222	ATG	2	6	2858054	2858059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063203
48225	NC_013222	GTG	2	6	2858084	2858089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063203
48226	NC_013222	GGC	2	6	2858170	2858175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063203
48227	NC_013222	GGTG	2	8	2858322	2858329	0 %	25 %	75 %	0 %	260063203
48228	NC_013222	C	7	7	2858386	2858392	0 %	0 %	0 %	100 %	260063203
48229	NC_013222	GAT	2	6	2858419	2858424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063203
48230	NC_013222	GGT	2	6	2858430	2858435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063203
48231	NC_013222	CTT	2	6	2858518	2858523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063203
48232	NC_013222	TCG	2	6	2858552	2858557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063203
48233	NC_013222	GAT	2	6	2858608	2858613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063203
48234	NC_013222	TCG	2	6	2858630	2858635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063203
48235	NC_013222	GGTC	2	8	2858664	2858671	0 %	25 %	50 %	25 %	260063203
48236	NC_013222	GCA	2	6	2858772	2858777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063203
48237	NC_013222	TAT	2	6	2858877	2858882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063203
48238	NC_013222	CTT	2	6	2858893	2858898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063203
48239	NC_013222	ATTTT	2	10	2858906	2858915	20 %	80 %	0 %	0 %	260063203
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48241	NC_013222	AGGT	2	8	2858984	2858991	25 %	25 %	50 %	0 %	260063203
48242	NC_013222	AAT	3	9	2859037	2859045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063203
48243	NC_013222	CAG	2	6	2859049	2859054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063203
48244	NC_013222	CAG	2	6	2859064	2859069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063203
48245	NC_013222	TAA	2	6	2859124	2859129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063204
48246	NC_013222	T	6	6	2859156	2859161	0 %	100 %	0 %	0 %	260063204
48247	NC_013222	ATT	2	6	2859171	2859176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063204
48248	NC_013222	TCCACC	2	12	2859274	2859285	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260063204
48249	NC_013222	CTTC	2	8	2859314	2859321	0 %	50 %	0 %	50 %	260063204
48250	NC_013222	CCGG	2	8	2859390	2859397	0 %	0 %	50 %	50 %	260063204
48251	NC_013222	GTA	2	6	2859420	2859425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063204
48252	NC_013222	TAT	2	6	2859476	2859481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063204
48253	NC_013222	CGG	2	6	2859488	2859493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063204
48254	NC_013222	GGT	2	6	2859566	2859571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063204
48255	NC_013222	CGG	2	6	2859653	2859658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063204
48256	NC_013222	T	6	6	2859724	2859729	0 %	100 %	0 %	0 %	260063204
48257	NC_013222	TCA	2	6	2859773	2859778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063204
48258	NC_013222	GCA	2	6	2859779	2859784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063204
48259	NC_013222	GTC	2	6	2859849	2859854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063204
48260	NC_013222	CGG	2	6	2859986	2859991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063204
48261	NC_013222	CCG	2	6	2859995	2860000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063204
48262	NC_013222	AAT	2	6	2860136	2860141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260063205
48263	NC_013222	GGA	2	6	2860177	2860182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063205
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48267	NC_013222	CGG	2	6	2860500	2860505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063205
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48269	NC_013222	TCC	2	6	2860704	2860709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063205
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48273	NC_013222	TGC	2	6	2861594	2861599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063207
48274	NC_013222	CGGC	2	8	2861642	2861649	0 %	0 %	50 %	50 %	260063207
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48277	NC_013222	TGC	2	6	2861870	2861875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063207
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48291	NC_013222	GCCGG	2	10	2862760	2862769	0 %	0 %	60 %	40 %	260063207
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48297	NC_013222	CAT	2	6	2863062	2863067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063208
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48300	NC_013222	CGT	2	6	2863217	2863222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063208
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48302	NC_013222	TGG	2	6	2863295	2863300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063208
