MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22618	NC_013222	GCT	2	6	1310077	1310082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061772
22619	NC_013222	GGT	2	6	1310095	1310100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061772
22620	NC_013222	AGC	2	6	1310166	1310171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061772
22621	NC_013222	GCA	2	6	1310203	1310208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061772
22622	NC_013222	TTG	2	6	1310211	1310216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061772
22623	NC_013222	GT	4	8	1310328	1310335	0 %	50 %	50 %	0 %	260061772
22624	NC_013222	CGG	2	6	1310359	1310364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061772
22625	NC_013222	GAT	2	6	1310480	1310485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061772
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22629	NC_013222	GC	3	6	1310650	1310655	0 %	0 %	50 %	50 %	260061772
22630	NC_013222	GTG	2	6	1310669	1310674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061772
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22632	NC_013222	CGT	2	6	1310755	1310760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061772
22633	NC_013222	GCC	2	6	1310861	1310866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061772
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22644	NC_013222	GGCC	2	8	1311361	1311368	0 %	0 %	50 %	50 %	260061772
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22722	NC_013222	CGG	2	6	1316112	1316117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061778
22723	NC_013222	ATG	2	6	1316214	1316219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061778
22724	NC_013222	CTG	2	6	1316226	1316231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061778
22725	NC_013222	GACCTG	2	12	1316234	1316245	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260061778
22726	NC_013222	GCC	2	6	1316258	1316263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061778
22727	NC_013222	CTG	2	6	1316359	1316364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061779
22728	NC_013222	T	6	6	1316368	1316373	0 %	100 %	0 %	0 %	260061779
22729	NC_013222	GTA	2	6	1316409	1316414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061779
22730	NC_013222	T	7	7	1316440	1316446	0 %	100 %	0 %	0 %	260061779
22731	NC_013222	AAG	2	6	1316520	1316525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061779
22732	NC_013222	ATA	2	6	1316641	1316646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260061779
22733	NC_013222	GGT	2	6	1316771	1316776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061780
22734	NC_013222	CTG	2	6	1316793	1316798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061780
22735	NC_013222	ATC	2	6	1316850	1316855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061780
22736	NC_013222	GTTG	2	8	1316927	1316934	0 %	50 %	50 %	0 %	260061780
22737	NC_013222	AGC	2	6	1316949	1316954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061780
22738	NC_013222	TTC	2	6	1316961	1316966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061780
22739	NC_013222	GAG	2	6	1316967	1316972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061780
22740	NC_013222	GTG	2	6	1317084	1317089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260061780
22741	NC_013222	GGC	2	6	1317300	1317305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061781
22742	NC_013222	GTTG	2	8	1317323	1317330	0 %	50 %	50 %	0 %	260061781
22743	NC_013222	GCG	2	6	1317373	1317378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061781
22744	NC_013222	TTTTG	2	10	1317402	1317411	0 %	80 %	20 %	0 %	260061781
22745	NC_013222	ACG	2	6	1317915	1317920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061782
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22747	NC_013222	GCA	2	6	1318015	1318020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061782
22748	NC_013222	GCT	2	6	1318031	1318036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061782
22749	NC_013222	TCA	2	6	1318138	1318143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061782
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22752	NC_013222	CCCG	2	8	1318501	1318508	0 %	0 %	25 %	75 %	260061782
22753	NC_013222	GAT	2	6	1318625	1318630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061782
22754	NC_013222	GTATT	2	10	1318677	1318686	20 %	60 %	20 %	0 %	260061782
22755	NC_013222	G	7	7	1318719	1318725	0 %	0 %	100 %	0 %	260061782
22756	NC_013222	CAG	2	6	1318835	1318840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061782
22757	NC_013222	GGC	2	6	1318910	1318915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061782
22758	NC_013222	GAT	2	6	1318970	1318975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061782
22759	NC_013222	GAT	2	6	1319051	1319056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061782
22760	NC_013222	CCA	2	6	1319165	1319170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061782
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22764	NC_013222	AGG	2	6	1319432	1319437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061783
