MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43004	NC_013222	CGC	2	6	2536906	2536911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062887
43005	NC_013222	TGC	2	6	2536955	2536960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062887
43006	NC_013222	GAA	2	6	2537011	2537016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062887
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43011	NC_013222	CCGG	2	8	2537271	2537278	0 %	0 %	50 %	50 %	260062887
43012	NC_013222	C	7	7	2537382	2537388	0 %	0 %	0 %	100 %	260062887
43013	NC_013222	TA	3	6	2537394	2537399	50 %	50 %	0 %	0 %	260062887
43014	NC_013222	GTC	2	6	2537545	2537550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062887
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43017	NC_013222	GAA	2	6	2537707	2537712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062887
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43019	NC_013222	ATC	2	6	2537780	2537785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062887
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43021	NC_013222	CTG	3	9	2537810	2537818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062887
43022	NC_013222	GGT	2	6	2537821	2537826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062887
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43032	NC_013222	GAT	2	6	2538990	2538995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062888
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43115	NC_013222	CGT	2	6	2544701	2544706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062892
43116	NC_013222	TCA	2	6	2544710	2544715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062892
43117	NC_013222	CCT	2	6	2544740	2544745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062892
43118	NC_013222	GGC	2	6	2544798	2544803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062892
43119	NC_013222	GCG	2	6	2544837	2544842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062892
43120	NC_013222	CCA	2	6	2544863	2544868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062892
43121	NC_013222	TCACT	2	10	2544944	2544953	20 %	40 %	0 %	40 %	260062892
43122	NC_013222	TCG	2	6	2545005	2545010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062893
43123	NC_013222	A	6	6	2545049	2545054	100 %	0 %	0 %	0 %	260062893
43124	NC_013222	CTG	2	6	2545174	2545179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062893
43125	NC_013222	CAG	2	6	2545207	2545212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062893
43126	NC_013222	GGAA	2	8	2545266	2545273	50 %	0 %	50 %	0 %	260062893
43127	NC_013222	AAT	2	6	2545386	2545391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260062893
43128	NC_013222	GAT	2	6	2545468	2545473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062893
43129	NC_013222	TTC	2	6	2545498	2545503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062893
43130	NC_013222	TGG	2	6	2545565	2545570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062893
43131	NC_013222	CCA	2	6	2545593	2545598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062893
43132	NC_013222	TCG	2	6	2545601	2545606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062893
43133	NC_013222	CCGG	2	8	2545745	2545752	0 %	0 %	50 %	50 %	260062893
43134	NC_013222	AGG	2	6	2545811	2545816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062893
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43136	NC_013222	CCAT	2	8	2545988	2545995	25 %	25 %	0 %	50 %	260062893
43137	NC_013222	CAA	2	6	2546031	2546036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260062893
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43144	NC_013222	CAG	2	6	2546570	2546575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062894
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43147	NC_013222	GGA	2	6	2546654	2546659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062894
43148	NC_013222	CAA	2	6	2546663	2546668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260062894
43149	NC_013222	A	7	7	2546688	2546694	100 %	0 %	0 %	0 %	260062894
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43153	NC_013222	CCAG	2	8	2546959	2546966	25 %	0 %	25 %	50 %	260062894
43154	NC_013222	A	6	6	2547029	2547034	100 %	0 %	0 %	0 %	260062895
43155	NC_013222	CGCC	2	8	2547070	2547077	0 %	0 %	25 %	75 %	260062895
43156	NC_013222	CTC	2	6	2547080	2547085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062895
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43162	NC_013222	CGGTT	2	10	2547333	2547342	0 %	40 %	40 %	20 %	260062895
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43168	NC_013222	AATT	2	8	2547715	2547722	50 %	50 %	0 %	0 %	260062895
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43174	NC_013222	GCC	2	6	2547932	2547937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062895
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43185	NC_013222	GAC	2	6	2548773	2548778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062897
43186	NC_013222	TCC	2	6	2548851	2548856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062897
43187	NC_013222	TTCCA	2	10	2549133	2549142	20 %	40 %	0 %	40 %	260062897
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43189	NC_013222	CAT	2	6	2549225	2549230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062897
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43193	NC_013222	AGCGT	2	10	2549445	2549454	20 %	20 %	40 %	20 %	260062897
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43195	NC_013222	CAAA	2	8	2549503	2549510	75 %	0 %	0 %	25 %	260062897