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48320	NC_013222	TGG	2	6	2864711	2864716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063211
48321	NC_013222	TAC	2	6	2864724	2864729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063211
48322	NC_013222	ATC	2	6	2864776	2864781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063211
48323	NC_013222	CGG	2	6	2864814	2864819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063211
48324	NC_013222	GGGC	2	8	2864852	2864859	0 %	0 %	75 %	25 %	260063211
48325	NC_013222	CT	3	6	2864905	2864910	0 %	50 %	0 %	50 %	260063211
48326	NC_013222	TTC	2	6	2865028	2865033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063211
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48328	NC_013222	TGG	2	6	2865092	2865097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063211
48329	NC_013222	A	7	7	2865112	2865118	100 %	0 %	0 %	0 %	260063211
48330	NC_013222	GAG	2	6	2865121	2865126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063211
48331	NC_013222	GATTG	2	10	2865238	2865247	20 %	40 %	40 %	0 %	260063212
48332	NC_013222	CAATC	2	10	2865259	2865268	40 %	20 %	0 %	40 %	260063212
48333	NC_013222	T	6	6	2865270	2865275	0 %	100 %	0 %	0 %	260063212
48334	NC_013222	CGA	2	6	2865294	2865299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063212
48335	NC_013222	ATC	2	6	2865325	2865330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063212
48336	NC_013222	GCA	2	6	2865340	2865345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063212
48337	NC_013222	GGA	2	6	2865474	2865479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063212
48338	NC_013222	GAA	2	6	2865537	2865542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063212
48339	NC_013222	A	6	6	2865541	2865546	100 %	0 %	0 %	0 %	260063212
48340	NC_013222	CTG	2	6	2865559	2865564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063212
48341	NC_013222	GCG	2	6	2865598	2865603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063212
48342	NC_013222	GGAA	2	8	2865659	2865666	50 %	0 %	50 %	0 %	260063212
48343	NC_013222	GTG	2	6	2865667	2865672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063212
48344	NC_013222	GCA	2	6	2865762	2865767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063212
48345	NC_013222	CGGC	3	12	2865965	2865976	0 %	0 %	50 %	50 %	260063212
48346	NC_013222	TTC	2	6	2866036	2866041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063212
48347	NC_013222	GAT	2	6	2866062	2866067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063212
48348	NC_013222	GCA	2	6	2866073	2866078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063212
48349	NC_013222	CCA	2	6	2866255	2866260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063213
48350	NC_013222	CCAC	2	8	2866374	2866381	25 %	0 %	0 %	75 %	260063213
48351	NC_013222	C	6	6	2866448	2866453	0 %	0 %	0 %	100 %	260063213
48352	NC_013222	A	6	6	2866455	2866460	100 %	0 %	0 %	0 %	260063213
48353	NC_013222	CCG	2	6	2866482	2866487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063213
48354	NC_013222	CGG	2	6	2866504	2866509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063213
48355	NC_013222	C	6	6	2866517	2866522	0 %	0 %	0 %	100 %	260063213
48356	NC_013222	CGT	2	6	2866696	2866701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063213
48357	NC_013222	ACC	2	6	2866740	2866745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063213
48358	NC_013222	CGGG	2	8	2866786	2866793	0 %	0 %	75 %	25 %	260063213
48359	NC_013222	C	8	8	2866833	2866840	0 %	0 %	0 %	100 %	260063213
48360	NC_013222	G	6	6	2866867	2866872	0 %	0 %	100 %	0 %	260063213
48361	NC_013222	A	6	6	2866902	2866907	100 %	0 %	0 %	0 %	260063213
48362	NC_013222	AGG	2	6	2866920	2866925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063213
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48364	NC_013222	TCC	2	6	2867211	2867216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063213
48365	NC_013222	GTA	2	6	2867225	2867230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063213
48366	NC_013222	C	6	6	2867253	2867258	0 %	0 %	0 %	100 %	260063213
48367	NC_013222	CGT	2	6	2867302	2867307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063213
48368	NC_013222	G	6	6	2867349	2867354	0 %	0 %	100 %	0 %	260063213
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48373	NC_013222	GCC	2	6	2867646	2867651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063213
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48377	NC_013222	GTC	2	6	2867853	2867858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063213
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48382	NC_013222	CGTCC	2	10	2868101	2868110	0 %	20 %	20 %	60 %	260063213
48383	NC_013222	CGGGGT	2	12	2868178	2868189	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260063213
