MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013222	ATAGCC	2	12	198898	198909	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260060752
3502	NC_013222	GACG	2	8	198934	198941	25 %	0 %	50 %	25 %	260060752
3503	NC_013222	ACC	2	6	198971	198976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060752
3504	NC_013222	ACG	2	6	199025	199030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060752
3505	NC_013222	CCG	2	6	199043	199048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060752
3506	NC_013222	TTCC	2	8	199077	199084	0 %	50 %	0 %	50 %	260060752
3507	NC_013222	ATCC	2	8	199101	199108	25 %	25 %	0 %	50 %	260060752
3508	NC_013222	GCG	2	6	199118	199123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060752
3509	NC_013222	CGG	2	6	199181	199186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060752
3510	NC_013222	TGT	2	6	199205	199210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060752
3511	NC_013222	T	6	6	199210	199215	0 %	100 %	0 %	0 %	260060752
3512	NC_013222	AAC	2	6	199222	199227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060752
3513	NC_013222	GC	3	6	199234	199239	0 %	0 %	50 %	50 %	260060752
3514	NC_013222	ACC	2	6	199389	199394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060753
3515	NC_013222	TG	3	6	199395	199400	0 %	50 %	50 %	0 %	260060753
3516	NC_013222	CGA	2	6	199428	199433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060753
3517	NC_013222	GC	3	6	199459	199464	0 %	0 %	50 %	50 %	260060753
3518	NC_013222	GAA	2	6	199496	199501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060753
3519	NC_013222	GAC	2	6	199670	199675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060753
3520	NC_013222	GCC	2	6	199694	199699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060753
3521	NC_013222	ACC	2	6	199800	199805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060753
3522	NC_013222	TTC	2	6	199895	199900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060753
3523	NC_013222	CAG	2	6	199919	199924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060753
3524	NC_013222	GCG	2	6	199960	199965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060753
3525	NC_013222	CTG	2	6	200201	200206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060753
3526	NC_013222	CGT	2	6	200382	200387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060754
3527	NC_013222	GCC	2	6	200399	200404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060754
3528	NC_013222	TTC	2	6	200449	200454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060754
3529	NC_013222	CCGG	2	8	200513	200520	0 %	0 %	50 %	50 %	260060754
3530	NC_013222	GGAT	2	8	200628	200635	25 %	25 %	50 %	0 %	260060754
3531	NC_013222	GGT	2	6	200640	200645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060754
3532	NC_013222	TGG	2	6	200702	200707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060754
3533	NC_013222	CGGG	2	8	200709	200716	0 %	0 %	75 %	25 %	260060754
3534	NC_013222	TGG	2	6	200720	200725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060754
3535	NC_013222	GGT	2	6	200826	200831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060754
3536	NC_013222	CCTT	2	8	200840	200847	0 %	50 %	0 %	50 %	260060754
3537	NC_013222	TTTGAT	2	12	200848	200859	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	260060754
3538	NC_013222	TCG	2	6	200876	200881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060754
3539	NC_013222	GGT	2	6	200985	200990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060754
3540	NC_013222	ATC	2	6	201044	201049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060754
3541	NC_013222	CAG	2	6	201061	201066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060754
3542	NC_013222	TGG	2	6	201125	201130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060754
3543	NC_013222	AAC	2	6	201134	201139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060754
3544	NC_013222	GCC	2	6	201194	201199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060754
3545	NC_013222	ACC	2	6	201230	201235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060754
3546	NC_013222	CGG	2	6	201312	201317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060754
3547	NC_013222	TGGG	2	8	201359	201366	0 %	25 %	75 %	0 %	260060754
3548	NC_013222	GGT	2	6	201375	201380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060754
3549	NC_013222	ACA	2	6	201381	201386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060754
3550	NC_013222	GGA	2	6	201388	201393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060754
3551	NC_013222	GCT	2	6	201423	201428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060754
3552	NC_013222	CGT	2	6	201444	201449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060754
3553	NC_013222	GGA	2	6	201630	201635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060755
3554	NC_013222	GCGG	2	8	201666	201673	0 %	0 %	75 %	25 %	260060755
3555	NC_013222	CGGG	2	8	201674	201681	0 %	0 %	75 %	25 %	260060755
3556	NC_013222	CAA	2	6	201688	201693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060755
3557	NC_013222	A	7	7	201692	201698	100 %	0 %	0 %	0 %	260060755
3558	NC_013222	CCTC	2	8	201700	201707	0 %	25 %	0 %	75 %	260060755
3559	NC_013222	A	6	6	201736	201741	100 %	0 %	0 %	0 %	260060755
3560	NC_013222	GCC	2	6	201744	201749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060755
3561	NC_013222	T	8	8	201837	201844	0 %	100 %	0 %	0 %	260060756
3562	NC_013222	GAA	2	6	201908	201913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060756
3563	NC_013222	ACC	3	9	201915	201923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060756
3564	NC_013222	TTG	2	6	201924	201929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060756
3565	NC_013222	CCA	2	6	201937	201942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060756