43196	NC_013222	GCCA	2	8	2549573	2549580	25 %	0 %	25 %	50 %	260062897
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43200	NC_013222	C	6	6	2549756	2549761	0 %	0 %	0 %	100 %	260062898
43201	NC_013222	CGG	2	6	2549768	2549773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062898
43202	NC_013222	ATCCCC	2	12	2549807	2549818	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260062898
43203	NC_013222	C	6	6	2549858	2549863	0 %	0 %	0 %	100 %	260062898
43204	NC_013222	AGGT	2	8	2549886	2549893	25 %	25 %	50 %	0 %	260062898
43205	NC_013222	TTCCT	2	10	2550190	2550199	0 %	60 %	0 %	40 %	260062899
43206	NC_013222	GAC	3	9	2550211	2550219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062899
43207	NC_013222	AACGGC	2	12	2550235	2550246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062899
43208	NC_013222	CCTGGG	2	12	2550249	2550260	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260062899
43209	NC_013222	CGAA	2	8	2550293	2550300	50 %	0 %	25 %	25 %	260062899
43210	NC_013222	TTC	2	6	2550355	2550360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062899
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43212	NC_013222	ACG	2	6	2550437	2550442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062899
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43214	NC_013222	CA	3	6	2550514	2550519	50 %	0 %	0 %	50 %	260062899
43215	NC_013222	TCA	2	6	2550779	2550784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062899
43216	NC_013222	GAACA	2	10	2550823	2550832	60 %	0 %	20 %	20 %	260062899
43217	NC_013222	GCG	2	6	2550844	2550849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062899
43218	NC_013222	CTT	2	6	2550945	2550950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062899
43219	NC_013222	GGA	2	6	2550990	2550995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062899
43220	NC_013222	GAA	2	6	2551033	2551038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062899
43221	NC_013222	AAC	2	6	2551141	2551146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260062899
43222	NC_013222	CTG	2	6	2551509	2551514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062900
43223	NC_013222	TCA	2	6	2551534	2551539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062900
43224	NC_013222	TTC	2	6	2551595	2551600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062901
43225	NC_013222	AGC	2	6	2551817	2551822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062901
43226	NC_013222	GTA	2	6	2551927	2551932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062901
43227	NC_013222	GCT	2	6	2551963	2551968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062901
43228	NC_013222	TA	3	6	2552029	2552034	50 %	50 %	0 %	0 %	260062901
43229	NC_013222	CCGAT	2	10	2552145	2552154	20 %	20 %	20 %	40 %	260062901
43230	NC_013222	TGT	2	6	2552271	2552276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260062901
43231	NC_013222	TCG	2	6	2552300	2552305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062901
43232	NC_013222	AT	3	6	2552354	2552359	50 %	50 %	0 %	0 %	260062901
43233	NC_013222	ATTG	2	8	2552392	2552399	25 %	50 %	25 %	0 %	260062901
43234	NC_013222	TGG	2	6	2552436	2552441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062901
43235	NC_013222	GTA	2	6	2552467	2552472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062901
43236	NC_013222	TCG	2	6	2552681	2552686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062901
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43240	NC_013222	T	6	6	2553128	2553133	0 %	100 %	0 %	0 %	260062902
43241	NC_013222	CATT	2	8	2553250	2553257	25 %	50 %	0 %	25 %	260062902
43242	NC_013222	C	6	6	2553298	2553303	0 %	0 %	0 %	100 %	260062902
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43337	NC_013222	GTA	2	6	2560432	2560437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062912
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43341	NC_013222	CAG	2	6	2561074	2561079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062912
43342	NC_013222	GCC	2	6	2561120	2561125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062912
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43349	NC_013222	CTG	2	6	2561469	2561474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062913
43350	NC_013222	CGC	2	6	2561599	2561604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062913
43351	NC_013222	AGGCC	2	10	2561612	2561621	20 %	0 %	40 %	40 %	260062913
43352	NC_013222	CTT	2	6	2561688	2561693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062913
43353	NC_013222	GCC	2	6	2561773	2561778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062913
43354	NC_013222	GGAACC	2	12	2561783	2561794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062913
43355	NC_013222	GCC	2	6	2561824	2561829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062913
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43357	NC_013222	C	6	6	2561900	2561905	0 %	0 %	0 %	100 %	260062913
43358	NC_013222	TCC	2	6	2561976	2561981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062913
43359	NC_013222	GGC	2	6	2561988	2561993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062913
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43363	NC_013222	CTG	2	6	2562217	2562222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062913
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43365	NC_013222	GGC	2	6	2562267	2562272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062913
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43367	NC_013222	CAAA	2	8	2562461	2562468	75 %	0 %	0 %	25 %	260062913