48384	NC_013222	AAG	2	6	2868219	2868224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063213
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48395	NC_013222	CGCAT	2	10	2868605	2868614	20 %	20 %	20 %	40 %	260063213
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48400	NC_013222	CTT	2	6	2868965	2868970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063214
48401	NC_013222	CGGG	2	8	2869063	2869070	0 %	0 %	75 %	25 %	260063214
48402	NC_013222	CAT	2	6	2869079	2869084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063214
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48405	NC_013222	GGT	2	6	2869184	2869189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063214
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48413	NC_013222	ATC	2	6	2869440	2869445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063214
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48416	NC_013222	A	6	6	2869665	2869670	100 %	0 %	0 %	0 %	260063214
48417	NC_013222	CAT	2	6	2869676	2869681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063214
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48420	NC_013222	GACC	2	8	2869805	2869812	25 %	0 %	25 %	50 %	260063214
48421	NC_013222	TGA	2	6	2869894	2869899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063214
48422	NC_013222	ACC	2	6	2869959	2869964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260063214
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48424	NC_013222	GAT	2	6	2870054	2870059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063214
48425	NC_013222	AG	3	6	2870099	2870104	50 %	0 %	50 %	0 %	260063214
48426	NC_013222	GCA	2	6	2870200	2870205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063214
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48428	NC_013222	GAT	2	6	2870312	2870317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260063214
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48432	NC_013222	CG	3	6	2870479	2870484	0 %	0 %	50 %	50 %	260063214
48433	NC_013222	AGC	2	6	2870486	2870491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063214
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48436	NC_013222	TCT	2	6	2870697	2870702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260063215
48437	NC_013222	TAC	2	6	2870852	2870857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063215
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48439	NC_013222	TTCC	2	8	2871118	2871125	0 %	50 %	0 %	50 %	260063215
48440	NC_013222	T	6	6	2871188	2871193	0 %	100 %	0 %	0 %	260063215
48441	NC_013222	GTCTTT	2	12	2871218	2871229	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	260063215
48442	NC_013222	TAT	2	6	2871247	2871252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260063215
48443	NC_013222	GGA	2	6	2871328	2871333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260063215
48444	NC_013222	TCA	2	6	2871354	2871359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260063215
48445	NC_013222	CTG	2	6	2871503	2871508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063215
48446	NC_013222	TGG	2	6	2871531	2871536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063215
48447	NC_013222	GCC	2	6	2871551	2871556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063215
48448	NC_013222	ACA	2	6	2871585	2871590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063215
48449	NC_013222	CCT	2	6	2871621	2871626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260063215
48450	NC_013222	A	6	6	2871634	2871639	100 %	0 %	0 %	0 %	260063215
48451	NC_013222	GCA	2	6	2871647	2871652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063215
48452	NC_013222	ACG	2	6	2871888	2871893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063215
48453	NC_013222	GGACG	2	10	2871916	2871925	20 %	0 %	60 %	20 %	260063215
48454	NC_013222	CAA	2	6	2872012	2872017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260063215
48455	NC_013222	CTG	2	6	2872022	2872027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260063215
48456	NC_013222	GCC	3	9	2872061	2872069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260063215
48457	NC_013222	CGG	2	6	2872135	2872140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063215
48458	NC_013222	GCG	2	6	2872152	2872157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260063215
48459	NC_013222	AGC	2	6	2872164	2872169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063215
48460	NC_013222	GAA	2	6	2872195	2872200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260063215
48461	NC_013222	C	6	6	2872201	2872206	0 %	0 %	0 %	100 %	260063215
48462	NC_013222	A	6	6	2872278	2872283	100 %	0 %	0 %	0 %	260063215
48463	NC_013222	TGG	2	6	2872431	2872436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260063215
48464	NC_013222	GCA	2	6	2872441	2872446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260063215
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