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3568	NC_013222	TGC	2	6	202045	202050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060756
3569	NC_013222	CTG	2	6	202127	202132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060756
3570	NC_013222	GTC	2	6	202172	202177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060756
3571	NC_013222	CCA	2	6	202246	202251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060756
3572	NC_013222	GGC	2	6	202255	202260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060756
3573	NC_013222	GAG	2	6	202298	202303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060756
3574	NC_013222	CCG	2	6	202318	202323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060756
3575	NC_013222	TGG	2	6	202363	202368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060756
3576	NC_013222	GCCG	2	8	202375	202382	0 %	0 %	50 %	50 %	260060756
3577	NC_013222	GATG	2	8	202408	202415	25 %	25 %	50 %	0 %	260060756
3578	NC_013222	G	6	6	202472	202477	0 %	0 %	100 %	0 %	260060756
3579	NC_013222	TCA	2	6	202627	202632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060756
3580	NC_013222	GCG	2	6	202637	202642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060756
3581	NC_013222	GGGCA	2	10	202730	202739	20 %	0 %	60 %	20 %	260060756
3582	NC_013222	TC	3	6	202813	202818	0 %	50 %	0 %	50 %	260060756
3583	NC_013222	TGTC	2	8	202822	202829	0 %	50 %	25 %	25 %	260060756
3584	NC_013222	CAG	2	6	202964	202969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060756
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3586	NC_013222	CCTT	2	8	203280	203287	0 %	50 %	0 %	50 %	260060757
3587	NC_013222	TCC	2	6	203349	203354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060757
3588	NC_013222	CAG	2	6	203369	203374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060757
3589	NC_013222	TCC	2	6	203388	203393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060757
3590	NC_013222	GTT	2	6	203434	203439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060757
3591	NC_013222	TCG	2	6	203472	203477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060757
3592	NC_013222	CCG	2	6	203593	203598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060757
3593	NC_013222	TTC	2	6	203618	203623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060757
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3595	NC_013222	T	6	6	203780	203785	0 %	100 %	0 %	0 %	260060757
3596	NC_013222	CTC	2	6	203825	203830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060757
3597	NC_013222	ATAAAT	2	12	203907	203918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060757
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3601	NC_013222	CTG	2	6	204257	204262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060758
3602	NC_013222	CCA	2	6	204280	204285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060758
3603	NC_013222	TCA	2	6	204288	204293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060758
3604	NC_013222	CAG	2	6	204373	204378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060758
3605	NC_013222	GCT	2	6	204427	204432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060758
3606	NC_013222	GCT	2	6	204454	204459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060758
3607	NC_013222	A	8	8	204516	204523	100 %	0 %	0 %	0 %	260060758
3608	NC_013222	TACC	2	8	204535	204542	25 %	25 %	0 %	50 %	260060758
3609	NC_013222	TTCCT	2	10	204581	204590	0 %	60 %	0 %	40 %	260060758
3610	NC_013222	CTGG	2	8	204619	204626	0 %	25 %	50 %	25 %	260060758
3611	NC_013222	GGT	2	6	204676	204681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060758
3612	NC_013222	GGGAT	2	10	204692	204701	20 %	20 %	60 %	0 %	260060758
3613	NC_013222	ATC	2	6	204803	204808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060758
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3616	NC_013222	TTC	2	6	204875	204880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060758
3617	NC_013222	CAG	2	6	204881	204886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060758
3618	NC_013222	GGA	2	6	204958	204963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060758
3619	NC_013222	GCT	2	6	205012	205017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060758
3620	NC_013222	AAC	2	6	205025	205030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060758
3621	NC_013222	GGCCC	2	10	205102	205111	0 %	0 %	40 %	60 %	260060758
3622	NC_013222	A	6	6	205118	205123	100 %	0 %	0 %	0 %	260060758
3623	NC_013222	AAC	2	6	205152	205157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060758
3624	NC_013222	CG	3	6	205178	205183	0 %	0 %	50 %	50 %	260060758
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3632	NC_013222	GCA	2	6	206056	206061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060758
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3730	NC_013222	A	6	6	210888	210893	100 %	0 %	0 %	0 %	260060763
3731	NC_013222	CGA	2	6	211031	211036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060763
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3735	NC_013222	GCT	2	6	211340	211345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060763
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3737	NC_013222	GGAA	2	8	211492	211499	50 %	0 %	50 %	0 %	260060763
3738	NC_013222	CAG	2	6	211704	211709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060764
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3740	NC_013222	CGA	2	6	211850	211855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060764
3741	NC_013222	ATTG	2	8	211947	211954	25 %	50 %	25 %	0 %	260060764
3742	NC_013222	CTGCA	2	10	212107	212116	20 %	20 %	20 %	40 %	260060765
3743	NC_013222	CTC	2	6	212212	212217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060765
3744	NC_013222	ATC	2	6	212227	212232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060765
3745	NC_013222	G	7	7	212233	212239	0 %	0 %	100 %	0 %	260060765
