MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_013222	GAAG	2	8	2448259	2448266	50 %	0 %	50 %	0 %	260062807
41502	NC_013222	GGA	2	6	2448301	2448306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062807
41503	NC_013222	CGA	2	6	2448343	2448348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062807
41504	NC_013222	TGA	2	6	2448363	2448368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062807
41505	NC_013222	GGA	2	6	2448421	2448426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062807
41506	NC_013222	TACCT	2	10	2448527	2448536	20 %	40 %	0 %	40 %	260062807
41507	NC_013222	GAG	2	6	2448605	2448610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062807
41508	NC_013222	CTACCG	2	12	2448643	2448654	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260062807
41509	NC_013222	AGA	2	6	2448708	2448713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062807
41510	NC_013222	AGG	2	6	2448837	2448842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062807
41511	NC_013222	GGGC	2	8	2448870	2448877	0 %	0 %	75 %	25 %	260062807
41512	NC_013222	AAG	2	6	2448911	2448916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260062807
41513	NC_013222	G	6	6	2448936	2448941	0 %	0 %	100 %	0 %	260062807
41514	NC_013222	GCT	3	9	2448952	2448960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062807
41515	NC_013222	TGAACC	2	12	2449113	2449124	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260062808
41516	NC_013222	TCC	2	6	2449184	2449189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062808
41517	NC_013222	CGA	2	6	2449225	2449230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062808
41518	NC_013222	AAC	2	6	2449373	2449378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260062808
41519	NC_013222	GGCC	2	8	2449572	2449579	0 %	0 %	50 %	50 %	260062808
41520	NC_013222	GGTGG	2	10	2449609	2449618	0 %	20 %	80 %	0 %	260062808
41521	NC_013222	GCG	2	6	2449626	2449631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062808
41522	NC_013222	TCCA	2	8	2449682	2449689	25 %	25 %	0 %	50 %	260062808
41523	NC_013222	CA	3	6	2449717	2449722	50 %	0 %	0 %	50 %	260062808
41524	NC_013222	GGA	3	9	2449756	2449764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062808
41525	NC_013222	GAC	2	6	2449817	2449822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062808
41526	NC_013222	CAGC	2	8	2449885	2449892	25 %	0 %	25 %	50 %	260062808
41527	NC_013222	TGA	2	6	2449905	2449910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062808
41528	NC_013222	GGGC	2	8	2449933	2449940	0 %	0 %	75 %	25 %	260062808
41529	NC_013222	TCA	2	6	2450105	2450110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062809
41530	NC_013222	GAG	2	6	2450119	2450124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062809
41531	NC_013222	AACCCG	2	12	2450125	2450136	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260062809
41532	NC_013222	CAGG	2	8	2450145	2450152	25 %	0 %	50 %	25 %	260062809
41533	NC_013222	TGG	2	6	2450153	2450158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062809
41534	NC_013222	G	6	6	2450173	2450178	0 %	0 %	100 %	0 %	260062809
41535	NC_013222	TC	3	6	2450319	2450324	0 %	50 %	0 %	50 %	260062809
41536	NC_013222	TCC	2	6	2450399	2450404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062809
41537	NC_013222	AAT	2	6	2450410	2450415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260062809
41538	NC_013222	AAGAAA	2	12	2450434	2450445	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	260062809
41539	NC_013222	GGC	2	6	2450504	2450509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062809
41540	NC_013222	GAC	2	6	2450539	2450544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062809
41541	NC_013222	TGG	2	6	2450597	2450602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062809
41542	NC_013222	G	6	6	2450626	2450631	0 %	0 %	100 %	0 %	260062809
41543	NC_013222	CCCGAA	2	12	2450665	2450676	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260062809
41544	NC_013222	GGGA	2	8	2450684	2450691	25 %	0 %	75 %	0 %	260062809
41545	NC_013222	AGGC	2	8	2450717	2450724	25 %	0 %	50 %	25 %	260062809
41546	NC_013222	GTT	2	6	2450803	2450808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260062810
41547	NC_013222	CTT	2	6	2450829	2450834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062810
41548	NC_013222	ATC	2	6	2450837	2450842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062810
41549	NC_013222	ACG	2	6	2450884	2450889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062810
41550	NC_013222	GTA	2	6	2450935	2450940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062810
41551	NC_013222	GCGG	2	8	2450962	2450969	0 %	0 %	75 %	25 %	260062810
41552	NC_013222	CCA	2	6	2451087	2451092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062810
41553	NC_013222	TGT	2	6	2451111	2451116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260062810
41554	NC_013222	CAC	2	6	2451118	2451123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062810