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22767	NC_013222	GGCC	2	8	1319517	1319524	0 %	0 %	50 %	50 %	260061783
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22772	NC_013222	GAA	2	6	1319635	1319640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260061783
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22776	NC_013222	TCG	3	9	1319771	1319779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061783
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22785	NC_013222	TGC	2	6	1320198	1320203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061783
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22801	NC_013222	GCG	2	6	1320928	1320933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061783
22802	NC_013222	GCCG	2	8	1320942	1320949	0 %	0 %	50 %	50 %	260061783
22803	NC_013222	GGA	3	9	1320991	1320999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061783
22804	NC_013222	CGG	2	6	1321073	1321078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061783
22805	NC_013222	AATC	2	8	1321487	1321494	50 %	25 %	0 %	25 %	260061784
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22807	NC_013222	CTG	2	6	1321636	1321641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061784
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22818	NC_013222	CGG	2	6	1322369	1322374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061785
22819	NC_013222	TGAG	2	8	1322472	1322479	25 %	25 %	50 %	0 %	260061785
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22821	NC_013222	CGGGG	2	10	1322522	1322531	0 %	0 %	80 %	20 %	260061785
22822	NC_013222	CCTGGA	2	12	1322575	1322586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260061785
22823	NC_013222	TTC	2	6	1322591	1322596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260061785
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22829	NC_013222	GCCA	2	8	1323084	1323091	25 %	0 %	25 %	50 %	260061786
22830	NC_013222	CAT	3	9	1323119	1323127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061786
22831	NC_013222	CGCC	2	8	1323169	1323176	0 %	0 %	25 %	75 %	260061786
22832	NC_013222	GCT	2	6	1323286	1323291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061786
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22836	NC_013222	TTG	2	6	1323459	1323464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061786
22837	NC_013222	CCA	2	6	1323490	1323495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260061786
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22840	NC_013222	GTA	2	6	1323605	1323610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260061786
22841	NC_013222	CGG	2	6	1323637	1323642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260061786
22842	NC_013222	TGT	3	9	1323833	1323841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260061787
22843	NC_013222	T	6	6	1323919	1323924	0 %	100 %	0 %	0 %	260061787
22844	NC_013222	TCCG	2	8	1323972	1323979	0 %	25 %	25 %	50 %	260061787
22845	NC_013222	AAAT	2	8	1324178	1324185	75 %	25 %	0 %	0 %	260061787
22846	NC_013222	GCCC	2	8	1324241	1324248	0 %	0 %	25 %	75 %	260061787
22847	NC_013222	ATC	2	6	1324255	1324260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061787
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22966	NC_013222	AGG	2	6	1330785	1330790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260061791
22967	NC_013222	GGCA	2	8	1330817	1330824	25 %	0 %	50 %	25 %	260061791
22968	NC_013222	ATTC	2	8	1330873	1330880	25 %	50 %	0 %	25 %	260061791
22969	NC_013222	CCG	2	6	1330887	1330892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061791
22970	NC_013222	CGT	2	6	1330970	1330975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061791
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22977	NC_013222	GAGG	2	8	1331269	1331276	25 %	0 %	75 %	0 %	260061791
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22985	NC_013222	GCC	2	6	1331853	1331858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260061791
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22990	NC_013222	CTGG	2	8	1332212	1332219	0 %	25 %	50 %	25 %	260061791
22991	NC_013222	GCCG	2	8	1332373	1332380	0 %	0 %	50 %	50 %	260061791
22992	NC_013222	TCC	2	6	1332384	1332389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260061791
22993	NC_013222	CAG	2	6	1332407	1332412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260061791
22994	NC_013222	CCGT	2	8	1332426	1332433	0 %	25 %	25 %	50 %	260061791
22995	NC_013222	GTTTGA	2	12	1332487	1332498	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	260061791
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22997	NC_013222	CCCA	2	8	1332576	1332583	25 %	0 %	0 %	75 %	260061791
22998	NC_013222	TCA	2	6	1332622	1332627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260061791
22999	NC_013222	CGT	2	6	1332685	1332690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061791
23000	NC_013222	CGT	3	9	1332727	1332735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260061791

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