3746	NC_013222	TGG	2	6	212249	212254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060765
3747	NC_013222	TGA	2	6	212312	212317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060765
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3749	NC_013222	GTG	2	6	212362	212367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060765
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3752	NC_013222	CCTGC	2	10	212472	212481	0 %	20 %	20 %	60 %	260060765
3753	NC_013222	TGA	2	6	212579	212584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060765
3754	NC_013222	GCC	2	6	212590	212595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060765
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3756	NC_013222	C	6	6	212720	212725	0 %	0 %	0 %	100 %	260060765
3757	NC_013222	C	7	7	212727	212733	0 %	0 %	0 %	100 %	260060765
3758	NC_013222	TCC	2	6	212861	212866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060766
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3760	NC_013222	A	7	7	212882	212888	100 %	0 %	0 %	0 %	260060766
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3772	NC_013222	ACA	2	6	213558	213563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060766
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3776	NC_013222	ACG	2	6	213711	213716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060766
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3780	NC_013222	CGG	2	6	213919	213924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060766
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3856	NC_013222	CGA	2	6	218087	218092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060770
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3863	NC_013222	GGGAA	2	10	218527	218536	40 %	0 %	60 %	0 %	260060770
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3865	NC_013222	AGG	2	6	218572	218577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060770
3866	NC_013222	CAA	2	6	218673	218678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060770
3867	NC_013222	CGA	2	6	218714	218719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060770
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3869	NC_013222	G	6	6	219145	219150	0 %	0 %	100 %	0 %	260060771
3870	NC_013222	CAA	2	6	219273	219278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060771
3871	NC_013222	CCGG	2	8	219298	219305	0 %	0 %	50 %	50 %	260060771
3872	NC_013222	CCA	2	6	219320	219325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060771
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3879	NC_013222	GCT	2	6	219629	219634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060771
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3882	NC_013222	CCT	2	6	219803	219808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060771
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3889	NC_013222	GTG	2	6	220325	220330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060772
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3894	NC_013222	G	6	6	220557	220562	0 %	0 %	100 %	0 %	260060772
3895	NC_013222	AGG	2	6	220586	220591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060772
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3899	NC_013222	CCAT	2	8	220887	220894	25 %	25 %	0 %	50 %	260060772
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3934	NC_013222	GCA	2	6	223160	223165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060774
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3956	NC_013222	CGGG	3	12	224354	224365	0 %	0 %	75 %	25 %	260060775
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3967	NC_013222	CCGG	2	8	224912	224919	0 %	0 %	50 %	50 %	260060775
3968	NC_013222	AGG	2	6	224983	224988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060775
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3970	NC_013222	TCGGGC	2	12	225055	225066	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260060775
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3973	NC_013222	ACC	2	6	225160	225165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060775
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3981	NC_013222	AAC	2	6	225643	225648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060775
3982	NC_013222	CCT	2	6	225763	225768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060775
3983	NC_013222	G	6	6	225855	225860	0 %	0 %	100 %	0 %	260060775
3984	NC_013222	CCGA	2	8	225886	225893	25 %	0 %	25 %	50 %	260060775
3985	NC_013222	CCT	2	6	225910	225915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060775
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3987	NC_013222	AGCC	2	8	226076	226083	25 %	0 %	25 %	50 %	260060775
3988	NC_013222	CGT	2	6	226094	226099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060775
3989	NC_013222	GGC	2	6	226124	226129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060775
3990	NC_013222	ACC	2	6	226149	226154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060775
3991	NC_013222	CAG	2	6	226164	226169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060775
3992	NC_013222	GGA	2	6	226214	226219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060775
3993	NC_013222	GGC	2	6	226256	226261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060775
3994	NC_013222	A	6	6	226266	226271	100 %	0 %	0 %	0 %	260060775
3995	NC_013222	GGAA	2	8	226327	226334	50 %	0 %	50 %	0 %	260060775
3996	NC_013222	GAC	2	6	226428	226433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060775
3997	NC_013222	ACA	2	6	226475	226480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060775
3998	NC_013222	A	6	6	226532	226537	100 %	0 %	0 %	0 %	260060776
3999	NC_013222	CGC	2	6	226547	226552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060776
4000	NC_013222	CAC	2	6	226564	226569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060776

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