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43370	NC_013222	GCT	2	6	2562747	2562752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062913
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43378	NC_013222	TCT	2	6	2563364	2563369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062913
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43405	NC_013222	CCA	2	6	2564715	2564720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062914
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43442	NC_013222	CGG	2	6	2566731	2566736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062915
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43447	NC_013222	CCG	2	6	2566941	2566946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062915
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43450	NC_013222	CAT	2	6	2567242	2567247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062916
43451	NC_013222	CCGT	2	8	2567302	2567309	0 %	25 %	25 %	50 %	260062916
43452	NC_013222	C	7	7	2567332	2567338	0 %	0 %	0 %	100 %	260062916
43453	NC_013222	TCG	2	6	2567375	2567380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062916
43454	NC_013222	TCT	2	6	2567381	2567386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062916
43455	NC_013222	TTTTC	2	10	2567397	2567406	0 %	80 %	0 %	20 %	260062916
43456	NC_013222	T	6	6	2567423	2567428	0 %	100 %	0 %	0 %	260062917
43457	NC_013222	TCG	2	6	2567487	2567492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062917
43458	NC_013222	CCAG	2	8	2567560	2567567	25 %	0 %	25 %	50 %	260062917
43459	NC_013222	TG	3	6	2567605	2567610	0 %	50 %	50 %	0 %	260062917
43460	NC_013222	CAG	2	6	2567675	2567680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062917
43461	NC_013222	CAAT	2	8	2567698	2567705	50 %	25 %	0 %	25 %	260062917
43462	NC_013222	TCG	2	6	2567877	2567882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062917
43463	NC_013222	CCG	2	6	2567897	2567902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062917
43464	NC_013222	TTC	2	6	2567903	2567908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062917
43465	NC_013222	CGG	2	6	2567926	2567931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062917
43466	NC_013222	GAT	2	6	2567939	2567944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062917
43467	NC_013222	GCAGGT	2	12	2568016	2568027	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260062917
43468	NC_013222	ATCAGG	2	12	2568030	2568041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260062917
43469	NC_013222	TTC	2	6	2568051	2568056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062917
43470	NC_013222	CTTCC	2	10	2568176	2568185	0 %	40 %	0 %	60 %	260062917
43471	NC_013222	GGT	2	6	2568239	2568244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062917
43472	NC_013222	C	6	6	2568315	2568320	0 %	0 %	0 %	100 %	260062917
43473	NC_013222	GAT	2	6	2568329	2568334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062917
43474	NC_013222	T	8	8	2568334	2568341	0 %	100 %	0 %	0 %	260062917
43475	NC_013222	C	7	7	2568392	2568398	0 %	0 %	0 %	100 %	260062917
43476	NC_013222	TCA	2	6	2568562	2568567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062917
43477	NC_013222	GAT	2	6	2568869	2568874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062917
43478	NC_013222	CCT	2	6	2568961	2568966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062917
43479	NC_013222	TGC	2	6	2569104	2569109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062917
43480	NC_013222	AGG	2	6	2569110	2569115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062917
43481	NC_013222	CTT	2	6	2569298	2569303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062918
43482	NC_013222	GCG	2	6	2569321	2569326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062918
43483	NC_013222	GCCG	2	8	2569337	2569344	0 %	0 %	50 %	50 %	260062918
43484	NC_013222	GGA	2	6	2569355	2569360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062918
43485	NC_013222	TCA	2	6	2569387	2569392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062918
43486	NC_013222	ACG	2	6	2569405	2569410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062918
43487	NC_013222	GGC	2	6	2569494	2569499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062918
43488	NC_013222	CTA	2	6	2569754	2569759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062918
43489	NC_013222	TGAT	2	8	2569912	2569919	25 %	50 %	25 %	0 %	260062918
43490	NC_013222	TTC	2	6	2569991	2569996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062918
43491	NC_013222	GTG	2	6	2570070	2570075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062918
43492	NC_013222	GCTA	2	8	2570091	2570098	25 %	25 %	25 %	25 %	260062918
43493	NC_013222	GCGCG	2	10	2570116	2570125	0 %	0 %	60 %	40 %	260062918
43494	NC_013222	AGC	2	6	2570218	2570223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062918
43495	NC_013222	TAT	2	6	2570241	2570246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260062918
43496	NC_013222	GCC	2	6	2570277	2570282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062918
43497	NC_013222	GCG	2	6	2570398	2570403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062918
43498	NC_013222	GAA	2	6	2570478	2570483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062918
43499	NC_013222	G	7	7	2570497	2570503	0 %	0 %	100 %	0 %	260062918
43500	NC_013222	GAA	2	6	2570523	2570528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062918

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