41555	NC_013222	GCT	2	6	2451178	2451183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062810
41556	NC_013222	TCG	2	6	2451248	2451253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062810
41557	NC_013222	TGT	2	6	2451426	2451431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260062810
41558	NC_013222	TGA	2	6	2451432	2451437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062810
41559	NC_013222	GTT	2	6	2451445	2451450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260062810
41560	NC_013222	TCC	2	6	2451512	2451517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062810
41561	NC_013222	CAG	2	6	2451550	2451555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062810
41562	NC_013222	TTTG	2	8	2451570	2451577	0 %	75 %	25 %	0 %	260062810
41563	NC_013222	AGTGCC	2	12	2451620	2451631	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260062810
41564	NC_013222	AAT	2	6	2451646	2451651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260062810
41565	NC_013222	T	7	7	2451654	2451660	0 %	100 %	0 %	0 %	260062810
41566	NC_013222	ATG	2	6	2451792	2451797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062811
41567	NC_013222	TAA	2	6	2451802	2451807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260062811
41568	NC_013222	GCG	2	6	2451826	2451831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062811
41569	NC_013222	ATC	2	6	2451871	2451876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062811
41570	NC_013222	TAA	2	6	2451892	2451897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260062811
41571	NC_013222	GGC	2	6	2451960	2451965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062811
41572	NC_013222	AGC	2	6	2451976	2451981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062811
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41574	NC_013222	AGGT	2	8	2452060	2452067	25 %	25 %	50 %	0 %	260062811
41575	NC_013222	AAT	2	6	2452130	2452135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260062811
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41577	NC_013222	TGG	2	6	2452186	2452191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062811
41578	NC_013222	AAT	2	6	2452391	2452396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260062811
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41583	NC_013222	CCG	2	6	2452570	2452575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062811
41584	NC_013222	TCC	3	9	2452612	2452620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062811
41585	NC_013222	G	6	6	2452852	2452857	0 %	0 %	100 %	0 %	260062812
41586	NC_013222	G	6	6	2452865	2452870	0 %	0 %	100 %	0 %	260062812
41587	NC_013222	ATCC	2	8	2452906	2452913	25 %	25 %	0 %	50 %	260062812
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41592	NC_013222	CCGG	3	12	2453128	2453139	0 %	0 %	50 %	50 %	260062812
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41596	NC_013222	GGA	2	6	2453327	2453332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062813
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41600	NC_013222	GCA	2	6	2453579	2453584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062813
41601	NC_013222	AAC	2	6	2453602	2453607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260062813
41602	NC_013222	CCA	2	6	2453638	2453643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062813
41603	NC_013222	GAAA	2	8	2453683	2453690	75 %	0 %	25 %	0 %	260062813
41604	NC_013222	TCA	2	6	2453692	2453697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062813
41605	NC_013222	CCG	2	6	2453771	2453776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062813
41606	NC_013222	CTG	2	6	2453823	2453828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062813
41607	NC_013222	GACC	2	8	2453843	2453850	25 %	0 %	25 %	50 %	260062813
41608	NC_013222	CGAA	2	8	2453863	2453870	50 %	0 %	25 %	25 %	260062813
41609	NC_013222	GAG	2	6	2453928	2453933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062813
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41611	NC_013222	A	6	6	2453973	2453978	100 %	0 %	0 %	0 %	260062813
41612	NC_013222	GCAG	2	8	2453985	2453992	25 %	0 %	50 %	25 %	260062813
41613	NC_013222	GAAA	2	8	2454041	2454048	75 %	0 %	25 %	0 %	260062813
41614	NC_013222	CTG	2	6	2454072	2454077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062813
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41616	NC_013222	TGC	2	6	2454097	2454102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062813
41617	NC_013222	GCC	2	6	2454189	2454194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062813
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41727	NC_013222	C	6	6	2460306	2460311	0 %	0 %	0 %	100 %	260062817
41728	NC_013222	CGA	2	6	2460319	2460324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062817
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41732	NC_013222	GCC	2	6	2460492	2460497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062817
41733	NC_013222	TCT	2	6	2460612	2460617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062817
41734	NC_013222	GAT	2	6	2460644	2460649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062817
41735	NC_013222	TCG	2	6	2460660	2460665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062817
41736	NC_013222	TCA	2	6	2460670	2460675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062817
41737	NC_013222	CG	3	6	2460695	2460700	0 %	0 %	50 %	50 %	260062817
41738	NC_013222	GTC	2	6	2460863	2460868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062817
41739	NC_013222	GCAG	2	8	2460880	2460887	25 %	0 %	50 %	25 %	260062817
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41744	NC_013222	CCCG	2	8	2461132	2461139	0 %	0 %	25 %	75 %	260062817
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41834	NC_013222	CAGGTC	2	12	2465641	2465652	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260062819
41835	NC_013222	T	6	6	2465754	2465759	0 %	100 %	0 %	0 %	260062819
41836	NC_013222	CCCG	2	8	2465809	2465816	0 %	0 %	25 %	75 %	260062819
41837	NC_013222	A	6	6	2465866	2465871	100 %	0 %	0 %	0 %	260062819
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41840	NC_013222	CCT	2	6	2466066	2466071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062819
41841	NC_013222	ATA	2	6	2466073	2466078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260062819
41842	NC_013222	GGT	2	6	2466081	2466086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062819
41843	NC_013222	CCGAA	2	10	2466102	2466111	40 %	0 %	20 %	40 %	260062819
41844	NC_013222	TG	3	6	2466223	2466228	0 %	50 %	50 %	0 %	260062819
41845	NC_013222	TTTTC	2	10	2466230	2466239	0 %	80 %	0 %	20 %	260062819
41846	NC_013222	TCC	2	6	2466279	2466284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062820
41847	NC_013222	CAA	2	6	2466388	2466393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260062820
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41966	NC_013222	GGC	2	6	2472935	2472940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062824
41967	NC_013222	TGC	2	6	2472967	2472972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062824
41968	NC_013222	GGT	2	6	2472974	2472979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062824
41969	NC_013222	GCC	2	6	2473007	2473012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062824
41970	NC_013222	C	6	6	2473014	2473019	0 %	0 %	0 %	100 %	260062824
41971	NC_013222	ATC	2	6	2473068	2473073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062824
41972	NC_013222	ACC	2	6	2473143	2473148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062824
41973	NC_013222	CCA	2	6	2473162	2473167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062824
41974	NC_013222	GGA	2	6	2473240	2473245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062824
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41979	NC_013222	TGT	2	6	2473398	2473403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260062825
41980	NC_013222	CCA	2	6	2473479	2473484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062825
41981	NC_013222	TCC	2	6	2473532	2473537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260062825
41982	NC_013222	G	6	6	2473572	2473577	0 %	0 %	100 %	0 %	260062825
41983	NC_013222	GTA	2	6	2473618	2473623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062825
41984	NC_013222	TGC	3	9	2473674	2473682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062825
41985	NC_013222	GGT	2	6	2473687	2473692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260062825
41986	NC_013222	GCA	2	6	2473728	2473733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062825
41987	NC_013222	GGC	2	6	2473986	2473991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260062826
41988	NC_013222	GCC	2	6	2474037	2474042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260062826
41989	NC_013222	CCGGC	2	10	2474066	2474075	0 %	0 %	40 %	60 %	260062826
41990	NC_013222	GTA	2	6	2474088	2474093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260062826
41991	NC_013222	GA	3	6	2474119	2474124	50 %	0 %	50 %	0 %	260062826
41992	NC_013222	CCA	2	6	2474191	2474196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260062826
41993	NC_013222	G	6	6	2474238	2474243	0 %	0 %	100 %	0 %	260062826
41994	NC_013222	ATC	2	6	2474244	2474249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260062826
41995	NC_013222	GCCA	2	8	2474256	2474263	25 %	0 %	25 %	50 %	260062826
41996	NC_013222	GGA	2	6	2474360	2474365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260062826
41997	NC_013222	ACG	2	6	2474410	2474415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260062826
41998	NC_013222	TTC	2	6	2474516	2474521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260062826
41999	NC_013222	CTG	2	6	2474544	2474549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260062826
42000	NC_013222	A	6	6	2474649	2474654	100 %	0 %	0 %	0 %	260062826

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